Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23852 LG5 69180879 69184385 PREDICTED: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B120 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 69180920 missense_variant p.Phe14Leu
A/G 69180921 missense_variant p.Ile15Val
T/G 69180926 synonymous_variant p.Ser16Ser
G/A 69180934 missense_variant p.Arg19His
C/A 69180980 missense_variant p.Asp34Glu
C/G 69181040 missense_variant p.Phe54Leu
G/A 69181050 missense_variant p.Gly58Ser
G/A 69181104 missense_variant p.Ala76Thr
A/G 69181154 synonymous_variant p.Thr92Thr
G/A 69181176 missense_variant p.Asp100Asn
T/A 69181205 synonymous_variant p.Gly109Gly
C/T 69181259 synonymous_variant p.Asn127Asn
G/T 69181556 synonymous_variant p.Gly226Gly
G/A 69181784 synonymous_variant p.Ala302Ala
C/T 69182331 intron_variant
C/A 69182395 intron_variant
T/G 69182411 intron_variant
T/G 69182416 intron_variant
G/T 69182448 intron_variant
G/A 69182452 intron_variant
A/C 69182467 intron_variant
C/T 69182491 intron_variant
C/A 69182545 intron_variant
G/A 69182591 missense_variant p.Cys446Tyr
G/A,* 69182602 missense_variant p.Gly450Arg
G/T 69182604 synonymous_variant p.Gly450Gly
A/T 69182629 missense_variant p.Met459Leu
A/G 69182800 missense_variant p.Ser477Gly
T/C 69182860 missense_variant p.Tyr497His
T/C 69182974 upstream_gene_variant
C/G 69183069 upstream_gene_variant
G/T 69183129 upstream_gene_variant
T/G 69183421 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23852.1
MAAMSISVVFLFSFISFHRMYSLAASSEIIITQDVVIRDEGLETLVSEELNFTFGFFGSDNSSSRYVGIWYHSIPATPVIWVANGDKPINGTGGSITIADDGNLVVHDGAKNLVWSTQVSIDSSTKNCSAKLRETGNLVLSCERKDLWQSFENPTDTFMPGMRVPVGASTGNSSGYVFTSWKSSTDPSKGNYTMGVDPKGLPQIVVWEGDKRRWRTGYWDGIMFEGVSMAGNYLYGFTLNGDGKGGRYFIYNPGTDKVRFQIGWDGYEREFRWNEDEKRWDVVQRGPSHECEVYNKCGSFAACDMATSNSPVCTCIRGFEPKNRDRWGKGNWSGGCTRMTPLKAQRENVTSADTTQVSVGEDKFLELSSMRLPDFASVVGTNDCQKVCLNDDSCTAYANVNGIGCMVWNVDLVDIQHHGTGGNTLNIRLAHSDLDGGKKNMIAIISAVVAGLICLGIIVWLVYRFKGKLKVLPTVSSASCCKNSDVLPVYDGSRSRDMSAEFSGSADHNPFKQTQLDWRRRFEIIEGIARGLLYLHRDSRLRIIHRDLKASNILLDENMNPKISDFGLARIFGGNQNEANTNRVVGTYGYMAPEYAMEGLFSVKSDVYSFGVLLLEILSGRRNTSFRHSDDSSLIGYAWHLWNEQRAMELIDPCIRDCSPKSRALRCIHIGMLCVQDSAAHRPNMSAVVLMLESEATTLPTPTQPLITSMRRTEDRQFYMEGLDVSNDLTVTMVVGR*


