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Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23849 LG5 69157168 69167889 PREDICTED: beta-amyrin synthase-like
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09109 Metabolism of terpenoids and polyketides   C 00909 Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis [PATH:ko00909]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 69157278 synonymous_variant p.His37His
T/A 69157305 synonymous_variant p.Arg46Arg
A/T 69157411 intron_variant
A/T 69157422 intron_variant
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T/A 69157496 intron_variant
G/A 69157608 intron_variant
C/A 69157610 intron_variant
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C/G 69157839 intron_variant
G/C 69157880 intron_variant
C/A 69157901 intron_variant
A/G 69157902 intron_variant
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T/A 69157956 intron_variant
A/G 69158104 intron_variant
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C/T 69158203 intron_variant
C/T 69158396 intron_variant
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G/T 69158659 intron_variant
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C/T 69158867 intron_variant
G/A 69158901 intron_variant
T/G 69158932 intron_variant
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G/C 69159063 missense_variant p.Arg95Thr
T/A 69159082 synonymous_variant p.Ala101Ala
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T/C 69159145 synonymous_variant p.Ser122Ser
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T/C 69159449 intron_variant
G/C 69159450 intron_variant
G/T 69159579 stop_gained p.Glu190*
T/C 69159602 synonymous_variant p.Asn197Asn
G/A 69159638 synonymous_variant p.Thr209Thr
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C/T 69159722 intron_variant
G/A 69159890 intron_variant
C/T 69160050 synonymous_variant p.Leu289Leu
T/C 69160106 intron_variant
C/T 69160113 intron_variant
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A/T 69160211 intron_variant
A/C 69160216 intron_variant
T/A 69160217 intron_variant
A/C 69160346 synonymous_variant p.Pro327Pro
T/C 69160374 synonymous_variant p.Leu337Leu
G/A 69160548 intron_variant
A/G 69160651 synonymous_variant p.Leu395Leu
C/G 69160700 intron_variant
A/C 69160736 intron_variant
C/T 69160746 intron_variant
T/C 69160793 intron_variant
G/A 69160810 intron_variant
G/T 69160838 splice_region_variant&intron_variant
T/C 69160847 synonymous_variant p.Ile407Ile
G/A 69160892 synonymous_variant p.Leu422Leu
C/G 69160936 missense_variant p.Ala437Gly
C/T 69161008 intron_variant
T/C 69161062 intron_variant
C/A 69161072 intron_variant
A/C 69161104 intron_variant
G/A 69161113 intron_variant
A/C 69161123 intron_variant
G/A 69161183 intron_variant
A/C 69161184 intron_variant
G/T 69161206 intron_variant
T/G 69161231 intron_variant
A/T 69161304 synonymous_variant p.Ser451Ser
T/G 69161344 missense_variant p.Ser465Ala
A/G 69161503 intron_variant
G/C 69161544 missense_variant p.Val493Leu
C/G 69161553 missense_variant p.Gln496Glu
T/C 69161582 synonymous_variant p.Leu505Leu
G/C 69161658 intron_variant
G/A 69161679 intron_variant
A/T,* 69161709 intron_variant
C/A 69161741 intron_variant
A/T 69162008 stop_gained p.Lys570*
T/C 69162286 splice_region_variant&intron_variant
C/G 69162332 intron_variant
A/G 69162339 intron_variant
A/T 69162342 intron_variant
A/C 69162497 intron_variant
A/T 69162520 intron_variant
A/T 69162561 synonymous_variant p.Pro693Pro
T/C 69162695 intron_variant
C/A 69162705 intron_variant
A/T,* 69162771 intron_variant
A/T 69162772 intron_variant
T/G 69162780 intron_variant
A/G 69162854 intron_variant
T/A 69162867 intron_variant
G/T 69162872 intron_variant
T/A,* 69162953 intron_variant
T/G 69162957 intron_variant
T/G 69162958 intron_variant
C/T 69163035 intron_variant
G/A,* 69163099 intron_variant
T/A 69163141 intron_variant
T/*,A 69163169 intron_variant
T/A 69163179 intron_variant
G/A 69163183 intron_variant
A/*,G 69163197 intron_variant
G/*,T 69163210 intron_variant
C/*,T 69163213 intron_variant
G/A 69163284 intron_variant
A/T 69163313 intron_variant
G/T 69163318 intron_variant
A/G 69163336 intron_variant
G/A 69163501 intron_variant
A/C 69163521 intron_variant
C/T 69163528 intron_variant
T/G 69163565 intron_variant
T/C 69163579 intron_variant
A/C 69163595 intron_variant
A/T 69163605 intron_variant
A/G 69163607 intron_variant
G/C 69163636 intron_variant
A/C 69163680 intron_variant
A/G 69163682 intron_variant
A/C 69163798 intron_variant
G/T 69163849 intron_variant
T/G 69163888 intron_variant
C/G 69163940 intron_variant
G/A,* 69163948 intron_variant
T/G 69164036 intron_variant
C/A 69164067 intron_variant
C/G 69164070 intron_variant
C/A 69164074 intron_variant
G/A 69164237 intron_variant
G/T 69164266 intron_variant
A/T 69164328 intron_variant
A/C 69164335 intron_variant
C/T 69164382 intron_variant
A/T 69164413 intron_variant
T/A 69164611 intron_variant
G/A 69164747 intron_variant
T/A 69164896 stop_lost p.Ter744Lysext*?
