Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23661 LG5 67482848 67485228 CBL-interacting protein kinase 5-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04371 Apelin signaling pathway [PATH:ko04371]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 67483145 synonymous_variant p.Asp396Asp
C/T 67483247 missense_variant p.Met362Ile
A/G 67483883 synonymous_variant p.Gly150Gly
A/T 67483907 stop_gained p.Tyr142*
A/G 67484036 synonymous_variant p.Asn99Asn
G/A 67484082 missense_variant p.Ala84Val
A/G 67484210 downstream_gene_variant
G/T 67484217 downstream_gene_variant
T/A 67484248 downstream_gene_variant
G/A 67484595 downstream_gene_variant
C/A 67484671 downstream_gene_variant
G/C 67484797 downstream_gene_variant
G/A 67484859 downstream_gene_variant
G/A 67484922 downstream_gene_variant
C/T 67485012 downstream_gene_variant
T/C 67485103 downstream_gene_variant
A/G 67485132 downstream_gene_variant
A/T 67485143 downstream_gene_variant
C/T 67485149 downstream_gene_variant
C/T 67485150 downstream_gene_variant
T/C 67485156 downstream_gene_variant
A/G 67485158 downstream_gene_variant
A/T 67485209 splice_region_variant&intron_variant
C/T 67485216 missense_variant p.Val5Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23661.1
MTQLVRSSSLCTKRNTPHAAKGDSSTQPPKPSRFPYTSLGFSKCSTLTKWRVGTESGGMEKKIVMQKYEIGRFLGQGNFAKVYHARNLKTGQSVAVKVINKEMMMMKEGMKDQIKREISVMRLVRHPNIVQLYEVMATKTKIYFAMELVKGGELFHKVSRGRLKEDVARKYFQQLIDAVDYCHSLGVCHRDLKPENLLLDENGDLKITDFGLSALVESKKKDGLLHTICGTPAYVAPEVIKNKGYDGAKTDIWSCGVILYVLLAGFAPFNDRNLMEMYKKIIKADCQFPKWFSIDVKRLIYRILDPNPTSRISVAKIVQSRWFRKGYVQTVEYQLPPLFPRNGDDILDVQVVFDSSDSDGSPMSTKKESPLKLYQFNAFDLISLSSGLDLSGLFENDQNERQLTRFTTRERPSTVVSMLEEIAQIDDKFKVLKKDGIVRLEGCKSGIKGQLILHAEIFEVTSSLHVVEVTKVAGNTLEYSKFREQYLKPSLKEII*


CDS Sequence:
>Vu_23661.1
ATGACGCAGCTAGTGAGATCTTCATCTCTTTGCACCAAGAGGAACACCCCTCACGCTGCCAAAGGTGATTCCTCCACACAGCCTCCTAAGCCTTCACGTTTTCCCTACACCAGTCTTGGTTTTTCCAAGTGTTCCACATTGACAAAATGGAGAGTGGGGACCGAATCAGGAGGAATGGAGAAAAAAATTGTGATGCAAAAGTACGAGATTGGACGCTTCCTTGGACAAGGCAATTTCGCCAAAGTTTACCATGCAAGGAACTTGAAGACAGGCCAGAGCGTGGCCGTGAAAGTTATCAATAAAGAGATGATGATGATGAAGGAGGGTATGAAGGATCAAATCAAGCGCGAAATCTCAGTGATGCGCCTTGTGAGGCACCCCAACATCGTGCAGCTGTACGAGGTCATGGCAACCAAGACAAAGATATATTTTGCAATGGAATTGGTGAAAGGTGGCGAACTTTTTCATAAAGTGTCCCGAGGAAGGTTGAAGGAGGATGTAGCAAGAAAATATTTTCAGCAGCTGATTGATGCTGTTGATTACTGCCACAGCTTAGGGGTGTGTCATCGTGATCTCAAGCCAGAGAATCTTCTTCTTGATGAAAATGGGGATCTCAAAATTACGGATTTTGGTTTGAGCGCATTGGTTGAATCCAAAAAGAAGGATGGCCTTCTTCACACAATATGTGGAACTCCAGCCTATGTTGCTCCTGAGGTTATAAAGAATAAAGGATATGATGGAGCCAAGACAGATATATGGTCTTGTGGAGTGATTCTCTATGTTCTTTTGGCAGGTTTTGCTCCTTTCAACGACAGGAATTTGATGGAGATGTATAAGAAGATTATCAAAGCAGATTGCCAATTCCCAAAATGGTTCTCTATAGATGTGAAAAGACTTATTTATAGGATCCTTGATCCCAATCCAACGAGTAGAATTAGTGTTGCTAAGATTGTGCAAAGTCGTTGGTTTAGAAAGGGGTACGTGCAGACTGTAGAATATCAGCTGCCACCTTTGTTCCCCAGAAATGGAGATGATATCTTGGATGTTCAGGTTGTATTTGATTCATCAGATTCAGATGGCAGTCCAATGTCAACAAAAAAAGAAAGCCCCTTGAAGCTATATCAATTCAATGCATTTGATTTGATATCACTCTCATCAGGTCTTGATCTTTCTGGTTTGTTTGAAAATGATCAGAATGAAAGACAACTGACGAGATTTACTACCAGAGAAAGACCTTCTACTGTTGTATCAATGCTTGAAGAGATAGCACAGATAGATGATAAATTTAAAGTCTTGAAGAAAGATGGGATTGTTAGATTGGAGGGATGCAAATCAGGAATAAAAGGCCAACTCATCCTACATGCAGAAATTTTTGAAGTTACATCTTCCTTGCATGTTGTTGAGGTGACAAAAGTAGCTGGAAACACATTGGAATATTCAAAATTCAGGGAACAGTACCTCAAACCTTCTTTGAAAGAAATTATTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23661::LG5:67485228-67487228(-)
GAAGACTTTTTTTTTAAATAAAAACAATAAACTAAAATATAAAATATGTAAACGGATGTCAACATCCGTTGAAGGTGAAACCGTTTTAGAGTAAGGACAAAATAGGTATCGGGTGGCGCAGGGAGCATTCGGTGGTGATGGAGGGAGCAAGTGTCCTAAATTTAATGCACGTAAATGTTATATTTATTTGTATCTCCTATAGTTACTTCAAGTATTCTTTTGCCTTTCTTCGTTGGTCTTCATTTCTTCCTAAGTCTTTCATTAATTAATTGTGATGGTTCTTTTGCTTCCTTTACTTTATTGGTCCCTACTTTCCCTTGTTGGTTTTTGTGTTTGTGTTATTTATTTGTGTTGAGATTTGTCATTGTTGATTATGTGGTGGTCTTTTATCTAATTATTGTTTATGGTGTTCATCGAGTACGTTTATGAATTGCGTGACACATGAGATAAAAGTAACTTCATTCAAAACCCCTTATATTATGTTATTACACATTTTAAAAATCGTTGAACTCTTAACCAACTTTTGAAATCATGTTCAAAGCACGAGTTCTTAACCAGATTTCGAAAGTTGACTAAGAGTTCAACAGCTTTTGAAAACTCTTAAAACCTTAATCGATTTTCTAAAGATGACAAACTCTTAATTGAATTTCAAAATCTAATTAAGAGTTTAATAAATTTCAAAATCCGTCAAACCCTTAACTGGATTTTGAAATTGGGTTAAGAGTTCATCGAATTTCGAAAATCGTTTAAAAGATTAACCGTTTCAAAAAGCATTCCCTTGTTAACTACGTGCATTAGACCATAATTTGACTGGTAGCGTAGGTCTTTTTCTCCTTTCACCTTGTGGTGAGCTTTCACCATGATAGTAGATGCATATCATGTTTTAACCATATATGGGGCAACCAAAATTTACAAACAACAAAATACATTAAAAAAATTTAGGGTTAAATATGTTTTTTGTCCCTTAACTTTTCAGTACAAATTGAAATAAGTTAATCTTTGAAACCTTGACCTAATTTAGTCCCTCATCTATTAAAATAGGTTGATTTAGTCATTTTAATCAAATTTTGTCTAGTTTATTTAAAGTTTCAAATGAGTTTCTAAATTAACATTGAAGTGAAAATACGTCAAATGGTGTAAACAAGTCAAATGTTATCATAAAACACGTTTGAAATATTAAATAAACTTAACAAAATTTGGTTAAAAGGACTAAATTCATACATTTTTAAGATTTAAGGATTAAATTGGGCCAAAAATTTTAAGAGAAACTAATTTCAATTTTGACTAAAAGTTGAAAGACAAAAATATATTTAATCCAAAAATTAAATATACAAACAACAAAAATAATAAAATATTTTAATATTTCAACCAATATATAAACAAGTAAATATAATAAAAAGTTAAAATTATTTTTTAAAACAAAAAAATATAACAAAATTAATTAATAAACCTAAAAAAAATTCGAAACACACACATTCAAAATTAAAAAAGAAAAAAAAGTAGATTTTGGAAACTGTAAAAGACTTAAATGGATTTCAAGATTCGATGCAGACTTAACCGGCTTTCTGTCAGAAGAATATATTTAGAAAACATTGGAATTACATAAAGAAAGTATTTTAGAAATTTAGAAAAAGTTGGAATTACATAAAGAAAGGTGTGAGGTAGAGGGAGAACGAGTCTTGAATTAATAGTCTGTAAATCTGAAATTGTGATAAGAAACAGATATATGAGAACAGGTACTGCACTTTATCCAAAAGGGTAATGAGATATTCAAACTTAACAATGATAATGGAACAATAATTAATATGTTTTGGTTACCTGCCACCTTCCAAATTCTGTTTCTCTCCTCCCCGGTTTACATTTCCCTGAAAAAGGTCAGGTGATTACTGAGTAAAAATAAACAATGGGCTCCACATCGATCATGTGTGTCTCATTAATTTGAGGTTGTTCTATATATTGATACAGAATACCCTGTAACGACCATCTTTGCGCTTGGGGCA