CDS Sequence:
>Vu_23852.1
ATGGCGGCGATGTCCATCTCCGTCGTCTTTCTCTTCTCTTTCATCTCTTTTCACCGTATGTATTCCTTGGCGGCAAGTTCAGAGATCATTATCACACAGGACGTCGTTATCAGGGACGAGGGGCTTGAGACATTGGTGTCTGAAGAGCTCAACTTCACCTTCGGTTTCTTCGGTTCGGACAACTCCTCTTCCCGCTACGTCGGAATTTGGTACCACAGCATTCCCGCGACACCTGTTATATGGGTCGCAAACGGCGACAAACCCATCAACGGCACAGGAGGATCCATCACTATTGCGGATGACGGCAACCTCGTAGTCCACGATGGTGCCAAGAACCTTGTCTGGTCCACCCAAGTTTCCATCGATAGCAGCACCAAAAACTGCTCGGCGAAGCTTCGTGAAACTGGTAACCTCGTTCTCTCATGCGAAAGGAAAGACTTGTGGCAAAGCTTTGAGAATCCAACGGATACATTCATGCCTGGTATGAGGGTTCCAGTGGGGGCTTCAACTGGGAATAGTAGTGGCTATGTGTTCACTTCATGGAAATCGTCAACGGATCCTTCGAAGGGAAACTACACCATGGGGGTGGATCCTAAAGGGTTACCTCAGATAGTGGTTTGGGAAGGAGACAAAAGAAGGTGGAGAACGGGGTATTGGGATGGTATAATGTTTGAAGGGGTGTCTATGGCAGGAAATTATCTTTACGGTTTTACGCTTAATGGGGATGGTAAAGGAGGTAGGTATTTCATATATAACCCCGGCACTGATAAGGTGAGGTTTCAAATTGGGTGGGATGGCTATGAGAGAGAGTTCAGGTGGAATGAGGATGAGAAACGCTGGGATGTGGTTCAGAGAGGGCCTTCGCATGAGTGTGAGGTTTACAACAAGTGTGGGAGTTTCGCGGCGTGTGATATGGCCACTTCGAATTCACCTGTTTGTACTTGCATACGAGGTTTTGAACCGAAGAACAGGGATCGGTGGGGTAAGGGGAACTGGTCGGGTGGGTGTACGAGGATGACTCCACTCAAGGCTCAGAGGGAGAATGTTACTTCCGCTGACACTACTCAGGTTAGCGTCGGAGAGGATAAGTTCTTGGAGCTTAGTTCTATGAGGTTGCCGGATTTCGCAAGTGTGGTTGGCACGAATGATTGTCAGAAAGTGTGTTTGAACGATGATTCTTGTACGGCATATGCCAATGTTAATGGAATAGGGTGCATGGTGTGGAATGTCGATTTGGTTGACATTCAACATCATGGTACTGGAGGAAATACACTCAATATCCGTCTCGCTCATTCTGATTTAGATGGAGGTAAAAAGAACATGATTGCGATAATATCTGCTGTTGTGGCGGGGTTAATCTGCCTAGGAATCATTGTATGGCTGGTGTATAGATTCAAGGGAAAACTTAAAGTTCTGCCTACAGTTTCCTCAGCTTCTTGTTGCAAGAATAGTGATGTACTGCCAGTTTATGATGGAAGCAGGAGCAGAGATATGTCAGCAGAATTTTCAGGATCAGCTGATCATAATCCATTCAAACAAACACAACTAGATTGGAGAAGACGGTTTGAAATCATTGAAGGCATTGCAAGAGGATTGCTCTACCTGCACCGAGATTCAAGACTTAGAATAATTCATCGAGATTTAAAAGCGAGTAACATTTTGCTGGATGAAAACATGAACCCAAAGATATCAGACTTTGGATTGGCTAGGATATTTGGTGGGAACCAGAATGAAGCCAATACAAACAGAGTAGTTGGTACATATGGTTATATGGCCCCTGAGTATGCAATGGAAGGTCTGTTTTCTGTCAAATCGGATGTATATAGTTTTGGTGTATTACTACTAGAAATTTTGAGTGGCCGCAGAAACACCAGTTTTCGACACTCTGATGACTCCAGCCTCATAGGATATGCGTGGCATCTTTGGAATGAACAGAGAGCAATGGAGCTAATCGATCCATGCATTCGTGATTGTAGTCCTAAAAGCAGAGCTTTGAGATGCATACACATAGGGATGTTATGTGTGCAAGATTCAGCAGCTCATAGACCAAACATGTCAGCTGTGGTGTTGATGCTGGAAAGTGAAGCAACAACTCTTCCCACGCCTACGCAACCTTTGATTACTTCCATGAGGAGAACTGAGGACAGACAATTTTACATGGAAGGCCTTGATGTTTCAAATGATTTGACAGTCACAATGGTGGTAGGGAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_23852::LG5:69178879-69180879(+)
TAAAAAATAATCATTTTACAATAAAAAAATATTATTTATAGATATAAATGTTAATTTATTTTTGAATTATCTAATTTATTTACATGATTTTTGTTTTCATCTCCATCATGTATTCTGTCTCTTGATAAAATTGATTGAAACTTTCACACATTCGTAGTTTTCAAGTTTTTTTTTATTTTACATAAGTAATTTAGATGATTAAAAATATTTTTTACTAAGATGAAAAGAAAATTCATAAATTTAAATTAGAAAAAGTGAATTAATAATGGATTCAACGTTGACAAATAAATTCATAGATTTATTAATAAAAAAAAGCATATCAGTTATGTAATGAATAATAATTAATTGGGTATAATATTTTATATACAATCTATCGAAAAGTAATTTTTTAAAATTTTAATATTTTTAAAAATTTTCAAAATGAAGGTATAATTGTGATTTTCTTTTCAAATGAATATTGATAAAAATGAAGACCAAAATTATGCAAAAGTATGTTATGTGAATAATATGCTATTTACAAATATTTTCGTTCGAACATTCCTACTATGAAAAAAATTGTATAAAGCGCGGAGCCTAACTTACGATGTGAAGTATGAAGGAATGTGACGTGAAGAGACCATATGAATCACATTAAATCCATGCTTCTCACTATATATAACACGCAACACCGCCCATAATAATAATGTTACCAAGGCTGAAATAAAGAAGAAAAGAAATAATTTTTTTTTTAGTTTTAATAGATAAAATATCAATTCGATAAAGATAGTACATTATTTTAAATTAAAATTAAAATTTAATATCTACTTTATCACTCGTAACATAAAATCATTCATATTTTTTTATGCTATAAAAATTATTTAACTTTTTAAAAAATAGATCAAACCTTATTCATCATTAATTTTATTCCATTTGAAGGAAATACATCTTAACTAATAGATTTATGTTCCCTTCATTATTCTTCTAAATAAAAACAAAATTTGGTAGTTTTATTTTTTTATGTTTGATTCACATTTAACCACCAAACGGGTAAAACTCATATTAAGTAGAAGAGAAGAAAGTGTCAGAGATGGCGACTGTTTATTGTTAAATGAATAGGTAGTTTATTTGTAAGTCATTGAATTGTGTGTCGTATAGGTTAACTTAAGTTTAAAATTTGACTTAATTATTTAAAGGAGTCGCGTTTAATTTTTACTTTATTTTTGGCAGGCACCAAATGTCACATGATGTTCTGAATCAATCGGCTGAGAAAAAGTAGTAAAACTGGTAATTATTCCTCCAAATTCAATTCTATCTCCCTTTTACGAAGACTTTCTACATATCTATCAATTTCTCTCAGTCTAGATTTTTTCGCCATTGTTTCCATTTTTCATATGATTACTTACTATTCTTTTTCCTTTTTGTGCTAAGCTTCACTGTGAGAAATACAGTGCGGTAATGTGTATCAGCTGGAAACTGGAACCTTCTTCCCACTGTGGCTTCTAATCTCTCTCTGCAGTGGAAGCCATTAAAGTCAATTATTAATACAAGTTACTGCATCACTGTTGTTCTTCAGTGCAGTATCTTTTATCTGTTTATTTACTAAAAAAAAATTTCATACAGTGTTATTTTTTTTATTAATTTATTATTCATTTATAATATTCTAAATCTAATAAAAAATAATACATGTGTTATGTTAAGGTACAATTACCCTTATTTATTATTTTCTTGGGAGGAAAAAAACAAAAAATAAATGAGACACAAAGGGTATTGGGTTATTTTTTCAACGCTTTCTCCAATCTGGGAGCCGTGTCTTCAACAACCACAACACAAGCGTGTCTTCTTCTCAAAATCAAATCGGCTCTTATTCTCTCCGGTCAAATAAATACATTTCGTCTTCTCTTTCTTTTTTTCATGTCACCACAGTCACACCCACTATCTCTTCCCCCCAAAGCTAAAAACACAATCCTATCCTTTATGCTTTCACTACTCCCATTCCGTCACCGCAACAGCTTATAACACTA


Gene Sequence:
>Vu_23852(+)
ATGGCGGCGATGTCCATCTCCGTCGTCTTTCTCTTCTCTTTCATCTCTTTTCACCGTATGTATTCCTTGGCGGCAAGTTCAGAGATCATTATCACACAGGACGTCGTTATCAGGGACGAGGGGCTTGAGACATTGGTGTCTGAAGAGCTCAACTTCACCTTCGGTTTCTTCGGTTCGGACAACTCCTCTTCCCGCTACGTCGGAATTTGGTACCACAGCATTCCCGCGACACCTGTTATATGGGTCGCAAACGGCGACAAACCCATCAACGGCACAGGAGGATCCATCACTATTGCGGATGACGGCAACCTCGTAGTCCACGATGGTGCCAAGAACCTTGTCTGGTCCACCCAAGTTTCCATCGATAGCAGCACCAAAAACTGCTCGGCGAAGCTTCGTGAAACTGGTAACCTCGTTCTCTCATGCGAAAGGAAAGACTTGTGGCAAAGCTTTGAGAATCCAACGGATACATTCATGCCTGGTATGAGGGTTCCAGTGGGGGCTTCAACTGGGAATAGTAGTGGCTATGTGTTCACTTCATGGAAATCGTCAACGGATCCTTCGAAGGGAAACTACACCATGGGGGTGGATCCTAAAGGGTTACCTCAGATAGTGGTTTGGGAAGGAGACAAAAGAAGGTGGAGAACGGGGTATTGGGATGGTATAATGTTTGAAGGGGTGTCTATGGCAGGAAATTATCTTTACGGTTTTACGCTTAATGGGGATGGTAAAGGAGGTAGGTATTTCATATATAACCCCGGCACTGATAAGGTGAGGTTTCAAATTGGGTGGGATGGCTATGAGAGAGAGTTCAGGTGGAATGAGGATGAGAAACGCTGGGATGTGGTTCAGAGAGGGCCTTCGCATGAGTGTGAGGTTTACAACAAGTGTGGGAGTTTCGCGGCGTGTGATATGGCCACTTCGAATTCACCTGTTTGTACTTGCATACGAGGTTTTGAACCGAAGAACAGGGATCGGTGGGGTAAGGGGAACTGGTCGGGTGGGTGTACGAGGATGACTCCACTCAAGGCTCAGAGGGAGAATGTTACTTCCGCTGACACTACTCAGGTTAGCGTCGGAGAGGATAAGTTCTTGGAGCTTAGTTCTATGAGGTTGCCGGATTTCGCAAGTGTGGTTGGCACGAATGATTGTCAGAAAGTGTGTTTGAACGATGATTCTTGTACGGCATATGCCAATGTTAATGGAATAGGGTGCATGGTGTGGAATGTCGATTTGGTTGACATTCAACATCATGGTACTGGAGGAAATACACTCAATATCCGTCTCGCTCATTCTGATTTAGGTAAGGTAATTAATCCATTATTTTTGTTTTCAAAATTAGCATTTCAAATTTAATTTGCATTTATCAGTACAAATGTTTCATGTGTGGTCTCACACGAAGAAAACTTGACTGTATTCATCCTGTTTCTATCTTGTTTCCAACATTTAAACCGATATATATTGCGAAAAGGAAAATAAAATAGTAGAATGACAAATCTTGGTTGAACTTGTATTTCAGCTAATTAGCCATCTCAAATTCTAAATCACTAAGATACGTTGATTTTTATTGTCTGTGAAGATGATGAGAAGCAAATAATCTTTTTAAATTTCTCACAAGCTTCTATGATAGTCAAGTTCTAATAACTTGTATGACTTTTGTATCTTCCAATTATACAGATGGAGGTAAAAAGAACATGATTGCGATAATATCTGCTGTTGTGGCGGGGTTAATCTGCCTAGGAATCATTGTATGGCTGGTGTATAGATTCAAGGGAAAACTTAAAGGTTAAAAATTCATAATTCATCTCCCCAGATTCTATTATTTTTTATCAGATATTTGACGACAAAGCTGTCCGATGCTATTATTGGTATTGACTTGCCTGCTTTACGTGTTATTTGTAGTTCTGCCTACAGTTTCCTCAGCTTCTTGTTGCAAGAATAGTGATGTACTGCCAGTTTATGATGGAAGCAGGAGCAGAGATATGTCAGCAGAATTTTCAGGATCAGCTGATCATAGTTTGGAGGGGAGCCAGCTAAGCGGGCCAGAATTTCCACTTTTCAATTTCAGTTGCATTTCAATAGCCACAAACAATTTTTCAGAAGAAAATAAGCTTGGCAAAGGTGGCTTTGGACCTGTCTACAAGGTAAATATGCTTCTGTAAAGCCCATCTTTTTAGTAATAAAAACAGGCTTTTCTAAAATGTAATGGAAAAAACGATTTGCTCTATTCACCAGGGAAAGCTTCCAGGCGGAGAACAAATAGCTGTTAAGAGGCTTTCAAGACGGTCTGGTCAAGGCTTAGAGGAGTTCAAGAATGAAATGATGCTGATAGCCAAACTACAGCACCGAAATCTGGTTAGACTAATGGGTTGTAGTATTCAAGGGGAAGAGAAGTTGCTGGTGTATGAATACATGCCAAACAAAAGCTTGGATTGTTTTTTATTTGGTATGTTTCTTCACATTAACCCCGTCAATTTCCTTACGCATTTTAAATTAACATGAAAAGAGACTATTTGGTTCATTTTCTTAACATTTGTGCATTTTCTGGTATACATAATGACAGATCCATTCAAACAAACACAACTAGATTGGAGAAGACGGTTTGAAATCATTGAAGGCATTGCAAGAGGATTGCTCTACCTGCACCGAGATTCAAGACTTAGAATAATTCATCGAGATTTAAAAGCGAGTAACATTTTGCTGGATGAAAACATGAACCCAAAGATATCAGACTTTGGATTGGCTAGGATATTTGGTGGGAACCAGAATGAAGCCAATACAAACAGAGTAGTTGGTACATAGTAAGTATGCTTTGATTTTACTTCTAAGTTAAGTCATCCACTTGTTAATTCCTGCTTGGACCGGGCTAATCTTAATCCATAACTCTGCTGCAGTGGTTATATGGCCCCTGAGTATGCAATGGAAGGTCTGTTTTCTGTCAAATCGGATGTATATAGTTTTGGTGTATTACTACTAGAAATTTTGAGTGGCCGCAGAAACACCAGTTTTCGACACTCTGATGACTCCAGCCTCATAGGATATGTGAGTATCTATCTCCTATTGAACTTTTTTGGTTATCAACGTGAATTCTTTGTTTTGCCGAAATATCTAACATGTCTAGAAAAACTAATTTGAAAATTTTGAGAGTTGCAACATTTTTATCACTAAGTTTACTGAAATGCCGATGTATTTATGATGATGTAGGCGTGGCATCTTTGGAATGAACAGAGAGCAATGGAGCTAATCGATCCATGCATTCGTGATTGTAGTCCTAAAAGCAGAGCTTTGAGATGCATACACATAGGGATGTTATGTGTGCAAGATTCAGCAGCTCATAGACCAAACATGTCAGCTGTGGTGTTGATGCTGGAAAGTGAAGCAACAACTCTTCCCACGCCTACGCAACCTTTGATTACTTCCATGAGGAGAACTGAGGACAGACAATTTTACATGGAAGGCCTTGATGTTTCAAATGATTTGACAGTCACAATGGTGGTAGGGAGATAG