Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23441 LG5 65376584 65377315 PREDICTED: nuclear transcription factor Y subunit C-9-like isoform X1
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 65376768 missense_variant p.Cys183Tyr
A/T 65376769 missense_variant p.Cys183Ser
T/C 65376851 synonymous_variant p.Arg155Arg
T/G 65376934 synonymous_variant p.Arg128Arg
C/A 65376956 missense_variant p.Trp120Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23441.1
MDENKHDQAAKEGRGKSKVQSEPKVEPPTSPPALTIGPSASSSNPQTAKESLEQQLSKFWAKQRQEVEETSESKNHCLPLARIKRIMKSDEDVRMVSAEAPVLLAKACEMFIMELTMRAWGNVEENKRRTLSKNDIAAAMSKTDMYDFLVDIVPREDTRGPQVFPGIPGTPIPPTLSQILPNCPVPPHNQHDAAGPQSGAPTMLMGVPLLDPTDPQQLQDQPSPTPVLPKPEEENNPSPDSDD*


CDS Sequence:
>Vu_23441.1
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Promoter Sequence:
>Vu_23441::LG5:65377315-65379315(-)
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Gene Sequence:
>Vu_23441(-)
ATGGATGAAAACAAGCATGATCAAGCAGCAAAAGAAGGACGTGGGAAGAGCAAAGTTCAATCTGAACCCAAGGTGGAACCTCCTACCAGTCCTCCAGCTCTCACCATTGGTCCCTCTGCCTCTTCATCCAACCCACAGACAGCAAAAGAATCATTGGAGCAGCAACTCAGTAAGTTCTGGGCAAAACAGCGTCAGGAAGTTGAGGAGACCAGTGAGTCCAAGAATCACTGCTTGCCATTGGCTAGGATCAAGAGGATAATGAAGTCTGATGAGGATGTGAGAATGGTATCAGCTGAGGCTCCTGTGCTGTTGGCCAAGGCTTGTGAGATGTTCATCATGGAGCTCACAATGAGGGCATGGGGTAATGTTGAGGAGAACAAGAGGAGGACACTTAGTAAGAATGACATTGCAGCTGCAATGTCAAAGACTGACATGTATGATTTTCTTGTTGATATTGTCCCCAGAGAAGACACAAGGGGTCCTCAAGTGTTTCCAGGTATACCAGGAACACCCATTCCTCCGACTCTGTCTCAGATTCTTCCTAACTGTCCTGTGCCACCTCATAATCAACATGATGCTGCAGGTCCACAGTCTGGTGCTCCAACAATGCTCATGGGAGTGCCCCTTCTTGATCCAACTGATCCTCAGCAGCTGCAAGACCAGCCTTCTCCAACTCCAGTGTTGCCCAAACCCGAAGAAGAGAACAACCCTTCTCCTGATTCAGATGACTGA