Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23746 LG5 68295900 68298028 PREDICTED: dof zinc finger protein DOF1.4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 68297238 missense_variant p.Tyr329Asn
A/T 68297239 missense_variant p.Tyr329Phe
C/T 68297489 3_prime_UTR_variant
C/T,G 68297501 3_prime_UTR_variant
A/G 68297911 3_prime_UTR_variant
T/C 68297936 3_prime_UTR_variant
T/A 68297941 3_prime_UTR_variant
T/A 68297946 3_prime_UTR_variant
T/A 68297971 3_prime_UTR_variant
A/G 68297984 3_prime_UTR_variant
A/T 68297991 3_prime_UTR_variant
G/T 68297998 3_prime_UTR_variant
G/T 68298005 3_prime_UTR_variant
T/A 68298027 splice_region_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23746.1
MSGNCEKMVVIPPTTNQWPQVDDRKVLMGSFGGSNNSKVMEKPDQELVQQQLQQQTLKCPRCDSSNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKACKRYWTRGGTLRNVPVGGGCRKNKRVKRPMTNSCSAAIDTASSSNSSSALTAASQPQIDTASTSNHINPLFYGLPSCSSDVNLPLFPRFGSRISSSGFDLQLNNALGLGFSSGVVSNEPSENNSFRNGFGSNNALLSSYNSIFGSSSSSTSTAPALSSLLSSTLLQQKFIGSGLKDGADSNTFQHGLGLTPLEQLQMPSDNSEAGMVSLKDVKVELGQNSRLEWNGACQNQIQHVGMYDPSLYWNNSATALGVWNDQAANIGS*


CDS Sequence:
>Vu_23746.1
ATGTCGGGTAACTGTGAGAAAATGGTAGTCATCCCTCCAACGACCAACCAATGGCCACAGGTGGATGATCGCAAGGTCTTGATGGGTTCCTTCGGTGGAAGTAACAATAGTAAGGTAATGGAAAAACCAGATCAAGAGCTTGTGCAGCAGCAGCTGCAACAACAAACCCTCAAGTGCCCTCGTTGTGACTCATCAAACACTAAATTCTGCTACTACAACAATTACAGTTTGTCTCAGCCACGACACTTCTGCAAAGCCTGCAAGCGCTACTGGACAAGAGGTGGAACCCTCAGGAACGTTCCTGTTGGTGGTGGGTGCAGAAAAAACAAGCGTGTTAAGCGTCCAATGACAAACTCTTGTTCTGCTGCCATTGACACTGCTTCTTCTTCTAATTCTTCTTCTGCTCTCACCGCCGCTTCGCAACCACAGATCGACACTGCTTCAACCTCGAATCACATCAACCCTTTGTTTTATGGGTTGCCTAGTTGCTCCAGCGATGTGAATCTTCCGCTGTTCCCTAGGTTTGGCTCCAGAATCTCCAGTTCCGGGTTTGATCTTCAGCTGAATAATGCCCTTGGATTAGGTTTTTCATCCGGGGTTGTGTCCAATGAACCCAGTGAGAATAATAGCTTTAGAAACGGGTTTGGTTCTAATAACGCGCTTCTTTCAAGTTATAATTCCATCTTTGGTTCTTCTTCAAGTTCTACATCCACTGCTCCAGCTTTGTCTTCACTGTTGAGCTCTACTTTGCTTCAACAGAAGTTTATCGGCAGTGGGTTGAAAGATGGTGCTGATAGCAACACTTTCCAGCATGGCTTAGGCTTAACCCCACTAGAGCAGTTGCAAATGCCGAGTGATAACAGTGAGGCAGGGATGGTGTCTTTAAAAGATGTGAAAGTAGAATTAGGACAAAACAGCAGGTTGGAGTGGAATGGTGCTTGTCAAAACCAGATCCAGCATGTGGGCATGTACGATCCTTCGCTTTATTGGAATAATTCAGCAACAGCTTTGGGTGTTTGGAACGATCAAGCTGCGAATATCGGTTCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23746::LG5:68293900-68295900(+)
