Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23787 LG5 68659626 68662439 LRR receptor serine/threonine-protein kinase
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 68659659 downstream_gene_variant
C/T 68659734 missense_variant p.Thr8Ile
A/T 68659901 downstream_gene_variant
A/C 68659918 downstream_gene_variant
A/T 68660084 missense_variant p.Thr62Ser
C/G 68660149 downstream_gene_variant
G/A 68660156 downstream_gene_variant
A/T 68660181 downstream_gene_variant
G/C 68660297 downstream_gene_variant
C/T 68660887 stop_gained p.Arg144*
C/T 68660989 downstream_gene_variant
C/A 68661186 downstream_gene_variant
G/A 68661187 downstream_gene_variant
A/G 68661199 downstream_gene_variant
G/T 68661340 downstream_gene_variant
C/T 68661553 stop_gained p.Gln204*
G/A 68661571 missense_variant&splice_region_variant p.Ala210Thr
T/C 68661638 downstream_gene_variant
A/T 68661697 downstream_gene_variant
A/G 68661741 downstream_gene_variant
A/T 68661950 downstream_gene_variant
A/G 68662130 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23787.1
MIAEYTRTIMTCGCFGAKSAKKRRSSNAAGEIDGYPLDNVRQFSDRELRLATDNYHSNNKIGRGGFGTVYQGTLKDGRRIAVKTLSFWSKQGVREFLTEIKTLSNVKHPNLVELIGFCIQGPSRTLVYEYVENGSLNSALLGTRNENIKLDWRKRSAICVAPEYAIGGQLTKKADIYSFGVLILEIVSGRSSARRTNGTNGEGSPKFLLEWAWQLYEEGKLLEFVDPEMEEFPEEEVLRYMKVALFCTQSAAGRRPLMIQVVDMLSKAIQLNEKELTAPGLFTDERESSSRNSQPVPFITSTHLAITQVTPR*


CDS Sequence:
>Vu_23787.1
ATGATTGCAGAGTATACCAGGACCATTATGACTTGTGGCTGCTTTGGAGCCAAATCTGCTAAGAAAAGACGCTCTTCTAATGCTGCTGGCGAGATTGATGGTTATCCCCTTGATAATGTTAGGCAATTTTCTGATAGAGAACTGAGATTGGCAACTGATAATTACCACTCAAACAATAAGATAGGACGAGGAGGTTTTGGAACAGTTTACCAGGGAACCTTAAAAGATGGAAGACGTATAGCAGTGAAGACTCTCTCATTTTGGTCAAAGCAGGGAGTTCGAGAATTTTTGACTGAAATTAAAACTTTGTCAAATGTTAAACATCCAAATCTTGTTGAATTGATTGGATTCTGCATCCAAGGACCCAGTCGTACATTAGTCTACGAGTATGTGGAAAATGGGAGCCTTAACAGTGCACTACTTGGCACAAGGAACGAAAACATTAAACTAGACTGGAGAAAAAGATCTGCCATCTGTGTAGCACCAGAATATGCAATAGGTGGCCAGTTAACCAAGAAGGCTGATATATACAGCTTTGGGGTTCTTATACTTGAAATAGTTAGTGGCAGAAGCAGTGCCAGGAGGACAAACGGGACAAACGGAGAAGGATCACCCAAATTCCTCTTGGAATGGGCCTGGCAACTTTATGAGGAGGGGAAATTGTTGGAGTTTGTAGATCCAGAAATGGAAGAGTTTCCTGAGGAAGAGGTACTGAGATACATGAAGGTTGCACTTTTCTGCACACAGTCAGCAGCAGGTAGAAGGCCTTTGATGATACAAGTTGTTGATATGCTATCTAAGGCAATCCAACTCAATGAGAAAGAACTTACAGCACCAGGATTATTCACAGATGAAAGAGAATCTTCTAGTAGGAACTCACAACCTGTTCCTTTTATTACCTCTACTCATCTTGCTATTACTCAGGTCACCCCACGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_23787::LG5:68657626-68659626(+)
