Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23730 LG5 68106119 68117121 PREDICTED: homeobox-DDT domain protein RLT1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 68106201 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/A 68106259 5_prime_UTR_variant
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G/C 68108235 downstream_gene_variant
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G/T 68112793 downstream_gene_variant
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T/A 68113296 synonymous_variant p.Ala917Ala
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A/T 68114334 downstream_gene_variant
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A/G 68114995 missense_variant p.Asp1304Gly
C/G 68115156 missense_variant p.Pro1358Ala
T/A 68115452 downstream_gene_variant
T/A 68115550 missense_variant p.Phe1420Tyr
A/G 68115860 downstream_gene_variant
C/G 68115863 downstream_gene_variant
C/T 68115865 downstream_gene_variant
C/T 68115947 downstream_gene_variant
C/T 68116447 synonymous_variant p.Leu1626Leu
A/G 68116451 missense_variant p.Lys1627Arg
A/G 68116454 missense_variant p.Asn1628Ser
G/A 68116464 synonymous_variant p.Glu1631Glu
G/T 68116475 missense_variant p.Gly1635Val
A/C 68116476 synonymous_variant p.Gly1635Gly
C/A 68117066 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23730.1
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>Vu_23730.2
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CDS Sequence:
>Vu_23730.1
ATGGAGGCGGAGCCAGAGAACAACGAGGTGAAGAGGGAAGAAAACAGCAATGACGACAACAACAACAACAATGAAAGTAACAGCAAATTTGGAAATTCTAGTGAGGGTCAGAGCAAGCCCAAGCGCCAGATGAAGACACCGTTTCAGCTTGAAACGCTCGAGAAAGCTTATGCTGTGGAGAATTACCCGTCCGAGATGATGAGAGCAGAGTTGTCTGAGAAGTTGGGGTTGTCGGATCGGCAGTTGCAGATGTGGTTCTGTCACCGGCGGTTGAAGGACAAGAAGGACTTGCCGTCGAAAAAGCTGCGTAAGGCTGCGGCGTTAACTGATTCTCCGGTTGAGGAGCCCAAGCTGGCTTCTGAAGTGGGTGCTGAATACGGATCCGGGTCGGGTTCAGGGTCCAGTCCGTTTACCCGTTCGGAGTTGAGGAATGTGGTGCCTAGGGGGTACTATGAGTCGCCACAGACTATAATGGAGCTTAGAGCAATTGCTTGTGTGGAGGCTCAGTTGGGGGAGCCTTTAAGAGAAGATGGACCTATTCTTGGAGTGGAGTTTGATCCGTTGCCGCCAGATGCATTTGGGGCACCCTTAGCTGTTACAGATCCTCAAAAGCGGCCTAGTCTTGCCTATGACAATAAAATGTATGAAAGACATGATGTTAGGACAAATAAGGCAATAGCAAGGACATTCCATGAATATCCCTTTCTTCCAAGCCAGTCTGGCATTAGATCTGATGTTTTTGGACAACTAAACCTGCCCCATTTACATGAACCGATGGAGGGTCCGGCAAGAACCCCTTTTCCCCTTGGAAATGAACAACCTAGAATTCATGCTCCTCAAAGTCATTCTGCTCGTGTTCGTCTTTTGTCTCAACCACAGGACAAACAAGTGATTCCCTATCCATCTCCCCCTCGAGAAAATGATGTTGTACCCAAAAGGGAACCTCACATAAACATAACAAATACTGGAATGAACTCCCACTATGCTACTGATCACCCAATTGTTGGACAAGAAATTCCATATGCTTTACCTGGTGGGCAAGTATCCCATAATGATGCAGTATTGAGGATGGAGAGGAAACGGAAGATTGATGAAGCCAGAGTTGCAAAGGAAGTTGAAGCCTATGAAATGAGGATGCGGAAAGAGCTTGAGAAACAAGATAACCTCAGACGAAAGAGTGAAGAGAGATTGAAGAAGGAAATGGAAAGGCAAGATCGTGAGAGAAAGAAGGAAGAAGAGAGGTTGTTGCGTGAGAAACAGCGAGAAGAGGAAAGATCAAAACGTGAGCAAAGGCGGGAAATGGAGCGAAGGGAAAAGTTTTTGTTGAAAGAACATTTGAGAGCTGAGAAAAGGAGGCAAAAAGAAGAGATCCGCAAAGAGAAAGAGGAAGAGAGGAGGAAAGCTGCACTTGAGAAGGCAAATGCTCGGAGAATAGCTAAAGAATCTATGGAGCTTATTGAGGATGAACAACTTGAATTGATGGAGTTGGCTGCTGCAAGCAAGGGGCTTTCCTCTATTATTCATATTGATCTTGATACTTTGCAGAACCTTGAATCATTTAGGGATTCATTGAGTGTATTCCCCCCCAAAAGTGTAAAGCTGAGAAAACCATTTGCTATCCAACCCTGGAGCAACTCAGAACAGAATGTTGGCAACCTTCTCATGGTTTGGAGATTCTTGATTACTTTTGCTGATGTTCTTGATTTATGGCCTTTTACTCTTGATGAGTTTGTACAGGCATTTCATGACTATGATTCTAGATTGTTGGGCGAGATACATGTTGCTCTTCTCAAGGTGATAATAAAGGACATTGAAGATGTTGCTAGGACACCTTCTACAGGATTGGGGATGAATCAGAACGGAGCTGCTAATCCTGGAGGTGGCCATCCAGAGATCGTGGAAGGAGCATATGCATGGGGCTTTGACATACGAAATTGGCAGAAGAACTTGAATCAGTTGACATGGCCAGAAATTTTCCGACAGTTAGCACTGTCTGCAGGATTAGGACCACACCTGAAGAAAAGAAGTATTGCATGGTCATACACAATTGATAAAGACGAGGGAAAAAGTTGTGTAGATATCATTTCTACACTTCGTAATGGTTCGGCAGCTGAAAGTGCCGTGGCCAAAATGCAAGAGAGAGGTCTATTAGCTCCCCGAAGATCAAGGCACCGGTTAACTCCTGGAACAGTTAAATTTGCAGCATTTCATGTTCTCTCATTGGAGGGTAGTAAGGGCTTGACAGTACTGGAGCTTGCAGAAAAAATTCAGAAATCTGGTCTCCGAGACCTAACGACCAGCAAGACTCCTGAAGCATCAATTTCTGTTGCTTTGACAAGAGACACTAAATTGTTTGAAAGAATAGCTCCATCAACATACTGTGTACGAGATGCATTCAGAAAAGATCCTGCTGATGCTGACTCCATTCTTTCAGAAGCAAGAAAGAAAATTCAGATATTTGAAAATGGGTTTCTAGCTGGTGAAGATGCTGATGATGTTGAAAGAGAAGAGGAGTCAGAAAGTGATGAAGTCGATGAGGATCCTGAAGATGATGATTTAGTGAATCCTTTGAGTGCAAACCAAAATTCTGAACAGTATCCTGACACAAACATTTGCTCATCAAATGGAAAAGAAAATTTGGGTCACAACATAGATCTTATTCAAAATGAGTTTGATACAGATTTACCCTGTCTTCCTAAGAATGGTTCAACAAGTGCTGATTGTCCCAGTTCTGTCACCAGACCTGTTGCTTGTGGAGATTTAAATGCTGGCAATCTTGATCAAGATAATATGGAAATTGATGAAAGCATATCTGGAGAGTCCTGGATTCTTGGACTTGCAGAAGGAGAATATTCTGATCTCAGTGTAGAGGAGCGTCTAAATGCTCTTGTTGCTTTGGTTGGTGTGGCAAATGAAGGAAATTCAATCCGTGTTGTCCTTGAGGATCGACTGGAATCAGCAAATGCTCTGAAGAAACAAATGTGGGCAGATGCTCAGATTGACAAAGTTCGTCTGAAAGATGATAATATTAGTAAATTAGATTTTCCATCTCTTACTGGAAATAAAGTTGAAACACAATACACATATCCAGCTGCGGAGGGACACCAAAGCCCAATAATGCTTGACATTAATATTAATAATAATGAAGCATCACCCAGCACTGCAGAAAACCAAAAGGGAGCTCCTGTTGCGCTGAGCATGCCTATGGAGAAGTCCTCATCAATTCAAGATTTTGGCATTGGTACTGGTGCAGACATCCCACAGACTCAAGTACCTGCACAATATTCAAAAAGGTCACGTTCACAGTTGAAATCTTATTTTGCCCACCTAGCGGAGGAGATGTATGTCTACAGGTCTTTACCCCTTGGCCAAGATCGCAGACGTAATCGATATTGGCAGTTTGTTGCATCTGCTTCTAGCAGTGATCCTGGTTCTGGCAGGATCTTTGTTGAATGTCATGATGGCAGGTGGTGGCTCATTGATTCTGAAGAGGCCTTTGATTCTCTTTTGACATCATTGGATTCACGTGGGCTCAGGGAATCTCATTTGCGCTTAATGTTGCAAAGGATTGAGAATTCCTTTAAAGAAAATGTTCGTAAGAGGAATGCACATTGTGCCAAAAATGGAAGCAGAGGCGAAGTTTCTATTAAAGTTGAAGCTAATGAACCATTTTCCATCCCTGACCACAATGCTGGATCTGACAGTCCTAGCAGTATCCTCTATGACTTGAACACTGATACATCTGAAGTTTCATCGTCCTTCAAAATTGAGCTTGGGAAAAGTGAGAGTGAGAAGAAAGCTGCCTTGAGAAGGTATCATGATTTTCAGAAGTGGTTGTGGAAAGAATGCTATAATTCATCAGTTTTATGTGCAATGAAATATGGGATAAAGAGATGCAAACCTCAGATGGACATTTGTGATATCTGTCTCGATCTTTATTTTGATGAAGACTCCCATTGCAGTTCCTGCCACCGGACTTTTTCCTCAAATAATGGATTTAATTTTTCTAAGCATGCATTTCAATGTCGAGACAAATTATCCAAAGATAATTGTATTTTGGAATACTCTCTTCCCTTGCGGACAAGATTGCTTAAGATCCTGTTGGCTTGTATGGAGGTATCTGTTCTATCTGAAGCGTTTGGAACAAATTGGACCGATGATATTAGGAAGCACTGGGGTGTAAAGTTGAGCAAATCATCTTCTGTTGAGGAGCTTATACAGATATTGACCCTATTTGAGAAAGCACTACGGCGAGATTTTCTGTCATCTAACTTCTCTACAACAGATGAATTGTTGGGATCAAGCAGTATGTTAGAATGTTCTGGGCAGGCTTCAACTGATCCTGAATCTGTTCCTGTGCTTCCATGGGTTCCACTAACAACTGCAGCTTTGTCTCTCAGACTTTTTGAGATTGATTCATCCATCAGCTATGTAAAGCCCGAAAGACTTGAGCCTTCTGAGGAAAAAGAAGCAAGAGAATACATAAGGTTTCCATCAAGATATACTCACTTGAAATCTAATAGGGAGGTTGAACCAGCAGAATTCGACCATGATGAATTCGCTAAAGATAAATCTGTTCCTAAGAAAATTGTACGAAGTGGCAATAAACGTCGTCGAGGGAGTAATGAACAAAGACGGGGCAAAAAACTGGCTAAAAGAGTGTACAATTCCAAACGAGACGGTGGTCGGAAGAATGCTAAGGTCACTGTCAATCTAAGTCACAAATTAAAACAGCAGGCACGAGGAACACAAGGACAAGGTGCTGGGCGAGGTCGCCGAACTGTAAGAAAGCGGAGAGTGGGAAAGCGAGCTGTTGAAGATTTGTTGCTGGGCCATACAACAGCGAGCCATAGCTCCAAGATTGATAGAGAACCACTGAAAAACTTGGATGAGGAATGGGATGGAGAAAAGGCAAGTCCCATGACTCCGGTGCACATTGGGGTTGCTGCTGACCATAGTAATAGTGCTGAAGAGGTAGAATCTGATTATGACCACGCTCA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>Vu_23730.2
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