Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23655 LG5 67440506 67445252 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g45780 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   homeostasis of number of meristem cells, protein phosphorylation, protein phosphorylation, anther development, protein phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation, homeostasis of number of meristem cells, anther development, protein phosphorylation, anther development, protein phosphorylation, anther development, phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   coreceptor activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 67440530 3_prime_UTR_variant
T/C 67440608 3_prime_UTR_variant
G/A 67440664 3_prime_UTR_variant
C/A 67440671 3_prime_UTR_variant
A/T 67440697 3_prime_UTR_variant
C/G 67440698 3_prime_UTR_variant
A/C 67440776 3_prime_UTR_variant
C/A 67440777 3_prime_UTR_variant
G/T 67440783 3_prime_UTR_variant
A/T 67441413 stop_gained p.Leu490*
C/T 67441655 synonymous_variant p.Leu409Leu
C/A 67441686 missense_variant p.Arg399Leu
G/A 67441687 missense_variant p.Arg399Cys
T/C 67441831 intron_variant
G/A 67442338 missense_variant p.Ser299Leu
T/A 67442424 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/A 67442431 downstream_gene_variant
T/A 67442432 downstream_gene_variant
C/A 67442433 downstream_gene_variant
G/A 67442450 downstream_gene_variant
C/G 67442453 downstream_gene_variant
A/T 67442462 downstream_gene_variant
A/C 67442463 downstream_gene_variant
C/A 67442556 synonymous_variant p.Leu266Leu
A/G 67442712 downstream_gene_variant
A/G 67442972 downstream_gene_variant
T/A 67442976 downstream_gene_variant
G/A 67442996 downstream_gene_variant
T/C 67443609 downstream_gene_variant
A/T 67443664 downstream_gene_variant
C/T 67444068 downstream_gene_variant
T/A 67444177 downstream_gene_variant
A/C 67444179 downstream_gene_variant
G/C 67444183 downstream_gene_variant
T/A 67444184 downstream_gene_variant
G/T 67444277 downstream_gene_variant
C/A 67444340 downstream_gene_variant
T/C 67444341 downstream_gene_variant
C/G 67444447 synonymous_variant p.Thr92Thr
T/A,* 67444745 missense_variant p.Asp50Val
T/C 67444811 downstream_gene_variant
G/A 67445153 5_prime_UTR_variant
A/G 67445231 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23655.1
MEDVKVLACLASLFLCYWVLLVEGTDSLLSPKGVNYEVAALMSMKSKMYDEFHVMHDWDINSVDPCTWYMVGCSAEGYVISLEMASAGLSGTISSGIGNLSHLHTLLLQNNKLSGPIPTEIGKLLELQTLDLSGNQLDGEIPNSLGFLTQLSYLRLNKNKLSGQIPQLVANLTDLSFLDLSFNNLSGPTPQILAKGYSISGNNFLCTSSSQICMGFSKPVNDTGSSQSTGGHHQRVLAVVIGFSCTFVISVVLLVFWLHWYRSNILYTSYVEQDCEFDIGHLKRFSFRELQIATGSFNSKNILGQGGFGVVYKGCLANKMLVAVKRLKDPNYTGEVQFQTEVEMIGLAVHRNLLRLYGFCMTPDERLLVYPYMPNGSVADRLRETCREKPSLDWNRRMRVALGTARGLLYLHEQCNPKIIHRDVKAANILLDESFEAVVGDFGLAKLLDQRDSHVTTAVRGTVGHIAPEYLSTGQSSEKTDVFGFGILLLELITGHKALDAGNAQVQKGMILDWVRTLYEEKRVEVLVDRDLRGCFDPVELEKAVDLSLQCTQSLPTLRPKMSEVLKILEGLVGQSMRAEESQGVTNLYGERTCSFSQNYSDVHEEPSFIIEAIELSGPR*


CDS Sequence:
>Vu_23655.1
ATGGAAGATGTCAAAGTGCTTGCTTGTCTAGCTTCCCTCTTTCTGTGTTATTGGGTGCTTCTTGTAGAGGGCACTGATAGCCTTCTCTCTCCAAAGGGTGTCAACTATGAAGTGGCTGCTTTGATGTCCATGAAGAGTAAGATGTATGACGAGTTTCATGTTATGCATGATTGGGATATTAATTCAGTTGACCCCTGCACTTGGTACATGGTTGGTTGCTCCGCCGAGGGTTATGTCATTTCCCTGGAAATGGCCAGTGCGGGTTTATCCGGGACGATTTCCTCAGGAATTGGAAATTTGAGCCACCTTCATACATTGTTATTGCAGAACAATAAGTTATCAGGTCCTATTCCGACTGAGATAGGAAAGCTTTTAGAGCTTCAAACCCTTGACCTTTCTGGTAACCAGCTAGATGGAGAAATTCCTAATTCATTGGGCTTTTTGACTCAACTTAGTTACCTGCGGCTCAACAAAAATAAACTATCTGGACAGATCCCTCAGCTTGTTGCTAATCTCACAGACCTTTCATTCTTGGACTTGTCATTCAATAATCTCAGTGGTCCCACTCCACAAATTTTAGCGAAAGGTTATAGTATTTCAGGGAACAACTTCCTCTGCACCTCTTCTTCTCAAATTTGTATGGGCTTCTCAAAACCAGTTAATGATACAGGATCATCTCAGTCGACTGGTGGTCATCACCAAAGGGTGCTTGCTGTTGTTATTGGCTTCAGTTGCACATTTGTAATTTCAGTGGTGCTTCTTGTATTTTGGTTGCATTGGTACAGATCAAACATTCTGTACACATCTTATGTGGAGCAAGATTGTGAATTTGATATTGGCCATCTGAAGAGGTTCTCCTTCCGTGAATTGCAAATTGCTACTGGAAGTTTCAATTCAAAAAACATCCTAGGGCAAGGCGGTTTTGGTGTTGTCTACAAAGGATGCCTTGCGAATAAAATGTTAGTGGCAGTAAAGAGGTTGAAAGATCCCAACTATACTGGAGAAGTACAGTTTCAAACAGAAGTTGAGATGATTGGCTTGGCAGTGCATCGAAACCTCTTGCGCCTTTATGGATTCTGTATGACACCGGATGAAAGGTTACTTGTTTATCCTTACATGCCCAATGGCAGTGTTGCTGATCGCTTGAGAGAGACTTGCCGTGAAAAGCCATCATTGGACTGGAACAGGCGAATGCGCGTTGCTCTTGGGACAGCACGCGGGCTTCTGTACTTGCATGAACAATGCAATCCAAAAATAATCCACAGGGATGTTAAGGCTGCAAACATTTTATTAGATGAAAGTTTTGAAGCTGTGGTGGGGGATTTTGGTCTTGCTAAGCTCTTAGATCAAAGGGATTCACATGTAACCACTGCAGTACGAGGGACAGTAGGTCACATTGCTCCAGAATATCTCTCCACTGGACAGTCATCTGAAAAAACAGATGTTTTTGGATTTGGCATATTACTTTTGGAGCTCATAACAGGACATAAGGCACTTGATGCGGGAAATGCTCAGGTCCAAAAGGGAATGATTCTTGATTGGGTTAGAACCTTATATGAGGAGAAACGGGTGGAAGTGTTAGTGGATAGGGATCTGAGGGGATGTTTTGATCCTGTAGAGTTGGAGAAAGCAGTGGATTTGTCTCTACAGTGTACTCAGTCACTTCCCACTTTGCGGCCAAAGATGTCAGAAGTTCTGAAGATTCTAGAAGGTCTGGTGGGACAGTCAATGCGGGCAGAGGAGTCACAAGGGGTGACTAACCTGTACGGTGAAAGGACTTGCAGTTTCTCACAAAATTACAGTGATGTTCACGAAGAACCTTCCTTTATTATCGAAGCCATTGAGCTCTCTGGACCTCGCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23655::LG5:67445252-67447252(-)
