Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23811 LG5 68833314 68838626 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 68833342 missense_variant p.Val10Asp
C/T 68833400 synonymous_variant p.Thr29Thr
T/G 68833516 intron_variant
G/A 68833863 intron_variant
T/C 68834117 intron_variant
C/T 68834182 intron_variant
G/A 68834199 intron_variant
C/T 68834307 intron_variant
T/G 68834593 intron_variant
T/G 68834648 intron_variant
T/C 68834666 intron_variant
G/C 68834676 intron_variant
C/A 68834679 intron_variant
T/C 68834688 intron_variant
C/T 68834757 intron_variant
G/A 68834859 splice_region_variant&intron_variant
C/T 68835356 intron_variant
A/G 68835651 missense_variant p.Lys297Arg
G/C 68835699 missense_variant p.Cys313Ser
G/A 68835781 synonymous_variant p.Lys340Lys
T/C 68836248 intron_variant
G/A 68836502 intron_variant
A/G 68836515 intron_variant
T/C 68836681 intron_variant
A/G 68836691 intron_variant
T/A 68837273 intron_variant
G/A 68837345 intron_variant
C/A 68837410 intron_variant
T/A 68837496 missense_variant p.Leu560Gln
A/C 68837510 missense_variant p.Ile565Leu
A/T 68837756 intron_variant
T/C 68837809 intron_variant
A/G 68837909 intron_variant
G/A 68837911 intron_variant
T/A 68837977 intron_variant
G/A 68837994 intron_variant
T/A 68838006 intron_variant
A/T 68838007 intron_variant
T/A 68838018 intron_variant
A/G 68838115 intron_variant
C/T 68838129 intron_variant
C/T 68838138 intron_variant
G/C 68838363 intron_variant
A/G 68838410 intron_variant
T/C 68838434 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23811.1
MTSTKLELHVGIFVTCVVILAGTFCVGDTDMVDVGAINSLYVSLGSPPLQGWKSVGGDPCLELWQGVACVFSNITAIHLGSMNLGGQLGSNLNFPSILELDLSNNHIEGPIPFTLPPTLRSLSLMGNRLNGSIPDALSLLTQLSNLDLSNNNLSGQLPSSTGSLSSLITLHLQNNQLSGTLYVLQDLPLQDLDIENNLFSGPIPPKLLSIPNFSKNGNPFNTTIIPSPPLAAPAPVAMVPSPQESPWKVAYGPSALTARVPASARRSFMAKSIIWIAGAGLFVFIVLGVCLLMLCCIKRRPEKKNAKKLDDVGVFGGPLNKSACNDSVFGATNQEEKGKCEVPNRSTNSIPKVQDEGDIHVKVVSATSECNNGHQSMNTGGGSKLSPLQPPPKHSFPTISGEKITINPATTTKETEKQVMTNSIEIYTIALLQQYTNNFSQENCIGEGTLGPVYLAELPDGKLLAVRKLDATASMGQSHEQFLQLVSSISNIQHANIARLVGYCVEHSQRLLVYEYCSNGTLHNVLHGDDDQRIKLPWNARIRVALGAARALEYLHENFRPPIVHRNFRSNNVLLNDNLEVCISDCGLGPLLSSGSTGQLSGRLLTAYGYSAPEFESGSYTQQSDVFSFGVVMLELLTGRKSHDKSRPRAEQFLVRWAVPQLHDIDTLSKMVDPCLNGAYPMKSLSRFADIVSSCLQVI*


