Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23854 LG5 69193339 69196968 G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 69193358 missense_variant p.Leu827Pro
A/T 69193745 downstream_gene_variant
A/T 69193997 downstream_gene_variant
C/A 69194466 synonymous_variant p.Val572Val
G/A 69194508 synonymous_variant p.Asn558Asn
T/A 69194590 splice_region_variant&intron_variant
T/A 69194695 missense_variant p.Gln520His
G/T 69194932 upstream_gene_variant
G/A 69194979 upstream_gene_variant
C/T 69195056 upstream_gene_variant
T/A 69195156 splice_region_variant&intron_variant
G/T 69195345 upstream_gene_variant
G/A 69195480 upstream_gene_variant
A/G 69195663 stop_lost p.Ter410Argext*?
A/G 69195714 missense_variant p.Trp393Arg
A/G 69195846 synonymous_variant p.Leu349Leu
A/G 69196136 missense_variant p.Ile252Thr
T/C 69196459 synonymous_variant p.Ala144Ala
A/C 69196463 missense_variant p.Met143Arg
G/A 69196689 missense_variant p.Pro68Ser
T/G 69196850 upstream_gene_variant
G/C 69196906 missense_variant p.Asp21Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23854.1
MTGNASAALCHLKFAAKHDQDENDALTPTSSIADGQELISPGQNFSLGFFTPGASKSRYIGIWYKNITPQTIVWVANRDIPLNDSRGNLTIAADGNIVLFDGAGNRIWFTSSSSSIEEPIAKLLDSGNFVLMDGKKHDSKGYIWQSFDNPTDTMLPGLMLGWDKNLGMNRYLTSWKSANDPSPGNFTFRFDQIEFPELVIRQGTNIRFRSGIWDGIRFNSDDWLSFMGITAFKPQLSVNSTVAVYWDEPGDRLSRYVMKDDGLLQRYIWDNKNFKWTLMHEARKDFCDNYGACGVNGICNMKDIPAYCDCLKGFTPHSPEDWDSFNWSGGCIRRTPLNCTQADRFQKLSWVKLPMLLQFWTNESMNLEECKVECLKNCSCTAYANSALNEGPHGCLLWFGDLTDIRQLINEEGVQLDLYLRLAASEIAIRVLKLKHLLDSCEESTANATKRKNIALIISVPVALLLCCIIFYLSKKYIKRRTSTSSVTVTSHRNQNEDQASPIFDIDTILAATNNFSIENKIGEGGFGPVYRGKLANGQEIAVKRLSKTSKQGISEFMNEVGLVAKLQHRNLVSVLGGCTQREERMLIYEYMPNSSLDHFIFDPIQGKFLNWRKRYEIIIGIARGLLYLHQDSKLTIIHRDLKTSNILLDSQLNPKISDFGVARIVEGDHSSITTEEIAGTIGYMPHEYAVNGILSLKSDVYSFGVIVLEILSGIRSSNYKVKHPDHDHNLMGQAWTLWKDGRAVGFMDVNLDLTVVPSELLRCLQVGLLCVQKLPEDRPTMSSVVFMLSNESIVLPQPKKTGFFEEDSEYHHAYSENESFSNNAMTITLLEARS*


CDS Sequence:
>Vu_23854.1
