Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23336 LG5 64412419 64416110 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 64412685 intron_variant
T/A 64413464 upstream_gene_variant
A/G 64413682 upstream_gene_variant
C/A 64413796 upstream_gene_variant
A/G 64414110 5_prime_UTR_variant
C/A 64414120 5_prime_UTR_variant
G/A 64415252 synonymous_variant p.Gly315Gly
G/T 64415336 synonymous_variant p.Arg343Arg
A/T 64415345 missense_variant p.Glu346Asp
C/G 64415351 synonymous_variant p.Ala348Ala
T/C 64415358 missense_variant p.Cys351Arg
G/T 64415686 missense_variant p.Arg460Met
A/G 64415699 synonymous_variant p.Glu464Glu
T/C 64415706 missense_variant p.Cys467Arg
G/T 64415814 missense_variant p.Ala503Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23336.1
MQTSQKHPASSGFDLYHQPVQNVDPYTRYQVLQSNSCHEIHDSNSQGTTISFEPCKEQYFTLESSPALNDLIGSDSPSYASVSSNSNRSPFSPHASHSYHSDQHQSSDNNYGSPTSAHSSADDSYELKHKLRELEISLLGPDSEIVDSCHCCYEGGHHGASPMAKYNWDQVVEMIPKLDLKEVLSRCAQAVSDGDIETAVGFMNNVLPKMVSVGGDPIQRLGAYMLEGLRARLESSGSLIYKALKCEQPASKDLMSYMHILYQICPYWKFSYVSANAVIGEAMQNESRIHIIDFQIAQGTQWMLLIHALASRPGGTPFIRVTGVDDSESFHARGGGLDIVGKRLSEYAKSCRVPFEFHSAAMSGCEVELENLVVLPGEALAVNFPFVLHHMPDESVSTENHRDRLLRRVKNLSPKVVTLVEQESNTNTSPFFQRFVETLSYYSAMFESIDVALPREDKQRISAEQHCVARDIVNMIACEGPERVERHELLGKWRSRFSMAGFAPCPLSSSVTNAVRNMLREFNGNYRLEHIDGALYLGWKRRALCTSSAWRCY*


CDS Sequence:
>Vu_23336.1
ATGCAAACGTCCCAGAAACACCCAGCTTCATCCGGTTTCGATTTATACCACCAGCCTGTGCAAAACGTCGATCCCTACACTCGTTACCAAGTATTGCAAAGCAATTCTTGCCATGAAATCCATGATAGCAACAGTCAGGGAACCACTATCTCGTTTGAACCCTGCAAGGAGCAATACTTTACCCTTGAATCATCCCCAGCACTCAATGATCTCATAGGTAGTGATTCTCCTTCCTATGCCAGTGTATCGTCCAATTCCAACAGAAGTCCTTTTTCTCCGCATGCTTCTCATTCATACCATTCAGACCAGCATCAGTCATCTGACAACAACTATGGATCACCAACGAGTGCACACTCCAGTGCTGATGATAGCTATGAACTGAAGCACAAGCTCAGAGAACTTGAGATTTCACTGTTGGGGCCTGATTCAGAAATTGTTGACAGTTGTCACTGCTGCTACGAGGGTGGCCACCACGGAGCATCTCCAATGGCTAAATATAATTGGGATCAGGTTGTAGAAATGATTCCAAAACTAGACTTGAAAGAAGTCCTCAGTCGGTGTGCACAGGCTGTATCTGATGGTGATATTGAAACAGCGGTGGGATTTATGAATAATGTATTGCCAAAGATGGTATCAGTAGGGGGTGATCCAATCCAGAGGTTAGGGGCCTACATGTTGGAGGGTCTAAGAGCAAGGTTGGAGTCTTCAGGGAGCCTAATATACAAAGCCTTGAAATGTGAACAACCAGCAAGCAAAGATCTCATGAGTTACATGCACATCTTGTACCAGATTTGTCCATATTGGAAGTTTTCTTATGTATCTGCCAATGCTGTCATTGGAGAAGCAATGCAAAATGAATCAAGAATCCACATAATTGACTTCCAAATAGCACAGGGCACTCAGTGGATGCTGCTTATTCATGCTCTTGCATCTCGTCCTGGTGGGACACCTTTCATTCGTGTAACTGGTGTCGATGATTCCGAATCCTTTCATGCAAGAGGAGGAGGACTTGACATTGTAGGAAAACGGCTCTCAGAATATGCCAAATCCTGTAGAGTTCCATTTGAGTTCCACAGTGCGGCAATGTCTGGATGCGAGGTTGAACTAGAAAACCTTGTGGTTCTACCGGGGGAAGCTCTGGCTGTGAATTTCCCTTTTGTTTTGCACCACATGCCAGATGAGAGTGTGAGCACAGAGAACCACAGGGACAGGCTATTAAGACGGGTTAAGAATTTGTCACCCAAGGTTGTGACACTGGTTGAGCAAGAATCCAACACCAACACTTCCCCCTTTTTCCAAAGGTTTGTTGAGACATTGAGTTATTACAGTGCAATGTTTGAGTCAATAGACGTGGCCCTGCCCAGAGAGGATAAGCAAAGGATCAGTGCTGAACAACACTGTGTGGCTCGTGACATTGTTAACATGATAGCTTGTGAGGGGCCTGAGAGGGTGGAAAGGCACGAACTTTTGGGGAAGTGGAGGTCAAGATTTTCAATGGCTGGTTTTGCACCATGCCCTTTGAGTTCCTCAGTCACCAATGCAGTTAGAAATATGTTAAGAGAGTTCAATGGAAATTATAGGCTAGAACATATAGACGGTGCGCTCTATTTAGGATGGAAGAGAAGAGCCCTCTGTACATCTTCTGCCTGGAGATGTTACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23336::LG5:64410419-64412419(+)
CTAAATATTAATAAGATGTTAAATATAATTATATTAAAATTATATTACATAAGAAGTATATCTTTACAAATAAGGTATTATGAATGAATGTATACTAACTTGACATCACTTACAAATTGTTTTTATTGGAGGACTCAGATCATGCATGTTGAATGCAGATTGATAGTACCCAAATATCTTGTATCAACCTTCCTTTTATACTTCCGAAATTTGGTGCGAATATTCTTGGATAAATTATAATTAAAAGTAAAATAACATAATTCGGATAGTTTTTTTTATTAATTTGAAATTGTCAAAGAAATTCAAGTTGAACTAATCTCGTTAAACTATATCAGTTGAATTTATTAGAAACTAAATCAACACAGGCAATTTAGCTTTTAAAAACACAAGCAATTTAGCTTTTAAAATAATTCTTTCATATATTTCTTTGATTAATTTGTTCAAGCATTGGTAAAAAAATTTAAACTGGGAGGGAATAAAAAATAGTGAAGACGACTCAGATTTATATTCATCATGATCGAGATTACGCATTCAATACCCAATCGGTATCGTTGGATTACACCAATGTCTTGATGATGCCACTCAACTTAATATTAAATAAACCGATTTTTCCTCTCTTTTTTCTTCAAGTTGGGTTCGTTTATTAGATTCTTATGTTAGATTGAATCCATCATCACCTCAAATGGTATTAATTAGGGAGGCTTCTTTTATAAATATTTACATTTGTATATATTTTTATGTAAGCTTCAGCTGCATTTTATATTGATATAACAATTTTTTTAATGAAATTAATATTTTATTTTTTACAACACGTGTTTGGTTTCAGCCAATTTTAGGCACCAAATATAGGGTGGAAACTTGGACGCGTTTGAATTAGTTTGAAGAATATTTTATGATGTAATTTTTGGACAATATTTTATAAATTATTTTTCTAGTTTATGAAAAAATTGATCAGAAATCTCTTTTTTTTTTCTGAATTTTAAACTTAAAAAAAAAAATCAACAACCGTCGAAACATTAGTATTTTCGATGCACCATTCTCAACTTAATATTTTATAAAATGACAAATCACTGAAGACAGCTGTTATATAAATGGAACATTGACCTTTACTTTAGTTTCTTTTTACATTTACTTATAAAGAAATGATATCGTTGGCACAAGACGATGTATATCGATTGGTTTACATTAAAGAATAATATTGTCTATACGAGACAATATCATCATCTCGTATTACTGATGTGATTAACGAAATTATAATTGATTCATGAAAGACTAAAATGAGATTGTAATACCTTAAAAATATTTAGTATGGACCTAACCTAGTTAACCCTCAGGTGAAGAATCATGACAATAATATAAAAATATATTATTCACGAGTTATTATTACAATTATTATTATACTTAACTGTCAGAGTGTTTTTACAAACACTCATTCTTGATTGAAAAGATCTCGACGGAATCGAAAAAATGATTAGAAACAACCCGTCTATTGAAGAAAAAAAAATCATGAACACTAAAAATTAAGGAGAGTATTTGGACTCTAAAGAACATAATAATTGCAACAATGTTTTGTTATATAATATTTATTTTGAATTGTTATATTTTGATAGAATAAAAAAAATTACAAATTAAAACATTATTATGGTAAAAAAGTCAGGGACGAGATAAGGTACACATAAAGACATGCTTTAAATTCCTTTGGCTTGTAGTATGACAAGTGAGACTGTGAGAGAGAAGATTTAAAATTTTGGTGTGCTCATAATGAATTAACGAGTACCTACTTTACTCGGAGTCGGAGAAGAAGCTTCTATTAAGTTCGGTTATGTTATTTGGTAGTATCTTTTTGATGGCTGTTAGCTAAGAATGAAACCGAGTGGTACTGTGACATGCAGGTCCCACGTAAGGGTTGTCACGTAATTATACTTCATTTCTAAGGCTGATTCTCACCATACATATTTATTTATTATAAATACATGTCATATGATCATATGATGCAATTA


Gene Sequence:
>Vu_23336(+)
AATGAACATTAAAATCACACAAAACGCTCACTGATTACCAATCCATTGTTTTTGGACTCCACACAAGCCTCAAACCTTTCTCTCTCTTTATCTCTCTATGCAAAACCACCCTCTTCCTTACCACGCATCTCTGCCAAACAGCACGTAACTCAACATATCAACCAAAGACCTGACTCTGAATCTGAACCTTCTGTCGACAAAAGGTATGTTCTGTCTGTCTTGTCTCCATAAGGTTGATGAGATGGCATGTGGTTTTCTCTTTCTGTTTATGTTCAACTTTGATCGTGGTTTGTTTGAGGACATGTTTGACAAGGGTTAATCTGGGTTGGTGTTATAATACGCTGAAACTTCTATTTCTGTCTATTTTCAACAGTCAAATCTGATTTGTAATCTTCGGAGATGTTTCTTGTTTCTTTAGCATTTTGGTTACGTTTCTTTGACGTGGAGGTTGTGGACGCGCTTCCACCGTGTTTGTGGTGGTTTTGTTCTAACATCCGGGTTATAGAGCATTGTTATTTGTGTTAGTTGTTTTTCTTTTGCCGACTTTGTTAAAAAACTGCTTTCTCTTTATTTTGGCAGTTACTTGCCTTTTTCTCTATCCTAAAACCTGGTAGAGTTTACCACCGTTATTGGAATATATGAATTTTGTTTTATATCTACCAATATTATGCTAGTCTCTCTGTTTCTTTATACCGGTGATTTTCTTGCTGAACTAATGGCTTTCAATTTTAAGAGTCCTCTCTGCTCTGTAAAATGAATTACGTATGTGTTGAAAACTTAGTTCTATTCTAGAAGGGAAAAGGAATAAAACTTGTTTTTGTCTTGCTTTATAATCTGTGCTTTTGGTTGCTAAGATCTTCTCTGGTTTCTAATTACATAATCTATTATTAGTTTCACAAGTGGATGATTTTTTTTTTTAAAGGTAATGCAGATTTAACTGTATAAGTTATTAAGAGTTTTGACAGCTACACCTCCTTGTTACATGAAATAAATCTTATTAGAGTGCGCATCTGTTTGTCCTTATCTTTTCCCTTACTTTTGACCCTTTCTAAATTTGACTCTCTTTGAGTTTGCATCTCGTGATTTCTAGAGCAATCGAATGGTCTTCTTCCCTCTTTCTAATTACTTTACCTTACTTTGCTTTTGTGGGAAAGAAATTCTGAAATAGATAAGATATTAGTCTTCTCAGTTCTTTCATCCTTCCTTTTGCACTTTTAGAAATTGTGAGAACCTTCCAAATCACAAGACTGGGATATGTTGCGAACTTGCTATAAGTTGATCTGTTGTGGTGTATTGTATAACATGGTTCATCACATACAAAAATCTCCTGGAATTGTTGTTTGAGTATCAAAAAACAGGTGTCTAATTAAAACTACTCTCTCTCAGTTGTCAAATGGTGTTAAGTAACCTTTTTCCTTTCATTTTTAGCATTGTAATTGCGCCTTGAGTGTTGGTCCTGATGGATTCTAGGATGATTTTAATTTTTTTTCTCTACATGGAAACAATTACGTAGAAACTCCTATGTGGACTGAAATCTTTGTATTATAGAGTGCATCAGCGTGTGCTTTTCTCTACTTCGTCTTCATTTGATAAGACCTTGCTTTGGCAAACTGTTAAAATTTATTTCTCGCTTTATTTAATCAGCATTGAATCTCCGTTGACAATTTATCTTACTATGCAGGTTGTAGACAACAATTTTTGCCGATATTTGAAGCATCTGGCAGCTGATCAAAATGAAGATTGATCATCCAACTAAACGGAAGTGTAGAGATATATGCATTTGATGAAGGGGAAATCAGAAAGAGTTAGGAAGAACTTTTACAACCACAAAATTTGACCATCATTATTCTAATCAATAACTCTCAGCTGAGCAAATAATTTCTTTTTAGATGCAAACGTCCCAGAAACACCCAGCTTCATCCGGTTTCGATTTATACCACCAGCCTGTGCAAAACGTCGATCCCTACACTCGTTACCAAGTATTGCAAAGCAATTCTTGCCATGAAATCCATGATAGCAACAGTCAGGGAACCACTATCTCGTTTGAACCCTGCAAGGAGCAATACTTTACCCTTGAATCATCCCCAGCACTCAATGATCTCATAGGTAGTGATTCTCCTTCCTATGCCAGTGTATCGTCCAATTCCAACAGAAGTCCTTTTTCTCCGCATGCTTCTCATTCATACCATTCAGACCAGCATCAGTCATCTGACAACAACTATGGATCACCAACGAGTGCACACTCCAGTGCTGATGATAGCTATGAACTGAAGCACAAGCTCAGAGAACTTGAGATTTCACTGTTGGGGCCTGATTCAGAAATTGTTGACAGTTGTCACTGCTGCTACGAGGGTGGCCACCACGGAGCATCTCCAATGGCTAAATATAATTGGGATCAGGTTGTAGAAATGATTCCAAAACTAGACTTGAAAGAAGTCCTCAGTCGGTGTGCACAGGCTGTATCTGATGGTGATATTGAAACAGCGGTGGGATTTATGAATAATGTATTGCCAAAGATGGTATCAGTAGGGGGTGATCCAATCCAGAGGTTAGGGGCCTACATGTTGGAGGGTCTAAGAGCAAGGTTGGAGTCTTCAGGGAGCCTAATATACAAAGCCTTGAAATGTGAACAACCAGCAAGCAAAGATCTCATGAGTTACATGCACATCTTGTACCAGATTTGTCCATATTGGAAGTTTTCTTATGTATCTGCCAATGCTGTCATTGGAGAAGCAATGCAAAATGAATCAAGAATCCACATAATTGACTTCCAAATAGCACAGGGCACTCAGTGGATGCTGCTTATTCATGCTCTTGCATCTCGTCCTGGTGGGACACCTTTCATTCGTGTAACTGGTGTCGATGATTCCGAATCCTTTCATGCAAGAGGAGGAGGACTTGACATTGTAGGAAAACGGCTCTCAGAATATGCCAAATCCTGTAGAGTTCCATTTGAGTTCCACAGTGCGGCAATGTCTGGATGCGAGGTTGAACTAGAAAACCTTGTGGTTCTACCGGGGGAAGCTCTGGCTGTGAATTTCCCTTTTGTTTTGCACCACATGCCAGATGAGAGTGTGAGCACAGAGAACCACAGGGACAGGCTATTAAGACGGGTTAAGAATTTGTCACCCAAGGTTGTGACACTGGTTGAGCAAGAATCCAACACCAACACTTCCCCCTTTTTCCAAAGGTTTGTTGAGACATTGAGTTATTACAGTGCAATGTTTGAGTCAATAGACGTGGCCCTGCCCAGAGAGGATAAGCAAAGGATCAGTGCTGAACAACACTGTGTGGCTCGTGACATTGTTAACATGATAGCTTGTGAGGGGCCTGAGAGGGTGGAAAGGCACGAACTTTTGGGGAAGTGGAGGTCAAGATTTTCAATGGCTGGTTTTGCACCATGCCCTTTGAGTTCCTCAGTCACCAATGCAGTTAGAAATATGTTAAGAGAGTTCAATGGAAATTATAGGCTAGAACATATAGACGGTGCGCTCTATTTAGGATGGAAGAGAAGAGCCCTCTGTACATCTTCTGCCTGGAGATGTTACTGACTCACTGGCATACATCTATCTATGTCTGCATCTTCTTCTTCCTTCTTCTCTTGTATTATCATCTACTCATTTTTCTCTAGTATCACCATTTTCTCAACAGGACCACTACCTATCAAGATACTTATGCATATTTTTTTCGAT