TTGTTTAAATTACCATCTTTTTTTACCTGGCCAGTGTAGTCTCAAGCTGAACCTGGACTGAGATTTGGGGTGCAGGATGGCTGCATTTGATCTATCCACATATGTATACACCTTTTGATTCTCTTTGGCCACTGTTGGATCTTATTTTCTGAGGCAAGTAGCCTTGTTTATTGTAAACTTCTGTATGTGTAGTAGTAGTATACTTGGCCTGAAATGGTCAGAACTTAGAATACTTATGTAAGGAGAAAACTAAAGTCTTGGCTGGAAGGAGGGAAGGGAAGGTCCACATGGGTTTTTGGGTTGCTGGGTTTAATTTATTTTCCTCCTTGTTAATGTAATGTGCTTTTTATAAATGCTGTTGACCAGTTTCTTTCTTTGTGAAATGTAATGTTGCTATCTGTCTGTTTTCTTTTCTTTAATGCTGCTTTCTAATAATGTTTCACATTTCATTTTGTTTCTTGAGTTTTTTTAATTCTTAAGTTTTAGCTATTTGATACTACCAGTTGTCATAATTTTTTATCTTATTATATAATATATTTTAAAAATGTTTATAGACTTTGCGCTTCGACCAATGTTATCTACTTAGATGCTGCAAATCCATACCATGTTATTCCTTTTTCAAAGAGAAAATAATTTACTTATGGTAAAGTATTGTATACTGATATCTAATTATATGATAATATTGATTTTATAATAATTATTTGATGGAAGGATGGGATAAATTATTACATGCTGTTTGTCTTTTAATTCCTTATTTAAAGTTGAACAAAACAAGTTGCTAGCAGAGTTGTTTTTGAAGTGGTAACGACTAAGATTTTGCAGATGAATTTTCTTAAATATAAATGGTGAAAAATTGAATTGTATACTTTACAGTCCTCCTGGGGATTGGACTTAACACCAAGCATATTTGTTCATAACGATCACTTTTGAACACTGTTTGATATGCATAGAAGAATGAATTGTTCTTTTCCTAATCTCGATTGAAAAGTAATTCCATAAATGTTTTAGACTATCCAGTTGTAATTAAAATATGCAAAAATGAGATTTTAATGTAACAATAAACTAGATCTTCTGTAATTTTATAAAAAAAGAAATATACCAGTAACTTTTGTATTTTCAATCCAATGAACAAAAGTTCTCTAGTTATTTCGTTTTGTAATGACCATGGACTCTACTCTTAAAGATTATGTATATTAAAGAAGTTTAATTTATAACGAATTGAATTAAGTCTTTAAATTACCTTAAGTATAATAAAAATATTTTGAAATTTTGTTTATTATATAAATGACATTAAATTGAATTAGTTCACAAACATCTCTAATCATGGATTCTTAAGTAAATCAATTATAACAGTCTTAATTATTGATCTCATGAGACTTAGCTACTAGCATGTTTGGATTTCTATTCAAGGTATGCAGCTTATTAGAAGAGTAGCTAAAATTATCCCGCCCCTTCAAAGGTTTTAAACAAACCATATTAACCTTAAATTGATTGATTTTAGAATAAAGTGATACCCGACTTCATACCAAAACTGGATCAACCTTACTTCATACATAATAGTAGTTATAAACAGATGTATCTAGGATCTATCCAAAGGGTTAATATTGAAAGTACCATGATGCAAACAGTTAAAAAGTATGCTTATAATACCTGTTACTGACGTTCCACAGTCAAACCATTTGTACAAGTGTTCCTTCCTTGAGCTCCGAGACATGCAATTTCTAAACCATCGAAATACTAAAATACCATCTACCATCAAATTTCGCGCCTCCAGTTTCCACTAACATACGTTCGTTCACACTCCTCTTGATCATCAACACTTTCCACTACTTCCATCTTCACCGTTCGTTCATTCATCATCACAATCCTAAACAAAAAAATCTAAAGCTTTTAACCAAATAAAGAGTCAACGCATGGTGTCAGAACATGAAGTTCACGTGACTGTCTGCACAGGATCATAGCCTTGAAGCTAAACACTGTAGTTGTACCTCACAAACCAT


Gene Sequence:
>Vu_23655(-)
