Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23429 LG5 65260292 65262170 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase CDL1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 65260425 splice_region_variant&intron_variant
G/T 65260441 downstream_gene_variant
C/A 65260473 downstream_gene_variant
T/A 65260617 downstream_gene_variant
G/T 65260621 downstream_gene_variant
T/G 65260626 downstream_gene_variant
T/C 65260699 downstream_gene_variant
C/T 65260844 downstream_gene_variant
A/G 65260852 splice_region_variant&intron_variant
A/G 65260932 missense_variant p.Ile68Val
C/T 65261056 downstream_gene_variant
T/C 65261188 synonymous_variant p.Leu125Leu
A/G 65261191 missense_variant p.Met126Val
G/A 65261296 missense_variant p.Glu161Lys
C/G 65261356 downstream_gene_variant
A/C 65261410 stop_lost p.Ter168Cysext*?
G/T 65261606 missense_variant p.Asp234Tyr
G/T 65261735 missense_variant p.Gly277Trp
T/A 65261855 downstream_gene_variant
A/G 65261913 missense_variant p.Lys305Glu
A/G 65261969 synonymous_variant p.Leu323Leu
A/G 65261990 synonymous_variant p.Ala330Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23429.1
MSCFPCCCKSDTKPTSNGAVSTKVSKGRRTFKSVAAAMSLKTGSSRNRQIDAEIRKFGIVKNDVKVFTYAQLLEATDNFSSDCLVGEGGFGNVYKGYMKSVEQTVAVKVLNRDGAQGTREFFAEILMLSMVQHPNLVRLIGYCADDHYRILVYEFLANGSLENHLLDIGEGKEPLDWKTRMKIAEGAAKGLEYLHSSEDTPIIYRDFKSSNILLDDNFNAKLSDFGLAKIGPKEGMEQVTSRVMGTFGYCAPEYAARGQLSTKSDIYSFGVVFLEIISGRRVYDTSRATAEQNLIDWAQPLFKDRTKFTLMADPLLKGQFPVKGLFQSLAVAAMCLQEEPETRPYMDDVVTALAHLAVHKVGDQDIAGDSIKCAGHVESFRVLSSAGSERT*


CDS Sequence:
>Vu_23429.1
ATGAGTTGCTTCCCATGCTGCTGCAAATCAGACACCAAACCAACCTCTAACGGGGCAGTCTCCACCAAAGTTTCCAAAGGAAGAAGAACATTCAAATCAGTAGCTGCGGCTATGTCTCTTAAAACAGGCAGCAGCAGGAACAGGCAAATAGACGCAGAGATAAGAAAATTTGGAATTGTAAAAAATGATGTCAAAGTATTCACATATGCACAGCTTCTTGAAGCAACAGACAACTTCAGTTCTGATTGCCTGGTCGGTGAAGGTGGATTCGGGAATGTTTACAAAGGATACATGAAAAGTGTTGAACAAACTGTAGCTGTGAAGGTACTGAACAGGGACGGAGCACAAGGAACACGAGAATTTTTTGCAGAAATTTTGATGTTAAGTATGGTTCAACACCCAAACCTTGTGAGGCTCATTGGCTATTGTGCAGATGACCATTATAGGATTTTGGTTTATGAATTCCTGGCCAATGGGAGTTTGGAAAATCACCTTCTAGACATAGGTGAAGGTAAGGAGCCTTTAGATTGGAAGACCAGGATGAAAATAGCAGAGGGAGCAGCTAAAGGACTTGAATATTTGCACAGCAGTGAAGATACACCTATCATATACCGTGATTTCAAATCATCTAATATACTGTTAGATGATAACTTCAATGCAAAGCTCTCTGATTTTGGGCTGGCTAAGATTGGTCCTAAAGAAGGGATGGAGCAAGTGACAAGCAGGGTGATGGGAACTTTTGGTTATTGTGCACCAGAGTATGCTGCTAGAGGTCAACTCAGCACAAAGTCGGACATTTATAGTTTTGGGGTTGTGTTTTTGGAAATAATATCGGGTAGGAGAGTATATGACACTTCAAGAGCTACAGCAGAGCAAAACTTGATTGATTGGGCACAACCTTTGTTTAAGGACAGAACGAAGTTTACTCTAATGGCTGATCCTTTGCTTAAAGGTCAGTTCCCCGTGAAGGGTCTATTTCAATCGCTTGCAGTGGCAGCAATGTGTTTACAAGAGGAACCTGAAACACGACCTTACATGGACGATGTTGTGACGGCTCTTGCACATTTAGCAGTGCACAAAGTTGGAGACCAAGACATAGCCGGAGACTCTATAAAATGTGCAGGCCATGTTGAATCTTTCAGAGTTCTAAGCTCTGCTGGATCCGAAAGGACGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_23429::LG5:65258292-65260292(+)
ACTGAACCAATAGTAAATGTCTCTACATTTAAATGCATATTGAGTATTAAATAGAAGTGTTAACGTTAATTGCCACCTTCAACTATAACTCTTGATGTAATGGTTCTTTTAGTCGTTGGAATATAGGAATGGGAGGAATTCAAGCATCGTGCTTCCTTCAAAGGAGTGCTGTATCTGAAAAGTACATGGGGGATGAAATCTTTTAAAGTATGTGTTATCGCTGATTTAAAAAACTGAGTTAGGATAAGCGCAAACTAACACTGGATCGCTTTATGCAAAAGTATTTGAACTTATTTAAGATTTAGAAAAGTAATCTTATTATATGTAATAATTTTGGACGGCACGAAATAAATTATCTCCAAATAGATGTATGTGTATGGCTTGTAAAAATGATAATTAGTTAGTAGCTTAGTCTGTGTCATGCATTGTGCTCGGATAATTGCTTTACAAATTCACTATTTTGGATTATTTGTTTGGTTCTGTTTACAAATTTCCATATAAATATTTTTTTTTAAGAACAAGTGGTGTTTTTTACAACAACCTCTAAATATGAATTAATGTTTATTTTTGCATTTGAATCGTGTTGAACGGAATTTTTCGAATCTATAAGACAAAAACAGGAAGAGGGAAATGTTTGGATGGACACTCAGTTAAATATAACAGAAAAACAAACCCAAATTTAGTTGGATATTAAATCTTTGTTCGAATATCCATACAAGTGAATATGTACATATGCAAGGGTATAAGCTTAACGTTAAAAGTTTATAAGATCTTGATCATTATATAAAACTTAAGATTCGGATATTATTAAAGCTTTTATTAGCATAGCTATCATGACATAAAATTTAAATTTTATAAACAAAATACTAAATTATAAAAGAAATTAACTTTAAAAACACATTTCCTTTTACAAAATATAAATAAAACATTAAATTAAAATCTAAGTGCCGTAAAACCCTTCCCAAATAAAAATTGAAAAAGATCGAGATACTCCACCTCACAAAAACATTAAGGCAGAAGTTTCTTTCATTATATCCAGATTTATACTTCCATATATCATACACGTTTTTGTCACACATGCCTCCTATTTGTGCTTTCATTGTTCAGTTTAATAATTGAATGAAAAAACTATTTTACGAATTTGTGAATTTCAATTAATAGGGTACGTTTAAGGTCTCATGTATCCACACCTCATGTTAAATATACACATAATTTATTTAACTGGAGTTATCAGGAAATGAAAAATAACACCCGTAATTGTCACTAAAATAATCTTATTTTAATCACAAAAATAAAACCTCTCTTATAATACCTCAAGTTGAAAGGAGTTTCTACCAAGGATAGGTACCATCAAAATAGAGATACTCAAAAAGCAAACTCAAATAAAATAAAATAAAAAACTGTATGTATAATGACACCTCAAACTAGGATTATTTTTATGTACAACTAAAATAAATAAACGAACAGACTATTCCCATGCAAGGTTCAAAAATAGAATGAATTTACCTAAAAACAATGTGTTTACCTTATTTGCATCTAACTCATCCTTATTTTCTACGTCACTAGATTTTCTAGGCTAGAAGGCCAAGTGTTTTTTAAAGTGAAAAAGGTTGTCTACGTGTTTATTTAATTCCAATTTCCAATTGAAAAAAGAGATCGTAAAACATGGTAAGAAGAAGTTGTTGTCTTTGTCAGAATTCCTTTTCTTTCTACGTGTCAGAGAAAACCAGCTAAGAATAACTATGTTAAAGAATTTCATTTCGATGCTCAAAACTAAAATAAGTAATTAAAAACAAATACGAAACAGAAATTTAAAGTATTTTGACCCTGAATTAGGGCTTACAGTTTAGAAAATTTAGCCATCTCCTACCTACCGACCGTTATTCTGTTTTTTTTTTCATAAGCTTTGTGCATACAATTTTTTTTCTGGAGATTATTGTGTTGGTTGATTACAAATCTTTTCAAGGTTTGTAGCCAACCATCAACAAGGTCTCCGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_23429(+)
ATGAGTTGCTTCCCATGCTGCTGCAAATCAGACACCAAACCAACCTCTAACGGGGCAGTCTCCACCAAAGTTTCCAAAGGAAGAAGAACATTCAAATCAGTAGCTGCGGCTATGTCTCTTAAAACAGGTATGTCGTATGCTTCATTGCTGATATAAATATTAATCTTTTCTAATTCCAACCCCATTATTATTACATTCAAAACAATCCACTTTTTATCCTTTTTATTCTTTTAACCCTTTCTTTCATCGTAATGTTTATGCCAGTTTATTTTTTTTAATCATTTTCTGTCACTTTCTTTAACGTTATCTGGGTGGAGATTAGCCCTCCCGGCAGTAACATTTTTTCAGGATATAAAGATGTCTCGTGATGAAGATTTTTTTCTTCTTAAGGAATTATTACCAATTAATTCCTTCGTTTTGTTTGATTTAACTGTATTTCTAAATTCAGCTGAAATTCTTCCTTGAATGTAATGAATTTCCTAATTCTACGAGCATCATGCATGAAAATATCATATTGCATGTGAATGAATAATTTTATAATAACTGGGTGATCTCAAATTACAGGCAGCAGCAGGAACAGGCAAATAGACGCAGAGATAAGAAAATTTGGAATTGTAAAAAATGATGTCAAAGTATTCACATATGCACAGCTTCTTGAAGCAACAGACAACTTCAGTTCTGATTGCCTGGTCGGTGAAGGTGGATTCGGGAATGTTTACAAAGGATACATGAAAAGTGTTGAACAAGTCTGCCTCGTATTTTATCATCTAATAATGCTTTGAGTTTTACACAAGGTTGTGAAAATCTAATGTAAAGTATTTTGTGTTCAGACTGTAGCTGTGAAGGTACTGAACAGGGACGGAGCACAAGGAACACGAGAATTTTTTGCAGAAATTTTGATGTTAAGTATGGTTCAACACCCAAACCTTGTGAGGCTCATTGGCTATTGTGCAGATGACCATTATAGGATTTTGGTTTATGAATTCCTGGCCAATGGGAGTTTGGAAAATCACCTTCTAGGTATGATGACAGAAAATTCTGGTATGGACTTAGCTTTACAGAAACACATTGTATATTATGCAACTCTAACTAGATTTTATTGATGTCAGACATAGGTGAAGGTAAGGAGCCTTTAGATTGGAAGACCAGGATGAAAATAGCAGAGGGAGCAGCTAAAGGACTTGAATATTTGCACAGCAGTGAAGATACACCTATCATATACCGTGATTTCAAATCATCTAATATACTGTTAGATGATAACTTCAATGCAAAGCTCTCTGATTTTGGGCTGGCTAAGATTGGTCCTAAAGAAGGGATGGAGCAAGTGACAAGCAGGGTGATGGGAACTTTTGGTTATTGTGCACCAGAGTATGCTGCTAGAGGTCAACTCAGCACAAAGTCGGACATTTATAGTTTTGGGGTTGTGTTTTTGGAAATAATATCGGGTAGGAGAGTATATGACACTTCAAGAGCTACAGCAGAGCAAAACTTGATTGATTGGGTATGCTACAGAACAAAACATGTCCATGGTTGTCACTAATGTTCTCATAACACATAACTGAATTTTTTGTACTTTTTTTTTGGTATTTGTCAGGCACAACCTTTGTTTAAGGACAGAACGAAGTTTACTCTAATGGCTGATCCTTTGCTTAAAGGTCAGTTCCCCGTGAAGGGTCTATTTCAATCGCTTGCAGTGGCAGCAATGTGTTTACAAGAGGAACCTGAAACACGACCTTACATGGACGATGTTGTGACGGCTCTTGCACATTTAGCAGTGCACAAAGTTGGAGACCAAGACATAGCCGGAGACTCTATAAAATGTGCAGGCCATGTTGAATCTTTCAGAGTTCTAAGCTCTGCTGGATCCGAAAGGACGTAG