Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23741 LG5 68218845 68224753 PREDICTED: putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g14440
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 68218847 splice_region_variant
A/T 68218866 3_prime_UTR_variant
T/A 68218870 3_prime_UTR_variant
A/G 68219519 intron_variant
C/T 68220037 intron_variant
G/T 68220040 intron_variant
G/T 68220045 intron_variant
G/A 68220362 missense_variant p.Ser484Phe
A/T 68221263 missense_variant&splice_region_variant p.Leu454Gln
T/C 68221291 missense_variant p.Ile445Val
G/A 68221781 intron_variant
G/A 68221784 intron_variant
G/T 68222131 intron_variant
T/A 68222310 intron_variant
A/G 68222334 intron_variant
A/G 68224182 intron_variant
C/A 68224189 intron_variant
A/C 68224601 5_prime_UTR_variant
A/C,* 68224603 5_prime_UTR_variant
T/C 68224622 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23741.1
MANIATFRFLLLWTLFLCFAFTTRAAQRGPYGMHISCGARHDVQTKPTTTLWYKDFGYTGGIPTNASKTSYIAPPLKTLRYFPFSEGLSNCYNINRVPKGRYSIRIFFGLVAHTTVTDEPLFDISIQGTQIYSLKSGWTTQDDQAFTEAQVFLMDGSVSICFHGTGHGDPAILSIEILQIDDKAYYFGPDWSQGVMLRTVKRLSCGFGQSKFGVDYGADPRGGDRYWQHIKTFGGDSDHQRSVETRIKQASHPPNFYPETLYRSALVSTSSQPDLTYTLDVDPNKNYSVWLHFAEIDNSVTAAGQRVFDIMINGDVAFRNVDVVKMSGDRYSALVLNKTVTVNGRTLTVTLSPIKGSFAIISAIEILEVITAEAKTLSDEVMALQTLKKALGLPPRFGWNGDPCVPQQHPWTGADCRLDKSSSKWVIDGLGLGNQGLKGYLPNDISRLHNLQILNLSGNGIRGAIPSPLGTITSLQVLDLSYNSFNGSIPESLGQLTSLQRLNLNGNFLSGRVPATLGGRLLHGASFNFTDNAGLCGIPGLPTCGPHLSAGAKVGIGLGASFTFLLLIIGSVCWWKRRQNILRVQQIAARAAPYAKARTQFSRDIQMARHNNNNNYGNAQTASENGPILLSR*


CDS Sequence:
>Vu_23741.1
ATGGCGAACATAGCAACGTTTCGATTCCTTCTGCTGTGGACGCTTTTCCTCTGCTTTGCCTTTACTACGCGTGCAGCTCAACGAGGGCCATATGGCATGCACATAAGCTGTGGGGCTCGTCATGATGTTCAAACAAAACCAACCACTACCCTTTGGTATAAAGACTTTGGTTATACAGGAGGTATTCCCACCAATGCATCTAAGACAAGTTACATTGCCCCTCCTCTGAAGACTCTACGCTATTTCCCCTTTTCTGAAGGTCTTTCAAATTGCTACAACATTAACAGGGTGCCCAAAGGGCGCTACTCAATCAGGATCTTTTTTGGACTTGTTGCACATACTACAGTTACCGATGAACCTCTATTTGACATCTCAATTCAAGGAACACAAATATATTCTTTGAAATCAGGTTGGACCACTCAGGATGATCAAGCATTTACTGAAGCCCAAGTATTTCTTATGGATGGTTCAGTATCAATCTGTTTCCATGGCACAGGTCACGGAGATCCGGCAATTCTTTCAATCGAGATTCTTCAAATTGATGATAAAGCTTATTATTTTGGACCGGATTGGAGTCAAGGGGTAATGCTTAGAACAGTCAAAAGATTGAGTTGTGGATTTGGACAGTCAAAATTTGGTGTGGATTATGGTGCAGATCCCCGGGGAGGGGACAGATATTGGCAGCATATTAAAACTTTTGGTGGGGATTCTGATCATCAGAGATCTGTTGAGACTAGAATCAAACAGGCTTCACATCCACCAAACTTTTATCCCGAAACTCTTTATCGATCAGCCCTTGTCAGCACTAGTAGCCAACCTGATTTGACATATACATTGGATGTGGATCCCAACAAAAACTATTCTGTTTGGTTACATTTTGCTGAGATTGATAACTCGGTGACTGCTGCAGGACAAAGAGTCTTTGACATTATGATAAATGGAGATGTTGCTTTTAGAAATGTCGACGTTGTGAAAATGAGTGGGGATCGTTATAGTGCTCTCGTGCTTAATAAAACTGTTACTGTTAATGGGAGAACTTTGACTGTAACTTTGAGCCCAATAAAAGGTAGTTTTGCCATAATTAGTGCCATTGAAATATTGGAGGTTATAACGGCTGAGGCAAAAACATTATCAGATGAAGTTATGGCTTTACAAACGTTGAAGAAGGCTTTGGGGCTTCCTCCCAGGTTTGGGTGGAATGGTGATCCATGTGTTCCCCAGCAACACCCGTGGACTGGAGCAGATTGCAGATTAGACAAAAGTAGCAGCAAATGGGTCATTGATGGACTGGGTCTTGGCAATCAAGGTCTGAAGGGCTATTTGCCAAATGACATTTCCAGACTGCATAATCTACAAATCCTAAACTTGAGTGGAAACGGCATTCGTGGGGCTATTCCATCCCCACTTGGAACAATAACTAGCTTGCAAGTGCTTGACCTATCCTACAACTCTTTCAATGGATCGATTCCTGAAAGCCTTGGACAATTGACTTCATTACAGAGACTGAACCTAAATGGGAACTTCCTGTCTGGAAGGGTACCAGCGACTCTAGGAGGAAGACTTCTACACGGGGCAAGCTTTAATTTTACTGATAATGCAGGTCTATGTGGCATACCTGGATTACCCACTTGTGGACCTCACCTTTCTGCCGGTGCTAAAGTTGGTATTGGCTTAGGTGCTTCTTTTACTTTCCTACTTCTTATTATTGGTTCAGTTTGCTGGTGGAAACGGCGGCAGAATATCCTCCGAGTTCAGCAAATAGCCGCAAGGGCAGCTCCATATGCGAAAGCTAGGACCCAATTTTCACGTGACATCCAGATGGCAAGGCATAATAACAATAATAATTATGGCAATGCTCAAACTGCTTCGGAGAATGGGCCTATCTTGCTTTCACGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_23741::LG5:68224753-68226753(-)
CTCTTCAAACTCTGTTGAATATGCATATCTGGCTCATCGAACTAATAAATATGTTAACATGTCATCTTATCTAAACAACAATTTAAAGGTTAAACAAACATTAACAACTAACTACATGTCTGATTGTGTAAAACGGTATAAATATTTGATTAAAAGTAGTAAAAAATTAAACAATTTTACACAAACTTTAATAATTAATGTAGCTGTATATATATGTCGAGAGATAATATTTTCATTATTTATAAATGCTTTAATATAATATGTTTTGAAAATGACTTGGACATCACTGGAAGACATTATATTAATTAGTGATTTGGTGAAATATTATTAATCAAAATAAAATTCATCAACATTTTTTATGACCATTAGCTTATATTATACTTATACAAATTAAATATATCTATAGATTAAGTTGTGAAGAGAAATAAATAAAAGTAAACTCATATTTCAACCAAGTTTTAGGTTAAAATTTATATTATTTATACAAAATTAAATTATTCACCACATTATTGTAACTATTATATTATAAACTACGTTACTATAATATAATATCTAAATTATTTTTAAGGATTTGGTTTTGTTGAGATTGATGGTAGGATAAAAGTTAGTGAAATAATGAAAAAAAAATAGAAATTGAGAGTGAGATTATTTGTGTTGTGGGAAAACAAGTGAAAGTTTGTAAACGATGTATTAATTTTTTTTTTAATAAATTGATGAAAAACTTATTCATTTTGAAGAATTATAACACCTTTAAAAAATAAATGAAGATTCAAATCGACAACTATAAAACAAAAGTATAAATATTGTTCATTTAAAACCTAGTAACTTTTAACAACCTTAAACACATGTTTGAAATGGGAATTGTCAATTACATTCTCTAAATGTTGAGAAATGAACAAATTCCACAATATTTAATGAAACAATGACAAACATTGTGAATATGTAAACACTGTGATGGATGAGAACGCTTGAAAGAAAACTCATGCAATGAAAAAATGTTTGTATTTTTTTTTGTGAACTTCTATAATGTCTCATATGGTAAAAGAACCAACGAAAGACTATTTCTCTCCACTTTACTTGTTTATTAGAGCACTACAAACATTGAAAAAAAAATCATCCCTGTAAAACTTCTGTTATTAAAACTTATTTCTACCATACTATTCATTTTTTACTAAAAAATTACATAAACAATATTCTACATCTCTTCACATGTATTAACTATTTTTTTTTTTGTACGTAAGAATGAAGAATATATATATTAGTCTAAAATATAAAAATAACTTTTCCTGCTAACAAAATGAAAAATTTAAGACACGGGAGAAAAGTGACATAAGGATTCAAAGTGAAGATGATGTTTTACGATAATGTAAACATCCATTTCAAATTTGACCCTTTATCCAATGCGCTGCGTCCGCTGGCGGTGATGTTCGCCTATGATTGCGTCCTATTCAAATGTCAAAACACTTCAAAGTCCACACCATCCACCTCATCTCCACCGTCCGATGAAGAATAACAAGATTATTCCTCACAAGGCCAATCACGTAATTTCCTTTCACTAACATATTTTAATAGTAATTATTTGACATGACATTTCTCCTCCATGAACCGTTATTCTTTGTGTGTACCTAAACTAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCACTCACTCACGTTGCTGTTGTCGTTTCATAGCAACATAAAAGCAGAATCCACCTCAAACAGGGAGCTATCAATGCATCAAATGAAACCATTCATTTTTTTTGTTTCCTGAGATAAAATAAGTGGGGCTCACATGCATCTACAAAATTAACTAGGCTTTTGATCAAAGGACCAAGCTACACCCACTCCCCCTAAACTCAAATCTAGCCGTCAAAAAAAGCGGACCCACGAACAGTAACCACGCAGAGTTCAGACCTACCATACTTTCACACACGTCAATTAATATTGAACCATTAATGACCATTAAAACCGTTGAGATGGTTCGCGCCTGCATT


Gene Sequence:
>Vu_23741(-)
AATCGTGATATGGCTCAGTACCACCGTAACAGCTGTTCTTTCATTAGTTCACGGGTCAACTAAACGAAGTAGTAGCTAGTGAATGTGAATTTGTGAATTTCTATTTCCAACTGCTGTGCAGGGTTGCTGCGAAGTGCAGACACGTTCGTCTCTCTCTCTCTCTAGAAAAGTTGGAATGTGAGAGAGAGAGAAAAGAAGAAGAAAAGCGAAGATGGCGAACATAGCAACGTTTCGATTCCTTCTGCTGTGGACGCTTTTCCTCTGCTTTGCCTTTACTACGCGTGCAGCTCAACGAGGTGAGATTCTCTATTTTGCATTGAAGTTGAACGCTGAGTTGATAAGGATTTTGGCTTGGATGTGTTTTAATTTCGTTTTGGTTTGCTTTGAATTAAGTAATAGAGGTGAAAATGCGCGTGTGCGTCGTGGAATTGATGGTTGAATCTGAGTGGTGGTGTAGGGGTGCATTTGATTTCACCTGGTGTGGCATAAATTGCTCATGGATTAGAGAAAGGCAAAATGATGCAGTTTTCCGCATCTTCTTATGTTTTTTTAATGTGCTTTGGGGTTGAAGTCATAGTATGAGACAAAGCCAGTAGGCAACACTGAATGATTTAAAAGAGGGGGAAAATGGGAAAATTCAATAACATGGTCAAATTATTCCCTGCAACTTAACATTTTGCTTACAGTACAGTATAGGCCGGACGCGTTGGTCAAGTTAGAATGGTTCATGACAAACATTTCTCGTAGCGTAGTGCTTTGATCCTAAAAGCATAAGAACTGAGCATTTCCAAACTTTAAAACTAGCTAAGTTTATTTAACTCCTTTTTTGTTATTTTATGTTCTATTCTCAGTAAGAACTGGGGGAAACTGAGTATTTCCCCTGGGTTTGCTCTCTGCCAGTTTAATAAGTTATCATGGTTCACGAAAAGGCTTTATTGGTGGTTGTGTGGTACACAAACTGTTGCATTTAATCGAGCAGCATCGTAGAGATATGATTAAATTATGCTTTTGTGCGAGTGTGAGCGTGCAATCTTTTGACAAACTACAAAATGATTTATATCAAGAGGTCGTTGCTGGCTGCACTGTAATTGCTACTGGGGAATTCCAGTGCCAACGAAACCAGCATGATAGCTTGCACATTCCAGTGGATTAGGACTTTGTTACTTTTAACAGTTTATCCCCTTTGAGTTGATTTAAATTTCTGAGACATTGTATTCGTTGCAGGGCCATATGGCATGCACATAAGCTGTGGGGCTCGTCATGATGTTCAAACAAAACCAACCACTACCCTTTGGTATAAAGACTTTGGTTATACAGGAGGTATTCCCACCAATGCATCTAAGACAAGTTACATTGCCCCTCCTCTGAAGACTCTACGCTATTTCCCCTTTTCTGAAGGTCTTTCAAATTGCTACAACATTAACAGGGTGCCCAAAGGGCGCTACTCAATCAGGATCTTTTTTGGACTTGTTGCACATACTACAGTTACCGATGAACCTCTATTTGACATCTCAATTCAAGGAACACAAATATATTCTTTGAAATCAGGTTGGACCACTCAGGATGATCAAGCATTTACTGAAGCCCAAGTATTTCTTATGGATGGTTCAGTATCAATCTGTTTCCATGGCACAGGTCACGGAGATCCGGCAATTCTTTCAATCGAGATTCTTCAAATTGATGATAAAGCTTATTATTTTGGACCGGATTGGAGTCAAGGGGTAATGCTTAGAACAGTCAAAAGATTGAGTTGTGGATTTGGACAGTCAAAATTTGGTGTGGATTATGGTGCAGATCCCCGGGGAGGGGACAGATATTGGCAGCATATTAAAACTTTTGGTGGGGATTCTGATCATCAGAGATCTGTTGAGACTAGAATCAAACAGGCTTCACATCCACCAAACTTTTATCCCGAAACTCTTTATCGATCAGCCCTTGTCAGCACTAGTAGCCAACCTGATTTGACATATACATTGGATGTGGATCCCAACAAAAACTATTCTGTTTGGTTACATTTTGCTGAGATTGATAACTCGGTGACTGCTGCAGGACAAAGAGTCTTTGACATTATGATAAATGGAGATGTTGCTTTTAGAAATGTCGACGTTGTGAAAATGAGTGGGGATCGTTATAGTGCTCTCGTGCTTAATAAAACTGTTACTGTTAATGGGAGAACTTTGACTGTAACTTTGAGCCCAATAAAAGGTAGTTTTGCCATAATTAGTGCCATTGAAATATTGGAGGTTATAACGGCTGAGGCAAAAACATTATCAGATGAAGGTACATGCAGTGCACTATTTTTTCAACATGAATTTTTATAATAACCAAACACAGTCTGGATTTTGATCGGATTTAAGTCAATAAATATAATAATTACATTCTTAGGAACTTATATGTGATATAATTATACATTTTCTGGTCGTTTTTTCCCCTTATGTTACTTAACATTCTTCATGATACTCAATTATTTAGGACTTTGACCATGGTGAGTGCTACTCATTGCTACTTTTTGATGCATTATCATACTTCTTATGTTACCTTGTCTTTTCATACTTTTCCTTAACCAATTACTGCTGTTGTTCTTACTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTAAGGACGAAATTCAAGCCTGGTGTTGATTTGTTCCTTTATGATACTGCTGCATCTAGTTGTTGTCTAATTTATGTAGTGTTAGTCAATGTGATTTCTGTTAATCCAAATGCTTATAAAAGTTTGCCTCTTGACTATTGTTCTTTTACTCTAGTTATGGCTTTACAAACGTTGAAGAAGGCTTTGGGGCTTCCTCCCAGGTTTGGGTGGAATGGTGATCCATGTGTTCCCCAGCAACACCCGTGGACTGGAGCAGATTGCAGATTAGACAAAAGTAGCAGCAAATGGGTCATTGATGGACTGTAATTTCTTATTGTCCTTGGTCTTAGGCTTTTATTGTGTATTTAGTTGTGGTGGTGTCTTAACTCCATCTTCCTCGTGTTAATTCTTTGACTTTTTTTTTCTTTCTCATTATTTCTTTATTTTTGCGACGAAAGCAAGAATAAAAATCATTTCTTCAGCATCGAAGCTTCGAAGTATGAATCCCATAAAAAAACAAAATGAAATTACAAGACTCTGTTTATAAGTATGTCTTTGTTCACATTGATAACTAACATTTGAAGACTATTTCACACACACTCACACGAATAATCCTTTTTATATTAACTTATTTGAGGGAGTGACCTCCGCCCTCTTCCTCCTCTTTGTTAAATTTCTTTGTGCCCTTATTGTATTCATTAGCCAAAATGTACTTACAAATCCACTCCGCTTCATATTGTTAGCTTTGGGTTCCGAAACCATTGCATTTCCTTTGAAAGCTGTATTTAATATTTAATCTCAATATCTTATTGACTTGGTGCTGGATCTGTGAACAGGGGTCTTGGCAATCAAGGTCTGAAGGGCTATTTGCCAAATGACATTTCCAGACTGCATAATCTACAAATCCTGTGAGTTTGAAATAGTTTTTTCTTTTATGAAAACATTATTATTTGTTTCATGGCAATTGGCATTGCATATATGTATGAATCATGCTTGATAATTGATAACACAATAAAGCTCTGATAATTAAATGACAAGTTGCTTGAGAATTTCTGATATAGTGACATTGTATAATTGATCTCACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTCGCTATTCCCCAAGATATACTAACATTGAGCATGTTCATTTTCATATTCCTTATGTTTATTGTACTTGTGCACAGAAACTTGAGTGGAAACGGCATTCGTGGGGCTATTCCATCCCCACTTGGAACAATAACTAGCTTGCAAGTGCTGTAAGTGATTTCTTGTTCTTAGCTTATTTGACCGATGGATTTATTTATCTGTTTCCCAGGTCATTCTATACATGGTACAATGCCAATATGTGATTTTCATCTTCAGGACAGGTGTATTAGAAGTTTTATCAGCTTCTATCTAAACATTTCTGTGAGTTAAGCCTTAGAGCCATTAGTGGCGTGGCATAGTAAGACGTGTGGGACAAGATATACTTAGCATGAAGTATTGACTTGTATTTATACTTTTTTCACAACAAACATTTGTAGTCCTCACCTACTCTCCATAATTCCTACTGACTACCGGGATTTCTTACTTAGACCAATGTGTTGTTCCAAAACCTCTAAAATGAATAACAAACAGAAAGTGAAAAAGAAACTGTTCCTCTTATGTAATTTTTTTGACTCGGCCTCTTCATGCTTTGGTTTAAACCTCTTGGAGATTTGCTATTTAGCTTCACTGTTAAATTATGCGAAGGTTTGAATCTTTGCTTGACTATCATGGTGATATGATTTCTGAATGCATGTACACGTGCAGTGACCTATCCTACAACTCTTTCAATGGATCGATTCCTGAAAGCCTTGGACAATTGACTTCATTACAGAGACTGTAAGATTTCTCAGTATTTAGTTTGACGATATGAGAAATAATAAACGATAAATCAGTATTAAGCAGTCTTCATGCAGGAACCTAAATGGGAACTTCCTGTCTGGAAGGGTACCAGCGACTCTAGGAGGAAGACTTCTACACGGGGCAAGCTTTAAGTATGTTGTCAAATGTTAAACTATATAAAGAATATTTGTATGTAATGGGAGAAGAGGCACATCTATTTGCCATTCCTCCACTTTCTCTGTGACTAAGGTTGCTAAATCTGCACTTGTGGATGGGTGCAGTTTTACTGATAATGCAGGTCTATGTGGCATACCTGGATTACCCACTTGTGGACCTCACCTTTCTGCCGGTGCTAAAGTTGGTATTGGCTTAGGTGCTTCTTTTACTTTCCTACTTCTTATTATTGGTTCAGTTTGCTGGTGGAAACGGCGGCAGAATATCCTCCGAGTTCAGCAAATAGCCGGTAAGAATGTTGATTTGTGGGTTATAGTTGTCCTAATAAAATGTGTCTGGTTTGAGCTTGTGTTACAACAGTTCATGACCGATTATAA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