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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23659 LG5 67470654 67472520 PREDICTED: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 67470721 5_prime_UTR_variant
T/C 67470787 5_prime_UTR_variant
C/G 67470852 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/A 67471839 synonymous_variant p.Val310Val
A/G 67472088 synonymous_variant p.Lys393Lys
G/T 67472212 missense_variant p.Asp435Tyr
T/A 67472292 synonymous_variant p.Thr461Thr
T/A 67472336 missense_variant p.Leu476His
T/G 67472340 synonymous_variant p.Ser477Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23659.1
MAAATPTSHHKREPSNLLLGRFEIGKLLGHGTFAKVYYARNLKTGEGVAIKVIDKEKILKGGLVAHIKREISILRRVRHPNIVQLFEVMATKSKIYFVMEYVRGGELFNKVAKGRLKEEVARKYFQQLISAVGFCHARGVYHRDLKPENLLLDENGNLKVSDFGLSAVSDQIRQDGLFHTFCGTPAYVAPEVLARKGYDGAKVDLWSCGVVLFVLMAGYLPFHDQNVMAMYKKIYRGEFRCPRWFSPDLSRLLTRLLDTKPETRIAIPDIMENKWFKKGFKQIKFYVEDDRLCNVDDDVLLDNDDDVASVASFSDYSISESDSEVEVRRKNAPLPRPPSLNAFDIISFSPGFDLSGLFEEKEDETRFVTAAPVNRIISKLEEIAQLVRFTVRKKDCRVSLEGTREGVKGPLTIAAEIFELTPSLVVVEVKKKGGDRAEYERFCNNELKPGLQNLMVEESSTSSGLSTPQPSLLRGLSESVSDISSEIGSPCYMPSV*


CDS Sequence:
>Vu_23659.1
ATGGCCGCCGCCACCCCCACGAGCCATCACAAGAGGGAGCCATCGAACCTTCTATTGGGTCGTTTCGAGATTGGGAAACTCCTTGGACATGGAACCTTCGCAAAGGTCTACTACGCGCGGAACCTCAAAACCGGCGAAGGCGTGGCCATCAAGGTAATCGACAAGGAGAAGATTCTGAAGGGAGGTTTGGTGGCACATATAAAGCGCGAGATCTCCATCCTCCGCCGCGTGCGCCACCCCAACATTGTCCAACTCTTCGAAGTAATGGCCACCAAGAGCAAGATCTATTTCGTAATGGAATACGTTCGCGGGGGCGAGCTTTTCAACAAGGTCGCGAAAGGAAGGCTCAAAGAAGAGGTTGCCAGGAAGTACTTTCAGCAGTTAATCTCCGCGGTGGGGTTCTGCCACGCCAGAGGGGTGTACCATAGAGATCTCAAACCTGAAAATCTCTTGCTTGATGAGAATGGTAATCTTAAGGTCTCGGATTTCGGGTTGAGTGCGGTTTCTGATCAAATCCGACAGGATGGGTTGTTCCATACTTTTTGTGGGACACCTGCGTATGTTGCTCCCGAAGTCTTGGCGAGGAAAGGATACGATGGTGCCAAGGTGGATCTCTGGTCTTGTGGGGTCGTGTTGTTTGTGTTGATGGCGGGGTATTTACCCTTCCACGACCAGAATGTTATGGCAATGTATAAGAAGATTTACAGAGGGGAGTTTCGGTGTCCCAGGTGGTTTTCTCCTGATTTGTCCAGGCTTCTCACGAGGCTTCTTGACACCAAGCCCGAAACCCGGATTGCGATTCCCGATATTATGGAGAACAAGTGGTTCAAGAAAGGGTTCAAGCAGATCAAGTTTTATGTTGAGGATGACAGGCTTTGCAATGTGGATGATGACGTGCTTTTGGACAATGATGACGATGTTGCTTCTGTTGCTTCTTTTTCGGATTACTCGATTTCGGAGTCTGATTCCGAGGTTGAAGTTAGGAGAAAGAATGCTCCTTTGCCTAGACCACCTAGTTTGAATGCTTTCGACATTATATCGTTTTCCCCTGGGTTTGATCTCTCTGGGTTGTTTGAGGAGAAGGAAGATGAAACCAGGTTCGTGACTGCTGCACCAGTTAACAGGATTATTTCCAAGTTGGAGGAGATTGCTCAGTTGGTGAGGTTTACAGTGAGGAAAAAGGATTGCAGGGTGAGTTTGGAGGGTACCCGAGAGGGGGTGAAAGGGCCTTTGACCATTGCTGCTGAGATTTTTGAGTTGACACCTAGTTTGGTTGTGGTGGAGGTGAAGAAAAAGGGAGGGGATAGAGCTGAATATGAGAGGTTTTGTAACAATGAATTGAAGCCAGGACTGCAGAATTTGATGGTGGAGGAGTCTTCAACTTCTTCAGGATTGTCTACACCTCAACCTTCCTTGCTACGTGGACTTTCTGAATCTGTTTCGGATATTTCTTCTGAAATCGGAAGCCCATGCTATATGCCTTCCGTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_23659::LG5:67468654-67470654(+)
GAAACTACCACCCACTAAGTCTCGGTTTCTTTTCATGGAATTCTGGTCCAACACAAAACATAAATAACAACGAAACCCATGTTCTATAATAAGATTAATCCCAGAACATGGCATGTAACAAAATTCATATGTTACGTGTGTTTGTTAAATGATCATAGTAGGCTAATAACACCAACAGACGAAAACAAGTGCAACTTTTTAGAAAAATTAAAAAGATATTATAAATAAATTGTGTCACGATAATATATAATTTTATTGTAAAATAGTCATATTAAAATAACACGATATTAATTCAAAATATTTTTAAAATTAAAATCGTGTTAAAATTTAACTAAAACATTCTTAACTGAAAGAGTGTTATCTTGATATAATTATTATTTTTATCAAAATTAAATTAAAATAATATTATTTTTTATATAATTTTAGTTTAAAAATTTATACATTTAAAAATATTACACAGTTTACTCATAGTTATAATTTTCTAAAATTTATCAATTTCTTTCGCTAATTTAAAAAGAATGCAGCATAGTGTTTTCGCGAATCATACAGTAAAATTCAATATAACAAATTTAATACTTGTTAAACTCTTACAAGTAATTTATAATATTTTATATAGTACTATTTTAATTATTATCCATATCCTTTAATAGTATAAATACGATTATTATTTATGTTATCTTTGAATTGAAAATTTGCAACCGACTTGAATTGGTTAGCAATACATGATACGAAATTACAGGTGAGCAGTGACAGATACACGTGTTGGTGAAAAGGTGGCTGCACTAGCAGCCACCACTACATGTGTGAGTGCCAATGAAGAGGGAAAAGTAAGTACCCATAAGCTTGGAAGACCACAAAAACACATGTTGAGACCTAAAAGTCCAATAAATCTTCATTTTTCTCAATAAAAAATAATAATCATTTTAATCGACAGACCAAACTCAAATTATATAAACCAATTTATTAATAATTAATTAATAATAACACAAAATTTCATAATAATTAATTAATTAATTAATAATTATACGATAACACAAAATAATAATATATCATATATGTATACAATTACATATATCTTAAAGGTTGCTTTTATAAAATAAAATAGTATAATTGTTTAACTTAATTTGACTTTTGAATCTTCCATTTAGAAATTGGAGTAGAGGTAAGTTGAATCGAAATGTTTACTTTGTTTTAAATATATTTATTAAAATATGCTTAGCGAGAACTTTTTAAAAATACATATACCAAGAGTAATAATTTTATTTATTAGTCATTGGTTATTAATGTTATTATGATATTAAAATGTTATTAGTGAAATAATTATATATATATATATATATATATATATAATTATTGTAGTCTCTATCTAGTAAATATAAGTTTTGTATATATAAGTTATTCATAGAATATTTTTTTTTTTTTTGCTAATATAATTTAAAGAGTCTGGGGTTCTACGTGGTATTGCAATATCAAAATTTAAAATAAAAATTGAATCAACCCAATTTTAATTTTTTTAAAATTAAACTTATAAACTTATGGAATTAACGTCCATTTCTAATTTGTCACAAATAACTATTATAAAAATAAGTTTGAAATAAATTTTTTAATAATTATGTGATTACCTTTTTAAATCAAATTTAATAATACAAATGTTTATTTAATTTAAAAAACATAACAATAGAACCATAAAAATGCTTCAATCTTTCACTTTTTTCCTTTGACTAAAAACACAAAAACCCTAATTGGTGTAAGTTTTGGTAGTTCAGGATATTGTGGCACCGGAAAAGGTGTTCAATTTTGCTGGTTCGATTTTTGTGGCACAACAATTGGCTAATGTGAAATAAAACAATAAGAAAAGCGAAAGTATTAGCAGTACAAATTGCAAAAGCAAATAAATAAATAAAAAGGAAAAGATAAAAAAGCAAAAGAAAAATAGAAACGAATTAATGGTGGTATATACTCTTCCTTATATAAGCATCTCTCTCTCGTTCATTCCCTCA


