Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23314 LG5 64252710 64253527 PREDICTED: nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 64252861 3_prime_UTR_variant
T/C 64252902 missense_variant p.Ser176Gly
T/A 64253078 missense_variant p.Glu117Val
A/G 64253113 synonymous_variant p.Pro105Pro
G/T 64253160 missense_variant p.Leu90Ile
G/T 64253161 missense_variant p.Asp89Glu
C/T 64253463 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/A 64253518 5_prime_UTR_variant
C/A 64253520 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23314.1
MAESDNDSGGQAGNTSGGNEFSGCREQDRFLPIANVSRIMKKALPANAKISKEAKETVQECVSEFISFITGEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAMTTLGFEEYVEPLKIYLHKYREMEGEKTAMMGRPQGGGGGGGGSGGGDQRDEAYIHGHAHGGMVPNSMMAMMGHQGHVYGSGSAGSASSARTR*


CDS Sequence:
>Vu_23314.1
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Promoter Sequence:
>Vu_23314::LG5:64253527-64255527(-)
AAAATTAGTCGGCGTAACACCAAATATCGGGGTGTTACACAGAGCACATTTCTTAGAGTTGAAAGGGACAGAGAAACTAAAGGAAAAACTACCCGTAACAGGCAACCAGCAAGTTGCATGGCTTAGGTTCAAGAACGGTTGAAAGAAAAGGAAAAAAAACACTTACCGGTCGGAATGGAAAAACGTTCGGTTCAAACTGAAGCCTTTGGTGCAGCAAGCGCGAAAACACTTTCAAATCAAAATTTGATCGGTTCAATGAAAAGAAAATCTAGAGAGAAGGAAAAGAAAATTTTAGGACAAGGGTTTTAGAGAGAGAAAAAAAGCTGGCAAAATGAAGAAATCCTGATATTTAGAAAACCTCTTTCTAAAGTCATGGATCTTAGCTTATGACTGACAAGTCCAATAGCTTTATTATTTTCAAGTTCTTACAGGTATTATTTAAAAAAAAAACAGATAATATACATCGTGTTATTTAACATATATAATTTTTTAAGCGTTGCATTCCCACTTTGTATTTCGAACAACATTAATTCTGCATTTCTTTCAATACTTCATAATTAAAACTTAAACTGAAAACATTTCAACCAATAGATTGCAGCTTTATCATCGTGCATTTTTTTTTTCATATCCTGGTCCATTCGAAAGTTATTAAATGTTTGAAAAAGTTAAATTGAAAATCGAAATCTAACAAATTAGCGAATTCAGGTAAAATAACGAAGTGATGCTTTTACATTAAAGGTTGAAAATGGAAAGAAGGAAAATTCTTATTTTTCCATTAAAGATTGACAAGTAGAAAGTTGAAAATTGAAACATTACTCATTTAGTTCATTGTCATTGTTTATACAAATAAATAAAATTTTCTGAGGTTTAAATATGTGTAATACATAGTCTCATTACAGGACCAAAATAATTAAACTAAATTAATAATAATATTAACTGTGAAACATAAAAGTTGTTCAAATCCAAGCAATAGTGTAACACCTACAAAATCAAGACAAACAATTTATTTAAATAATTATACATAATAGATTATTAAATGGTCGAAGTATGAATATTTGACAAAATTAATTAATTGTCCAATTTAATGAAATTTAATTAAGTATTAATAATTAGATTAGGAAGTACAATATTTTATTTTTTCCACCAAAAAGTATATAATTTTCAATTCATTAAATACATAATTGTTATTTAAATCATTATAAATTACAATTTTGTTAAATGAGAAAATATTACTACAGTAACATATTTTTGTTTTTAATTTTGAAAAAAAACCTGTTCATCATAGGGTAGGCTTGAAGTTTTTTGTTTTCTTCAGCCGATGGAGCCGTCCTACAGAAACAGCTTATAAGGTCTTCTTTCCTTTTGCCATAATTCAACGTCCACGTGGATCTTCATCTTTTTCCTTCTAATCCAGCGCTAATCATCAACCATACGCGTCAATTACTTAACCAATCACATAAACCAACGGCCACAAATTAGCCACGTCTCTTAACTATGTACACGCAGTAATAATTAAACATAATTAATTAACTCCAAATACCTTAATTAATCCAATTCTCCAATCCAACAAACACCCACTTCTCCCACTCCAACCCCCCATTTGCCAACCTTCCTTATTTAATCCTATCCTCTCACAAATTAATTCCAATTACATTCACACTCAACCTTATTCTCCACATCATTCTCACTATTCAATCCCAATTATTATTTTTAAAATAATATTTTAATACACAAGATTTTTATATTCATTTAACAAAAATTCATTTTTTATGATATTTTTTGTTAAATGAATATAAAAATCTTAGATGTGTATTACTCTTTCTATTAATATTAATAATAATATATCTAATTTCATGAAGTACACATATTTATGTGAATAAGAGAACCTTATTTCAATCAAATAATTTTGTATCAGTTAATTTATTACAGTTGTAGTTAAGTGACGGTTAATTAATACTTTGTACGTATACATATACCTGCATTTGTGTCTCTGTGTGTGT


Gene Sequence:
>Vu_23314(-)
ATATATAGAGAGAGAGAGAGGGGGGAGAAAAAAGGGTTATGTGTATATAATAAGTTTGTGTGTGGTGGTGGTATATATCTGTGTGTGTGAGAGTGAGGTCATGGCGGAGTCCGATAACGATTCCGGAGGTCAAGCCGGAAACACGAGTGGAGGCAATGAATTCTCGGGGTGCAGAGAGCAAGACAGGTTCCTTCCGATAGCAAACGTGAGCAGGATCATGAAGAAGGCGTTGCCGGCGAACGCGAAGATCTCGAAAGAGGCGAAGGAAACCGTGCAAGAGTGTGTGTCGGAGTTCATCAGCTTCATAACAGGTGAAGCATCTGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGAAAAACTATCAACGGTGATGACCTACTGTGGGCCATGACCACACTGGGGTTTGAGGAGTATGTGGAGCCTCTCAAGATTTACCTGCACAAGTATCGGGAGATGGAGGGGGAGAAAACTGCTATGATGGGAAGGCCACAGGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGTAGTGGTGGCGGTGATCAGAGGGATGAGGCTTATATCCATGGCCATGCTCATGGAGGTATGGTGCCAAACTCTATGATGGCGATGATGGGGCATCAGGGACACGTGTATGGATCTGGGAGTGCTGGATCAGCATCTTCTGCAAGAACTAGATAGTAGCATGTTTATGCATGTGTCTGTTTAAGCTTAATTGATTCTATAAGATGATTATCATTATTTAAATTCGTATATGTTTGGTTTTAGAAGCAGCTCCACCTTGTAATTTCTTGTTGAAATTTCGTCGTTGAGAATATAGACATTATATATCATGGAT