Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23747 LG5 68322962 68323885 PREDICTED: dof zinc finger protein DOF1.1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 68323135 missense_variant p.Gly251Ser
T/C 68323138 missense_variant p.Ile250Val
G/A 68323181 synonymous_variant p.Thr235Thr
T/A 68323185 missense_variant p.Asn234Ile
G/A 68323448 synonymous_variant p.Tyr146Tyr
A/T 68323631 synonymous_variant p.Gly85Gly
A/G 68323829 synonymous_variant p.Ser19Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23747.1
MEQGGGEGGDMNKLPQDSSMKEMQQGDAQPQVQAPQQPQKCPRCDSLNTKFCYYNNYSLSQPRYFCKTCRRYWTQGGTLRNVPVGGGCRKGKRAKSSNPSSSENSSSRSLPQQQQSQDVVVQTQPPPLTTVVRAKDPSSVLASPLYQSGGYLSSLAAMHSLNPSSHPFDQSLNSDALRSSNLGLLSGFNVQRPIGSIGTIRPAQLYQMGSGQREVASLYDQGLVNPSSSMANTNTNSSGVSHHDWPQIFIGNNTNAGNRASDASLWSTISTTIGGNSERTGAGAGTVSGSSLVQNQWPDIPGYGPPP*


CDS Sequence:
>Vu_23747.1
ATGGAGCAAGGAGGTGGAGAAGGAGGTGACATGAATAAACTACCTCAGGATTCGAGTATGAAGGAGATGCAACAAGGGGATGCACAGCCTCAGGTTCAGGCCCCTCAACAACCCCAAAAGTGTCCTCGATGCGACTCTCTCAACACCAAATTTTGCTATTACAACAACTATAGCTTGTCACAGCCTCGTTACTTCTGCAAAACATGCAGGAGGTACTGGACTCAAGGTGGAACCTTAAGGAACGTTCCCGTCGGTGGTGGTTGCCGCAAGGGGAAGCGCGCCAAGAGTTCCAATCCATCATCGTCGGAGAATTCCTCTTCTCGGTCGCTGCCGCAACAACAACAATCACAAGACGTGGTGGTTCAAACCCAACCACCACCTTTAACAACGGTGGTGAGGGCTAAAGACCCTTCTTCGGTTTTGGCTTCACCTTTGTACCAAAGTGGTGGGTACTTGTCTTCTCTGGCTGCTATGCATTCGCTCAATCCATCATCACATCCTTTTGATCAGTCTCTGAACAGTGACGCCTTGCGTTCTTCCAATTTGGGCCTTCTATCTGGTTTCAATGTTCAGCGGCCAATTGGATCGATTGGTACAATTCGTCCGGCGCAATTGTATCAAATGGGCAGTGGTCAGAGGGAGGTGGCGTCTCTCTATGATCAAGGTTTGGTTAATCCATCCTCCAGCATGGCTAATACCAATACCAATAGCAGTGGTGTTTCTCACCATGATTGGCCTCAGATCTTCATCGGTAATAATACTAATGCCGGCAACAGAGCCTCTGATGCGTCTTTGTGGAGCACCATCAGTACCACTATTGGTGGTAACTCCGAGAGGACTGGTGCTGGTGCTGGTACTGTTTCTGGGTCGTCTTTGGTTCAAAATCAATGGCCTGATATTCCAGGGTATGGCCCTCCACCGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23747::LG5:68323885-68325885(-)
GATTTTTTTGCTTGATAAAAAAAAAAATCTTTTTAAAAAGATAGAACTTGAGTTTATAGTCTTAATCTTCAGTTGCATTGAAGAGGAAAACGAAGATACGACTTAGTAACGTTTTCTTTTCTAAAATATGATTTTAAATAGATTATTTTTAACGATTACAATTTATCTGAATTATGAAATCAAGATTAATAATTATTAAATAAGAAGTATATTTATAAATTATTTTATTTTAAATAGGTTTTAACACAATCACAAAATAACAGAATATATTTGAATGATTTGATATAATTTAGACTTAACTCAACCTTATTAATCTAGTTTAATTAGTTACAATTGTCTCGTCTTATATAATATAAATTAATTTTATTTATAATCAAGACTAATCCAAATAAATGTGTAAGAGATTTGTTTTTTTTTTAAATTTTTTAAACCAAAACATATAATTAGATATTAAAATTTAAAAAGTAAAAAAGTCCCTATGTGATAACTTTAAACATATTCAGGATTTGGTTGGGAAAATTTCTTTCTAAATGTAGAAGAGATAGATAAAATAAAATTGAATTAAAAATTTTATGCATGAGTTAATTATTACATTAAGTACAATTTGATTGAAAATAATTTTAAAAATTTAATTTATGTATAAATTAAATTAAGTTATAAAGAAAATACTTTTATTTTATTTTTTAAAACTTACAGAAAATTTTATTCAAACAAACCCTTAATATTAAACCAATTTTTATTATATTCAAATAATAAAGAATATAGATATATTAGACATATAGTTAAACTATATATAGATGAATGCTCTTTATAAATGGTTTTTTTTTTATAATATCGAGTTACATAAATTTAAAAACTTGTATATTATTTTATGTTTATCATATCAATTACATTTTGTATTTCTTACTTTTGACTTTTAATTTCAAGAGAGTGATACAACGCAAACATGTTTTTCTAACTGTTACCGTACAGTATTTATTATGTTATATTATATTATGATTATACAAGAATGTTATTTAATAAAATGAGTATTTGACCTCTTTTTTCTAAACAATTATTAAACTAAGTTTTTAATAATAATAATAATAATACATTATATTGAGATGATAAAAATAAAAATAAAGATCGTAGAAAGTTGAAGATATTGATGAAATTTATGATATATTAATTTAGAATTAAAAATGAATGGAAGAGTAAAAAGCTGTGGGAGTGGGGTGGAAGTGCAATGAAAGGAAAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGCCAGCATTTCATAAACCACTCACTCCAATTACTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTTCCTCTTCAGCCGCCTCATCCTTCAACCTTCTTCTTGGTCCTTACTCTAACCCTATTCTACTCCTATTTCTTTTTCTCTCTCTTTCCTTTTAAGTTGCTTCAAAAATCTCACTGCACTTCTCAAGGCTTCTCCACTCATCCGATTGAGACCCTTCCTTTTGGACTTTCTACACGTTGTACATCAATACACGAATCTCCCAATTTTCCACACCTCTCCTACTCTTTTTCCTTATACTCACCACTTCAAAACATCAAATTTTCTTCTCTTTCAAGATCCTTAGATTTCCCAGAATCGATCCTATTCAATTAATACCATTTACACACTCGTTACCTATTCTTCAAAGTTTTTTATGGAACTTTGAGATTCCCGGTTCTTCTCTTTTTTAATTGCGGGTAGGTGGGAACTCATGCACAAGGTAAGTTGCCACAGTTTTTCCATTCTAGATTCTCAGATACATTTTGCAGACACGTACCATTCAAATACAACCTCTCAAATCTCAAACCCCTCGCACACTTTTCAATCGTACGTCCCCATATTAACTGCATGCTCCTCCAAGCCGCCACCAACTACTACTACTACTATAGTTTCTAGAATATAAATACAAAACAACACATCTCAAACACACACACATACTCCAAAGTCAAAAGGGTCGAGAAAAAGATACAAGAG


Gene Sequence:
>Vu_23747(-)
ATGGAGCAAGGAGGTGGAGAAGGAGGTGACATGAATAAACTACCTCAGGATTCGAGTATGAAGGAGATGCAACAAGGGGATGCACAGCCTCAGGTTCAGGCCCCTCAACAACCCCAAAAGTGTCCTCGATGCGACTCTCTCAACACCAAATTTTGCTATTACAACAACTATAGCTTGTCACAGCCTCGTTACTTCTGCAAAACATGCAGGAGGTACTGGACTCAAGGTGGAACCTTAAGGAACGTTCCCGTCGGTGGTGGTTGCCGCAAGGGGAAGCGCGCCAAGAGTTCCAATCCATCATCGTCGGAGAATTCCTCTTCTCGGTCGCTGCCGCAACAACAACAATCACAAGACGTGGTGGTTCAAACCCAACCACCACCTTTAACAACGGTGGTGAGGGCTAAAGACCCTTCTTCGGTTTTGGCTTCACCTTTGTACCAAAGTGGTGGGTACTTGTCTTCTCTGGCTGCTATGCATTCGCTCAATCCATCATCACATCCTTTTGATCAGTCTCTGAACAGTGACGCCTTGCGTTCTTCCAATTTGGGCCTTCTATCTGGTTTCAATGTTCAGCGGCCAATTGGATCGATTGGTACAATTCGTCCGGCGCAATTGTATCAAATGGGCAGTGGTCAGAGGGAGGTGGCGTCTCTCTATGATCAAGGTTTGGTTAATCCATCCTCCAGCATGGCTAATACCAATACCAATAGCAGTGGTGTTTCTCACCATGATTGGCCTCAGATCTTCATCGGTAATAATACTAATGCCGGCAACAGAGCCTCTGATGCGTCTTTGTGGAGCACCATCAGTACCACTATTGGTGGTAACTCCGAGAGGACTGGTGCTGGTGCTGGTACTGTTTCTGGGTCGTCTTTGGTTCAAAATCAATGGCCTGATATTCCAGGGTATGGCCCTCCACCGTGA