Gene Sequence:
>Vu_23659(+)
ACCTGTTGTTTGAATTTGAACCAAATACGATAAATTTATTTACACACATCATCACACTCTCTCTCTCACACATAGGAAACCTCAAACAAATCAAAACCACAACCTTGTTCCTTCCTCCATCCGTTCACTCTTTTCAACAACCTTCAATACAGGCCAATCCAGACACCAATCACCACCAACCACCTTCATTATTCTCTTCCTTCAACCAAAACAAAACAAAACTTTAGCCTCCAAATTTCAAATCCAAGGGCCATCCATGGCCGCCGCCACCCCCACGAGCCATCACAAGAGGGAGCCATCGAACCTTCTATTGGGTCGTTTCGAGATTGGGAAACTCCTTGGACATGGAACCTTCGCAAAGGTCTACTACGCGCGGAACCTCAAAACCGGCGAAGGCGTGGCCATCAAGGTAATCGACAAGGAGAAGATTCTGAAGGGAGGTTTGGTGGCACATATAAAGCGCGAGATCTCCATCCTCCGCCGCGTGCGCCACCCCAACATTGTCCAACTCTTCGAAGTAATGGCCACCAAGAGCAAGATCTATTTCGTAATGGAATACGTTCGCGGGGGCGAGCTTTTCAACAAGGTCGCGAAAGGAAGGCTCAAAGAAGAGGTTGCCAGGAAGTACTTTCAGCAGTTAATCTCCGCGGTGGGGTTCTGCCACGCCAGAGGGGTGTACCATAGAGATCTCAAACCTGAAAATCTCTTGCTTGATGAGAATGGTAATCTTAAGGTCTCGGATTTCGGGTTGAGTGCGGTTTCTGATCAAATCCGACAGGATGGGTTGTTCCATACTTTTTGTGGGACACCTGCGTATGTTGCTCCCGAAGTCTTGGCGAGGAAAGGATACGATGGTGCCAAGGTGGATCTCTGGTCTTGTGGGGTCGTGTTGTTTGTGTTGATGGCGGGGTATTTACCCTTCCACGACCAGAATGTTATGGCAATGTATAAGAAGATTTACAGAGGGGAGTTTCGGTGTCCCAGGTGGTTTTCTCCTGATTTGTCCAGGCTTCTCACGAGGCTTCTTGACACCAAGCCCGAAACCCGGATTGCGATTCCCGATATTATGGAGAACAAGTGGTTCAAGAAAGGGTTCAAGCAGATCAAGTTTTATGTTGAGGATGACAGGCTTTGCAATGTGGATGATGACGTGCTTTTGGACAATGATGACGATGTTGCTTCTGTTGCTTCTTTTTCGGATTACTCGATTTCGGAGTCTGATTCCGAGGTTGAAGTTAGGAGAAAGAATGCTCCTTTGCCTAGACCACCTAGTTTGAATGCTTTCGACATTATATCGTTTTCCCCTGGGTTTGATCTCTCTGGGTTGTTTGAGGAGAAGGAAGATGAAACCAGGTTCGTGACTGCTGCACCAGTTAACAGGATTATTTCCAAGTTGGAGGAGATTGCTCAGTTGGTGAGGTTTACAGTGAGGAAAAAGGATTGCAGGGTGAGTTTGGAGGGTACCCGAGAGGGGGTGAAAGGGCCTTTGACCATTGCTGCTGAGATTTTTGAGTTGACACCTAGTTTGGTTGTGGTGGAGGTGAAGAAAAAGGGAGGGGATAGAGCTGAATATGAGAGGTTTTGTAACAATGAATTGAAGCCAGGACTGCAGAATTTGATGGTGGAGGAGTCTTCAACTTCTTCAGGATTGTCTACACCTCAACCTTCCTTGCTACGTGGACTTTCTGAATCTGTTTCGGATATTTCTTCTGAAATCGGAAGCCCATGCTATATGCCTTCCGTTTAGTGAGGTAGAGAAGAGAAAAGGGTAAAACTAAAACCTTCTCTCCGTCTCTCACTTTCTCTTTTGCTTTATTTATTTTTTTATAGATTGTGTATGAAAATCGGTAAAAAATTTTGCCCACAG

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