Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23672 LG5 67581506 67586769 trihelix transcription factor ASIL2 isoform X4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, protein binding, DNA-binding transcription factor activity, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 67582129 missense_variant p.Pro145Ser
G/T 67582329 missense_variant p.Glu211Asp
G/T 67582348 missense_variant p.Gly218Trp
G/T 67582485 missense_variant p.Arg263Ser
A/G 67582778 intron_variant
T/A 67582780 intron_variant
C/T 67583531 intron_variant
C/A 67583793 intron_variant
A/G 67584992 intron_variant
G/T 67584993 intron_variant
T/A 67585169 intron_variant
A/G 67585259 intron_variant
T/C 67585264 intron_variant
T/A 67585265 intron_variant
A/T 67585294 intron_variant
G/T 67585477 intron_variant
G/T 67585734 intron_variant
T/A 67585781 intron_variant
C/A 67585806 intron_variant
G/T 67586197 intron_variant
A/T 67586202 intron_variant
G/A 67586387 intron_variant
T/A 67586388 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23672.1
MPDFNDSIAPPSRPVPVREDCWSEEASSTLVDAWGRRYLELNRGNLRQKDWQDVADAVNALHGHTKKTHRTDVQCKNRIDTIKKKYKIEKARVSSSNGTLSSSWPFYERLDALIGPNFNAKKPPSSSPSPSPPVALPLLPHRKNPSSSPAIAVTPTAVALPQKRSAAAAAMDEGYFRRNYSAVAAAAAAAEADEDEEEEEEEEADDVEEEEDEDEGRGSEVEEGEKEREGMRRLAKAIERFGEVYERVEGQKLRQMVDLEKQRMQFAKDLEVQRMQMFMDTQVQLERIKRGKRSGSNDMYS*


CDS Sequence:
>Vu_23672.1
ATGCCCGACTTCAACGACTCCATCGCGCCGCCGTCGCGCCCCGTCCCTGTTCGCGAGGACTGCTGGTCCGAGGAGGCCTCTTCCACGCTTGTTGACGCCTGGGGCCGACGCTACCTCGAGCTCAACCGCGGCAACCTCCGCCAGAAGGATTGGCAGGATGTCGCCGATGCTGTCAACGCGCTCCACGGACACACCAAGAAGACGCACCGCACAGACGTCCAGTGCAAGAACCGCATCGATACCATAAAGAAGAAGTACAAGATCGAGAAGGCTAGGGTTTCGTCCTCCAATGGTACTCTCTCTTCCTCCTGGCCTTTCTACGAACGATTGGATGCTCTTATTGGCCCTAATTTCAACGCCAAGAAACCTCCTTCCTCCTCGCCGTCTCCTTCGCCGCCTGTGGCTCTTCCGCTGCTTCCGCATCGGAAGAACCCTTCCTCCTCACCTGCGATTGCGGTGACACCGACGGCCGTCGCGCTGCCTCAGAAGCGTTCCGCCGCTGCGGCGGCGATGGACGAGGGTTATTTCAGAAGAAATTACTCCGCTGTTGCCGCGGCTGCGGCGGCTGCGGAGGCTGACGAAGACGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGCGGACGATGTGGAGGAGGAGGAGGACGAAGATGAAGGGAGGGGGAGCGAGGTGGAGGAAGGGGAGAAGGAGAGGGAAGGGATGAGGAGATTGGCGAAGGCGATAGAGAGGTTTGGTGAAGTGTATGAGAGAGTGGAGGGTCAGAAGCTGAGGCAGATGGTGGATTTGGAGAAACAGAGGATGCAGTTTGCTAAAGATCTTGAAGTCCAGAGGATGCAGATGTTTATGGACACACAGGTTCAGCTCGAGAGAATTAAGCGGGGTAAACGATCTGGCTCTAACGATATGTATAGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_23672::LG5:67579506-67581506(+)
GTATTTGTGAACGAAAACTAATTAGGGCATTTGAGATATTTGAGATAGAGTGTTTCTGAGTTGAGGAAGGGTGAAAAATCGCAATTGGGGCTTTTGAAAGCAAAACGCGTTTGGTGATTTGGAAGCGTTTTTCGCATTGTTCGTGGGGTATTTGGAAGTGCGAAGTGGGTTCCATTCGAAGAACAGCCATTTCTCAACAACCAAGCTTTCTCACCCAACCCCAATCCACACAGTACCAACACTTCTTCAACCAACTCCAAACCGAAGAACAGCCATTTCTCAACAAACACCCAAAGAGGGAGGAAGAAGTAGAGGGAGGAAGAACAATAAACTCACCAAGCTACTGCCAACACAAAACAGCAAACCCTAACGAAGAAGAAGACAGCCAACACCATCAACTCCCACCACGCATCTGTCACTTATAACCTCATTGAGGTACTTCCCACTTAGGGCATCCACGTAAACCTCTCTTTTGCCACGTTTTAATTCTCTAGTGCTAAATAATCAGCCACTTAACACCGTTAGTGTGTATTTAACAGAGATGACTACATTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTACACCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTAGAGACAAAGGAAGCAATTAAACCTTAAATTTAATAAATTACTCTTAACAACTTTAAATGGTTGGAATTAATTAAAATAATTTCTATCTGCTTTTAAAACAAAGTTAAATGTTTGTAAATAAAATTTTATTTTTACAATTTTTTAAAACAAATTAAGTAAATAATTGTAAGTATATATAGGCTTGATTATATAATTTTACGTAATATTTTTTATAACTATATAAAATTAAGTAATTAAATAAAATACTTTTATTTATCAATATTTTAAATATTAATTAAAATAATACTTTTAATATTATAGTAAAATGTCTTTGTTATCATTAATATCTTTTATAATTATTGTGTTGTTAAATAGTTAAAATAACTAATTATTTCATTTTTTAGACAAAAATTCACTTTAAAAATTAAAATAATTTTTTATTAAAAAAATGTATAAAAAATAAGAGTATGACCTAATAACCTTGAATTCCTTAAGCTGAAATTGTAAAGTAATAAAACAAAAATGAGTTACATGGGTTTTGTCTTAACTTTCTACTTGGTGGACAAGTATAACTTTATTTAAAAAGAAATTCTAATTATACATATGGTCATTCATAACTAAATTTAACATTTTGCACTACTATACAGATATTATTCTAATTTAATATTTGACTAATAAAAATGAATTACTTAATTAATTCATGTATTTTTTAAGAAAAATATATAAAATTAAATAATACTTACTAATTTTATTTGATAAAAAATTATTAATTAAAAGTAAATAATTGCTTACTGTGGAATCGGAGTGGTCACCGATCGCGGCATGTTTATTTATAAGAAAAGAAAACAGAAAAAGAGAGTGTAGAGGCAACGCAAGGTATATATTGCACCCACTGAATCTTAATCTTCAATCTTCACCAATCCACTGGCAGCTTAAGGCCTTGATCTTAATCCTAATTATCTTCTTAATCTCAAACTCTATCTCTCTCCTTAATTATAATTATTTATCCAAAATTATTATTAAAATAAAAATAAAATCCAAAAAAGAAGAAAAATGCCAAACGGAATTTGAAGCCATCACACACCGCAAGTCAAGTCGGCAACAACGCGCGTTGGCCTCCCTCTCCAACCTTCACCTTCTAAAAATTCAAAACACATTGAAAAATTAGAATAATATGTATTTGCCCACACATTTATAAATTATAATCTATAATAATATAAACAAGTGGCATTGCAATGGAAATGGCATGATAAGATTATATGAATTGATTGATTAATTAATAAATTTGAAATTTAAAAAACAGAAAAATAATTGGGTGTTTCCGATAGTAGTTGTAGCGGTCAAGCCGAGCCGATCCG


Gene Sequence:
>Vu_23672(+)
GATGACGCGAGCCACTCACACACTGGGGGTTCCCCCAACAACACGCGCCCCTCCCCGGCGACCGTACCGTATTATCCCCCACCCTTCCCACTCTTTCGCCTTGCCGTTTCGCTTTCTCTCTCTTCTTTCTCTTTCCGCATTCCCTCTCTCTTTCTCTCTCTTCTTCCCCGAACCCTAATTTCTGTTTTCCGATGCCCGACTTCAACGACTCCATCGCGCCGCCGTCGCGCCCCGTCCCTGTTCGCGAGGACTGCTGGTCCGAGGAGGCCTCTTCCACGCTTGTTGACGCCTGGGGCCGACGCTACCTCGAGCTCAACCGCGGCAACCTCCGCCAGAAGGATTGGCAGGATGTCGCCGATGCTGTCAACGCGCTCCACGGACACACCAAGAAGACGCACCGCACAGACGTCCAGTGCAAGAACCGCATCGATACCATAAAGAAGAAGTACAAGATCGAGAAGGCTAGGGTTTCGTCCTCCAATGGTACTCTCTCTTCCTCCTGGCCTTTCTACGAACGATTGGATGCTCTTATTGGCCCTAATTTCAACGCCAAGAAACCTCCTTCCTCCTCGCCGTCTCCTTCGCCGCCTGTGGCTCTTCCGCTGCTTCCGCATCGGAAGAACCCTTCCTCCTCACCTGCGATTGCGGTGACACCGACGGCCGTCGCGCTGCCTCAGAAGCGTTCCGCCGCTGCGGCGGCGATGGACGAGGGTTATTTCAGAAGAAATTACTCCGCTGTTGCCGCGGCTGCGGCGGCTGCGGAGGCTGACGAAGACGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGCGGACGATGTGGAGGAGGAGGAGGACGAAGATGAAGGGAGGGGGAGCGAGGTGGAGGAAGGGGAGAAGGAGAGGGAAGGGATGAGGAGATTGGCGAAGGCGATAGAGAGGTTTGGTGAAGTGTATGAGAGAGTGGAGGGTCAGAAGCTGAGGCAGATGGTGGATTTGGAGAAACAGAGGATGCAGTTTGCTAAAGATCTTGAAGTCCAGAGGATGCAGATGTTTATGGACACACAGGTTCAGCTCGAGAGAATTAAGCGGGGTAAACGATCTGGCTCTAACGGTGAGATACAATTTCTTTCTACCTTTTTCTCCTTTTGGCTTGATTTGATCCGCGTTGTACTTTTTAGTGTTTGGTTTTTCAACGAACGAATTATGTTTTGAACTTGAGGGTTGTGGGTCGCCAGGGGATTCTTCGGTGAATTACATTTTTTTTGGGAAAAGAAAAATAGGTTTTGTATGTTGGTTTTAGACTCTAGGCGTTCACTGAATGCTCTGAATTGGTTGTTTCTTGTAGTTCTGCAATTAAATATACTAGCAAGTGGTTCACTTTAGTACTTCGTTTTGGCAGGTTATCATAGTTTATGTTGAGATATTTTTTTATGAACTGTTTTTCTATATAAATGGTTGAGGCATTGAGTTGAGGTAGTCTTCATGGCTATACATTTTTATCTGTGTTCTGATGTTGGTTTAGTATTATAATCACTTTTTTAAGCTTATGGTGACATTGACATTAATGTGGGTGGTCTAGTAAAGCTTTTGATTGAAGGGTCCAACGTTATTCTTTTTGTATGGCTTCTCTTAATCTGTAAGTTAGCTTGAATTTTTTATAAACTCAAGGATTCATTAGTGTTTTGGTGGACTAAAATGGTGTTCAAACCTTACAAATCACATGTATTGCTCATTAACTTCTGTATACAGATGTGTTTAGGTCTGCAAACATTTTTTTTTTATCTTTCTTTGTGGTAGTAGTGTGGAAGATTCTCACATTCAAAGCTTTGTTTCTTAGTTCTGCATTCAGTGGCTGTTGTTAATGATATATTTCCCTTTCCTTTTGTATCTGAGTGAAATAGAGCCAATCTTGGTAAATTGATGCTGTGTTTCTGCTTTTATAAATGCAGTGCTGAACCATGTGTGGTACATGTGTGCTATATATTTCAACTTTCATAAATGTGATGCGGTTTTGGGTAGTTGTGTACTAATATGTAAGGTAAATCGGGGGAAACATGTTGATGATTGAACTCCTGGATATTTTGTGGCACACTGATGTTGATTTAGGGGATAGGAAACCGCTACCATGCAGTAGCTTTAGTAGATGGATATTAGGAATATGATGGCAGTTATATGTTGACTAAAAATAACACAATTGGTAACACATGATTTCTCTGCCAAATTGAGAAATATTGTCTATGCCATACCTTCAATACCAAGAAAGGCTTTATGAATGTTATTTACTAATCTTGTTTAGTATTATTAAAAATGGATTCCTGTTTTGTCTCCATTTTTACAAAACGACTTTAATGCGTTAACTTTATAAATTTAAGGTCCCTTATGGATTCTTGAACCTGTTGTATATGGTTATTTGAACTCGTGGTTTTGCAAAGTTGAGGCACAAATGTCATAATGAATTTAACTTTCTCCTGTATATTTTTTAGCAACTGAGGAGTAATTGTCTGCTATTACTGACAATGAACGCTGAACTTGTACAAATTGCTCTCTGGTTTGCCTGGTCATCTATTGACAATGGCTTAAGAATGTGTCCAAACTAGTACCTATACCCGTACAATGCATGGATATAGGTACTAGTTTGAATTCGGAAATGTAGCCTGTGTTGACTAAAAAAACGATGTGGCGGTAGTGGGAGAAGCAACATGTTGGTTAGTGAATGTGCCACTTGTTCGATCTTGAAGCAGGCACAACCCTTTCCTTATTTAGCTTAATTTATTTCGTTTTTATTTTTTTTGTAGCTTAATAGAGTCACTTATTTTAATTTAAAAATTAGCCATTTTAAATGTTGTATTTGGGTACATCTTACGAAACTGAGGAACGTGATATGAACTCTGAATATTTCTTATGTGCCCACCACAAACCTATTTCAGTCCAGTTCCATTCCAACTCAGTTAAGAGTTACGATTGATGTCATACAGCTCCCAAGCTGTCCATGTGGTTTGAATTCTCAAAGGAAAACCTTCAGTGTCCTCTCTAGTTATTTGTACTTGTCATCTGTTCTCAACACAGGTAGGTAATGGTGGAGTCTGGCAGGAAGCGGCATCTATTATCTGCTCTGTTCAAATCTTCCAGAAAGGTGCAACTACAAGCACTGTAACATGTCCCAGGTTTTCTATCTGTGTGAAGTGAGCCGGATTTTTTAAAGAATGGGCTTGAGACACAGATAAAAGGCTCGGGAGGTTGATTTACCAAATGTCCTTTATTAAAACTAATCCCATTTACTCAGTTCGATAGATACCAGTATGGTTCAAGTTGATAGATTTCATTTAAATATGGATCGATGATGAGTTAATGATTCCAGTTGCCACATGATCCCTATTGGTACGGATGTGCAAAGCTAGGTTAGGATCAAGGTATCCAATCTGTAGCTTAGTTGTTTTGTTTCTTATTTCTGCATGGTGCAGCTCTTTTCTTTGTCCTCTGATTATTGCTTGCCAATCTGCATACTAGAAAAGTTAGGATACTATTTTAGAGAAGTTTCTAATATCGATGAATTAAAACTCAGCAAGATTCCATTTGTCCTGTACTGAAGTAATGATGACCTAGATCCTCAGTAAGGTCCTATGCTGAGAACATTAAGTGTGTAGATGAAAATTTGATGGTAGCTCTGGCTTGCTGGTGGCTTTGAACCCCCTCAGTTGGATTGGCTTCTGGTCAATTGTTTTTCCCCAATTTTATCCTTTTTACCACTCCAGTTTTCTTATATTAAATATATAATTTGGACATATCTTCCTGTCAAACAATGAATAGGTACGACACATTATGTGCTTGAAGAAAGGAGGAGAACGGTGAGTTATTGGTTTGGAAGGTATGGGGTTTTGAGCAAGTTTGATTTTGTTGTAGGAGAAAAAGAAGAGAACTGGAAACCAGTAATACTTTTCTTTTGATGTTGTTTTCAGTCGTAATATTCATAAAAATCAAGACAGTGAGGAAAATGGTAAAGATTCCTTTGATTATCGAGGTTTTCTTATTTCTACCTGTTTCTTATTGTATGTGTTAGGATTATAACTTATATCACTTATATGACGATGTAAGGACTATTTTTTTTTTTTTGCTTGAGAAACGGTAATTTTACTATCTTTTTAAATTCACTTGATTCGTTTTCAGGCCAGTGCTACTAAATGTCAGCTTTCTAGGAGTTATGGGTTTAAGAAAAGTGCCAATAAGATGTTACGTTTTTAATGTTTGCATAATTTGTAGTAATGCGATCTCAACAAATACGGAGTTACAGATGATCTTTGGGGTTTTAGTTCCATGGTTTCGGTGGGATGCGTACCAGTGTGTTTTTTATTTTCATTTCTAAGCATGTAAATGGAAAAGCAAGAACTAGTTGCATATTGGTAAAATGTGCGTTAGGTTCCTTTCCAACTGTAGAAAACCAAACACTTGTAACCTTGCTTCACTTCATATTTATATTGCTGAGCTCAGCGAGACAACTGCTTCAGATTACTAATCAATCCAAGTTTGTTTGGTTTTATTCATTCAGGAATAAGTGTCATTTCATAGAGATATCTTTAGGTACAAAAATCTGGAATTCTTATCCAATCTCATTTTATACACTTTGATTATTACCTGTGGATAAGTATTACCACTTAAAGGCATTCGTGTTTTTTACTTTCAATTGATTGCATGCACATATACTATCGAGGTGCTCTAGATAAGGTGTCACTTTAGAAATAATATTTTTTTTGCTGTTTCAATACAATTATGTAAATGTGTCCGTTTCTTTTGACTTGAAACATACAGGAATTATTTTGTGGTTGTTGGAATCTTGGTGATCTACGATCTGATCTAACTAGTGAAATAATACCATAAGAGTAGTTATGAATTATTCTTTTATTCTAAACCTTTTGTATTTAAAGAAGTATTGATAATTTCAGATTGAACATATCTTAATATACACTTCTCACAGCTCTGCTGAACTATTTTGACAAAATTGTTCATTGCTGCAGATATGTATAGCTAGCCTGGTGAAGTGGGCGATGGTTGGATAATGGTGCTTGAAAAACTGTCTTGGTTTGGGTCTAGTCGTGGGAAAAGTACATATCTTCAGCTGATATACTGTCATGAGGGAAATATCTCCTATAGAAATTTATCCTGGAGTAATTTTGGATTCTTTTAGCTAGCCTTTTATTTGTTGTTATTAGTCCTTCCTTATAAATTAAATCAGCGACTGTGCTAGGCCTAATTTGGCTCCGATATAGAATTTGCTCCAATGTATAACACTCTTATGCC