GCGACAATCACTGTCATATTCTCAAATCTCGAGTTGTCTTCTCTGTCCTCACCATCTTCGTTCATTTTAGTTCGTTTTTTCTTTCTCACTTTATTTTATCTTTTTTAAAAAAAAAATATGTAGGTTCTTTTCACTTTAGTTTCTCTCGGCAGCAAGCACGGAGAGATTTTCCAAAAGGGTTTGCTTGTTTTTATGCTCTTTTTTCTTTTCAGGAGCGTAGGAGCTAAGATCCTAATAGAAAAGTTGGAACTTCCCACTACCTGAATCAGTTGTTTTTTAATGGAAGATGTCAAAGTGCTTGCTTGTCTAGCTTCCCTCTTTCTGTGTTATTGGGTGCTTCTTGTAGAGGGCACTGATAGCCTTCTCTCTCCAAAGGGTGTCAACTATGAAGGTTTGTCATTTCTTCATTTTCCTAACTTCTCACATTTCTAACTTTGTTTCAGTGAGAGATTTTTGTTTGGTTGTTATCAGTGGCTGCTTTGATGTCCATGAAGAGTAAGATGTATGACGAGTTTCATGTTATGCATGATTGGGATATTAATTCAGTTGACCCCTGCACTTGGTACATGGTTGGTTGCTCCGCCGAGGGTTATGTCATTTCCCTGTAAGTCTTTTTGTCTTGCTTCCTTTCTTTTGGTTGTGACTAATGCAACAAATTATATATCTTTGAGTCACGGAAGAGAGGCCAACAATTCTTATTTTTGAAGAGTTACTTGTGGCATTCTTTCTCAAGCGAGGATATTGATAATTGGGAATAATTTGATGGTGTTGGCAGGGAAATGGCCAGTGCGGGTTTATCCGGGACGATTTCCTCAGGAATTGGAAATTTGAGCCACCTTCATACATTGTGAGTTGCAACTTGAATGGTCGATACTTGTTTATTCGAATGTGCACTCTTGCTTAGTTCACTTAGCTGGTAATGATATTGATGCATATTTTGGCATATAGGATGTAAAATGTGTTATTTGAGTCCTCCCCTTTGATCACTTTGGGTCAATCCAATGTCTGTGAACAAAGTCCATTTTCTATTTTTGGAAACAGAGTCTTTTTAAGCTGTTATTTGCATTGACCTATTAGGCTGGTAGCTAGTGCCATAATAGGGGTTCTTGGGTTAGATAGAAAAGTTAAGCTTTAGGTAAGGAATGTGCTGGGTGGGACTGGTCGAGCCAGACTGTGAGTTACAAGATAGACAACGTGATAGTGGGTAAAATATCTTGTTTAGTTTCTCTTGTTGTTAACAACTTACCATGTTAATTTTCTCGTTGTGATTTTCTTTTCCATACTTTCATTTTTATTTGATATTGTATATGCAAGGAGAAATGTTTTTCATCAAAAACTAAAATAGACATTCATTTATATTATCGAGCTTTGCTTATCACTTTGTTTTCCCATTGCATTATCTTAGGTTATTGCAGAACAATAAGTTATCAGGTCCTATTCCGACTGAGATAGGAAAGCTTTTAGAGCTTCAAACCCTTGACCTTTCTGGTAACCAGCTAGATGGAGAAATTCCTAATTCATTGGGCTTTTTGACTCAACTTAGTTACCTGTGAGTGTGGTCTGACAAATAAATTTATAGTTTATGATATTCTTGTTTCTTATTTGGCTAATTCAATAGCCTTTCTCTAATTGATTACTTCCTAATTTATTCACGCAAAGTATTTCAGGCGGCTCAACAAAAATAAACTATCTGGACAGATCCCTCAGCTTGTTGCTAATCTCACAGACCTTTCATTCTTGTATGCTCTGTATCACGATTTTGTTGTATTTTTACGTCTTAGATCCTCAAAAGCGAAAATGTTCATTTCATTATACTGTTCCTAATGCTGTAGGGACTTGTCATTCAATAATCTCAGTGGTCCCACTCCACAAATTTTAGCGAAAGGTTATAGGTGAGTTTTCTAATGCTGTATTATTTTCCCCGTCTGTTATTCTTAAGGAAACACTTAAAAATGCTTGTACTAGCTGCACGTTCAGTCGTTCCTTACCAAATTTTGCAATGGTTTAGTCAGCTAATACATTAAACATTACTTAACAAAGTCCCGTTTGAGGAGTATTTAATCAATTTATTGTTAGGGAAAGAGAATCTCTGCTTAATTGAAATAAAAACCCGAGATTATAATATAGCCAGACGGATTAACTTTTGTGTTCAGCATATGATGTTTTTGTTTTTAAATTTTGATGGAAACTGGGTTGATACATCAATGTTTTGGAACCCCACAGATGTTAACTCCGTAGTGGTTACTAAAATCAAATCAAACAATTTCAAATTACTCATGATATGCTAAGCAAAAAACTGATGCCACAGCTATAGACTGTTGAGGATTATGGTTATTACCATGTTAAAAATAATTATTGGCTTAACTTTTTTTTTCGTTCTTCGAAATATTTAACCTTCTTGTTTATTGCAGTATTTCAGGGAACAACTTCCTCTGCACCTCTTCTTCTCAAATTTGTATGGGCTTCTCAAAACCAGTTAATGGTAATGTAAATTTAACATGTATATATCAAAACCCTAGTAATCAGTAAATCGAAGTACATATAAGGGATGATTCAACTGCAGATACAGGATCATCTCAGTCGACTGGTGGTCATCACCAAAGGGTGCTTGCTGTTGTTATTGGCTTCAGTTGCACATTTGTAATTTCAGTGGTGCTTCTTGTATTTTGGTTGCATTGGTACAGATCAAACATTCTGTACACATCTTATGGTACTTCCTGACATGAACTTCCTACCTTTTTTCTTCACTCTGTAACACATTCTAACAATATGCAAATATTGCTCTCTGGTTTTTTCCTCGTTCTTGAACACGAACACTTGACATTTGAAGTGGAGCAAGATTGTGAATTTGATATTGGCCATCTGAAGAGGTTCTCCTTCCGTGAATTGCAAATTGCTACTGGAAGTTTCAATTCAAAAAACATCCTAGGGCAAGGCGGTTTTGGTGTTGTCTACAAAGGATGCCTTGCGAATAAAATGTTAGTGGCAGTAAAGAGGTTGAAAGATCCCAACTATACTGGAGAAGTACAGTTTCAAACAGAAGTTGAGATGATTGGCTTGGCAGTGCATCGAAACCTCTTGCGCCTTTATGGATTCTGTATGACACCGGATGAAAGGTTACTTGTTTATCCTTACATGCCCAATGGCAGTGTTGCTGATCGCTTGAGAGGTTTGTTTCATATTATTCATTTCTGTACTTAAAGCTGTGTAAAGTAATGTAACTGCTATTAACAGGCCTCTTACAGTGGAAATTAGGAGATTCAAATCAGTGACATGTAGTGATTCGTTACTCAGGGTGTCAGAAACTTGTGCTATTCTGTATATGTCCATTCATTCAATCATTTTCAAATGGCAGCGTATGATCTGTAATAACTAATAAAATGTTTACTTTCTGTATCAAGAAAAATCTTGTGATAGCACCATAATTCATGCAGCTTATTCCTTTAATACATTCTTTCATATATTAAATTCCAGTGGCTCTTGATTTTAATGAAGTTATCTTCTCCCTTGTCATCAAACAGAGACTTGCCGTGAAAAGCCATCATTGGACTGGAACAGGCGAATGCGCGTTGCTCTTGGGACAGCACGCGGGCTTCTGTACTTGCATGAACAATGCAATCCAAAAATAATCCACAGGGATGTTAAGGCTGCAAACATTTTATTAGATGAAAGTTTTGAAGCTGTGGTGGGGGATTTTGGTCTTGCTAAGCTCTTAGATCAAAGGGATTCACATGTAACCACTGCAGTACGAGGGACAGTAGGTCACATTGCTCCAGAATATCTCTCCACTGGACAGTCATCTGAAAAAACAGATGTTTTTGGATTTGGCATATTACTTTTGGAGCTCATAACAGGACATAAGGCACTTGATGCGGGAAATGCTCAGGTCCAAAAGGGAATGATTCTTGATTGGGTGAGTAGTTTCTTTAAATTATTTGTGAGCTCACTTTTTTACATCATATCTTTTTTGTCACTTTGGTATTTACATGATAATAAATATTCTAGAGTTTGCATTGATCATAAATATTGAGGAAGCTACCGAATTCCTGCAGGTTAGAACCTTATATGAGGAGAAACGGGTGGAAGTGTTAGTGGATAGGGATCTGAGGGGATGTTTTGATCCTGTAGAGTTGGAGAAAGCAGTGGATTTGTCTCTACAGTGTACTCAGTCACTTCCCACTTTGCGGCCAAAGATGTCAGAAGTTCTGAAGATTCTAGAAGGTCTGGTGGGACAGTCAATGCGGGCAGAGGAGTCACAAGGGGTGACTAACCTGTACGGTGAAAGGACTTGCAGTTTCTCACAAAATTACAGTGATGTTCACGAAGAACCTTCCTTTATTATCGAAGCCATTGAGCTCTCTGGACCTCGCTGACACCAGGTCTTGTCCTTTCATGTACATGTCTTTTTGCTTTTTATCAACACGGAAAACCCATAGGAATATATTGATTTCTCCCTCAGTTCCTTTTATCCTTAGGTTTTTTCAACGTTTAACTTAGTTCTAAATGATTATATTCCCCAGAATATTTAGGCATCTTTTCAGTCAATCTATAATTGTGACATTTCTCTAGTTCGTAATTTGTGAATCTGCCTTTAGGCAGTGAAGTTGTAAATAAAAAATCTTGAAAAGGGTTTATCCATGGAAAATGGTGAAAAATTATGATAGCATTTTGTTTGGGGCAGAATGAGAAGAAAATTATGCATAATTATTACCAACATTATGTATGTCAGTATTCAATCTTACATTCT