A/G 69164900 missense_variant p.Glu745Gly
A/G 69165042 synonymous_variant p.Pro792Pro
G/A 69165157 missense_variant p.Ala831Thr
G/C 69165285 missense_variant p.Trp873Cys
C/T 69165483 synonymous_variant p.Pro939Pro
G/A 69165495 synonymous_variant p.Lys943Lys
G/A 69165496 missense_variant p.Glu944Lys
A/T 69165710 missense_variant p.His1015Leu
C/T 69165726 synonymous_variant p.Gly1020Gly
G/A 69166067 upstream_gene_variant
A/T 69166136 missense_variant p.Lys1117Met
T/G 69166140 missense_variant p.Asn1118Lys
C/G 69166143 missense_variant p.Ser1119Arg
C/G 69166184 missense_variant p.Thr1133Ser
G/T 69166193 missense_variant p.Arg1136Leu
T/A 69166202 missense_variant p.Leu1139Gln
T/C 69166206 synonymous_variant p.Cys1140Cys
A/C 69166211 missense_variant p.Tyr1142Ser
T/C 69166215 synonymous_variant p.Ser1143Ser
C/T 69166226 missense_variant p.Thr1147Ile
A/G 69166250 missense_variant p.Gln1155Arg
A/G 69166398 upstream_gene_variant
T/A 69166683 upstream_gene_variant
T/A 69166723 upstream_gene_variant
C/T 69167011 upstream_gene_variant
G/A 69167040 upstream_gene_variant
T/C 69167292 upstream_gene_variant
A/G 69167294 upstream_gene_variant
T/C 69167440 missense_variant p.Val1202Ala
G/A 69167549 upstream_gene_variant
A/G 69167556 upstream_gene_variant
T/A 69167815 missense_variant p.Leu1299Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23849.1
MWRLKIGDGGNDPYLFSTNNFVGRQTWEFDSEAGTVHERDQVQLARQNFYQNRFQTKACADRLWRFQILRENKLKERIAKVKIEDGEKVSLEKTRNTVKRAASYLSALQTSDGHWPAHLAGSLFFTPALVICLYITGHLDSVFSEEHRKEILRYTYCHQNEDGGWGLHIESHSTMFCTALNYICLRILGEEPNACANARKWIRDHGGVTHIPSWGKFWLSVLGVVDWCGSNPMPPEFWILPSFLPMHPGKMWCYCRLVYMPMSYLYGKRFMAPITPLVANLREELFVEPYDKNTWRKARHTCAKEDLYYPHHWIQDLIWDSLYVFTEPLLNRWPLNKLVREKALEVTMKHIHYEDENSRYIAIGCVEKVLCMLACWVEDPNGDAFKKHLARIPDCLWISEDGMTMQGIGTQSWDAGFIVQALLATNLVDDLGPTLAKAHDFIKKSQVTENPSGDFKSMYRYICKGSWALADRDQAWQVSDTTAECLKCCLLLSVLPQEIVGEKMELQKIHDSVALILSLQSANGGIPAWEPARAQEWLELLNPTEFFADIVVEHEYVECTASSIEVLVLFKKLYPEHRKEEIENFIGKAVTFIEDSQLEDGSWYGNWAVCFTYCSMFALRGLVAAGKSYKNCVAIRKNVEFLLKIQNEDGGWGESYLSCPRKEYVPLEGGRSNLVQTSWALMALILSRQAERDPNPLHRAAKLLINSQDTLTYSQSIRDSEIVTSNDSVFVLGFFSPQNSTHRYVGIWYLSDSNVIWIANRDQPLLDSSGVFKISKDGNLVLVDGKNHVIWSSNVSNTATTNATAQISRYGNLMLKDDSTGRTIWESFEHPCDAAVPTMKISANKVTGEKIQFVSRKSASDPSTGYFSASLERLDAPEVFLWINGTRPYWRTGPWNGRIFIGTPLMSTGYLYGWSVGYEGNDIVYLTYSFADPSSFGILTLSPEGKIKLVRYYNNKKGLTLDLGISDCDVYGTCGAFGSCNGQSSPICSCLSGFEARNQEEWRKKNWTSGCVRKVPLQCQRLNNGGSEAAQEDRFLKLETMKVPDFAERLDVEEGQCGTQCLKNCSCLAYAYDAGIGCMYWTRDLIDLQKFQTAGIDLYIRLANSEFQSSNAQEHTNKRIAKELIIGITAATAGPIIVAICVYIVIRRHHSRKGTAKDSGEDEVNTKRVVGTYGYMSPEYAMEGLFSEKSDVYSFGVLLLEIISGKRNTSFRNDDQSLSLIGYAWNLWNEDNIRLLVDPEISASGSENHILRCIHIAFLCVQEVAKTRPTMTTVLSMLNSEISHLPPPRQVAFVQKQSSSSLESSSQENNCNSNNHVTLTDIQGR*


CDS Sequence:
>Vu_23849.1
ATGTGGAGGTTGAAGATAGGAGATGGAGGAAATGATCCATATCTGTTTAGCACAAATAATTTTGTGGGGAGACAAACATGGGAGTTTGATTCTGAAGCAGGCACTGTTCACGAGAGAGACCAAGTTCAGCTTGCTCGTCAAAACTTCTATCAAAATCGTTTTCAGACCAAGGCTTGTGCTGATCGACTTTGGCGTTTTCAGATTTTGAGAGAGAATAAGTTGAAAGAAAGAATAGCGAAAGTGAAGATCGAAGATGGTGAAAAAGTAAGTTTGGAGAAAACTAGAAACACAGTGAAAAGGGCTGCTTCTTATCTTTCCGCACTACAAACCAGTGATGGCCATTGGCCTGCTCACCTTGCAGGTTCTCTCTTCTTTACTCCAGCATTGGTCATTTGTTTATACATTACAGGACATCTTGATTCAGTATTCTCAGAAGAACATCGTAAAGAAATTCTTCGTTACACATATTGTCACCAGAACGAAGATGGAGGTTGGGGACTGCACATAGAAAGTCACAGCACCATGTTTTGCACTGCACTTAATTATATATGTCTGCGAATTCTCGGAGAAGAACCCAATGCTTGTGCTAATGCAAGAAAGTGGATTCGCGATCATGGTGGTGTAACGCATATACCTTCGTGGGGGAAATTCTGGCTTTCAGTTCTTGGTGTAGTTGACTGGTGTGGAAGCAACCCAATGCCTCCAGAATTTTGGATCCTTCCTTCTTTTCTTCCTATGCATCCGGGTAAAATGTGGTGTTATTGTCGATTGGTATACATGCCCATGTCTTATTTATATGGAAAGAGATTCATGGCTCCAATCACACCGTTGGTAGCAAATTTGAGAGAAGAGCTTTTTGTTGAACCCTACGATAAAAATACTTGGAGGAAAGCACGTCATACATGTGCAAAAGAAGATCTTTACTATCCTCATCATTGGATACAAGATCTAATATGGGATAGTTTATATGTATTCACCGAACCACTTCTAAATCGATGGCCTTTGAACAAGTTAGTGAGAGAAAAAGCACTTGAAGTAACAATGAAACATATCCACTATGAAGATGAAAACAGTCGATATATTGCTATTGGATGTGTGGAAAAGGTTTTATGCATGCTTGCTTGCTGGGTAGAAGATCCAAATGGAGATGCTTTCAAAAAGCATCTTGCAAGGATCCCAGATTGTTTATGGATTTCAGAAGATGGAATGACCATGCAGGGAATTGGAACCCAGTCATGGGATGCTGGTTTCATTGTTCAAGCTCTACTGGCCACTAACCTAGTAGATGATTTAGGTCCCACACTTGCAAAAGCACACGATTTCATCAAGAAATCTCAGGTAACGGAAAATCCATCAGGAGATTTTAAGAGTATGTATCGTTATATTTGTAAAGGGTCATGGGCACTGGCAGATAGAGACCAAGCATGGCAAGTTTCTGACACCACTGCAGAATGTTTAAAGTGTTGTTTACTTTTATCAGTGTTGCCACAAGAGATTGTGGGAGAAAAAATGGAACTTCAAAAGATACATGATTCAGTCGCTCTGATACTGTCACTGCAGAGTGCAAACGGAGGTATACCTGCATGGGAGCCAGCAAGAGCTCAGGAATGGTTAGAACTACTGAATCCTACGGAATTCTTTGCTGACATAGTAGTTGAGCATGAGTACGTTGAATGCACTGCATCATCGATTGAAGTTTTAGTGTTGTTCAAAAAGCTCTATCCAGAGCATAGGAAGGAAGAGATTGAGAATTTCATCGGTAAAGCTGTAACATTCATTGAAGATTCACAATTAGAAGATGGTTCTTGGTACGGGAATTGGGCAGTTTGCTTCACTTACTGTTCTATGTTTGCACTCCGAGGTTTAGTTGCTGCCGGAAAAAGTTACAAAAACTGTGTTGCTATTCGTAAAAATGTGGAATTTCTACTTAAAATACAAAACGAGGATGGTGGATGGGGAGAGAGTTACCTTTCTTGCCCAAGGAAGGAGTATGTACCTCTTGAAGGAGGTCGATCAAATCTTGTGCAGACATCTTGGGCTCTCATGGCTCTAATTCTTTCTCGGCAGGCTGAAAGAGACCCAAATCCCCTTCATCGTGCAGCAAAATTACTAATCAATTCTCAGGACACCCTTACATATTCTCAATCCATAAGAGACTCAGAGATAGTAACCTCGAACGACAGTGTCTTCGTACTTGGTTTCTTCAGTCCTCAGAATTCAACGCACCGCTACGTAGGAATCTGGTACCTCTCTGACTCCAACGTCATATGGATAGCTAATAGAGACCAACCGCTCCTTGATTCTTCTGGGGTTTTCAAAATCTCCAAAGATGGTAACCTGGTTCTAGTTGATGGAAAAAACCATGTAATTTGGTCGTCCAATGTGTCCAACACTGCAACAACGAACGCCACTGCTCAAATTTCCCGTTATGGGAATCTAATGCTCAAAGACGACTCCACGGGACGGACCATATGGGAGAGTTTCGAGCATCCTTGCGATGCAGCAGTGCCAACCATGAAGATCAGTGCTAACAAAGTCACAGGTGAGAAAATACAGTTTGTGTCAAGGAAAAGTGCTTCCGATCCTTCTACTGGCTATTTCTCTGCTTCTCTTGAGCGTTTGGATGCTCCGGAGGTGTTTCTATGGATTAATGGAACTCGGCCTTATTGGAGGACTGGCCCATGGAATGGTAGAATCTTCATTGGGACACCATTGATGTCAACTGGGTATCTTTATGGATGGAGTGTAGGATATGAAGGAAATGATATTGTTTATCTGACTTACAGTTTTGCTGACCCATCTTCATTTGGAATCCTTACCCTGTCTCCAGAAGGAAAGATTAAATTGGTAAGGTATTATAACAATAAGAAAGGGTTGACTTTGGATCTGGGAATTTCTGATTGCGATGTTTATGGCACATGTGGGGCATTCGGAAGCTGTAATGGGCAGAGTTCACCAATATGTAGCTGTTTGAGTGGATTTGAGGCCAGGAATCAAGAGGAGTGGAGAAAGAAAAATTGGACTAGTGGGTGTGTCAGAAAGGTGCCACTCCAGTGTCAGAGGCTTAACAATGGGGGGAGTGAAGCTGCACAAGAAGATAGATTTTTGAAACTTGAAACAATGAAAGTACCAGATTTTGCAGAGAGATTAGATGTTGAGGAAGGTCAGTGTGGAACACAGTGCTTGAAGAATTGCTCTTGTTTGGCATATGCATACGATGCTGGCATTGGATGCATGTATTGGACTAGAGACTTAATTGACTTGCAAAAATTCCAAACTGCAGGCATTGATCTCTACATCCGTCTCGCCAATTCAGAATTTCAATCCAGTAATGCACAAGAGCATACTAATAAAAGAATAGCCAAGGAATTAATCATCGGAATTACAGCGGCAACTGCTGGACCAATCATCGTGGCCATCTGTGTTTATATAGTCATTCGTAGACATCACTCGCGTAAGGGAACTGCCAAAGATTCGGGCGAGGATGAAGTTAATACCAAGAGGGTTGTTGGCACATATGGCTACATGTCCCCTGAATATGCTATGGAAGGATTGTTTTCTGAGAAATCAGATGTGTATAGCTTCGGAGTTTTGCTACTAGAGATTATCAGTGGAAAAAGGAACACTAGTTTTCGAAATGATGACCAGTCTCTCAGCCTTATAGGATATGCGTGGAATCTATGGAACGAAGACAATATTAGGCTTTTGGTTGATCCAGAGATATCAGCTTCAGGATCTGAGAATCATATTTTGAGGTGCATCCACATTGCATTTCTTTGTGTGCAAGAAGTTGCAAAAACTAGACCAACTATGACTACTGTGCTCTCAATGCTTAACAGTGAGATTTCCCATCTACCTCCTCCTAGGCAAGTTGCATTTGTTCAGAAGCAAAGTTCATCAAGTTTAGAGTCTTCTTCTCAAGAAAATAATTGTAACTCCAACAACCATGTAACTCTTACTGATATCCAAGGGAGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_23849::LG5:69155168-69157168(+)
