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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23537 LG5 66329325 66341193 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 58-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 66329732 3_prime_UTR_variant
T/G 66330001 missense_variant p.Thr474Pro
G/T 66330002 synonymous_variant p.Thr473Thr
C/T 66330316 missense_variant p.Ala369Thr
G/A 66330352 missense_variant p.His357Tyr
G/A 66330542 downstream_gene_variant
G/T 66331198 downstream_gene_variant
A/T 66331209 downstream_gene_variant
G/T 66331265 downstream_gene_variant
A/T,* 66331995 downstream_gene_variant
T/C 66332176 downstream_gene_variant
T/A 66332181 downstream_gene_variant
A/T 66332182 downstream_gene_variant
T/A 66332188 downstream_gene_variant
T/G 66332192 downstream_gene_variant
T/G 66332194 downstream_gene_variant
A/G 66332668 intron_variant
C/T 66332894 intron_variant
C/G 66332895 intron_variant
A/G 66332899 intron_variant
A/G 66332902 intron_variant
A/T 66332905 intron_variant
T/A 66332906 intron_variant
T/C 66332920 intron_variant
A/G 66332930 intron_variant
A/G 66333001 intron_variant
A/G 66333211 intron_variant
A/G 66333237 intron_variant
G/C 66333381 intron_variant
G/A 66333429 intron_variant
G/T 66333448 intron_variant
A/T 66333782 intron_variant
A/T 66333791 intron_variant
G/A 66334116 intron_variant
T/C 66334192 intron_variant
G/A 66334198 intron_variant
A/T 66334204 intron_variant
G/A 66334207 intron_variant
G/A 66334221 intron_variant
C/A 66334224 intron_variant
G/A 66334226 intron_variant
G/A 66334248 intron_variant
A/G 66334255 intron_variant
T/C 66334260 intron_variant
G/A 66334262 intron_variant
T/A 66334265 intron_variant
A/G 66334269 intron_variant
A/T 66334271 intron_variant
A/T 66334284 intron_variant
G/A 66334295 intron_variant
C/T 66334300 intron_variant
C/G 66334311 intron_variant
T/G 66334315 intron_variant
C/T 66334317 intron_variant
C/T 66334322 intron_variant
C/A,* 66334326 intron_variant
G/T 66334336 intron_variant
C/A 66334340 intron_variant
A/G 66334342 intron_variant
T/C 66335725 intron_variant
G/A 66335726 intron_variant
C/G 66335763 intron_variant
A/T 66335769 intron_variant
T/A 66335824 intron_variant
A/T 66335952 intron_variant
C/T 66336064 intron_variant
G/T 66336550 intron_variant
A/C 66336612 intron_variant
T/C 66337094 intron_variant
T/A 66337121 intron_variant
A/T 66337273 intron_variant
T/G 66337378 intron_variant
