Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23739 LG5 68194779 68195878 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 68194811 5_prime_UTR_variant
T/A 68194827 5_prime_UTR_variant
A/T 68194832 5_prime_UTR_variant
A/G 68194838 5_prime_UTR_variant
C/T 68195093 synonymous_variant p.Pro75Pro
C/G 68195105 synonymous_variant p.Thr79Thr
T/A 68195129 missense_variant p.Ser87Arg
T/A 68195134 missense_variant p.Val89Asp
C/T 68195228 synonymous_variant p.Leu120Leu
C/T 68195233 missense_variant p.Pro122Leu
C/A 68195248 missense_variant p.Ala127Asp
G/T 68195250 missense_variant p.Ala128Ser
C/T 68195253 missense_variant p.Arg129Cys
C/G 68195343 missense_variant p.Arg159Gly
T/A 68195418 missense_variant p.Ser184Thr
G/T 68195470 missense_variant p.Gly201Val
T/G 68195572 3_prime_UTR_variant
T/A 68195632 3_prime_UTR_variant
T/C 68195793 3_prime_UTR_variant
T/A 68195796 3_prime_UTR_variant
A/T 68195801 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23739.1
MAPRDKTTAVKVNTNANAAGVKEVHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDAAAREFRGPKAKTNFPPPSDSNVKNASPSQSSTVESSSRDRDVAADSSPLDLNLAPAAVSAARFPFQHQFSVFPAAANQVMYFDAVIRAGLGRPRGFGFGYNQHPVVASEFHATTSDSDSSSVIDLNHNEGDVKGSGSRIFDLDLNNPPPQEMA*


CDS Sequence:
>Vu_23739.1
ATGGCGCCCAGGGACAAGACCACTGCCGTTAAGGTTAACACTAACGCTAACGCCGCCGGAGTCAAGGAGGTGCATTTTCGGGGAGTCAGGAAGAGGCCGTGGGGAAGATACGCCGCCGAGATCAGAGATCCCGGCAAGAAGAGCCGCGTTTGGCTAGGCACCTTCGACACGGCGGAGGAGGCGGCGCGTGCCTACGACGCCGCTGCTCGGGAGTTTCGCGGCCCCAAGGCCAAGACCAATTTCCCTCCTCCGTCCGATAGTAATGTCAAGAACGCCAGCCCTAGCCAGAGCAGCACCGTCGAGTCTTCCAGTCGCGACCGCGATGTCGCCGCCGATTCCTCCCCTCTGGACCTCAACCTCGCCCCGGCCGCCGTCTCCGCTGCCCGCTTCCCCTTCCAGCACCAGTTCTCCGTTTTTCCGGCGGCGGCCAACCAGGTTATGTACTTCGACGCTGTCATACGCGCCGGTTTGGGCCGCCCGCGTGGGTTTGGATTTGGCTACAATCAGCATCCCGTTGTGGCGAGCGAGTTCCACGCGACGACCAGCGACTCGGACTCGTCCTCCGTGATCGATCTGAACCACAACGAAGGCGATGTGAAGGGGAGCGGTTCCAGAATTTTCGATCTCGACCTTAATAACCCTCCTCCACAGGAGATGGCCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23739::LG5:68192779-68194779(+)
TTTAATTAAAATTTTATTTTTTTAGATAATTAATACTCACAGATATATTAATGATATTTACACCAAACTCATTTATAAATAAATATTAAAATATAGTTACTCGTAATAATTATATACTATACTAACTATATTTTATGCTGTAAAATTTATTTGCGATCGTATATACAGATATTTTTGTCATTTTAAAACTATCATATTGAACACGTTTTCTAATGTTATTTAATAACACTTTTTAAAAATATAGTTTTTAAATAATAATTTAAAAGTTACAATAAATTCACGTGTGAATTATTTTTAGTAGATAAGTTATATAATTGTATTTGAATGGATAAACTGTGCACTTCGGCATTTCATTAATTAAAAATAAGTTATTTTTATATATTAAAAGATAAATGATTTAGTTTTATATTTGTCTATTAAAAAGTAAATTGTCTTATTAAAAACGACTGGCTAAAAATATTGTATCTAATGTATAAAAAAAAGTGAAAATAATTATTTTTATTGATATAAAGATGTATTTAAAATATTTATTATATAATTTAAATTTAATTTAAAACTGTTGAGTTTTTTTAAAGTATTGGTTGAGTTTAATTATTTTGTTCTTTTCACACGGTATAATCTACTGTTGATATAATCAAAGTTATTAAAACATTTTCACTTTAATTTTGAAATAGAAAAATAATAAAACATTTTCATTTAAGTTTCAAATACAAAATTATTTAAGCATTTTTACTTATATTTGAAATAAAAAGAACTTAAAATATTTTAGCTTAAATTTGAAAAAAAAATAGCACAGTACTAAATATAGTGTTTTTTATGTTGATTTGCAATAAAAGACTTTAATTTCTAACTTATTTGAAAATTTTTATTACAAGGTAAAATTTGTGTGAACCAGAGACAAACATACTTTTTTTAATGTATTTGAATTTATGACTAAGAAAATGATAGAATTATTTATAGAAGTAAATAAAATTTATGATAAGGTTTGTATTTTGGGGTCTTGGTTCCGATTGACTGGGAAAGAAGAATATAATTATTGCAGGGGTTTAAACATTTTTTCCTTCTTTCCTCTCAAAGGCAGATAATGTAATATAAAATAGGTACATCAGTTGTAACGGAAAGGGAGGAAGTTGGGCAGTCCCGTATTCCTGTAAAGTTAAATAATTTAATTAAGTATTGAATTTTAAAAATTGAAGGTAGAAGAGAGAGAAGAAGAGGAATAATTAAGTTAATTAAGTAGATTATAAATGTAAAAAGGAAGTATAATAATAGATAGTAGTGGAGATGTGAAAGAAAAATAGAGGGTAGGAAGGGAATGTAAGATAGAGAATGAGGTTATTGATTGATTGGTTTGGAATAATAATATAATTAGCCGCCGCAGATTGATATGTTATGTCATTGGGAGAGGGAACGAGTGAGCGTTTCCCATGCCCATAAACAATAGCAGCCACCATCCTTCCCTTCAAAATCATTCTCAAATCAAATAATAATAAAAAAATAAAAAAACATCAGATATAGATCCAACTATCAAGTCACGCGGCGAGACAGAAGATTCCGCCGACAACATTTCTACGTACTACTACAATATCCACCCATTTTCAAATCCACACACTTTTCTTTAATAAATTAAATATTTTTACATTCAATATTCCATATTAAAAAAAACAGACGAATGAGCACCACAGAATAAATACATAGAAATGAAATAATAAATTATTAATGAGAGAGGGTTGTCCGGAGGCATAGGATAAGTGGGGTGGATGATGTGATCATCAGACGAAACCAACTGCTTTGTCTGCTGTCTGTCTGGACAACCCACATGCCACGTAACTCTGTAACTTCCACACTGCAATGGTAATTTCCATGTCCAACACCCCAGTCAAATTCATAGTTGACTCTCTCTCTCTCTTTATTTCTCTCTCTGGATTCATCATCCATCATGCACGGCCCATCCATCCCATCCCCATCTATAAAAAACGCACCTGCTCCCTCCCACTACC


Gene Sequence:
>Vu_23739(+)
CCTGCATCCATCGTCTATGCTCTTCCTTTTCTCTCTTTCCTCTCCCACTCTCAACACAAACCAAAATTAAATTCACTCCATAACAATATTATGGCGCCCAGGGACAAGACCACTGCCGTTAAGGTTAACACTAACGCTAACGCCGCCGGAGTCAAGGAGGTGCATTTTCGGGGAGTCAGGAAGAGGCCGTGGGGAAGATACGCCGCCGAGATCAGAGATCCCGGCAAGAAGAGCCGCGTTTGGCTAGGCACCTTCGACACGGCGGAGGAGGCGGCGCGTGCCTACGACGCCGCTGCTCGGGAGTTTCGCGGCCCCAAGGCCAAGACCAATTTCCCTCCTCCGTCCGATAGTAATGTCAAGAACGCCAGCCCTAGCCAGAGCAGCACCGTCGAGTCTTCCAGTCGCGACCGCGATGTCGCCGCCGATTCCTCCCCTCTGGACCTCAACCTCGCCCCGGCCGCCGTCTCCGCTGCCCGCTTCCCCTTCCAGCACCAGTTCTCCGTTTTTCCGGCGGCGGCCAACCAGGTTATGTACTTCGACGCTGTCATACGCGCCGGTTTGGGCCGCCCGCGTGGGTTTGGATTTGGCTACAATCAGCATCCCGTTGTGGCGAGCGAGTTCCACGCGACGACCAGCGACTCGGACTCGTCCTCCGTGATCGATCTGAACCACAACGAAGGCGATGTGAAGGGGAGCGGTTCCAGAATTTTCGATCTCGACCTTAATAACCCTCCTCCACAGGAGATGGCCTGATCCGGAATCTGACACACCCTTGAGTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTAATTTTGTTTTTCGGATTATGAATTTCTCTTTAGTTTTTTTATAAGTAGAGAAAATAGCAGCGTCCGATAACCTAAAATAACAGGAAGGAAAGGAATGGCACTGTGTGAATAGGTAGGCGATATGATTGTCTGTATTTTTTGCGACAGATGAAGAACCGAACCGTCGGTTTGATGCTGTCGTTTCTTAAATGAGGAAACGGTTATTATTATTTTGGTTTTGATTAGTGGTGAGTAGTAGTATTGTGTAAGGTGTAATGTTGTTGGTTAAATGAATTTAACAGCAAAGTTTTGATTATACGTT