Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23586 LG5 66806207 66813523 PREDICTED: auxin response factor 6 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 66806765 5_prime_UTR_variant
C/T 66807110 intron_variant
C/T 66807135 intron_variant
T/A 66807411 intron_variant
T/G 66807415 intron_variant
G/A 66807453 intron_variant
G/T 66807784 intron_variant
C/G 66808608 intron_variant
G/T 66809370 missense_variant p.Lys218Asn
A/G 66809453 missense_variant p.His246Arg
C/A 66809454 missense_variant p.His246Gln
C/G 66809461 missense_variant p.Leu249Val
G/A 66809662 synonymous_variant p.Val287Val
G/A 66809761 intron_variant
A/G 66810530 synonymous_variant p.Gln376Gln
C/T 66810603 intron_variant
T/A 66810615 intron_variant
A/T 66810616 intron_variant
A/C 66811068 synonymous_variant p.Ser502Ser
T/G 66811296 synonymous_variant p.Ser578Ser
A/T 66811315 missense_variant p.Asn585Tyr
T/C 66811575 synonymous_variant p.Ala671Ala
G/T 66811625 missense_variant p.Gly688Val
C/A 66811673 stop_gained p.Ser704*
A/C 66811674 synonymous_variant p.Ser704Ser
T/A 66812164 missense_variant p.Leu836His
T/A 66812968 3_prime_UTR_variant
A/T 66812971 3_prime_UTR_variant
G/A 66812995 3_prime_UTR_variant
C/T 66813342 3_prime_UTR_variant
A/G 66813390 3_prime_UTR_variant
A/C 66813392 3_prime_UTR_variant
C/G 66813430 3_prime_UTR_variant
C/G 66813434 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23586.1
MRLSSAGFSPPPQEGERRVLDSELWHACAGPLVSLPAVGSRVVYFPQGHSEQVAVSTNKEVDAHIPNYPSLPPQLICQLHNMTMHADAETDEVYAQMTLQPLNPQEQKEAYLPAELGTPSKQPTNYFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKVFPALDFSQQPPAQELIARDLHGNEWKFRHIFRGQPKRHLLTTGWSVFVSAKRLVAGDSVLFIWNEKNQLLLGIRRANRPQTVMPSSVLSSDSMHLGLLAAAAHAAATNSRFTIFYNPRASPSEFVIPLAKYVKAVYHTRVSVGMRFRMLFETEESSVRRYMGTITGISDLDSARWPNSHWRSVKVGWDESTAGERQPRVSLWEIEPLTTFPMYPSPFPLRLKRQWPPGLPSFHGMKDDDFGLNSSLLWLRDGDRGLQSPTFQGIGVNPWMQPRFDPSMLNMQTDMYQAAAAVQEMRALDPSKQHSASILQFQHQQQQNFPNRTAAFVQAQMSQQPQHQQIFGNNQENQHSPQSQLQTQAHLQQHLQHQHSFNSQHHHQHQQQLRQTQQQQQQQQVVDNQQISSAVSSMSQFVSAPPPQSPPMQAISSLCQQQNFSDSNGNSGPTIVSPLHSILGSFPQDETAHLLNLPRTSSWIPVQNSTGWPSKRVAVDPLLSAGVSQCVLPQVEQLGQPQSTVSQNAITLPPFPGRECSIDQEGSNDPQNHLLFGVNIDSSSLLMPNGMSTLKGVSSNNDSSTMPYQSSNYLTTATGTDSSLNHGITPSIGGESGYLQSPENAGQGNPLNKTFVKVYKSGSFGRSLDITKFSSYHELRSELAQMFGLEGELEDPVRSGWQLVFVDRENDVLLLGDGPWPEFVNSVWCIKILSPQEVQQMGNSGLELLNSVPIQRLSNGICDDYVSRQDPRNLSTGITAVGSLDY*


CDS Sequence:
>Vu_23586.1
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Promoter Sequence:
>Vu_23586::LG5:66804207-66806207(+)
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Gene Sequence:
