Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23442 LG5 65393045 65393737 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 65393277 missense_variant p.Val86Asp
C/T 65393652 missense_variant p.Gly29Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23442.1
MDQNQRREAGKRISGAPAQADGGKKQAVGVPVASPYAGGYRYDRQCIYQRQQEQLQQRDDKRKIIQKTDVASAISMNDMFDFLVDVVPRDDTVPVMAGQQVLPAPNQNAPYPYMSLPPPPPPPYAAPTTAPGNASSSSAANPFYFNFNPTPDEQGPSNSNHH*


CDS Sequence:
>Vu_23442.1
ATGGATCAAAACCAGCGACGTGAAGCAGGAAAAAGAATTAGTGGAGCTCCAGCACAAGCAGATGGAGGCAAGAAACAGGCAGTTGGTGTTCCTGTAGCTTCACCCTATGCTGGAGGGTATCGCTATGATCGGCAATGCATATACCAGCGGCAGCAAGAACAGTTGCAGCAACGGGATGACAAAAGGAAGATAATTCAGAAGACTGATGTTGCATCTGCAATCTCAATGAATGATATGTTTGATTTTCTTGTTGATGTTGTTCCCAGGGATGACACTGTCCCAGTCATGGCGGGACAGCAGGTGCTTCCGGCGCCAAATCAGAATGCTCCTTACCCTTATATGTCACTTCCACCACCACCACCACCACCGTATGCTGCTCCGACAACTGCTCCTGGGAATGCTTCTTCTTCATCCGCTGCAAATCCATTCTATTTCAACTTCAATCCCACCCCAGATGAACAAGGCCCTTCCAATTCCAATCATCATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23442::LG5:65393737-65395737(-)
TATTTCTTATTTTAAAACGGATCATCACTTAGTTTGTTTTTATTGAAGTTCGCAAAATATTAATGATTTTAGTTTTAAATGAGACTTTATTAATTTGAAATTGATGACTAATAAAAGCTATAAAAACAATAAATGTGAGTATAGGATGCTTAACTGGCATGAGTTGTTTAAAAGTAAAATTATTATGTCAAAATAGGAGCAAAAAATTGTTTAAATAATAGCCCTCTTTTGAAATAGTTTTATGAATACAAATTTCATTTTAATATAAGTTTCACGTACATATATTCACATGTTGCTTTGAATATAAAGAAAGTTGTTTATAAAGTGAAAATTACTTATACAGAAAGTTCTTAAAATTTATAAACGACTACTTTTAATTTAATTAATTCATGTAGGTAAGATCTACATTAAAATAATATTTTTAATTATAAGCAGGAACATGAAAATTTTGAAAAACTAGTTTATTTATTTTTTTAAAAAAACCTATACTTTAACACAATTTGTTTAGATTTGCTAGGAACCTTTTGTCATACAAAGAGTGTTGTAGTTTTGAAAAATCTAATTACTTATACAGGAACATGAAAATTTTGAAAAACTAGTTTATTTTTTTGAAAAAACCTATACTTTAACACAATTTGTTTACTTTTGCTAGGAATCTTTTGTCATTCAAAGAATGTTGTAGTTTTAAAAATAGTACTATATATTGATAATTAATGAGTTAAATAAAGTTTTTATTTGGTTATATATATGCTTAATGAGGTTGTCAACTTCTTATCTTTATTATATTAGTGTTATTAATTGGTAGAAATTTATTTTATTTCAGTACATCCACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAAAATAATTAATACATATTTTTATTCAACTTTCTTTAGTTTGTACAATTGAAACAGTTTATTGGCGCTTTTTTAGATAACACTTTGTGTTCTATTGTCTATTGAAGAGCATATAGCTCTCTTTTTTTCAGAAGTGATAGTTTGTTTTAAAAAATATTTTTATAGTTAAATTAAACAATTTATTTTCCAGGTAGTAAATACTAGTATAAAAAAAGGAAAATAATAATAGAGTAACACATATTTATATTTATTTAACATATATTATAATATATTATAAGTATAAAATGATTATAAAAAAATTAATTTTTTTTATTTTAAAAAAATAACTATTGTAACATAACTACTTGCAGTTCTTTCTTTGACTTTCATTATCACCTTCGTTTGTCTTAAAATTTTCTCTCATTGTTTGGGAACTGAAATTTCACTTCGATCAAAGCAAATTCGAGGTATATATATCTTCTTCTCCGTGACTTTGTCCTTCTATGTTTTTACTATAATATATGTTGCTGGTTTTTAGTTTTTGCTAGTTGTTGGAAAAATCTTTAATTTCTAATGTTAAAGTATCATTTTTTTTTAGAAAAATGATTTTTTTACATATCTAAATTTAATACATTCATTTGGCATTATTTTTATTTACTTTTCTTCTTTTTTTTTCTTGTAAAAATACAAAATTTATATTTTTATTACTATTTTATCTGTGTCAAATAAATATATAAAAGTGTCTCCTGGTATGTTATTCCTTTTCTTACTGTGATTCTAATTGTGTGTAACAGAAACAGGCTTTTTACGAGTTATCGTTAAAGTTTGACACAAATGATTTCATTTAGTTGAGTTCAAAACGGTCATCAATGTATTTGGTGTCTAAAATCGCCTATACTAGGCAAACATGATGTACGAAGTTCTATTATATAGAGATTTTATTTTTCTTACAAATTTTTATCTTAATGATTCTTTTTCAAAATTAAAACTTGAGGAATCTTCTTGATGTGCTCTATTTCTGAATCAGAAGGGTTTCTTTAGGGCATAGACGATGTTCGTTTTTCATGAATCCTATTGCTTATGGTATGAATGGTGAAATATTAATTTGAATTGAATAACAGGAGTTAAG


Gene Sequence:
>Vu_23442(-)
ATGGATCAAAACCAGCGACGTGAAGCAGGAAAAAGAATTAGTGGAGCTCCAGCACAAGCAGATGGAGGCAAGAAACAGGCAGTTGGTGTTCCTGTAGCTTCACCCTATGCTGGAGGGTATCGCTATGATCGGCAATGCATATACCAGCGGCAGCAAGAACAGTTGCAGCAACGGGTAAAAACCTTCTGGGAAAGACAGATGAAGGAAATTAAAGAGAGCAGTGATTTGAAGAACAACTTGCCTCTGTCGAGGATTAAGAAGATCATGAAGTTTGATGAAGATGTGAAGATGGTATCAAGTGAGGCTACTATGCTGTTAGGCAAGGCTTGTGAACTGTTCATAATGGAGCTCACAATGAGATCTTGGGCTCACGTGGAGGATGACAAAAGGAAGATAATTCAGAAGACTGATGTTGCATCTGCAATCTCAATGAATGATATGTTTGATTTTCTTGTTGATGTTGTTCCCAGGGATGACACTGTCCCAGTCATGGCGGGACAGCAGGTGCTTCCGGCGCCAAATCAGAATGCTCCTTACCCTTATATGTCACTTCCACCACCACCACCACCACCGTATGCTGCTCCGACAACTGCTCCTGGGAATGCTTCTTCTTCATCCGCTGCAAATCCATTCTATTTCAACTTCAATCCCACCCCAGATGAACAAGGCCCTTCCAATTCCAATCATCATTGA