TAAACGGAGGTGACATTCCTTCAACGGATGTCAACATCCGTTTAAGGTAAAACTGATGTCGACATCCGTTTTTCCTTAAACGGATGTTGACATAAGGATGTCAAAGGTTACATTTTTTATTTTAGGATTTGTTTTATTAGTTTATTCTTTATTTTGGAAATATTTTAATAATTTAATTTAAATGTTTTGATTTATTATTTTTGAATATATTTTTAATGTATTTTAATAATGTAAGGAAAATGAAGAAGAAAGAAACGGAGGAGGAGAAGTGAAAGGGAAAAGACAAATGGGGTTGCAGAGTAAAACGGAAGACAAATTGTTAAACAGAAATGAGAGATGGAAAAATTGAGTGCAAGAAGTAAAGTAGGAGAACTAGGTTTGAAATAAATTAAAATAATAAAAGTAAAAAATTTTAATCTGAAAATATAATTAGAATTAAAATAAATTGGGGAGATGGAGAAAGAAAAGTGCGATGGTGGAGGGAGCAACACCCTCCGACCCTTTGCATTTTATGAAATTTTCGGAAAATAAAATATGGATATATGGCCATTTTACGTCCACCAATAGTTACCAACAAAAAATTCGTAAAAAACATAACAAAATAACGCTACACAAACATTTTTATTTTCTTTTAATACTATGTAACAAATCAATATAACAATTACATTATTATGTTAAAAATAAATTAGTTAAAGCTCAATTCGAAAAAGTAAATTTTAAGTATTCAAAATTCTGAAAGAATTTAATAGAAACTTAATAAAAAAAGTTAAATTTTAAAAAAATTATAACTGATTTAATTTATAAAAATAGGATTTTTCCACAAAACAAGAGTATACCCATTGACCCGAGAAGTGGAGATTTAACTAAAAGTGGTAAAGTCATTTTCCACACCGTGTGACCAAGTGGGAAGGGGCGCTGGCATATGTGACTGTTTATAATTTCATTCAATTTCTGTGATTAATTTATAGAAAAATAATTATGTTTCTTTACATGCTATTTGTAGATTAATAAAATTCGGATATTTTTAGTCATTTAGAATATTTATATTATATGGCTGTTAAAATGAACTATTTGTTCTAGAGTTAAGACATTCACACTGACAAATCATTCGTGTATATTTTGAAATTGTTAAATAAGTGTTTCAGTTTTTATTTACTCAATTTAAAAGAAAGACTTTTATTGTTAAAAAAATACGAAAAAATAACTTATATAAATAATATATTTATAAGAAAAAGACCGGTTTTGATCAAATAAAACATCTCATTTAAATTACTCTCCTAAACCGGAACATGATTAATCAAATAAAATATTTTGTTTAAATTACTCTGATAAATCAGTTGAGGCACTGTGATGAAATAGATCCCATTGAAGAGAAATACACACATTTCAAGTACATATTTATCATACATCAAACATCTTTGAATAAATTAATATACTTTCTTTTAGTAGAATTATGGGTTAGTTTAATTGGCATTATGAAAAAAAAATTATAAGAGAGAAGCAACAGATATTAGTATGAATGAGAAAGATAAGGTAAAAGGTGGACATTGAAAATGGTGTTGAAAATTAGCACAGAAGAAGCAGACGACTAACTAGAAAAACAACAACGAACCAATTTTCCATTTAAATAATCACCGGCCGTCTGGCGGCTGTATTCCACATTTCATTGCTTTCAAATTTCAATCATGCGAACACTATAAAATCTATTTTCACATTCTATCACTGTTTCAGTTTTTGTTTCCCATTGTTTATTCAACTTTAAGCCTTAGTCAATACTACCACAACTCTGTTTCTGCCTCAATTTTCTTATCAACCCAGATAAGGTACCCATTTTTCAATCTCAAGATTAACACTCTTTAGAAAATAAAATAAAAGGAAAATGATGGTTTACTTTGTTTCTGAACTTGCTCTTATTAAAAGTCCAAATCTTTTTCTAAAAAGGTTTCTGGGTTTTGTTCTTCAGTTTTATGTTTGATTCTTTGATTTGAAGAGACGGTGCA


Gene Sequence:
>Vu_23787(+)
ATGGTCTAATTTTCAATTGGGTGGCCGTGCCTGCAAATATTTCTGTCTCTTAATGTTCTCATCTCATGTTAGAACATTAGATTATGCAGATTGCAGAGTATACCAGGACCATTATGACTTGTGGCTGCTTTGGAGCCAAATCTGCTAAGAAAAGACGCTCTTCTAATGCTGCTGGCGAGATTGATGGTGAGGATTTGGGGGTTGGATGTTTTCATATTTTAACAATGCTTTTCATTATCATTTATGTGTGCTAAATATTGTAAATAAATTCGTTTAAATGGCTCTGTAGTTAAAGATTATTAACTTGCAATATGTTGATCTATAGAGTTCTTTTATTGCCGCTTATATTCATTTGTATTATTTTGTTGTGCAGGTTATCCCCTTGATAATGTTAGGCAATTTTCTGATAGAGAACTGAGATTGGCAACTGATAATTACCACTCAAACAATAAGATAGGACGAGGAGGTTTTGGAACAGTTTACCAGGTATAAATTTTAATGTTTGCACGAAATCAATATGAATCTTACTCGCTTAAATTCTTCATTCTGGGACCAACCTTAATACATTGTTTTTGGGTTATGAAGAATATCATCACACATACACTCTTTTTTACTCTTCTTTCAGCATTAGGCTCCTTGAGGAATGACCAAACATACATACATACATATGGGATTCTAGTACCAATAAGCTATATTTTCCCCAAATGAAACATGATAAACTCAAATTTGAGTATCTGATGAATACACGCCATAAACAAAAAAATCAAATTGAGGTGCATTGTTTAGCATCTAGTCTTGCATGTTAAAATGTTTCTTTCTTATTGAATATGTGTTAAGCTATTGAAGAGTAATTGTATCACTTTAGCATTTTAGGTTTCTTACTATGTTAAGCCATTCTAAAAAGCCATCATGTGACAATTTTTCTAGGGAACCTTAAAAGATGGAAGACGTATAGCAGTGAAGACTCTCTCATTTTGGTCAAAGCAGGGAGTTCGAGAATTTTTGACTGAAATTAAAACTTTGTCAAATGTTAAACATCCAAATCTTGTTGAATTGATTGGATTCTGCATCCAAGGACCCAGTCGTACATTAGTCTACGAGTATGTGGAAAATGGGAGCCTTAACAGTGCACTACTTGGTAAATATGTCAAATTTTCGCAGTATATTATGAAGTCACAAGTTAACTCCAGATACAGATGAGAGAATGAAATATGCATGTAAACTTTATTTCCTTTTTTCCTTCCTTTGTAGGCACAAGGAACGAAAACATTAAACTAGACTGGAGAAAAAGATCTGCCATCTGTGTAGGTACTGCTAAGGGTCTTGCTTTTCTTCATGAAGAACTTTCACCACCAATAGTGCACAGAGACATCAAAGCTAGTAATGTACTACTTGACAAAAATTTCAATCCCAAAATAGGTGATTTTGGGTTGGCTAAATTATTTCCAGACGGTATCACTCACGTTAGCACAAGAATTGCTGGAACAACGTATGTAAAGAGTTTTTAGAATACATAGTCCATGCAGTTCTATTGTTAAGAATTCTTACACTGTCATTTACCGTAAATACTTTAAAAGTCATATCTGTCATGATTCTGATTGATTGACAGTATAAAAAGACAGAATAAAAATAGATCTTTTTTGCTTGTGTCACTTTGTCTCTTGCCCAAATCCTATCTCTACATTGTTATTGGATTAAACATATTTCAATTTTTGCATTTCATGAATTGGTCAATTTATACTTGAACTATTGGTTATGGAACTCATTAATGCAATACCTGCAGTGGTTACTTAGCACCAGAATATGCAATAGGTGGCCAGTTAACCAAGAAGGCTGATATATACAGCTTTGGGGTTCTTATACTTGAAATAGTTAGTGGCAGAAGCAGTGCCAGGAGGACAAACGGGACAAACGGAGAAGGATCACCCAAATTCCTCTTGGAATGGGTACATAAATCTTAGTTTTATGAGTTACTTTGCAACATTATATATTTTATGTCCAATAGATATTTATACTATGAAATCCTATCATATCCTTCTTACTCAATATCTTGTTTATTCATTATCTCTCCACTACCTTGTTCCATGTAACCTAATACATTGGTGTGTTCCTGAAAATAGGTCATCTTTGGTTTTAGTTCTTTAAAATCTTAAGTTTCCATCCATTATACTTTGCAACTTCTGATAGGGTGAGATTTTATCAGGGACTAAAGTTTGAATATTTAAGAGAATTAGGAACAAAAACATTTAATTTTAAAAGTTCGAGACTAAAATCAAAGATGACCCAATTTATTAAGGATAGAAAACATTGGGAATTCATTTTACAAAAAAGGTAACATAGAGTTGAATAGTGAGACAGGATGATAAAGAAGAAAAGTTGATTTTAGAAGATGATGGATAATATGATGAAATTTATTGGTCTTTGACTTTGATGGTATTTATTTTTGTTTATGCTATTCATATTGTGGAAGTTTGGAGTGGACATGATGATAGTTATTTGGTCTAATAGGCCTGGCAACTTTATGAGGAGGGGAAATTGTTGGAGTTTGTAGATCCAGAAATGGAAGAGTTTCCTGAGGAAGAGGTACTGAGATACATGAAGGTTGCACTTTTCTGCACACAGTCAGCAGCAGGTAGAAGGCCTTTGATGATACAAGTTGTTGATATGCTATCTAAGGCAATCCAACTCAATGAGAAAGAACTTACAGCACCAGGATTATTCACAGATGAAAGAGAATCTTCTAGTAGGAACTCACAACCTGTTCCTTTTATTACCTCTACTCATCTTGCTATTACTCAGGTCACCCCACGATGA