Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23529 LG5 66245774 66251433 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase CDL1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 66245811 missense_variant p.Ala501Val
T/A 66246065 synonymous_variant p.Arg416Arg
A/G 66246110 synonymous_variant p.Gly401Gly
C/G 66246158 synonymous_variant p.Gly385Gly
A/G 66246504 downstream_gene_variant
A/T 66246519 downstream_gene_variant
G/A 66246527 downstream_gene_variant
A/T 66246636 downstream_gene_variant
G/A 66247329 downstream_gene_variant
T/C 66247801 downstream_gene_variant
A/G 66248574 downstream_gene_variant
C/A 66248975 intron_variant
T/A 66249447 intron_variant
G/A 66249634 intron_variant
T/A 66249788 intron_variant
T/C 66250177 intron_variant
A/T 66250182 intron_variant
A/T 66250183 intron_variant
G/A 66250370 synonymous_variant p.Tyr81Tyr
A/T 66250374 missense_variant p.Ile80Asn
G/T 66250380 missense_variant p.Thr78Lys
A/G 66250537 intron_variant
C/G 66250916 intron_variant
G/T 66251170 intron_variant
A/C 66251178 intron_variant
A/C 66251179 intron_variant
G/T 66251189 intron_variant
G/A 66251279 splice_region_variant&intron_variant
A/C 66251283 splice_region_variant&intron_variant
T/C 66251289 missense_variant p.Thr49Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23529.1
MGGCFPCFGSSNKEDSGGVRVKEVPNKDSSFKEAASLVPQSHHPSRANTDKSKSSRSGADAKKEAPVPKDGPTAHIAAQTFTFRELAAATKNFRPECLLGEGGFGRVYKGRLESTGQVVAVKQLDRNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLIGYCADGDQRLLVYEFMPLGSLEDHLHDLPPDKEPLDWNTRMKIAAGAAKGLEYLHDKANPPVIYRDLKSSNILLDEGYHPKLSDFGLAKLGPVGDKTHVSTRVMGTYGYCAPEYAMTGQLTLKSDVYSFGVVFLELITGRKAIDNTRAHGEHNLVAWARPLFKDRRKFPKMADPLLQGRYPMRGLYQALAVAAMCLQEQAATRPLIGDVVTALTYLASQTYDPNAANQSNRVGPSTPRMRDDRRSLADGVDSPDRRLGSPSTHRNSPDFRKRDSRDASIGTELGSRMDTGGGSGRKWGLDDYERQESQRDSPVNTARARETPWNRDLDRERAVAEAKVWGENWREKKKANAMGSFDATND*


CDS Sequence:
>Vu_23529.1