CGACCAATAAATAATAAAAATATTTAACACGTGGAAATGTACTAAGAAAGTGAGATTCTTTCTTATTGGGATTCCTTTTTGGAATCGATTTATGAGATTGTGTTGTGTGTAATGTGTAGATGTAGTAGGGTGTGTGGTAGAGGCTAAAGATTTATTATTTCACGAGTGATTAGGTTTTAATACTTATCCTTATGTTATTATTTGTCAGCTTACATTTAAAAGTTATACCTAGAAAATATTCCGATTTTTAAAGATTTAATTATTTAAGTAATATGTATTGAATGTAATAATTTGTTTTTTAATCTAAAACTTATATTTATATGTTTTAAAATGTGTTTTAAATTAATGAGACTTAAATATGACCTAATTGGTAATAATTATAATTTTTTTGTAAGTTAATCAATATTAAATATAATTGTTACATAGGATGACCGTTCAATTTGTAGATCAGAACCATTGAGTCTCAAGAGTAGTATGTGATTGTAGTTATTATTTATCTATTTGAATTGTTCGATTTAATGATGACCAGAGTAATATGGTACAGTAACTTTTATGGTAGTTAATTGATTTTTTTTAACAATTTTTCTTTTATACTTTTCAAGTTTATCTTCTTGTTGTGGGTTAAGTTTTCTAATCATCTCTCTACCTTGTCATTTTGTACTCAAATATTAGATGGATGAGATGTTTCGTTTGTTTATTTTAGGATAATCATGGAATAGAATGTACAAAATTTAAATACTTATTTATTTTACAGTCGAACTAATGATTATAATTAATACTATACATTTTCCACTATTTCATTTAATAGTTTAATAAAATATACGATCGCAAAATTTGTTCATATATGCATCTAAGCCCCATATTGAGGTTTGATGGAATATCAATCAAGGACGTAATTACATGAGCACATATTATTATTAAGAATATATATATAGTTATTACTTTATGACTTATATATTTATTCTGGTTATAACACGTGTTATTTCAATTTTTAACAACATTTTATCTTTATATCTTTATAAAAAATGAAAATAATTCGAAGTGTTTGGAAAAAAAACTAGCAATAAATTTACCTTCAAAGATATTTATTTCTAATAAAAATATATTGTATTTATAAATAGATAAATATACCCTTTTATATCTTTTTTGCAAATTTCTGATTATTCAACAAAATATTTATAATGAAAAATAAACTATCATGCTGTTTTTCAACTTTCGACTTTAATTATAGCATTTAAATAACTAATATGCTAATCATTCATTAAATTTAATTTTGTTCAAGTAGATAAAGTTTACATGAGGATGAAATTAATTAGATTTTTCTGAAAAAAAAATTCTGATGAAACTAGATTCAAAAGTCAAACAAACATCGATTGAAATCAATCATTTGTTAAATTTTGTTGTCTTGGATTTTGAATTTCCTTCTCAAACTTAATCTTAATTTTTATATTCATAAGATTTTTCCCTCGGTATCTTATTTTTTTAATTGTTGTCTAAAAATAGCTATTCACATCCATAGTAACAGAAGAGAAGAAAAGAAAAACATGTAGATAAAGAATAAAAAGAAACGAAACGAGGACAAGATGATACAAAAATTAAAAAAATACAAAAATAAAAAAATGTTAAAAAAAAAAACTATAAGAATTTAACTGCAGTAATAATCCTATTTGAACTCTAATATAAATCAAACTCGTCGCGTGAAATTAGGTCGTGACATGCAACTATACAAATTTTCTTTTTACATCAAAGCCATTAATAAAATTCTAGTACCTCAATTTTGCAACCTGAGCATTATCCTTTACGGTCACGATTGAAAATGAAAAAATGAAACGATTATTAAAAGTATAGTATTTAATATTATTAATGCGTTGCATGCGGTGGTTTTTAATAAAGAAAAAAATCCTGGATTATTATTTTTTATAAAATTTTTAGTAAAAGTGCAAAAGTAATTTAATTCATATATATTAGTAGATAAATAATTAGGTTGAAGTTGGCATGTG


Gene Sequence:
>Vu_23746(+)
GGTGATCGACAACTTAAAATTTTGAGCTTCGGAGTCCCTTCTAAAACTCGCACTACATTACTATTTGAAAGCTTGAAGCGAGTCTCATATCTGTTCTTTGTCTGTTTACTCTTTGTTTTCAAGGATTCCTTGGAACCAGCAAAATGTCGGGTAACTGTGAGAAAATGGTAGTCATCCCTCCAACGACCAACCAATGGCCACAGGTTCATTTCTCTCTCTTCTTCCCACACACACAAAAACGCTTGGTAGACGAATACATGACCAGTGCAATTTTGTTGCTTAGCTTTTGGAATAGAATATCACACTGTGCTGTATCATACATACCCTAGAACGCCACCTTAAACTGGATCTCCCTTTTCTTTTTTCATATTTTATTTTATCAATTTTCCTTACCCTCTAGTAATATGTTATCAGGTGGATGATCGCAAGGTCTTGATGGGTTCCTTCGGTGGAAGTAACAATAGTAAGGTAATGGAAAAACCAGATCAAGAGCTTGTGCAGCAGCAGCTGCAACAACAAACCCTCAAGTGCCCTCGTTGTGACTCATCAAACACTAAATTCTGCTACTACAACAATTACAGTTTGTCTCAGCCACGACACTTCTGCAAAGCCTGCAAGCGCTACTGGACAAGAGGTGGAACCCTCAGGAACGTTCCTGTTGGTGGTGGGTGCAGAAAAAACAAGCGTGTTAAGCGTCCAATGACAAACTCTTGTTCTGCTGCCATTGACACTGCTTCTTCTTCTAATTCTTCTTCTGCTCTCACCGCCGCTTCGCAACCACAGATCGACACTGCTTCAACCTCGAATCACATCAACCCTTTGTTTTATGGGTTGCCTAGTTGCTCCAGCGATGTGAATCTTCCGCTGTTCCCTAGGTTTGGCTCCAGAATCTCCAGTTCCGGGTTTGATCTTCAGCTGAATAATGCCCTTGGATTAGGTTTTTCATCCGGGGTTGTGTCCAATGAACCCAGTGAGAATAATAGCTTTAGAAACGGGTTTGGTTCTAATAACGCGCTTCTTTCAAGTTATAATTCCATCTTTGGTTCTTCTTCAAGTTCTACATCCACTGCTCCAGCTTTGTCTTCACTGTTGAGCTCTACTTTGCTTCAACAGAAGTTTATCGGCAGTGGGTTGAAAGATGGTGCTGATAGCAACACTTTCCAGCATGGCTTAGGCTTAACCCCACTAGAGCAGTTGCAAATGCCGAGTGATAACAGTGAGGCAGGGATGGTGTCTTTAAAAGATGTGAAAGTAGAATTAGGACAAAACAGCAGGTTGGAGTGGAATGGTGCTTGTCAAAACCAGATCCAGCATGTGGGCATGTACGATCCTTCGCTTTATTGGAATAATTCAGCAACAGCTTTGGGTGTTTGGAACGATCAAGCTGCGAATATCGGTTCTTAAGTCACTTCTCTGATCTAGAAAATACCACCCAATCAAATGAAGAAACATGTTTTTCAATGTTTGTCTCCCCCTACATGTGTTGTTACTGCTACTTTTTTCTTCTTTTCTTTTTTCTTCTCTTGGGGCAAATGGGTCTGGTTTACTTAATTACATAAAAAGTTACTGAACAAGGAGGGAAAGCGATACTCATAAGAAAACGGGAAAGCTAAAGGTGAGAGGAGTTTGGATCGGAGCGATCATGTCAGCTGCATCCTGCAAATATATATAATTACTCTTCAGCCAGTTAGTTTTACATGTCAAGGTTGGGAAGAAAAATTGCACAAATTGCTCTGAGAGGAACCTCGGATCCTCTTCTCTCATCATCTCACAGTTGCTGCCACCTCGTCAAGCAGTGTTCTCCATAGTCGAGCAATGCAAGTTGGTCTTTCATTTTGTTATATGTATATACGCAATGACATCTATTTTTTCTTATTTTGTATTGTATTAATTAGCTGTTGTAGTTAGGTTGGGTAGGGGATTTACTGCGTGATGCTGTCCTTGAAGAGAGGAAGTAGTATTGGTTTCAATTTTGTTAACTTTGAGATGATTTTTGTTTTGGATAGGGAGAATGGGAATATATTGGATACATTTGGTATAATGTGGTATAGAAGAGAGGGGGATTATTTACTTGGTTTTAGGTGATTAATGATTTAATGTATGTGGGTGGTTTGGTGCTTATATTGTTC