CDS Sequence:
>Vu_23811.1
ATGACAAGCACCAAATTGGAGTTGCATGTTGGGATTTTTGTCACCTGCGTCGTGATTCTCGCAGGGACTTTCTGTGTTGGAGATACCGATATGGTTGATGTTGGTGCAATCAATAGTCTATATGTTTCTCTGGGGTCGCCACCACTTCAAGGGTGGAAATCCGTGGGAGGAGATCCATGTTTAGAACTGTGGCAAGGTGTCGCTTGTGTCTTCTCCAACATAACTGCTATACACCTTGGAAGCATGAATTTGGGTGGACAGCTGGGCAGCAATTTGAATTTCCCATCCATTTTAGAATTGGATCTTAGTAACAACCACATTGAAGGGCCTATTCCATTTACTCTGCCCCCTACTCTGCGGAGCTTGTCTCTCATGGGAAATCGATTAAATGGAAGCATTCCGGATGCCTTGTCCTTATTAACTCAGCTGTCAAACTTGGATTTGTCAAATAATAACTTGAGTGGTCAGCTGCCTTCCTCAACAGGGAGTTTATCATCTCTTATAACATTGCACTTGCAAAATAATCAACTTTCGGGGACCCTTTACGTGTTGCAAGACCTGCCACTTCAAGACCTGGATATAGAGAACAATTTATTCTCTGGGCCAATTCCTCCAAAATTGTTGTCTATCCCTAATTTCAGTAAAAATGGGAATCCGTTTAATACTACCATCATTCCATCACCTCCTCTTGCAGCCCCTGCACCAGTAGCTATGGTTCCATCCCCCCAAGAATCGCCTTGGAAAGTGGCATATGGTCCTTCTGCCCTGACAGCACGAGTGCCTGCAAGTGCTAGGAGGTCTTTTATGGCTAAGAGCATCATCTGGATTGCTGGTGCAGGTCTTTTTGTATTCATTGTATTGGGAGTTTGTCTTCTAATGTTGTGTTGCATTAAAAGGAGGCCGGAGAAGAAAAATGCTAAGAAACTTGATGATGTGGGCGTGTTTGGGGGACCTTTGAATAAATCTGCATGCAATGATTCAGTTTTTGGAGCAACTAACCAAGAGGAGAAGGGTAAATGTGAAGTACCAAATAGAAGCACAAATTCGATTCCTAAGGTTCAAGATGAAGGAGACATACATGTGAAAGTAGTATCTGCAACTTCAGAATGCAATAATGGTCATCAATCAATGAACACTGGAGGGGGTTCCAAACTTTCACCCCTGCAGCCACCACCAAAACACTCTTTCCCAACCATTTCTGGTGAGAAGATCACTATCAATCCCGCTACAACTACCAAAGAAACTGAAAAACAAGTTATGACAAATTCCATCGAAATTTATACTATTGCATTGCTTCAACAATATACAAATAACTTTTCCCAAGAAAACTGCATTGGGGAAGGCACACTAGGGCCGGTTTATCTGGCTGAACTCCCTGATGGAAAGCTATTGGCAGTGAGGAAACTGGATGCTACTGCTTCCATGGGGCAGAGTCATGAGCAATTTCTTCAATTGGTATCCAGCATCTCCAATATTCAGCATGCAAATATTGCAAGACTTGTAGGCTACTGTGTTGAACACAGCCAACGACTACTTGTATATGAGTATTGCAGTAATGGGACCCTACATAATGTATTGCATGGGGATGATGATCAGCGAATCAAACTTCCATGGAATGCACGCATTCGAGTGGCACTCGGAGCTGCCAGAGCTTTAGAGTACCTGCATGAGAACTTTAGGCCACCTATTGTGCATCGAAATTTTAGGTCTAATAATGTTCTTCTGAATGACAATTTGGAAGTGTGCATCTCTGATTGTGGATTAGGGCCATTGTTATCTTCTGGCTCTACGGGTCAGTTATCAGGACGCCTCCTTACTGCTTATGGTTACAGTGCTCCAGAATTTGAGTCTGGAAGTTACACACAGCAAAGTGATGTCTTCAGTTTTGGTGTTGTAATGTTAGAACTCCTTACTGGACGAAAATCTCATGACAAGTCCCGGCCTCGTGCAGAGCAATTTTTGGTGAGATGGGCTGTCCCTCAACTCCATGACATTGATACATTGTCAAAAATGGTTGACCCCTGCTTGAACGGAGCCTATCCTATGAAGTCCTTGTCGCGTTTTGCAGATATTGTTTCTTCATGTCTACAGGTAATCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23811::LG5:68831314-68833314(+)
TGTTTATAGATTTACTTATTATGAAAGTAAATTGATATGAAATTTAGATAGTTATAAAAGTAGAGTGAAAAAAAAAAAAGAACTAACTGAGTGACCCACCATCTGTTAACCGAACGACTTCGTTTGGCCGATGCTTCCAACTTTAAACATCTAATTACAAACCGATCATCACTCACCAACATCCACCAAACATATACAAATCATGACGCAATTTATACCCTCTAAATTTATTTAATTTCAGTATATAATGTTTTAATAACAATAATAAGAAGAATATTATTATTATTATTATTATTATGTTTGTGATACTCCACGTTAAGGATGTGACTTAAATAGTTATGACATCCACGAATTTGAAAAAAAATTGTTATTTCAATAGATATCTTTTAGAATAATGGTAATTTGATACTATAATTTCTTTTAGACCCATTTGACGGTGGCTCTCACTATCTTTCACTATATATTTTTTAAATAAAAAAGTTATCTTTTGTTAAAGCAATTTTACCCTTATAAAGATTATCAAACGATTAATGATATCAATTTTTTTCCCTACTTTTATGATCACCCTGATCAGAATTTTTACTTATACACTCCATCATCTTCAACTGATGTTACGATCATATCATAAAAAAAATTGTCTATTATTTGTTTACCGTTAAATTAGTTGTTTTTTGAACTATTTGAAATTAAACAATGTTTGAAAATTTCTGATCAGATTTTCTCATTATTATTGGAATGGTTAAGCACACGAGCGAGATAGCTCCGGGTTAGTGATATAGTATAAGATGTGATGGCTCTTTATTATCACACTAAACAAACCGGTGGCTATTGATTGAATCTGTGAGTCAGATTTTAATTCCTAGTAAAAGTTCAACACAATTGTTCATCTAATATTAGCAAGAAGCATGCGATGTTGCAGATGAAACTTGCATATTACTTTATAAGATACACAAGCAAAATCCTAGTTTACTTTTTCCTCTTTGCAATCATGTTAATATACTAGTGAGGGTGAGTGTATAACATCTCCAAGAGTCTTATTCAATAACTAAACCCAGCTAATTGAATTTTTTAAACGCAAATTGACCATTGAAAAAGAATTCAATACACATAAATAATAATTCAATAAAAAGAGTCAATAAGTTTTAAAGCACATGAAGCAAATGAAAGGATAGTTGAGATCGCTTACTGTTTTTTTTTTTTTCATGCTAGCGTACAATGTGTAGTGTCCATTGTTGATGATTAAAAAACGTTATGATGTTAAATACAGAAATAATCCTTAATTATGCATGATTGCAGCTATAAAAGCAGTTGTAAGTACCAGTGAGATTTAAATTGGCATACGAAAATTCAGACTGTGAATTTAACTAAGCTTGTATATTTATGTTCGTGCAAACAAATTTTTTCTCTCCTCATTTCACCGTTATAAGAAGTCGAATCTAACGTTGGAAATGTCTTAAATCCTTGTGTGTACGCGAGGATGGTGGACCCCCTTATTATTACAAATCAAACATGTAAAACAATTTTTGAATGATGTCTCAAAAAGCGCTCTGCTTGTCTCTGCTTTTGAGAAGAAAGACAGAAAAAGAAACAGATAAAGAGTGTCACACAGTGCCTGTATATCCTTACACTACACTGTACAGTACTAGTGTGTGCTTTGGACGACACTCTTTAGGGTTTCTCAACTCTTGCTTACCCTGCATTGCTCACCTTTTGTTTTTCATTTTCCTCTTCTCTTAAGTCTCCTTCTTTCCCATTTTCTTTCTCCATGTCGCACTGAAGCCTTTTTTATTTTGGTCACTTTCCCCCACCATTTTCATTTTCCTTTATTTTTGTCTCTGTTCTGAAAAGGGTTTGATTCCCTTTTAAGAACGACCTCGGATTCTCGTGGAAGTTTTTGTCTTGTTCTTTAGTGTGTTTTCAGTTTTGAAGTTTTGAGCTTCCCCAACTTCGGTGTATAGCTTCTGTGGCTTCAATCTTGGAAGTTAACTCCATTGTGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_23811(+)
ATGACAAGCACCAAATTGGAGTTGCATGTTGGGATTTTTGTCACCTGCGTCGTGATTCTCGCAGGGACTTTCTGTGTTGGAGATACCGATATGGTTGATGGTATTGCAAATAGTCTTCTCATCTCTTAGTTTTATTTCCATATTAGAAATATAATGCTTCATTTACTTCTTAGGGAAGGTACATTAAAACCGAAGAAAAATATCAAGAAAATAAGTAAACGAAGTTCTTTTTATTTATTTGTTGTTTAACTTATAAAGTGCACAGGTTATGGAAACTAATCTGTTTCAAGGTGTGTCATGGTTACAGTTGGTGCAATCAATAGTCTATATGTTTCTCTGGGGTCGCCACCACTTCAAGGGTGGAAATCCGTGGGAGGAGATCCATGTTTAGAACTGTGGCAAGGTGTCGCTTGTGTCTTCTCCAACATAACTGCTATGTATGTCTATCCTCCCTTTCTTAAGGTGGTATTGATTTCAATTTTGTTATTGTTTTCATATTCTAGGTAATTGGTTTGCATTGCATAAGTTATTTGATTAATAGTGCTGAATGTGAACACCTGGGATAAGGCTCAGTGGAATTTATATTTGACAGACACCTTGGAAGCATGAATTTGGGTGGACAGCTGGGCAGCAATTTGAATTTCCCATCCATTTTAGAATTGTAAGTAGTGCCTTTTGAGATAATTTTACCCGTGCTGATTGATCATGCAAACATTTGTTGCTTTTCAGAGTTACTCGATTCAGCAGTATTTATATCATATAAATACGTGTGTCCACTGTGAATACTGCCCAGTGCTCATATATACTGAAATATGCACATATATAATGGTTACTACATCAAAATTATGTACACTAGGCTCATATTTGCCCAAAGTCACTGGTTATGGAGGAGTCAGTTTTGTTTAGATTAATTGGGAAAATTTGGCCCTTGACAAGTAATTATGTAATTATTAGTATTCGCACTAGAAAACCTCATGAAGCTTTCTTGTTTCACCATTCCACAGGGATCTTAGTAACAACCACATTGAAGGGCCTATTCCATTTACTCTGCCCCCTACTCTGCGGAGCTTGTATGTTATCATTTTTATCTTGAAATTCATGATTTTACAGCAGTATTTACTGAATGATCTGTTGATAAATGCATATCTACCAGAATACTTAACCACTTTATGTTTTGATTGAATATTTAGGTCTCTCATGGGAAATCGATTAAATGGAAGCATTCCGGATGCCTTGTCCTTATTAACTCAGCTGTCAAACTTGTGAGTTCTTAAAATGTTTGTCCATTTTGGAAGATAAATGGTGTCCATTGATAATTAAGCAACCTTTTCAATTGTTAAATCCTACATGTATTTCATCATCGTACTGGTTCAATTAATACGTTGGAAAATGATGTTAAATTGCACTGGCATTTCTCTTTCTTTATTCCATTTCCATGCACAACTCATGGAAACCCTATGCCATGTTTCAGGGATTTGTCAAATAATAACTTGAGTGGTCAGCTGCCTTCCTCAACAGGGAGTTTATCATCTCTTATAACATTGTGAGTAAAATTTCTTCCTATGAATATATTCTATTTTGCTACATGTAATGAGGTGTTATTTATTATTGATTCATTTTGCACTTTCAGGCACTTGCAAAATAATCAACTTTCGGGGACCCTTTACGTGTTGCAAGACCTGCCACTTCAAGACCTGTACAATTCTAACTATGAAATTACATTTTGAGATATATCCTGCAATTGCATCAATGGCTAGAACTAGATATATTTTACTTGTGATTTTATTATTATGCAGGGATATAGAGAACAATTTATTCTCTGGGCCAATTCCTCCAAAATTGTTGTCTATCCCTAATTTCAGGTGAGACATGTTTTGTTTTGTACTATTATTTATTTTCCATGCTCCCATTTTTTCAAGCTTTGGTTCTGGTGTGTGACAGTATGAGAAATAACAATAGATCTTGAACTCTGCACTATGAATCTTTTATTCTAGATGTTTTAAGTATGTTCTTATAAGATAAATCGGTTCATTACCTTATTCCAGATCTTTTATTCTAGTTAACATAGTAGCATGTCCTGTGCAGTAAAAATGGGAATCCGTTTAATACTACCATCATTCCATCACCTCCTCTTGCAGCCCCTGCACCAGTAGCTATGGTTCCATCCCCCCAAGAATCGCCTTGGAAAGTGGCATATGGTCCTTCTGCCCTGACAGCACGAGTGCCTGCAAGTGCTAGGAGGTCTTTTATGGCTAAGAGCATCATCTGGATTGCTGGTGCAGGTCTTTTTGTATTCATTGTATTGGGAGTTTGTCTTCTAATGTTGTGTTGCATTAAAAGGAGGCCGGAGAAGAAAAATGCTAAGAAACTTGATGATGTGGGCGTGTTTGGGGGACCTTTGAATAAATCTGCATGCAATGATTCAGTTTTTGGAGCAACTAACCAAGAGGAGAAGGGTAAATGTGAAGTACCAAATAGAAGCACAAATTCGATTCCTAAGGTTCAAGATGAAGGAGACATACATGTGAAAGTAGTATCTGCAACTTCAGAATGCAATAATGGTCATCAATCAATGAACACTGGAGGGGGTTCCAAACTTTCACCCCTGCAGCCACCACCAAAACACTCTTTCCCAACCATTTCTGGTGAGAAGATCACTATCAATCCCGCTACAACTACCAAAGAAACTGAAAAACAAGTTATGACAAATTCCATCGAAATTTATACTATTGCATTGCTTCAACAATATACAAATAACTTTTCCCAAGAAAACTGCATTGGGGAAGGCACACTAGGGCCGGTTTATCTGGCTGAACTCCCTGATGGAAAGGTAATGTTCTAGCTTCTATGTCTCTACATAAAAGGATTCTCCTAGTTTTATAACATGTCTATTTCGGCATTCTTTTGTATTCATTCTCTCAAATGTCTCCTCATTAATGAATTTCTTGTTTCTATTTAAACCTGTTATTTTAGAGATTGGAACACTTATGTTTTTTCCCCTTTGGGTTTTATGAAATAGCAAGAACCTGCTTGTGTTTGTTGAGATTTTGTCTGTCACTGCTTATGTTATGATCATATCGAATAATATCCAAGGCCAATTGATATATTCTGTTACTATTTGAACCCAACCAATGCTCTCAGAAACTACTCTTCAACCTATCTAAGAACAAGTTCTGATTGGGTGGTTTGGTCCACAAGACCATTGTGGTCCAGCCAGCTTTATCTGCAGATATAGAATTCATAAACACTGATTTAATCAATGATATTTTTTGAAACAGAGTTTATATTGGTTTTGGAGAATTTTTAATGAAACAATTTCTCTGACTTAGTAGTCAGCCAGTCACTCCTGGCTATCTATTTTAGATAGTTCTAATCAAACAGTTAATATTGAGTGTTGCATTGATGACCATTGGCTTTGCCCCAGTTCATACTTTGTTAGGATAAATATATTGGTTTGTGATTTTTTATGCTCTGCACAGCCTTTTAATTGTCCTTTCTTGAGATTATCTGTTGTCTAATTTTCCTGGCTTGACTACTGTTTACTGGTGCCTCACGTGCTTATATCTTTGAAATGTTCTTTTTAGCTATTGGCAGTGAGGAAACTGGATGCTACTGCTTCCATGGGGCAGAGTCATGAGCAATTTCTTCAATTGGTATCCAGCATCTCCAATATTCAGCATGCAAATATTGCAAGACTTGTAGGCTACTGTGTTGAACACAGCCAACGACTACTTGTATATGAGTATTGCAGTAATGGGACCCTACATAATGTATTGCATGGGGATGATGATCAGCGAATCAAACTTCCATGGAATGCACGCATTCGAGTGGCACTCGGAGCTGCCAGAGCTTTAGAGTGAGTTTAGTGACCAACCCGATTCCAATTTTTTAGTTACATAAACTCAATATTAGTCACTAAGTAATACCTTTTGGAGGTGGGAAGCATTGCTTTTATATTTTAGTCGCTGTTATCCTATAATATGTTAACTGAAACACAGCTATTGGTACAATTGTGGAAGGTCTTGTAGCATGACATAAATTTGAGTCTGCTAGTATAAACCAGTTATGTTCAAGACTATTAGCAATAGGCCATGGCCTTGATTTTTCTTTTCATGACGGCCTTATCTCTGATATTCCTTGTCTTTCTTGTACAAGGTACCTGCATGAGAACTTTAGGCCACCTATTGTGCATCGAAATTTTAGGTCTAATAATGTTCTTCTGAATGACAATTTGGAAGTGTGCATCTCTGATTGTGGATTAGGGCCATTGTTATCTTCTGGCTCTACGGGTCAGGTAACTCTTTTAATTTCTTAATCTGTGAATTCTCAACTGATATTTATTGAATGCTTTTTAGGCTTCTTAACTATGTAGCAGACATTCTTGTAGTTCTGTTGAATGTCATGGAATAAATGGCGCAAAAGAATTATATTCATATGTAAAAAGTAAGTGCAAAAGCGTATGATCAGATATTTTATCAGACCTTAGCCTTGCGTTTGGATAGAAAAGTTTTAGAGGGTAATTCATTTTACAAAGAATTTGATATATTTTATGGCAATAAAGATGAAGGTATGGAATGGAATTTCATATTGTATGAAAGGAGATACAGTTTATGCCACTATGCAGCAAAACCATGATGGTTGCGTGGAAAATCTTAATATAGAATTTGTGTGGTACTAAGAGCCGAAATAGATTATTGGTTTGGTTCATAAACTCTGTTGTATATATAACTAAAATGACTTAAATTCTAGTTCTCCTGATATTCTTAATTTCAGAAAATTGCATTCTATATTTTCGGAGTCTAGTTTGTAGGGTGGCAAAAAGTACTGCTACAGACCCAAGATTTAAGTTTATTTCCTCTGTTTTTGTTACATTCCTGTCTAACAATGACGCATCTAATCTCAGTTATCAGGACGCCTCCTTACTGCTTATGGTTACAGTGCTCCAGAATTTGAGTCTGGAAGTTACACACAGCAAAGTGATGTCTTCAGTTTTGGTGTTGTAATGTTAGAACTCCTTACTGGACGAAAATCTCATGACAAGTGAGTAATGCCATTAGCAATTATGATAGTTGTGTTCATATCTTTTCCAGCTTAACAGAAACAATGCTTAAAATTTCGAATTTGGCTAAAGCATCACAAATGTTTAGGTCCCGGCCTCGTGCAGAGCAATTTTTGGTGAGATGGGCTGTCCCTCAACTCCATGACATTGATACATTGTCAAAAATGGTTGACCCCTGCTTGAACGGAGCCTATCCTATGAAGTCCTTGTCGCGTTTTGCAGATATTGTTTCTTCATGTCTACAGGTAATCTAA