ATGACTGGAAATGCAAGTGCAGCTTTGTGCCATTTGAAATTTGCTGCCAAACATGACCAAGACGAGAACGATGCGTTGACTCCAACATCTTCCATTGCAGATGGCCAAGAACTCATTTCTCCTGGACAGAATTTTTCTCTTGGATTCTTCACTCCAGGAGCATCAAAGAGCCGCTACATAGGGATATGGTACAAGAATATTACCCCGCAAACAATAGTTTGGGTAGCAAACAGAGATATCCCACTTAACGACTCCAGAGGAAATTTAACCATTGCTGCTGATGGTAATATTGTACTTTTTGATGGAGCAGGTAACAGAATATGGTTTACAAGTTCATCAAGCTCAATCGAAGAACCAATTGCAAAGCTGTTGGATTCTGGAAACTTTGTGTTGATGGATGGCAAGAAGCATGATTCTAAAGGTTACATATGGCAGAGCTTTGATAATCCAACAGACACAATGTTACCTGGGTTGATGTTGGGTTGGGATAAGAACTTAGGTATGAATAGATATTTGACTTCTTGGAAGAGTGCTAATGACCCCTCTCCTGGAAACTTTACCTTCAGGTTTGACCAGATAGAATTTCCTGAGTTGGTAATCCGCCAGGGAACGAACATCAGATTCAGAAGTGGAATTTGGGATGGCATCCGTTTTAATTCAGATGATTGGTTGTCCTTTATGGGAATTACAGCCTTCAAGCCACAACTTTCAGTAAATAGCACTGTGGCAGTGTATTGGGATGAACCTGGAGATAGATTGTCAAGATATGTGATGAAGGATGATGGACTCCTTCAAAGATATATCTGGGACAACAAAAATTTTAAGTGGACTCTGATGCATGAGGCAAGAAAGGACTTTTGTGATAACTACGGAGCATGTGGGGTGAACGGTATTTGCAATATGAAGGATATTCCTGCTTACTGCGATTGCTTGAAAGGGTTTACACCACATTCTCCGGAAGATTGGGATTCATTTAACTGGTCTGGTGGGTGCATCAGGAGAACACCCTTAAACTGCACACAAGCTGATAGGTTTCAGAAACTAAGTTGGGTTAAACTACCCATGTTGTTGCAATTTTGGACTAATGAAAGCATGAATCTTGAAGAATGCAAGGTGGAGTGCTTGAAGAACTGTTCCTGCACGGCGTACGCAAACTCAGCCTTGAATGAAGGGCCACATGGATGCTTGCTCTGGTTTGGGGACTTGACTGACATTCGGCAGCTTATAAATGAAGAGGGTGTACAACTTGATCTTTATTTAAGGTTAGCCGCTTCAGAAATAGCAATACGTGTTCTGAAACTTAAGCATCTTCTTGATTCTTGTGAAGAGTCCACTGCTAATGCAACTAAAAGGAAAAACATTGCACTGATTATTTCGGTACCTGTGGCACTGCTTCTTTGTTGTATCATTTTCTACCTTTCTAAGAAGTATATAAAACGGAGGACAAGCACTAGTTCGGTCACAGTCACAAGTCACAGAAATCAAAATGAAGATCAAGCATCACCTATTTTTGATATAGATACTATTCTGGCTGCTACAAACAATTTTTCCATTGAGAACAAGATCGGGGAAGGTGGTTTTGGCCCAGTATACAGGGGTAAATTGGCTAATGGACAAGAAATAGCCGTGAAAAGGCTATCAAAAACCTCAAAACAAGGCATCTCAGAGTTTATGAACGAAGTTGGATTGGTAGCCAAACTCCAACACCGTAATCTTGTGAGTGTTTTGGGAGGGTGCACTCAAAGAGAGGAAAGAATGCTGATCTATGAATACATGCCAAATAGTAGCTTGGACCACTTCATTTTTGATCCTATACAAGGAAAATTTTTGAACTGGAGGAAACGATATGAAATTATCATTGGGATTGCTCGAGGACTACTTTATCTCCACCAAGATTCAAAACTAACCATCATTCATAGGGATCTAAAAACTAGTAACATTCTACTAGACAGCCAATTGAACCCCAAAATTTCGGATTTTGGTGTGGCCCGCATAGTTGAAGGAGATCATTCTTCAATAACAACAGAAGAGATTGCTGGGACAATTGGTTACATGCCTCATGAGTATGCAGTAAACGGGATTCTTTCCCTGAAGTCTGATGTATATAGCTTCGGAGTTATAGTGTTAGAGATACTAAGCGGGATCAGAAGTAGTAACTACAAAGTCAAGCATCCAGATCATGATCACAATCTGATGGGGCAGGCATGGACATTATGGAAAGATGGACGAGCTGTGGGATTTATGGATGTTAATTTAGACCTTACAGTGGTTCCATCAGAATTACTAAGGTGTCTGCAAGTTGGTCTCTTGTGTGTTCAAAAGTTACCTGAAGATAGACCAACTATGTCTTCTGTTGTTTTTATGTTGAGCAATGAAAGCATTGTTCTTCCCCAACCAAAGAAAACTGGTTTCTTTGAAGAAGATTCAGAGTATCATCATGCGTACAGCGAGAACGAGAGTTTTAGTAACAATGCTATGACTATAACTCTATTAGAAGCTCGAAGTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_23854::LG5:69196968-69198968(-)
ATTTCAACCATATAATGTTCAGTTAAAGTGTGGTGATAACGCGAAAAGAAATCACATTTGACAAAGAAAATGCAAAATAAGTAGATAAAATTGGTATGAAATATTGGAGAGCAACGTCAAGTTTAGGTCATCAGACTCAACAACACCAACCTTTAATGTGGAGACAGCATTGCAGCAAGAACAAGAAAGAAAGATGGGGCATAGTTTGAAATTTGTTACCAAAAATCCATCTTATTCGATGCATTGCAGATCTTTATTTAATCATAGTACAATATTTGAACGTGGCATGTGGAGTGAAAGGAACTGCAGAGACTCTTGGTCAATGAGTGCCGGAAGATGTTGATAGCAGCAGAGACTTTTTACCAAACTCTACCAATAAACAAGTATATAACAATCCACTGCTTTCTAAATAATGGAATGTTGGAAGTCTCGAAATCTTGTTTCTTTCTTCTTCTTTTCTTTCCCAGCGTTCCCTTTTCTCTGCATCTACAGTCTGTATTTTCCACTAAATTCTGTAGGATGAGAAGAATTACTACCTGGATGTCTCCATCTCATTAACTGACGTGTTATTAAATATTTTATAAACATATATAAAAAAGTAAATATATTCATTAGAACTAAACAATTTATCCATACTTGATTAAGTTAATAAACTTATAAAGTTAGTAAATATTTTTTTATTATAGTAATAAAAAATATTTTATTGTTTATATCCGTCAATTGATGTTTTTAACTTACTGATTAACTTGTGAATTTGGATATTTTATTGAATTTTTTGTGTTATTCTTTTGCTAAACTTTTAAAATACTGATTTTATTAAAAACTTTTTTGTATACTAATATAATTATATTTTAAATGTTGAGTAGAAGAGAATACTGAGCAGAAAATCTTTAATTTACACATTTCTTTGTGGAAAAGAAAAAAAAAAGTTGGAGATGAAAGATGATGGAAAAAATTACTAAACGTCCCTTTGATAACAACAATCAAGTCAGAAAATATTTAAATAAAAAAATTAAATATAAAGTAAAATATTTTTTTTATTAAAGAGTTAATTAAAAGCATTCAAATTTATTATATATTTAAAACTTTGATTAAATCTTTGTTTTTCTTTAGCCAAGATCCTTTGATGTTCCTTCTTTTTTCCTTTTGGATTGCTCATCAGTTTTCTTGGGCCCAAACATCATTTGTTTTGGGCTTGGTTTAATATCAGAACTGGATTTGAGTCGCTATAATGCACCCATTTTAACAATCACTGATTTTTTTTTATTCTTTTGCACACAAATATATTTTTTGAAATATCGAATACATTAAATGTTTTAGTTTAAATAGTATATTTTATACATTAAATATCGAATATCACTGATTTGGGTTACTATATTTTATTCACTACCTGAAGAATTTGATACATACCATTATCCTTCGTTTAAATAGTACTATATGTATTTTAATGACACAGTAAAATTGATGCAGGAGAATAATCACGGAAGGTAGGTGTGGCCAAACCCAATATTATCAATTTGATCAGTAATCTTCAAAATTGAGTTCAATATAAAGACTGGGTCTCTTAACAAACTTAAAAATTGTCTGTTTTGAATGTTAAATCGAATCTCAAACAACGTTTATTCCGAAGGAGGATGATTATGGGAAAAATTAATCAGTTCGAGCTTCACAATGCAGAAAAAAAATATTAGATATTCAGACTTGAAAGTTCAAAGTTTCAATTTGAAAACATTAATTTATTACGCAACTGAATATCTGAAGGAAGAACGTTTTCATTTTAAAACTTTTCAAAGGTCTTCTTCGCCAAGTAAACATGCATTCAACGACTCTCAATATAAAAATCATTAATCATCTAACACCAACAAAACTACTCGCTGTTTGAACCGTGTCGTTTCCATTCATAACATAGTGGATTTTATAAGAAGACCATTCCAGGAAATAGTTTATATAGCTACTTGAGCTTTTGTTTATTCAAAAGTCAAAGCTCTTCGCTTTAAAAG


Gene Sequence:
>Vu_23854(-)
ATGACTGGAAATGCAAGTGCAGCTTTGTGCCATTTGAAATTTGCTGCCAAACATGACCAAGACGAGAGTGAGATGGAACAAACTTGATATCATTATGTTTGCTTATGCTTGTATATCAATCCTTCAGAATACGTCTTGTGCAGACGATGCGTTGACTCCAACATCTTCCATTGCAGATGGCCAAGAACTCATTTCTCCTGGACAGAATTTTTCTCTTGGATTCTTCACTCCAGGAGCATCAAAGAGCCGCTACATAGGGATATGGTACAAGAATATTACCCCGCAAACAATAGTTTGGGTAGCAAACAGAGATATCCCACTTAACGACTCCAGAGGAAATTTAACCATTGCTGCTGATGGTAATATTGTACTTTTTGATGGAGCAGGTAACAGAATATGGTTTACAAGTTCATCAAGCTCAATCGAAGAACCAATTGCAAAGCTGTTGGATTCTGGAAACTTTGTGTTGATGGATGGCAAGAAGCATGATTCTAAAGGTTACATATGGCAGAGCTTTGATAATCCAACAGACACAATGTTACCTGGGTTGATGTTGGGTTGGGATAAGAACTTAGGTATGAATAGATATTTGACTTCTTGGAAGAGTGCTAATGACCCCTCTCCTGGAAACTTTACCTTCAGGTTTGACCAGATAGAATTTCCTGAGTTGGTAATCCGCCAGGGAACGAACATCAGATTCAGAAGTGGAATTTGGGATGGCATCCGTTTTAATTCAGATGATTGGTTGTCCTTTATGGGAATTACAGCCTTCAAGCCACAACTTTCAGTAAATAGCACTGTGGCAGTGTATTGGGATGAACCTGGAGATAGATTGTCAAGATATGTGATGAAGGATGATGGACTCCTTCAAAGATATATCTGGGACAACAAAAATTTTAAGTGGACTCTGATGCATGAGGCAAGAAAGGACTTTTGTGATAACTACGGAGCATGTGGGGTGAACGGTATTTGCAATATGAAGGATATTCCTGCTTACTGCGATTGCTTGAAAGGGTTTACACCACATTCTCCGGAAGATTGGGATTCATTTAACTGGTCTGGTGGGTGCATCAGGAGAACACCCTTAAACTGCACACAAGCTGATAGGTTTCAGAAACTAAGTTGGGTTAAACTACCCATGTTGTTGCAATTTTGGACTAATGAAAGCATGAATCTTGAAGAATGCAAGGTGGAGTGCTTGAAGAACTGTTCCTGCACGGCGTACGCAAACTCAGCCTTGAATGAAGGGCCACATGGATGCTTGCTCTGGTTTGGGGACTTGACTGACATTCGGCAGCTTATAAATGAAGAGGGTGTACAACTTGATCTTTATTTAAGGTTAGCCGCTTCAGAAATAGGTATGCAGGGGTTCTGTTTTAACATGGCATGTAATGTTTACCTTCACAACATCTCTATCTTGGTACGAAAGAGTAAGACAAAATTCAGAACTCTGTACTTGGCCTTTTTCTGATATATTTTTCATCCAGGCTTCATCTGAACTATTTGTTGCCTCGTTCTAGGAAAACAGCAGTAACATATAGTGAAGACACAAGTTATTCATTCATTAGCATTTTAACAGAATGTATTCTTGATTAAATTTTCTTATATGTTTACATATGCATTCTCTTGAAGCAATACGTGTTCTGAAACTTAAGCATCTTCTTGATTCTTGTGAAGAGTCCACTGCTAATGCAACTAAAAGGAAAAACATTGCACTGATTATTTCGGTACCTGTGGCACTGCTTCTTTGTTGTATCATTTTCTACCTTTCTAAGAAGTATATAAAACGGAGGACAAGCACTAGTTCGGGTAAGATTCTTAAGCAATTCAATTTGTTTATTTACATTATTAAATGTTTTCACTTCAAATTCTTCCATCCAAGAACCATTTAGTATCTTTGTTGGACAAGGACGTTTATATTTGAGAAGACAGAAAATAAACTGCTATAATAGCTATAGTTTACTGTGATATGATTATCATTTCAAGGTTCAATACATATTCAGCTTAGGGCTCAGATGATCATCTGATCAAGAAAACTTAGTGACTCATTATTTTTTTGGTGCTTCAGAGTTTAACTGGAGCGGTAGAACAAAACTATTTTCTTATTAAATAGTTATCACATGAATGATGGTTAAGTATATCTATGATAAGTTACCCATTGTTTCTTGCAGTCACAGTCACAAGTCACAGAAATCAAAATGAAGATCAAGCATCACCTATTTTTGATATAGATACTATTCTGGCTGCTACAAACAATTTTTCCATTGAGAACAAGATCGGGGAAGGTGGTTTTGGCCCAGTATACAGGGTAATCTTCTTTTTCCGTTAAGAAGCTTGTTTTTATTTCTCCTCTTCAACTTAACTGTCACCTTAAAATCAGGGTAAATTGGCTAATGGACAAGAAATAGCCGTGAAAAGGCTATCAAAAACCTCAAAACAAGGCATCTCAGAGTTTATGAACGAAGTTGGATTGGTAGCCAAACTCCAACACCGTAATCTTGTGAGTGTTTTGGGAGGGTGCACTCAAAGAGAGGAAAGAATGCTGATCTATGAATACATGCCAAATAGTAGCTTGGACCACTTCATTTTTGGTAATACCACAACTGCAAGACTATGTAGTTCCCCTTATTTCAACTTTGAAAAACTCTGCTAGCATATATATACTCTTTTGCTTTAAATAACCTGTTCTGTAATGGCTAATCTGATCTTTCTCAGATCCTATACAAGGAAAATTTTTGAACTGGAGGAAACGATATGAAATTATCATTGGGATTGCTCGAGGACTACTTTATCTCCACCAAGATTCAAAACTAACCATCATTCATAGGGATCTAAAAACTAGTAACATTCTACTAGACAGCCAATTGAACCCCAAAATTTCGGATTTTGGTGTGGCCCGCATAGTTGAAGGAGATCATTCTTCAATAACAACAGAAGAGATTGCTGGGACAATGTAAGCTTTATGATGATTTACTGAGGATAATATAATTTTTTTTCTAAAAATAATATAATTCATACTATCAGTTGTTTGCTGATAATGTATGCAGTGGTTACATGCCTCATGAGTATGCAGTAAACGGGATTCTTTCCCTGAAGTCTGATGTATATAGCTTCGGAGTTATAGTGTTAGAGATACTAAGCGGGATCAGAAGTAGTAACTACAAAGTCAAGCATCCAGATCATGATCACAATCTGATGGGGCAGGTAACCAAAACTAACTACATGCCCTGATATGTTGACTTTACTGTAAAAGCCACTTGTTGATCTTTCTACGTAATAATATCTTTACTTTTACCAGTATTAACCTTCTCTTAAAATAACTAGGCATGGACATTATGGAAAGATGGACGAGCTGTGGGATTTATGGATGTTAATTTAGACCTTACAGTGGTTCCATCAGAATTACTAAGGTGTCTGCAAGTTGGTCTCTTGTGTGTTCAAAAGTTACCTGAAGATAGACCAACTATGTCTTCTGTTGTTTTTATGTTGAGCAATGAAAGCATTGTTCTTCCCCAACCAAAGAAAACTGGTTTCTTTGAAGAAGATTCAGAGTATCATCATGCGTACAGCGAGAACGAGAGTTTTAGTAACAATGCTATGACTATAACTCTATTAGAAGCTCGAAGTTAG