ATGGGTGGGTGTTTTCCTTGTTTTGGATCATCCAACAAGGAGGACAGTGGTGGGGTGAGGGTCAAGGAGGTGCCCAACAAGGATTCTTCTTTTAAGGAAGCTGCTTCTCTTGTTCCTCAGTCTCATCACCCCAGCAGGGCAAACACAGATAAATCGAAATCATCACGAAGTGGCGCAGATGCTAAGAAGGAAGCACCGGTTCCAAAGGATGGCCCAACAGCCCATATTGCTGCACAAACATTTACATTCCGAGAGCTTGCAGCTGCTACAAAGAATTTTAGGCCAGAATGTTTACTAGGCGAAGGGGGTTTTGGACGTGTTTACAAAGGTCGTCTCGAGAGCACAGGACAAGTAGTTGCTGTAAAACAGCTAGACCGAAATGGTCTCCAAGGAAATCGAGAATTTTTGGTGGAAGTTCTCATGCTCAGTCTCTTACATCATCCCAATCTTGTGAACTTAATTGGTTATTGTGCAGATGGTGATCAGCGGCTGCTTGTTTATGAATTTATGCCACTGGGGTCTTTGGAGGATCATTTACACGATCTTCCTCCTGACAAGGAGCCTCTGGACTGGAACACTAGGATGAAGATAGCAGCTGGAGCTGCAAAGGGATTGGAATATTTGCATGACAAGGCAAATCCGCCAGTGATATATAGAGACTTAAAATCATCCAACATCCTCCTAGACGAGGGTTACCATCCCAAGTTGTCGGATTTTGGGCTGGCAAAACTTGGTCCGGTCGGCGACAAGACTCATGTATCAACACGAGTAATGGGAACATACGGCTACTGTGCTCCGGAATATGCCATGACCGGTCAACTAACTCTGAAATCTGATGTCTACAGTTTTGGAGTTGTGTTCCTTGAACTTATTACTGGGCGCAAGGCTATTGACAATACACGTGCGCATGGAGAGCACAATCTTGTTGCATGGGCACGGCCTCTCTTCAAGGACCGTCGGAAATTCCCGAAAATGGCTGACCCTCTACTTCAAGGCCGTTACCCGATGCGAGGACTGTATCAAGCACTTGCAGTTGCTGCAATGTGTCTGCAGGAGCAAGCTGCTACAAGGCCTCTGATTGGGGATGTGGTGACTGCTCTCACATATCTGGCCTCACAGACATATGATCCAAATGCAGCCAACCAATCCAACAGGGTTGGGCCCTCAACACCTAGGATGAGGGATGACAGAAGGAGCCTGGCCGACGGTGTGGACAGCCCTGACCGGCGCCTCGGCTCCCCTTCCACGCACCGAAACTCCCCAGACTTCAGGAAGAGAGACAGCAGGGATGCAAGCATTGGGACAGAGTTAGGCAGCAGGATGGACACGGGTGGTGGCTCAGGGAGGAAATGGGGATTGGATGATTATGAAAGGCAGGAGTCTCAGAGAGACAGCCCTGTAAATACTGCAAGAGCCAGAGAGACTCCATGGAACCGCGACCTGGACCGAGAGCGTGCGGTGGCCGAAGCAAAAGTCTGGGGCGAGAATTGGAGAGAGAAGAAGAAAGCAAATGCCATGGGTAGCTTCGATGCTACAAATGACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23529::LG5:66251433-66253433(-)
TTATATTAAAATATTCTTCAATGAATTTAGTTTCCTTGTTTATTTTATAGTACACCATGAATGATATCACATCTTTCTTTAATTACTACTCTATTGTAACAAGTATTATTAAAAAATATATTACGAAATGTGTGACACATAAAATGCATTTGTTTATAACCATAATCAAGAGTTATTAAAATTAACATTTTCATTTGTCAGAGTTTATATAAATGAAACATTAATCCTAAAAAGGAAAATGTAAGAGGATATCTCAGCCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTCAATCTTGACAAAATATTTTATTTCTTGAAAGAGCACATGTATAATGAATTAGTTTGGTTCGTATATGTAAGAGTAAAAAAGATTATAGTTTTAGGTTCATATATTATACACACATCACTTAGAAAAAATAAAAAAAAAGGAGAGTAAATGTGTTAACTAAAAAAAAATCTAATTAGACCTTTTGTTTTTAGAACAACAAAAAAGGTTTGTATAGATAAAATATATAAAAACACGTTTTGAATTATTATTAATGATAACCTATGACGAGTTAAAAGGCTTGATATTATTATTTTTCCATATATGAATACATTATTTTATTTATACTAGGTCCACGTATTTTAATTATATTTTATATCTACATTAAGTTATACCTTGAATATTCTTCACATTTGACTATTATAGAATGGATATTGTTGGTCCAAATTAACTACTACTCAATTTGATTCCTTCCATATTTGAAAGAGATAATCTAAAATACTCTCTTTTACATGTTATATTATCGGTGTAAAATATCCATTAACTATTAATGATTAATTAAAGTAAGAAATTGTTTTACCAACATCAGTGAGATTTTCCATCCCATTATATTTCCACAGGAGCTTATTAAAAACTCGCTGATAAATTTTAAATCCAAAAATGTTAATTTGAATTTCCAATACATACACATATAATATTTTTTTTAGTTTATTATTTCTTTGATTTTTTTTCAATTTAAAAAATTTAGTACAATTTATCAAAATACTCGTTGGAATAGTACAATTTTGTGGTAGTGGGTAGATAAACCATTACATGTTGCCCCCATCCGTTTTCTCTCTCCTCACTGCCTTCTTCTTTGAACAAAATTTGGAGAACAGTTGTTTTAAGTTAAGAATTCAAACATAAGAACGTGCATAAGTAATTTTAGTTTAAAACCCAGAAACAGATTAAGAAAAAGATTATGAAAACTAATGTCAAAATTAAAAATTTAATAACACACAAAGAAAAATCAAAGATGTATGTCGTTGCTGGAGGAGTTCAACATGTGTTAGCAATGCCCATCACACATGGTAAGGGTGGGACCCACTTCCCGGCCGCGATGATGATTATTAAAAACTACAAATGTACATGTACATGTTTGTAATTATTGAGAGTTGCAGGGTGAAAGTGAAACTTCGTAGCAACACCGAAAATCCAATGACAACCTCGTAATAGAGATTGTGTAACGCAATTGTTGAGTTGCAACTGTGTTCCCTAATTAGTAATTACCATCCCAATTACAATTTTCCATTTCCACTTCAAATTTCCAAATTTGAAATTCCCCTTACACTTTTATTTCTTATTTATTATAATATCATACACACAGATATATAAATATTTGTTTTTTATTTTAGTTATTTATTATTTATTATTCTTCCTTTACCTTGTGCTGTGTTTCACCTCACCAGTTTCTTCGATTGGTTGATCTGCTTTCTGGGGCAAGTTGGTGTCGATGAGGATCACGTTCTGAGGCATCCACTGTGAGTTGTAGAAGCGGAAAAGGGAAGTGTTTGGTGGCGATTTCTGAGATTGGTCTTGTGTGGGTGTGAGTGTGAGTTGAACTGTGTTGTAGGATTTTGAGGGGTTTGTTGTTATGAAAGGCATTATTCCTTGGTGGGTTTTGTAAGGGGTGGCTTTGATTTGCTTGGATTTGAT


Gene Sequence:
>Vu_23529(-)
ATGGGTGGGTGTTTTCCTTGTTTTGGATCATCCAACAAGGAGGACAGTGGTGGGGTGAGGGTCAAGGAGGTGCCCAACAAGGATTCTTCTTTTAAGGAAGCTGCTTCTCTTGTTCCTCAGTCTCATCACCCCAGCAGGGCAAACACAGGTTTGGCTCCTAATTTTCCGACTTTCCTTCTCAGACTTCTGTTGCCTCTTTGATTGAACCACTACTTCCCTGCCTTGCTTCAATTCTCCTCAATTTCCCCTTTTCTTTACCTTTTCTTGCCTTTTCTGCCCATCTTCTTCAATCCATCTCATTCGTTGCTTTGATCTGGTTCATCCGAGGTTGTGCTCGTACTGCTGTAGTCACTGAAGTGATTTCTTGCCAGTGGATATGTTTTAGCTTCACTTAATTCAATTTTGTTCCTACCAAAGGCTTTTTGTTACATCTTTGGGGATCCGCCCTTGCCTTTGGATATGACAAGTATATCACATTGTTTCATAAGGTTTTCGTTTTGCCCTTTTGACAATTCTGGGACGCGAGGCAGATGCCGGGTCCAGTCCAATTGCTGCATTTTCTGTAGATTGTTCAATGTGGTAGTCTGGTAGCTTTTATAGAAATTTAGTCTAGATGATTTGTACAGAATGCCCTTGTCTGAAGAAAAATTTAGTTCATTCAGAAGATAGGTACTGAGAACTTTACCTTGGCATTTGTGCTGCTGGACAATTGGGATTGTCAGAACTAGTTGAATAACATTCTAACTGATGGCAGGATCTGGTACATGATTTAACGAACGAGACCCTGTCATTGTGCAATTTAAACTTAAACCCGTGAAACTCAAGCTGGGTTTTAAGTGTTACATGTAATTATAAGTTTAGCAGTATGATGCCGTGATATCACTCTTCAGTACATATTTTTATTCTCTAGTATACCAGATGTTCTTCTGTTACTTTTGCTCGATCTTATCTTTGATTATCTATTCAGATAAATCGAAATCATCACGAAGTGGCGCAGATGCTAAGAAGGAAGCACCGGTTCCAAAGGATGGCCCAACAGCCCATATTGCTGCACAAACATTTACATTCCGAGAGCTTGCAGCTGCTACAAAGAATTTTAGGCCAGAATGTTTACTAGGCGAAGGGGGTTTTGGACGTGTTTACAAAGGTCGTCTCGAGAGCACAGGACAAGTAAGTTGTGACATCTGCTATGAACATTAACAGATACTGAAGCTCAGCATAATGGCTTTCTTGTAGAAAAGTTTTATTATTTTTCAATTTGCATGTGCAGCTTTCAAAATTTGCCTGTCCACTGTCGGTTTTCCATTTGATTTTTGCACTGTTACTATAACTCTGCCTCTGTCTGAATTTTTGTTGATGAAATAATGAAATAATTCTCTTTGCAGGTAGTTGCTGTAAAACAGCTAGACCGAAATGGTCTCCAAGGAAATCGAGAATTTTTGGTGGAAGTTCTCATGCTCAGTCTCTTACATCATCCCAATCTTGTGAACTTAATTGGTTATTGTGCAGATGGTGATCAGCGGCTGCTTGTTTATGAATTTATGCCACTGGGGTCTTTGGAGGATCATTTACACGGTCAGATTGCATTCTTTTTGAACTGTTGCCATTGCTTCCTGAACTATTATGCTTTCGTATCATAAAACTAATGAATTTTATATTTCAACTTGGTTCAATCTTTTAAATGTCAAGAAAGTAGGTAATTGTAGGATTCTTTGTTGAATTGGAAATAATTATAAACTATAAATTGGCCTTATCTCTAGGCGATGTGGGACTAGTGGGTGGAAGCGAAGAATAGAGTGCCCACTTAGAACTCGCTAGGATAGGCTCTAACCATGACTTTGATACCATGTTAGTAATGGACTTTAAGTCTAACTCAACCCCACAAAACCGGCTTGTAGGATGAGGTTTGCACCCAATTATAAACTATGAATTGGCCTTATCTCTAGTCGATGTGGGACTTCCAACAATGTCTGTGTTGTTTCTAATAAAAATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAACTGTATGTGATACAAAACAGGGAGAAAATAAATAAGATTGTTATCACACGGTTCAAACTTCAAGGAATGAAATACATTATTCTAGAGGCTTTGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGCATCTTATGTTTCTATTTCTACAAATCAATTTATATTAGGAGTTAGGAAAGTTACTGTAATTTGTGAGTTGAAGGGCTAGTCCGTTAGATGGGATATAAGAGGTAAATAAATAGGAGGAGGAGGTAACAGGGGGACATTATATTCCATCTTGCATGATTTGTAGATTGAGCTTTTGCTCTTTTGTGAATGGAGAAACTGTATGAAGGAAAACCAGTTGAGACATCCTATTTTATGTTTTTTTTCCCATTCAATTCCAAAAATATTTCTTCTTTTCCCATTCCTATTCTTGGTACCTAACAGTTTATCTTCTACTTTAGCTAGTGAAAGTGTGTAGTATGTGAGGAGATCATGTATCTTTGAAAAAACATCATAGATTCCAATTGAATGATAGAATCTCCCTATAAAGATCATAGATTATCAATAGGTACCTTAAACTATTGTGTGGTGGATGCTATTCTTTTTATTGCCTTATACATATACTGTTTGAAAATTGTTTCATGTTTACATGATGTTGCATTGTTCAAATGCATGAGCAGTTAACTGTTACTGTAAGATTGGGCGGACATCTAAGTTTCAAGAACTACCATGAATATGTTTTAGTGAATCACTAGTGTTGATACTTTATGATATATGACTTGGGAATATTGTTAATGGTTGTATTTGCAAAATCATGATGTAAGTTCTGACAGTTGTTGAAATCTGTTAAATGAACCAAATTCCATTTTTATCACATAATTCTTTTACTACTTTTGACTTGGTATTACCTTCAAAGAGAAAACATGTATCGTTTTTTACTGTTAAGTATTGATCACTCATTTCTGTTGGATTTTTATCCTTTTCACTTTGTTTATTTAGGTGATGAGATATAAATTAATTTTACAGATTATTTTCCAAAAACCACATGGCAATGGTTATGTGCACATGTTTTGGAATAGCTCCTTGTTTTGTGGAGAGTTAACCTTTTCTTTCACAAGTTTTCTCAGGAAGTTGGCAAAAAAAATTATTGTTTCTTCAAAATATTCTAACTAAATATAGCCCTTAAAATCTACCACTTATATTAGGGTACCCTTTCGATGTTTTGGAAAATAATGATCTAAATCTATGGTAGAAGTTAAATTTCTTACTTGCAGATAGAAGTGCTTGGTCTCAAATGGAAGTATATTACTTTTGTTTATCAGTTTATCATAGAAAGGGGAGTGAAGGGAGAATACTTTCATGCACAAATTTTCCGTTGCCTCTTCATATACCACATTCAGAATTGACATAATGTTTCTTTATACTTTTTGACTAAGACAATAAGAATTATGGTTGTAACTAATAATTTACTATTAGGTTGAGTTGAGTTTGAGGATTCTGGGAATTTTTACAAAAAGGTTTCTGAATAATCCGTGTTAGACTTCCATTTTTTGCCTCTAGCTTTCTAGCTCCATGGGATGCACAAGTTTGCATAGGCTGACAGTTAGTGGCCTTTCGTAGTTTTGGGGTTATACCGCAAGGTGTGGTGACACCCTTTGGGTATGGGAGTGTTTTGCATAGACCAGCATGCTTATGGCTAAATAGATATGTTTTTGTTTATAATTAGCAAAAGCTTTAATTTGTAGATGGTTATTGAAGTTGGAAAACCGTTTAGACTCGTGCTTTATGATTTTCTCATTGCAAAGGAAAAATCTTTGATGAATTGTTGGTGTAGAATTCATGATGTAGTGGTGCTAGTTATAGAAGTTCGAAGCAGAATCTTAAATTCCAATGTAGAACTGTAGGAGTAATGAGGTTTTTAGTTGAATTTGGCATCAATAATGGTATCATTGAACTTGGCTGGGGGCTTGGTCTTGCAACACTAGATGATTTAGGATGGTATTTGTATTCTGCAGTCAATTTGATCAATCGTTTTCATTCAATCAATCTTCTTTGTAGTAATCAGATTAGCTCAGACATAAATATTCTACAATACGTGGTAATTTAATTTCATTTTTTTGCTTGAATACTTTTCCAATTGGTTAAAGATAAATAAAGCTAAAAAATTATTTGTATGTTAAAATTGTTGCAAATTACGGTGCATGTTGAAGAGCTTTTCTAACTTTATTTCGACTTATCTTACTACGCATAACCTTGTTCAAGTGTTTTCTCGTAATATTGTACATAAGAAATTTCTTACTCTGACTCCCTTTTCCAGATCTTCCTCCTGACAAGGAGCCTCTGGACTGGAACACTAGGATGAAGATAGCAGCTGGAGCTGCAAAGGGATTGGAATATTTGCATGACAAGGCAAATCCGCCAGTGATATATAGAGACTTAAAATCATCCAACATCCTCCTAGACGAGGGTTACCATCCCAAGTTGTCGGATTTTGGGCTGGCAAAACTTGGTCCGGTCGGCGACAAGACTCATGTATCAACACGAGTAATGGGAACATACGGCTACTGTGCTCCGGAATATGCCATGACCGGTCAACTAACTCTGAAATCTGATGTCTACAGTTTTGGAGTTGTGTTCCTTGAACTTATTACTGGGCGCAAGGCTATTGACAATACACGTGCGCATGGAGAGCACAATCTTGTTGCATGGGTGAGTATTCACATCTTATCATCCTTGTGGTTTTAGGCCATAAGAAATGCTCACAACACTCTCGATCTATCATCCTTCTTTTAATGCACTCTACTGTTGGTAAAAGCTTATTGAAAACTACAAAATCATGAATGGAGATCACTACATGAGAAGCAACACCCACCAGTTTCTTTAATTTCCAATACATTCCACTGAATTATAAACAGTGTGTTGCTATCATTTCTCCTAAGTCACACATACATGATGTAAACCAGTTTGTATGTTCACATTTTGATTCACTTCTAAATTAACACAACA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