A/T 66337380 intron_variant
T/C 66337384 intron_variant
A/T 66337385 intron_variant
T/C 66337655 intron_variant
A/T 66337664 intron_variant
A/T 66337840 intron_variant
C/A,* 66338229 intron_variant
T/*,A 66338613 intron_variant
G/A 66338615 intron_variant
A/T 66338623 intron_variant
A/T 66338652 intron_variant
T/A 66339946 intron_variant
C/T 66340371 intron_variant
A/T 66340381 intron_variant
G/C 66340814 intron_variant
A/G 66341040 5_prime_UTR_variant
A/G 66341137 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23537.1
MEQYGRSSEGSRSDPSPEWAGPGAQTGLEEPMWQLGLGAAEESYPQRPDEADCTYYLRTGFCGFGSRCRYNHPRDRGTFVGAERTAGEYPERVGQPVCQYYMRTRTCKFGSSCKYHHPRLAGGSATPVSLNYYGYPLRPGEKECSYYVKTGQCKFGATCKFHHPVPAGVQIPAPSPVAPVSPLPVPVPSPLYSTMQPPPGPSSQQIGVLVARPPLLPGSLVQSPYGPVVLSPAMVPISGWGPYQASGTGAVLPSGTPNVGSAQLYGMTQLPSSAAAYPGPYQLPGSLVGPSSSNQKEQAFPERSNQPDYQYYPKTGEVKVGPSYRYHPPPEMTAPKANVTLSPGGLPLRPGASPCTHYAQHGVCKFGSACKFDHSMGSLSYSPSASSLADMPVAPYPVGSTIGTLAPSSSSSELRLELSSGSNKESVPSRMSSSSGMLTGSIGLTLSTGGPISQSNSQPSAPSLDPLATATSTTTSNVSHTSS*


CDS Sequence:
>Vu_23537.1
ATGGAGCAGTACGGCCGGTCCAGTGAAGGTTCGCGGTCTGATCCGTCCCCGGAATGGGCCGGGCCCGGAGCCCAAACCGGTCTTGAAGAGCCTATGTGGCAATTGGGGCTGGGTGCTGCGGAGGAATCGTATCCGCAACGCCCCGATGAGGCTGATTGCACTTACTACTTGAGGACCGGTTTCTGTGGCTTCGGTTCGCGGTGTCGGTACAATCACCCTCGTGACCGTGGCACGTTTGTTGGAGCTGAGAGGACTGCGGGGGAGTATCCGGAACGAGTTGGCCAACCTGTGTGCCAGTATTACATGAGGACTAGAACGTGCAAGTTTGGTTCGTCTTGCAAGTACCACCACCCGAGGCTAGCAGGAGGATCTGCTACCCCTGTGTCACTAAACTATTATGGATATCCATTGCGTCCGGGTGAAAAGGAGTGCTCATATTATGTGAAAACGGGACAATGCAAGTTTGGTGCGACTTGTAAATTCCATCATCCGGTTCCTGCTGGCGTCCAAATTCCAGCACCATCACCAGTTGCTCCAGTTTCGCCTTTGCCTGTACCAGTGCCTTCACCGTTATATTCAACCATGCAGCCCCCACCTGGTCCTTCATCACAGCAAATTGGTGTGCTGGTTGCAAGGCCTCCTCTGCTGCCTGGCTCATTAGTCCAGAGTCCCTATGGACCTGTGGTACTGTCACCTGCCATGGTACCTATTTCTGGCTGGGGTCCTTATCAAGCTTCTGGAACAGGTGCTGTACTTCCTTCCGGTACTCCTAATGTTGGTTCAGCACAGCTTTATGGGATGACACAACTGCCTTCATCAGCAGCTGCCTATCCTGGACCTTATCAACTTCCTGGTTCCTTAGTTGGTCCTTCAAGCAGTAATCAGAAGGAGCAGGCATTTCCAGAAAGGTCCAATCAACCAGATTATCAGTATTATCCGAAAACAGGGGAGGTTAAAGTTGGTCCATCCTATAGGTATCACCCTCCACCAGAAATGACTGCACCAAAAGCAAATGTGACTCTTAGTCCTGGTGGTCTTCCTTTGCGCCCGGGGGCATCACCTTGTACACATTATGCACAACATGGAGTATGTAAGTTTGGTTCTGCATGCAAATTCGATCATTCTATGGGATCACTGAGTTATAGTCCATCTGCTTCTTCCCTGGCTGACATGCCTGTTGCACCCTATCCTGTGGGTTCAACAATTGGTACCCTTGCTCCATCGTCATCGTCATCAGAGTTGCGGCTGGAACTTTCCTCTGGATCCAACAAAGAGTCTGTTCCATCCAGAATGTCTTCATCGTCCGGAATGTTGACAGGGTCAATAGGCTTGACTTTGTCAACTGGTGGGCCGATTTCTCAATCAAATAGTCAGCCATCTGCTCCAAGTCTGGATCCATTAGCCACTGCCACTAGTACCACCACTAGCAATGTCTCTCACACCTCAAGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23537::LG5:66341193-66343193(-)
