Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23519 LG5 66175593 66181148 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 66175720 3_prime_UTR_variant
A/G 66175726 3_prime_UTR_variant
C/T 66176056 synonymous_variant p.Gly545Gly
C/A 66176086 synonymous_variant p.Gly535Gly
G/T 66176249 missense_variant p.Pro481His
T/C 66176502 intron_variant
A/G 66176707 intron_variant
A/G 66176734 intron_variant
T/C 66177009 intron_variant
G/A 66177040 intron_variant
A/G 66177351 intron_variant
T/A 66177454 intron_variant
C/T 66177462 intron_variant
T/C 66177556 intron_variant
A/C 66177822 intron_variant
A/T 66178014 intron_variant
T/C 66178283 intron_variant
T/A 66178306 intron_variant
C/T 66178310 intron_variant
G/T 66178778 missense_variant p.Pro367Gln
G/T 66179202 synonymous_variant p.Val288Val
C/A 66179452 downstream_gene_variant
A/T 66179457 downstream_gene_variant
A/T 66179639 missense_variant p.Cys180Ser
A/T 66180021 downstream_gene_variant
T/C 66180438 missense_variant p.Lys49Arg
C/A 66180509 synonymous_variant p.Val25Val
A/C 66180618 5_prime_UTR_variant
C/A 66180676 5_prime_UTR_variant
C/T 66180677 5_prime_UTR_variant
G/T 66181051 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23519.1
MGCAFGRESSREERREEVREAKAEVSRAEVVENENIEKEKEKEGEREEKRTRARGERRRSSKPKPNPRLSNPPNHVHGEQVAAGWPSWLSKVAGEAINGLTPRKADTFEKLDKIGQGTYSNVYKARDSLTGKIVALKKVRFDNLEPESVKFMAREILILRRLDHPNVIKLEGLVTSRMSCSLYLVFEYMVHDLAGLATNPAIKFTESQVKCYIHQLFSGLEHCHNRHVLHRDIKGSNLLIDNDGNLRIADFGLASFFDPHHKHPMTSRVVTLWYRPPELLLGATEYGVGVDLWSAGCILAELLAGKPIMPGRTEVEQLHKIFKLCGSPSDEYWKKSKLPHATIFKPQQSYKRCIAETFKDFPPSSLPLIDTLLSIDPDERLTATAALHSEFFTTKPYACDPSSLPKYPPSKEMDAKLRDEEARRLRAAGKANVDGVKKSRPRERAGRGIPVPEANAELQANIDRRRLITHANAKSKSEKFPPPHQDGALGYPLGSSHHMDPVFDPPDVPFSSTNFSQPKANIQTWSGPLVDPANGGAPRRKKKHGK*


CDS Sequence:
>Vu_23519.1
ATGGGGTGTGCGTTTGGGAGAGAGTCTTCGAGGGAGGAGAGGAGAGAGGAAGTGAGAGAGGCAAAAGCTGAGGTGAGTAGAGCAGAGGTGGTTGAGAATGAGAACATTGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGGTGAAAGAGAGGAGAAGAGGACAAGGGCAAGGGGAGAGAGAAGGCGATCTTCGAAGCCGAAGCCGAATCCGAGGTTGAGCAACCCACCTAACCATGTTCATGGTGAGCAGGTTGCAGCAGGGTGGCCCTCCTGGCTCTCTAAGGTTGCTGGTGAAGCCATCAACGGATTGACGCCTCGGAAAGCTGACACCTTTGAGAAGCTTGATAAGATCGGGCAAGGTACATACAGCAATGTTTACAAAGCTAGGGATTCCTTGACGGGAAAAATTGTTGCTCTAAAGAAGGTCCGTTTTGACAATTTAGAGCCTGAAAGTGTGAAGTTCATGGCTAGAGAGATTTTGATTCTCCGTCGTCTAGATCATCCCAATGTCATCAAACTTGAAGGCTTAGTGACTTCTAGAATGTCGTGCAGTTTATATCTTGTATTTGAATACATGGTGCATGATCTGGCTGGACTTGCCACAAACCCGGCAATTAAGTTCACGGAATCTCAGGTAAAATGTTACATTCATCAGCTATTTTCTGGACTGGAGCACTGTCACAACCGTCATGTGCTGCATCGTGATATAAAGGGGTCAAACCTTCTTATTGATAATGATGGAAATCTTAGGATTGCTGATTTTGGATTAGCTTCCTTTTTTGATCCTCATCACAAGCACCCTATGACTAGTAGAGTGGTTACATTATGGTATCGACCTCCAGAACTTCTTCTTGGGGCTACTGAATATGGTGTCGGAGTGGACCTCTGGAGTGCTGGCTGCATTCTTGCTGAATTATTGGCTGGAAAGCCTATTATGCCTGGTCGAACGGAGGTGGAACAACTACACAAGATATTTAAGCTATGCGGTTCTCCTTCTGACGAATATTGGAAGAAATCGAAGTTGCCACATGCTACCATTTTTAAGCCCCAACAGTCATACAAGCGGTGTATTGCAGAGACGTTTAAAGATTTTCCTCCATCATCCCTGCCGCTTATTGACACCCTTCTCTCAATTGATCCAGATGAACGTTTGACTGCCACTGCTGCGTTGCATAGTGAATTCTTTACAACAAAACCATATGCCTGTGATCCCTCTAGCCTTCCAAAATATCCTCCCAGCAAGGAGATGGATGCAAAGCTACGGGATGAAGAAGCTAGAAGATTGAGAGCAGCTGGTAAAGCTAATGTTGACGGTGTCAAGAAATCTCGTCCACGAGAGCGAGCTGGGCGGGGAATTCCAGTTCCAGAGGCCAATGCTGAACTGCAAGCAAATATTGATAGACGGCGGCTGATCACACATGCAAATGCTAAGAGCAAGAGTGAAAAGTTTCCTCCTCCTCACCAAGATGGAGCTCTAGGCTATCCACTGGGTTCTTCACATCACATGGATCCAGTTTTTGATCCTCCTGATGTTCCATTTAGTTCCACAAACTTCTCACAACCTAAAGCAAACATCCAAACCTGGTCAGGCCCATTGGTAGATCCTGCTAATGGGGGCGCACCAAGGAGAAAGAAGAAACATGGGAAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_23519::LG5:66181148-66183148(-)
TTTTATAATGTGTGGTTTTTTCCATTTCATATAGTTTGACGAATGAATTTTATGTCTATCGGACCCAACTTATGTCGACACTCTATACAAGAGTCTACTTTCAATTCTCATCTATTCCTTTTCTTGTATTTGATTTCAATGATTAATACAATCATAATAATTTTATTTCAATCCTTATTATCAATACATATCAAACAAACTACAAAACATGATTATTCTCCTTGAAATAACTATCTTCATGACTTTTACATACCATCATCCCATATAAATCCATAAGTTTACTTTGTCTTAAAAGAAAAACCTAAGAATAATTTACTTTTTTGTACTCTTAAATAGTTGTGCCCATACATTACAATGATGTGTACAAAAAATTTCATAAAACATATTACCATATAAAAGTAGTGTTGAAATGCAATCGAACATATATACTTATGTTCTTATTTACAGGAACCGTTGTTAACGATGATTTAACAACAGAAGAGTTACCAGAAACTGTTGATTTATATGGAAGATCTAGTGCAAGAGTTCTTGAGGAAAATAATTGAAAGATTGACTTGCAAGTACAATAACAATTACCTAGGTTTTCAGAAAGGCCACAACAGACGTAGTTTGAGTTACCCTTTCTACTATTTTATGCTCAGTTTTCTTGTACCACTTGGTGAGTATGTCAGGAGAGAGATGAACTCGCCACCTGAAAATCATCTATCTAAACTTTTAACCATAAAAGATGCAATATCATGTTTCAAATTTTTCGTAGTTGCATGCATATTATTTACTGCTTGCTTTTAGGTCTGTAATTTCATACTTAGAATAATAACTGTTTTTCTAGCTACAACTCTTGCATTGCTGAGATTCGGAATTATAGAAGCAAGATCAAGAAACATGTCGTGCTTTAAACATTGTCTCGCAGTGTCATAGGATGTTGGATCAAAATGGTGTTAACAACCGCATTTAACCAGTTTATAATCCTGTTGAAAATAAGGAACATCTTGAGAATAAGTTGTGTTTCTACAATGTAATGAAAATGAAAACTATTGCTATTGTTGGTATGAATGACTATTTGTTTCCCTTTTGTTAAGGTTCTATTATTGGAGAAAAAAATATTTTTTGACACACCTAAATTTTTTACATTCATTTAACACTATTCTTATTTACTTTTTTCTCTCTTCTTTCTTACAAAATACAAAAATTTACATTTTTATAACCATTTTCTATGTTAAATGAATATAAAAATGTGTCATAGTACATTTAAAAGTTCATTTAAATGAATTTTACATTCATCTTGTTGTAGCCTTCATCTGTTCGTATGTCTTGTCACATACAAATATTGTTTATATTGATGAAAAATCTTTCCATTTAAAAGTGAAAAGGAAAATAAAATTAATTTTATATTTATATAAATTTTACTTGTTTCACTAGGCAATCTTAAAATGACGTTGTAATTTCAATATAAAATAAATTATCTTTTAAAAAAATACCTAAATTTTGCATAATAGGATCTTTCTGAATATATGTGTCAATACACAGTACTAATATCAAAATTAAAAAAAAAATATATATTATAGTATTTGTTGGTACTATTATTAAGCACGTGCTTTGATCTTCCTTTATTTTTATCATAAATTTTGACCAACTTCACAGTCCATTTTCTTCCTGAAAGCAATGTTCAAACCTCCAAGTTATAAACCACCAAAACAGGCACAAAAAGTAAAATAAAATGTAATCAGATAGCAACGTACCTTCCTTCCTACTACTATAAATCACCAATGTTTTCCAACTATATCAGCAATATTTTTATTTTGTATTTTACTTATGCAATAAATAAATTCGTTAATTAACCACCATCAAATGTAATTATTAATTGACACCAACATATTCGGGGTACTTGAACCTGAATTTTTGTGTCTTGGTGTGATTGGACACTATGATGGAAGCTTCTTCAACTTCATAAAACACAGTCCTGGAAGGGTTAAAAAGAAGAAAAAAAATAAAACTTGGAC


Gene Sequence:
>Vu_23519(-)
ACAGACATTGACACACCTCAACCATAACTCGGTTATTATAGGTACAGGTCTTTGCTAACCTTTTGGTTCTTCTTTTAGTCAAAATAAATACAGAAACCATCATGGGTATGATGAGAGAGAAGTTGAAAAGGAGGGGAGATCCACGTTCACATTTTTTTTTTCTTTTTCTCTCTCTAAAACATTCCGTTCTTTTCACTGATCTTTGAATCTGGTAAGACTCAACTTCAACCGTTTCTGTTCAACTTTGATCTTCCTCCATATCACAGTGTCAAAGGGAGAAAGAAAATTTAAAAAAGACCCACCTTAAGGGGAAAAAAGGAACAGTGGTTTTGGTTTCTTTGACTGCACCACAAATTGTGGGGTGTCTCCAAATCATTGTTATCTCACTTTTGTCTGCCAAAGTTAGGGTCTTTAGAATTAGCGTTTGCTTGCACAGTCTAGCTTTTCGAGATTTATGATTAGGGTTTTGGAGGGGTGAGTGGTTGTGGGTGGTGTTGGGATGGCGAGAAAGTGAGGAAAAATGTGGCTGGTGGTAGTGGGGGGAGTAAATGAGAGATTTTGAGAGATGGGGTGTGCGTTTGGGAGAGAGTCTTCGAGGGAGGAGAGGAGAGAGGAAGTGAGAGAGGCAAAAGCTGAGGTGAGTAGAGCAGAGGTGGTTGAGAATGAGAACATTGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGGTGAAAGAGAGGAGAAGAGGACAAGGGCAAGGGGAGAGAGAAGGCGATCTTCGAAGCCGAAGCCGAATCCGAGGTTGAGCAACCCACCTAACCATGTTCATGGTGAGCAGGTTGCAGCAGGGTGGCCCTCCTGGCTCTCTAAGGTTGCTGGTGAAGCCATCAACGGATTGACGCCTCGGAAAGCTGACACCTTTGAGAAGCTTGATAAGGTAAAGAACAGCTTGGATTCACTCAACAGTATTTAATTTTGTTGCCAATTATGGTTTGGTGAACGCTGATATGGTCTTGCTGTCTGGATTTGATTTTTGACAATATGTGGGTTCTTGTCATCTTCTCCATTGCACTTTTCCTTCAATGAGGTGTTGATCCTGTTGGGTTTCCGTTTTTTGTTTTAACATAGTATGAGGAATTTCCCACTTTAGAAGGGTTTTTTTGTTATCTTTATTCAAACAAGGGCCACTGGTAAAGTAGTAATTTGGAATTTAGCCTTTTTTCTGAGGTTTGGGATTTGTAAATTTAAAAACCTTCCAACAAATTGTGTAAAAGTTATTTCTTCTGGCTACTTGCCTGACAAATATTAAATCTTTTGTTGGTGACTTTGCTATCTTTGAATCAGATCGGGCAAGGTACATACAGCAATGTTTACAAAGCTAGGGATTCCTTGACGGGAAAAATTGTTGCTCTAAAGAAGGTCCGTTTTGACAATTTAGAGCCTGAAAGTGTGAAGTTCATGGCTAGAGAGATTTTGATTCTCCGTCGTCTAGATCATCCCAATGTCATCAAACTTGAAGGCTTAGTGACTTCTAGAATGTCGTGCAGTTTATATCTTGTATTTGAATACATGGTGCATGATCTGGCTGGACTTGCCACAAACCCGGCAATTAAGTTCACGGAATCTCAGGTAATTGGTGTGTTATCTTTAGTTTTAAAATATACGATTTAAAAGTCTTTTACATTTTATGGTTACTACTTGAGCTGGACCTTATTATATGTTTGTATCTGGGTATTTTAGGTAAAATGTTACATTCATCAGCTATTTTCTGGACTGGAGCACTGTCACAACCGTCATGTGCTGCATCGTGATATAAAGGGGTCAAACCTTCTTATTGATAATGATGGAAATCTTAGGATTGCTGATTTTGGATTAGCTTCCTTTTTTGATCCTCATCACAAGCACCCTATGACTAGTAGAGTGGTTACATTATGGTATCGACCTCCAGAACTTCTTCTTGGGGCTACTGAATATGGTGTCGGAGTGGACCTCTGGAGTGCTGGCTGCATTCTTGCTGAATTATTGGCTGGAAAGCCTATTATGCCTGGTCGAACGGAGGTAATCTCTATGGTGATACGTCTTATAGGGTCTGTTATTACATCTTTTTGGTGCATAATATGTATTCAGTTGACTAGACTATGAGCAAGATTTTGTTGTCAAAAAGGTTTCTCAATTTTCTTCTACTTGTTCGTGATATTTGCGCTTAGGATTTTACTAATATAGTTAGCATGCTTCATGTTTTGTAGGTGGAACAACTACACAAGATATTTAAGCTATGCGGTTCTCCTTCTGACGAATATTGGAAGAAATCGAAGTTGCCACATGCTACCATTTTTAAGCCCCAACAGTCATACAAGCGGTGTATTGCAGAGACGTTTAAAGATTTTCCTCCATCATCCCTGCCGCTTATTGACACCCTTCTCTCAATTGATCCAGATGAACGTTTGACTGCCACTGCTGCGTTGCATAGTGAAGTAAGATAATAATTTAATTGAGTAAATGTTGTAAAGTTGCCTAATTTCTTATGCTTTAATAATTTTTTCCTTCCATGGGCATGCTACAACTGCATAACAGAACACCTTTTATCATATTTATATTCCAATGCAAGAACCATGAATATATATATTCCATAATATACCAGCAGAGACCTTTGGATTGTTTTTCTTCCTTTCGCTATTGCTCATTCTTTTAGTAAACGTGTTTTTGTTGTCACTCATAGCTAGAACAAAACATACCATGGAGAAAGAAGAAATTTATCAAGACAAATGGAAAAAAGTTAACAATAGAAGGGAGATTTAGGAGCACACTTTATCACTTTCAAAAAAAGGAGTACACCTTATCAGGAGAACGAATAAGAATCAACAAAATAAAGAGAAAACCTATTCAAAGAAGCTACTCAATTGTTCAAGTCATGCCCATTAAGGCTCTGTCTTATGCTCCACCCAAATGCAGCATAGAGTGCTCTCTGCGCATCTTTCTGCTAATTATTTAATTAACATTCGTGTTATGAGTGTCATAACACTGCAAGCTCTGAAATTTGGTTCCATAATTATCTTCTTTCTCGAACATGTGTTGCATGATTTTATGAAAATGGTTGTCTTGTAAGTGCATGATTGTGGAAATTCTAGTTGCTGTCCAATTTACTTAATTAGCCATGCACTAAGGTTTATGTTCAACTTAAACTCTGAAATTCCATTCTTGATTTGTCATCCTGTCTAGTTAGAGTATAATATTGAAAAAGTATTGAAGAATGGCTTAGCGAAATTGCTTCCTTAATAACAAGCTTTGACTTCTCTCCTATCCTGGTTAATATGCTGAATTCAATTGCATGATTGGCTCTAGTTTCCTGTGTCCATCTGTTGTGCTTGTGTACGAATTTACCAAACCTGGGGTATAGAATCCTTATCTAACTCAAGCTTACTTTAGTAGCATGGATCACTTTTGCTTTGATTATACCATAAAAATAGCAACTATGAAGTTAAACAAGATTATCTGACTTTCTGAGTTGCCATTGTTTTTGGTTGTTAAACAATGATCCTTGATTACGTAAAACTTAGTTTGGAAATCATGGTAAACTAAAATTAACATTTTGATGTCTGACTGATGAACTACAGTTCAATCGATGAAGTGTTGAAAACCCCTGAACAATTGTTTTTTATTTTTTATCTTCGCTCTGCATCAGAAAGGGGGTTCCTTCCTTGTCATAGTAAATGACAGCAGTAATTAGAGTGCCATGTGCTGTCAATTCGATTGTATGAAGTTTATAATTTTAGACGAACAAATTTGTGCTAGTGATCCTTATAGTGTTTCTGAATTTGAATATAATAACCTTAATGTAATGTTCTTTGGTTCCCTTTTGCAGTTCTTTACAACAAAACCATATGCCTGTGATCCCTCTAGCCTTCCAAAATATCCTCCCAGCAAGGAGATGGATGCAAAGCTACGGGATGAAGAAGCTAGAAGGTGGCTTAAATTACTTTTGGCATCTAAATGATCATTTCATCAATAGTTGATAAAAACGCTTATTTTCATAAAAGTTACCAAAGTACATGCATGTTGGTTAGGTTTTGACCACCTCCATTTTTCTTTCTTTAATTGAGGTTGCTAGGCATCTATACAGCTTCAACGCATATTTTAATTGCACTCCATCTTTACTTTCTCTGCCTCGTGATATTTGACGGAGCAGAAGATATATGTTTTTACAAGACAATATAATGCACAAAAATTCAGTATGTAATTTCAATGTCATCTTGTAGATTGAGAGCAGCTGGTAAAGCTAATGTTGACGGTGTCAAGAAATCTCGTCCACGAGAGCGAGCTGGGCGGGGAATTCCAGTTCCAGAGGCCAATGCTGAACTGCAAGCAAATATTGATGTATGTTTGATAAGGCTCCTATTTCTCTCCAACTAGTACTTCATATTGCTTGAGTTATGATTAAGTGATGAATTAATAAATTATCAATTAGCTGCAATGGTGTAGGTTTTCACTTAAACACACATCAAGATCTATTTCTTATTTATTTTTTCAATTGGCTGCAAGCAATCTACGTGGAAGTTTGTTTCTTTATCCTCCTTTTTTCACAAGTTATTAATTTATTCAGTTGATATTGTTTCCATATATAGAAGAACTTGCACACGGTTAATTGATATTGTTCTATAAAGACATTTGCCAGCAGCCATAACTGCTATTGATCAAGTGCAGGCAGATTGAACTGTTCTGACACCATCTTTTTGAATGCTTTAGATTTGGGGCATTTGGTTGCCTTGGTTGTATAAGTATATGCACCCCTCCTGGAAATTTTGGGGCTATTCAAGATAATTGTGTTATATCACACATTTCCTTTTATATAAAAGTGTGTTAACCTTTAATTCTTACTGTAGAGACGGCGGCTGATCACACATGCAAATGCTAAGAGCAAGAGTGAAAAGTTTCCTCCTCCTCACCAAGATGGAGCTCTAGGCTATCCACTGGGTTCTTCACATCACATGGATCCAGTTTTTGATCCTCCTGATGTTCCATTTAGTTCCACAAAC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