Gene Sequence:
>Vu_23661(-)
ATGACGCAGCTAGTGAGGTTCTAACCGAGGCGCGTCTATTGCTGGTTGAAAACTATTTCCAAACCCCCTCTTAGGCCTGGGCTTGTCTTGGGCCTTTGAGAATTTCTGGAAGGGCTCCCTCTGGGATAAAGTCCTGTAAGCTTAGTGAAAAGTAATTTTCATGTTGGAGAATCAATTTAAAATGTTGATGTGATGACCTTTGAAGGATATTTTGTAGTTTGTTCCATGTTAACTTATTGCATGAATTCCTTCTAAGAGAATTAAACATTTTAATTTTGTATTAAAACAGAAGAAAACTCACTTTTCCTGTTCTTAAGAAATTAATCACGAATTTTATAAATAAGTTCATACATAAATTATTTTAGCTTACATAAAATTTAGATTTTATTTATTTTTTGTTTCTTTTAAGTGTCTATCCAGAATTCTCCAATCGGGTCTATATAGTTCAGTCGTATTGGTAAATGTATAAAAACAAATTAAAAATGGAAACAAATTAAAAAGCAAACATTTATTTACAATACCTGAGATGGTGCATTGGGAGGAGCTGGTGTTTTGATGGTATATACTGAAATTAGAGTTTAAAATTCAGGTGTAGAATTTGAAATAAAACGACTGAAAAGTAAGCTTTAGTCTCAACTGATGTGAATGTCAGCAATCTTGGTAAATACTGTCATGTCCCTGAAGTGCAGATGCAGCTAAAACAATACCACAAACAAACCATTCCCGTATATTTTTATTCATTTCACTATTTTTATACATTGCCACTACTGGTTGGGTCTTGATTTGGTGTTTTGTTAGCTTAAATTCCTCTCTAACCATTTTGTCAGATCTTCATCTCTTTGCACCAAGAGGAACACCCCTCACGCTGCCAAAGGTGATTCCTCCACACAGCCTCCTAAGCCTTCACGTTTTCCCTACACCAGTCTTGGTTTTTCCAAGTGTTCCACATTGACAAAATGGAGAGTGGGGACCGTAAGAGCAAGACAATCTTATGTGTTACTTCTTCTTGATCTCACTCTTTTTTCAGATCATTCCTTTTGTTCCTCCACTTTCAGGAATCAGGAGGAATGGAGAAAAAAATTGTGATGCAAAAGTACGAGATTGGACGCTTCCTTGGACAAGGCAATTTCGCCAAAGTTTACCATGCAAGGAACTTGAAGACAGGCCAGAGCGTGGCCGTGAAAGTTATCAATAAAGAGATGATGATGATGAAGGAGGGTATGAAGGATCAAATCAAGCGCGAAATCTCAGTGATGCGCCTTGTGAGGCACCCCAACATCGTGCAGCTGTACGAGGTCATGGCAACCAAGACAAAGATATATTTTGCAATGGAATTGGTGAAAGGTGGCGAACTTTTTCATAAAGTGTCCCGAGGAAGGTTGAAGGAGGATGTAGCAAGAAAATATTTTCAGCAGCTGATTGATGCTGTTGATTACTGCCACAGCTTAGGGGTGTGTCATCGTGATCTCAAGCCAGAGAATCTTCTTCTTGATGAAAATGGGGATCTCAAAATTACGGATTTTGGTTTGAGCGCATTGGTTGAATCCAAAAAGAAGGATGGCCTTCTTCACACAATATGTGGAACTCCAGCCTATGTTGCTCCTGAGGTTATAAAGAATAAAGGATATGATGGAGCCAAGACAGATATATGGTCTTGTGGAGTGATTCTCTATGTTCTTTTGGCAGGTTTTGCTCCTTTCAACGACAGGAATTTGATGGAGATGTATAAGAAGATTATCAAAGCAGATTGCCAATTCCCAAAATGGTTCTCTATAGATGTGAAAAGACTTATTTATAGGATCCTTGATCCCAATCCAACGAGTAGAATTAGTGTTGCTAAGATTGTGCAAAGTCGTTGGTTTAGAAAGGGGTACGTGCAGACTGTAGAATATCAGCTGCCACCTTTGTTCCCCAGAAATGGAGATGATATCTTGGATGTTCAGGTTGTATTTGATTCATCAGATTCAGATGGCAGTCCAATGTCAACAAAAAAAGAAAGCCCCTTGAAGCTATATCAATTCAATGCATTTGATTTGATATCACTCTCATCAGGTCTTGATCTTTCTGGTTTGTTTGAAAATGATCAGAATGAAAGACAACTGACGAGATTTACTACCAGAGAAAGACCTTCTACTGTTGTATCAATGCTTGAAGAGATAGCACAGATAGATGATAAATTTAAAGTCTTGAAGAAAGATGGGATTGTTAGATTGGAGGGATGCAAATCAGGAATAAAAGGCCAACTCATCCTACATGCAGAAATTTTTGAAGTTACATCTTCCTTGCATGTTGTTGAGGTGACAAAAGTAGCTGGAAACACATTGGAATATTCAAAATTCAGGGAACAGTACCTCAAACCTTCTTTGAAAGAAATTATTTAA