ACGTGGTTTTTACTCGAATTAACAAATCTATATAACAATTAATATTATATAAAATATAAAATTTTAAGATAATAAACTTATAAATATTTGTTTATTATAATTGTGTAGAAAAAAAAAAATCATGATTAGAGTTATAAGAAATGGTAGGCAATTATTTGGACTGTTAAAGCTACGGATGGATCAATTCACATCGAATGTCTTCCATAACCTACTCATCTCATCATATAAATATTGGATCAACTCTTGTCATAATATATTCTATTGTCTTCAGTGTCAGCAAGCTTAGATAATAATGATTAGAATTTAATAGGATAAAAGTACTGATAACAAACGAAAATATGATTACAGAAATTGAGTTGAGAGGAATTGTTAGAATATATATTAAATTTAGTATATTATATATTCATATTTGTCTTATAATATTATTTTTAAAAGAAAATCTTATAAAATATTACAAATAGAAAAGTGCAAATCAAACTATATGTTCCAAACTTTATGAGCATTAATAAGTGTACACATGTTGGTATGTGTTTTGTCCAGTAGTTGGGAGGTGGTGGAGGAATTAATAACATTTAATACTAGGAAGAAAAAAAAACTAAATATTCCATTCATAGATGATTTTATGATTTTTTATCATTATAATTTTATTTTAATATTATTTTTAATAAATATTAAAAGTAATCTAAATTCATTTATTAGCAGTCATAAATTATTGGTTTATTGCTATTTAAAACCAATTAAGTGAGAAAAAAATCTTAATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGGTTTAATTAATTTCTTTTAATAAATTTGATATTTTTAATTCAATTTTTATCAAGTTTTTATTTTATTTGACATTTAGAATTTTTATATTTTAATTGAGTTTTTGTAATTTTTTTACAAACTAATTTATAAAAGAAAATATTTTTCAATTTTATATTTTATAAATAGTCATGAAAAAAGTTATTTAAAGAAATTCTTCACCTCTACATTTGAAGTACACATTATTATCATAAAATAACAATTAAAAAAATTCAATTATAATTTTTATTTGTTCAGCTTCTTATTATTTTAAAAATTATAAAAAATATTTATCAAATAAAATAATTATAATTTAAAAAAATTTAGTAAAAAATATTCAATCAACATTTTTTTAATAAATTATATAACTAAACATACCGTATTAACCTCACTTTCAATTCAAAATTATAAAATAATAAATTTATGTAGTTTTTAATCAAGTAATTAGATATAAGAGATGAGTCAAATCTATATAACAATTAATATTATATAAAATTTAAAATTTTAAGAGATAATAAACTTAAAAAAATTTGTTTATTATAACTGTGTGGAATAAACTCTTTCCTAAAAGAAACTCTTATAGAAAGATGTGACATACAAATATAGAATTTCGGAAAGTATTAGAAAATAGGGGAGTTTTATAGACAAAAAATAAATAAAAATAATCATAATTAGAGTTGTAAGAAATGGTAGGACGTTATTTGGAGAGTTATAGCAAGGGATGGGTGAATTCAGACCGAATACCTTCCGTATTCCCACTCATCTCACCATATAAATATTGGACCAACTCTCATCATAACAACATAGTTTCAATCTTAAAAAATCAGAAAGTTGGTTGCAATAATAATACCCTCATTCTGCATTTTTCGACTATACTTTTCAACTGCAACAACAGGTTTCTTCTCTAACTATTATTATTCTTCTATTCTGTACATACAATCATATTTTATATATGTTTTCGTCTTCAGTGTCACAGTTTTATTTGATTTTTTTATTTCCTAATAAAAACACGTTTTTTAATGATAATTTTGATGAGTAATATTAACTTAGACACACATCTTATAATAACATTTAATTGTTTTATTTCTATCATATTAAAGAACCCCAAAGGCGCCCTTAATTTTAAGGGCAGAAGGAAATCTAGGAAGAGGGTGTGCACAGAAAAAAAGAGAAGAAGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_23849(+)
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