>Vu_23586(+)
GCGTTGTGATTGATTGGAGTAGGGAGAGAGAAAGGAAAAGAGGAGGGTAAAGCTATAGTAGTAGCATGGCCACCAAGTTAGAAGTAGAGTAGTAGTAGTAGTATAGCTTGAACATGACCATGACCACAATCCGTAACCATAAAAATAAAGCACAAACACAACCACTGCTACTTCCCATTTTTTCATTACCGGAAATGAAACGAGCCTAACGCTGACTCTCCATTTTCTACTCCTCACCCAACCTTCTTACCTCTCTGTCTATCACTCTTCCCTTAAGCTCTTTCTCTTCTTGGATTCGCCGCTCTTTTTCTGAGATCTACGTCTTTTCGGCTTCTTCCTTTCTTCCCCTTCATCCCTCTCGTTGCTCTTTCAGATTGTTGCTAAATTTGGCACTCAGACCACACGTGCGTTTCCCAGAGACTCTGTTCTGTGTAATGAGGACTTATGTTCAGGATTGCAACCTGGGGTGTTCGGGGTTGAAGAGAACCGGAATCGAATGAGACGTAAAACAATCGTCTTTGGTTGTCACTCTGGTTTTGGTTGAGTGTGTAAGGGTGGGAATCTTGTGGGTAATTACTGGATTTTGTTGGGTTTTAAGAGGTGTTATAAACTGGGACAAAGATCACTCAGAATGTTATTCTGCAGTGGGAAGGAAGGAGGAGAGGACAAGGCTTGGTTTGTGGTGGAAGTTGTTATTTTGTGAGAATTCTGTTGCCTAATTGGTAGTGTTGTGATTGTGGACTCAATTTTGAATTTACTGATTTGCCTGAGACTTTTTTAGCTCAAATGAGACTTTCTTCAGCCGGTTTTAGTCCTCCTCCCCAGGAAGGTAACCACTTTCTTCCTCCTCTTCTTCTCGTCTTTCTCCTCTCCGTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCCAAATTTCATCTCTTCTTGGTTTTCACTTCTCAACTTTTCTGAAACTGGTTCTTGCAACCTTAAGTCCCTGGTGGATTAGAGTGTGTTTTTTGTGTTAATATGACTAGCCAAGCCAATGAAGTCTTTTGTATGTCTAACATGGCTGGTGCTAATGTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGATTTGAAAATTTAACTATTTGGGCTATGTTTTTCTCTTGTTTATTCACAGCTCAGAGATCAGAGAAAAAACGTAATTTGGTTTTTTGGGATTCGATTATTGGTATGAAGATCTTGGATTTGGCTTGAGTATGCCAAAATGAGTTTGTTGGTGTGGGCTCTTGATATTACTTCATGTTTGATGACATTGGGGTGGGTTTTGCAGGGGAAAGGCGAGTTCTAGATTCAGAACTTTGGCATGCATGTGCTGGTCCCCTTGTCTCTTTACCAGCAGTTGGTAGCCGCGTGGTATACTTTCCACAAGGTCACAGTGAACAAGTGAGTAAAATATATGATGTTTGATTATTGTATTGCTACTAGCCTTGTGGACATTGTGGTAACATTCTCTTACCGGTGTTGAGAATAAAGTAATAATGCGAATCTTGTGTTTCTGGGCATGAGGATGCTCTCTTGTCTCTTGTCTCTGTCTCCGTATTGCTTCTAATTTGGAGGATGGGGTGGGGTTTACTGTTACACTTTTGTTTAGCAAAACCTGTTTTTTCTTTCATTCTGGGGAACCATGTGTATATTTATGCTTAACTGGTGTTCCCAAGCTCAATTCTTTAGTCTTGAACTGTTGAAGGCTAATGAAGTAACTTCACTTACCTTCCAGAACCACCACATGAACCATCTCATTCAAAACTTTATCCTTTCTTTTCTGCATAAACTACGTGCACAAGTATATCCTAACTCTGCACTATTTTTGTTTGCTCAGGTGGCTGTGTCGACCAACAAGGAAGTGGATGCTCATATCCCAAACTACCCAAGCTTGCCTCCTCAACTCATTTGTCAACTTCATAACATGACTATGCATGTACGAATTGCTTGCTTGTTTTAGTGAGATGATTGGTTTGTTTTGGCCTTTGATTGCTTCAATTTTTACCTTGTTAGATCCTGCAGCCTCTTTGCCTTTATTATCTTTTTGTTTATTTGGGATTCAGGCTGATGCAGAGACTGACGAAGTGTATGCTCAGATGACCTTGCAACCTCTGAATCCTGTACATGACTCTGAAATCTCTATTGATAACTGGTTTTGGAGCTTTTAGAGTTGTGGTCATTCTTCAGCTTTTAACTATCTCTGTGTTTCAGCAAGAGCAAAAGGAGGCATACCTTCCAGCGGAATTGGGCACTCCTAGTAAACAGCCCACAAACTATTTCTGCAAAACTTTGACTGCAAGTGACACAAGCACCCATGGGGGATTCTCTGTACCACGCCGTGCAGCTGAAAAAGTGTTCCCTGCATTGGTAAGCCTTTGTGAAGAATAACATATTACGTGAAGTCAACCTATTTACTCGAATCTGGTAATTTTCTGGGTCTTATATTTAGTAGTTGTGATCTTGCAGGATTTTTCTCAGCAGCCTCCTGCTCAAGAATTAATTGCAAGGGATTTGCATGGTAATGAATGGAAATTCAGACATATCTTCCGCGGTGAGTTAAAAAGCACGGTTTCCGGCAACATAATTGCAAAAGTGTACTTTTCCTTTCAGTCCGAGACTTCTATATTCAGTTTTTGTGTACAATGTTTGAAGTTGGTTTTTATTTCTTTTCCTCTGTAGGCCAGCCCAAAAGGCATCTACTTACAACTGGGTGGAGTGTCTTTGTGAGTGCTAAAAGACTTGTTGCTGGTGATTCTGTGCTGTTTATCTGGCAAGTAATTTAATTGTTTCCTGCTCTCTAGAGACATGTGCTGCTATTTCTCTGAACAGCATTAATATTACTCTGCATCTTCACCTCGAAGTTTCTCATAAATTCAATCTTGACCTTTGGCTTTTTTGGCTCGTTGACTTTTACCCCCTGAACCAGGCCGTGTGACTTGCCTGTCATTTGGCCATTCTAAAGAACATATCATTATACTGAAAAGAAAAGTGAAAACATTTTCATTGACATGTGGGTCAGACTTTAAGATGTGTGGTTGCTTGTTATCTCTTATATCTGTTTACTTTATTAAGATAATGTGCGAGAAATGTTGACTTTGTTACTATTATATGATATGTTGTCTTGTGTAACATGCATTTTCTGGTATAGGAATGAAAAGAACCAGCTTCTACTTGGGATCCGTCGTGCTAATAGACCACAAACTGTGATGCCTTCATCAGTGTTGTCTAGTGATAGCATGCACTTGGGGCTTCTTGCTGCAGCAGCTCATGCAGCTGCAACAAATAGTCGGTTCACCATTTTCTATAATCCACGGTATAAGTTGTACACTTTTGCAGAACTTTAAAGTCATGGAAATGTTTGCTTTAATTGACTATTTTTTTTCTCCTTATAATTTCAGTGCTAGCCCATCAGAATTTGTCATACCCTTAGCGAAATATGTTAAAGCTGTGTATCATACTCGAGTTTCAGTTGGTATGAGGTTCAGGATGCTGTTTGAAACTGAGGAATCAAGTGTACGACGGTAGGTTTTTAGAACTTTCATTTCTTCGAGGAAGCATACGATCGGGGACCTGGATATTTTTAAGATTTATAATGACCTAAAGAATGATAATGATATTACAAAGATGAAGCATAAATATTAGATTTTTGACTTTCAAGTGTACTTGCTCTATACTTCAATTCATTAAAAAAATGTGAGGTCTTTTATAATGTGTGCAAAAACGTGCCTATGATGTGATGTTGTGTAACAGTATTTGTATCATATTTATCTTGGCTAGCCAAACATTGGCAAACGCTACTCTAAATTATAATGTTTACAATGAAATGAATGAGATGTGCGTTTCATTGTATGCTTGATCAAACCTCTGATCCTTAGTAAGGTTCTAATGAGTAAAGAATAAAAAAAACTTGAGTGTTTGGTTGAATAAATTTCTCATTGTCAGAAAAGATATGGCTAACCATTTAATAAAGTTTATAATACTTGTTTTTATTGTAATTATGTTTACTGTTGTATGTTTCTTGCGCAGATACATGGGTACAATAACTGGCATTAGTGACCTGGATTCTGCCAGGTGGCCAAACTCACACTGGCGCTCAGTTAAGGTTTGTGAAGAAATACTGTGCTTTTTCATTCCAGCTTTCTTATTATACTGGCCTACATCTTTCATCTCAAGTGTAAGGCTTTGAGTTGGATTGCAGGTTGGTTGGGATGAATCTACTGCTGGAGAGAGACAACCTAGAGTGTCTCTATGGGAAATTGAGCCATTAACTACGTTTCCTATGTATCCATCTCCATTCCCCCTTAGGCTTAAACGACAATGGCCTCCTGGACTTCCTTCATTCCATGGTGAGCTTCTTGCCCCTACCTGGGGAGGGGACTGAAATTCTCCACCTTTTTTTTTTTAAAATAAAATCCTAGCTAATTAATTTCATAGACTTTCGTTTATGTGTGGATGGAAACTCATTCTCCTTGCTCTCCCGATTTTTCTTGCTTAAAATGATGGCAGGCATGAAGGATGATGATTTTGGCCTGAATTCATCTCTCTTGTGGCTCCGAGATGGTGATAGGGGGCTTCAGTCTCCTACTTTTCAGGGAATTGGTGTTAATCCTTGGATGCAGCCTAGATTTGATCCCTCCATGTTGAATATGCAAACAGATATGTATCAAGCTGCTGCTGCTGTTCAGGAGATGAGGGCTTTGGATCCTTCCAAACAGCATTCTGCTTCCATACTTCAATTTCAACATCAACAACAGCAGAATTTCCCAAACAGGACAGCTGCTTTTGTGCAGGCCCAGATGTCGCAGCAGCCACAACATCAGCAGATTTTTGGAAATAATCAAGAGAATCAACATTCACCACAATCTCAGCTGCAAACTCAGGCTCATCTTCAGCAACATTTACAACATCAGCACTCATTCAATAGTCAGCATCATCATCAGCACCAGCAACAACTACGACAGACACAGCAGCAACAACAACAGCAACAAGTAGTA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