TAAACTTTACAAAGTCTTAGTTTAATTTTGTAAAATGTTAAAATTTCCTATTTTATAAGTCCTTAAAGGTTTTATTTCAAAATAACAAAAGTAGTCCTGCAAATCAAAATATTAAACCTGCATTTTCAGATTTGATTGACCAATTCAGTCTGTCTTTGCAGATCGAATGTGAGATGAACTTAAATAGACCAGTTTAACCATATTGTAACTCCTAATTAACACTTAAGTATTGATCTAAACCACATTAAAACAAAACTGTTTTTGTTTGATTTTTATCTTATCTATTCTTTTGGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAAAATTGAATTCTATTTCTTTTTAGTATTGTATTATATGGTTGGAAATGAAAATCCTCTTTTATATTTTGGAACACCACACAATATGAAAGAAATAATAATGCAGAAAATTTAATAAATAATTATTTTTAAATTTTATTAAACATTATATTTTCTATGACTATATGATAAAAGAGTAAGTAACTATATTAAAGTTGTGTCTGTTGCAAGATACGGAAATAAAAGAGATGTGAAAATGTTACGTACGTGGGAATAATTTCAATACTGAAAAGATTGTCATCAATGCGATTTATTTTTTAATTTTCACCCCAAACTTGTAAAGATTTGTGAAAATAGGTCAAATTTTCACCATAATGATATAATCAATTTAAACATTTAAACAATTAATATTAAAATATCATATAAAATAAAATTAGTTCATTTAGAGTTTCATAATTTATTTTAATGTATTTTAACACGAGTTCACTTTTTTTTTAATTTAATTTATTTTATATTTAATTTAATTTAATTTTAAAATTTTGTACCGTTCATACCAATCAAAGCATTCATAAATTTAAAAAAAAATTATTCTAAAAATGAAAGTGTAAAGTAGAAAAAAAATTGTATATAGTAGAAATATTTTTTTAAATTATAAAATTGGAACAAACTAATAATAAATAAATATATATGTATAAGAAAAATAAAAAACTTGAAATTAATCTAAATCAAATAGTAAAGTATTGATCTAAATTTAATATTTATAATGAAATCATTGTTAAGAAAGTCAGATATAATTTATTTTAAGTTTGATTGAATATATTTTTCACTAAAAAGGAGATAGATAAAAGACAAAGATATTGCAATGTTAAGTAAAATAAAATCCCTTTCACATGAAGGGAGAAAGGAAGTATAAGAAGCTAAGTAGAGTTAGTAGATAGGTGTGGACATACTAACTGTTGTGAAAAATTTGTGTAGGAGAAATTATCCCCTGTTGGTGGTCACATAGTAAATCCATGCGACCTTTTACCCCCTTTTAAGGAAGATCCTCCTTTTATGCCACGTGGGGCCAATAGCATCTATCTTCTGCTCTTTTCTGCATATGTTGTCATCACCGGTCAGTCATAGCCCACAAACACAAACTCATTTAATTTGACTAATTAATTAACTATTTAATTAATTAACTATTTAATTAATTAACTATTTAATTAATTAACTTTCCATTTACCTTTCTACATTAGTTTAATACGAAAGGACAACTCTGTCATATTCCATATTCTATTGACTCTCACTGTTCCACATGTTGAAATTCAAGGTCATTTTAGTCTTTTCAAAGTTTCTCTTTCTCAATATCTCTCACTCCATCACTTTAATAAAACTCCACCTGCTCCAACCTCAGTTCCAAATCAGCTTCACTCAATTCCTCACATTCTCTCTCTAAATAAAATAAATGTAAATATTTATTTTATTATTTATTATTATTACATATTTTGGACAATAATGGTATTAAGGCGAATAAAACAAAAATAAAGAGAGATTATATATTTGGTAAATATTGGTGGGATGGGTTGGCGGGTGCATATAAATAAAACCAACCAACAAACTCACACAGACCTATAAAAGAAGCCCCTCCCTGTAAGAGAGA


Gene Sequence:
>Vu_23537(-)
GAGAAAGATCAAAAATCAGAACACCCTTTGAAACTGAAAGACAGAGTGAGTGTGTGTTTGTGAAAGAGAGAGACAGAGAAGAAAACAGAAACAAACGTTGTCTGTGCGAGTTAGAGAGAGAAACCCCAGAAAATCAGAAAATCCAACCCCATTTTCTCTCTCTCTACTTTCCATTTGATCGGAGCCTCTCATTGTGCTTTTCCGATCACCGTCAAATCAGCTCCGTTCTCCGGTTCGGGTCGGTGCAATGGAGCAGTACGGCCGGTCCAGTGAAGGTTCGCGGTCTGATCCGTCCCCGGAATGGGCCGGGCCCGGAGCCCAAACCGGTCTTGAAGGTATCTCTCTCTCTCTATATATTTATTTACTTAGCTCATGTGTTCTCTGCGGTTCGTTTTGTTAGGTTCGGGGATTTTGATTTATGGTTTTGGGGGAATGTGTGGGTTTCTGAACCGGGTTCGATCTTGATTGTGGAAAATGCAGAGCCTATGTGGCAATTGGGGCTGGGTGCTGCGGAGGAATCGTATCCGCAACGCCCCGATGAGGCTGATTGCACTTACTACTTGAGGACCGGTTTCTGTGGCTTCGGTTCGCGGTGTCGGTACAATCACCCTCGTGACCGTGGCACGGTAATTTTTTTATTGTTCTTGTTGTTGCTTAATTTATTTCATCTGTGAAGGGTTTCTTACTGTGATCGTGTGCTTCTGTGTTTGGAATTTCGTTTGATCTTGCTGAAATAACCATTGTTTCACTGAGGTTAAGATGTTGTGTTTGCATTGCGTACTGTGATTTGGACTTTTGGTGCTTTCTAATTTTATGATGTTTGTGTGTTGTTTAGTTTGTTGGAGCTGAGAGGACTGCGGGGGAGTATCCGGAACGAGTTGGCCAACCTGTGTGCCAGGTGCTTTTTATTGTTCTACTGAATGATTGCATTTGACTATTCTGTAATTTGTTGTTTTTGTATAAAATGATGTTGATGATGGATGGAGTGTGGTTATGTTTTTTGTGAATATACTTTGTGCTGATTTCTATCTGCTGATGGTTAAAATGCAGTATTACATGAGGACTAGAACGTGCAAGTTTGGTTCGTCTTGCAAGTACCACCACCCGAGGCTAGCAGGAGGATCTGCTACCCCTGTGTCACTAAACTATTATGGATATCCATTGCGTCCGGTGTGTTATTTTTGAGTTTGCTGCATGAGACTACCTGTCTTTCATGAATATCCAGTTTAGTTTTCTGATTGTGCAAAATTTTTACGTGAATTTTGAATGTTATAAATGATAACAATTAACAGGGTGAAAAGGAGTGCTCATATTATGTGAAAACGGGACAATGCAAGTTTGGTGCGACTTGTAAATTCCATCATCCGGTTCCTGCTGGCGTCCAAATTCCAGCACCATCACCAGTTGCTCCAGTTTCGCCTTTGCCTGTACCAGTGCCTTCACCGTTATATTCAACCATGCAGCCCCCACCTGGTCCTTCATCACAGCAAATTGGTGTGCTGGTTGCAAGGCCTCCTCTGCTGCCTGGCTCATTAGTCCAGAGTCCCTATGGACCTGTGGTACTGTCACCTGCCATGGTACCTATTTCTGGCTGGGGTCCTTATCAAGTAGGTCAATCATTTCTTTTTTATTTCAGTCAATAAGTTATATGCATTTTACATCGTTAACTTTAGCTCTCTTGGTGCAGGCTTCTGGAACAGGTGCTGTACTTCCTTCCGGTACTCCTAATGTTGGTTCAGCACAGCTTTATGGGATGACACAACTGCCTTCATCAGCAGCTGCCTATCCTGGACCTTATCAACTTCCTGGTTCCTTAGTTGGTCCTTCAAGCAGTAATCAGAAGGAGCAGGCATTTCCAGAAAGGTCCAATCAACCAGATTATCAGTATTATCCGAAAACAGGGGAGGTTAAAGTTGGTCCATCCTATAGGTATCACCCTCCACCAGAAATGACTGCACCAAAAGCAAATGTGACTCTTAGTCCTGGTGGTCTTCCTTTGCGCCCGGTAATGGTTGCCTCTCAACTTTGTTATTGTGTGGTGTTTCTTATTGAGCTTTTAGTTACATATGCGTGATCATCCCCCATTTTCCACATAGTCGGAAAAAGCTCTGCTTTTGTTGCTTCATCGACCCTCTCCAACAAAATTTTGTAGTTTCTAGAGATCAAAATAGCTAATGTGAACTATAACCAAATTGATTTCTTATCACTTTGTTTTCAATAGCTTTTTTGAAAATCCAAAACTTGTATGCTGGAACTCGAGCTTGCTTTGAAAATCATCATTTAGAACAAAACAGGCACTATTCCTAGTTCTTGTGCTTTGATTTTCTTAAGACACACATTTCTGGGATTGTTTGAGGGCATGGAGTTAAAACTGTTGGTTTAATATTCTAACCTTGTGCATGATTGGACCTTTATGAGAGTGGAATTCCCACTTTGTCATACATTCATTTTGCTGGGTATCCTGTTCCTTTCTTTGATGTATTATGAATATTTGTGTGATCACTATAACTGCACCAGTGGTAAGTTCAGTCCGAAAGATCTTCAAAATCTTTGAGTGTGGATATGTTCTTTGCCATGGCAAGGAACTGTACCATAAACAGTTAAAACTCATTACGACTCCTTTTAAAGTTTGTAAGTTAATACTGAAATATCATTAATTATTGTGATTACTTTTATTTCCTGTTGCATTGGAATTGGTGTTACTGGGAATTCTCACATTAATTTAACAATCATAAAGGTTTTTTTTTTCTCATGTACTCCTTGAGGCAAATTTTCCTAGTCCTGCATGTTGTATTTACATATGATACCAATGCTGTTATGGTACATAGAAGTCATTTGTTTCATTTTTATCCTTTTATGAGCATACACATGCACGTATATCTTTCCCACTCCCACATATTTGGAATTTTTCATGTCATTGTTATATGGAATTTCTATAATTGCTCTTTTAGCAGCTTGCTTGTTGTTTCTAATTTTTGTACTCCTGCATGTTAACGTGATATTGATTACTGGGTAATGTGATATTGTGATACCTATTATACCTGTTATGGTGGTATTATCAACTACTTTGAATCAGAACAATGCTAAGTCACTAACCCCTTTTTTTCCAAATGTCAAGCTTTAGCAGTCGCAATCTGTATGTGTCATATGCACATGCAGGGCTTGCAAACTCAGGTTGGAAATAAAAATGCTGATCCCAAACTAGGAATGGTTTGGTTCACTTGCGTAGTTGATTGAATGATAGGATCATAGGAACAAGGTTGAGAATCTTGCCTTGTGGCAGTCCATGATCGTATTCATACCTTAGATTTCACTATCAAAAACTAAGTTCATTTGGCACTCACAGATTTTGTTAATGAATATAGCTATTTGAGATAAGCCAGTAAATAGTCCTGCATACAATCTGTCTCAGTATTCAGAGATCTCCATTCCCCACAGGGGAGAGGGTGGGGCGAGAGTGGGCAAGTTTGTTAATGGCTGTATAGGTGAAATTGGTTCATGTTACTTAAAATACACATTTGAAAATCGTTGCTCATAGACTTAAGAATGGTTATCATGAATGGCAGGGACTAAAACTGAAGTCTGTGGAAGAATCAAATTAGGGATAAATCAGCCATTGTCTCCTTACATTTTCTCCAGTAGCCAACATCATCAGGTTAGGAATCATATTCCTATATGTAGATCAGCTTGGCATATAAGCAAATTTCTTACTTGAAAATTCATCTATTAAATTCTTGTTGAGTTTAGGAAATGTGTCTAACATTGTTTTTATTTTGATGGTAATTTTTTCTCCATTTTTTTATTATTTTATTATTATTTTTATTTTTATTTTTTATCTTTGGTATAAATTGCTGCTCTTGTCATGGCTTATGCTTGGGACTAGTATGAGTTTTTAGGTTCTTCCGAGATTGATGCTTAGCTTAATATAATCAAAGCTTTTTAAATTTATGGACTGTCAATACTTGATAGTCTTAAATTTATAGGATTAAAGCGTATGGATCATGTCATGAAGTTTTCTAAATAAATGAGCAGAATAATAACAACAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAATAGTAATAGTAATAGTAATAGTAATAGTAATAGTAATAATAATAATTAATACTCTCACTTGTCAAAGAAAATCTAGGTGCTGATTATTCAGGTTCAATGACCACCAGGTGTATTTATTTTGATCTAAATGGGATTCTGGTAAATGCTAATCTGTCATAAAATATCTTGGATTGATAGTTTGATAACAGAATTTATTGATTTTTAGCATAGAATGGTTGAAGTGGTATAAGCACTATGGAAGATCTGCTATAACGTCTGGTTTTAGGCTTTCAAAGTTTCCTTGCAGGCTGGTAGAGTATTGTGTTAGTAGTTTGAACAGTTTTCTTCTTTTTGCTCCAGTGTTATCAATTGTGGATTGCAGAAAGCTGATAATCTGCTATATCATACAGCAGATGGTGTAGGGGGCAGATAGTGGAAGTGGCATAATGGCTGAAATATGAGATATATAAATTATCTATGTATAAAAAAAATTAATTTGCATTCAAATTAAATAAAATGAATAAAAATTGGCGTAATATTAACTCAAGTTTGTTTGGCTGGAGACTTGATGGAGATGACAAGAGGATGTCGGATGGATGCTGCAATCATGATGCCCATATTGGCTGCAAAAGTAGACAGAGTTGCTATCATGATCCAAGGAATTTCGCAATGCAATAGTGGGCATAGCACTATAATGCTCATATAGAGGCCATTTAACAACACTGTCTTGTTCATTGCTGTGATTTTAGATTTAGCCCTGATAGTAAAATATTCTAAGGATCATCTTTTCTCTTTTATTCTTTTTGTTGTTTTGTTACAACAATTTCAATAATCACTAATATCTCATAACATCATTATTGAATCCAGGGTTTTAAATAGCATGCTGTATTGCCGGCGGGGCAGCCCCTTCCCACTACAGGG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