Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23200 LG5 63236108 63241752 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein ATHB-14
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 63236169 5_prime_UTR_variant
G/A 63236195 5_prime_UTR_variant
C/A 63236200 5_prime_UTR_variant
T/G 63236416 5_prime_UTR_variant
A/G 63236435 5_prime_UTR_variant
G/C 63236484 5_prime_UTR_variant
G/T 63236522 missense_variant p.Lys7Asn
C/G 63236812 intron_variant
G/C 63236826 intron_variant
T/A 63236848 intron_variant
T/C 63236987 synonymous_variant p.Asn94Asn
C/A 63237091 intron_variant
T/A 63237134 intron_variant
A/T 63237230 missense_variant p.Gln146Leu
A/T 63237333 intron_variant
G/T 63237343 intron_variant
T/A 63237358 intron_variant
C/T 63237516 intron_variant
T/C 63237527 intron_variant
G/T 63237538 intron_variant
A/T 63237785 intron_variant
C/A 63237882 synonymous_variant p.Pro250Pro
T/A 63237979 intron_variant
G/A 63237981 intron_variant
G/T 63237982 intron_variant
T/C 63237983 intron_variant
T/G 63238353 intron_variant
C/G 63238635 intron_variant
A/G 63238675 splice_region_variant&intron_variant
G/A 63238774 intron_variant
C/A 63238782 intron_variant
A/G 63239287 missense_variant p.Lys461Arg
T/A 63239719 synonymous_variant p.Gly539Gly
G/A 63240021 splice_region_variant&intron_variant
C/A 63240154 intron_variant
G/C 63240320 missense_variant p.Leu632Phe
G/C 63240489 missense_variant p.Gly689Arg
A/T 63240496 missense_variant p.Lys691Met
G/A 63240664 intron_variant
T/A 63240717 intron_variant
T/G 63240719 intron_variant
A/G 63240722 intron_variant
A/T 63240974 intron_variant
A/G 63240975 intron_variant
C/A 63240993 intron_variant
C/T 63241469 missense_variant p.Pro815Ser
T/A 63241668 3_prime_UTR_variant
C/T 63241739 3_prime_UTR_variant
G/T 63241748 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23200.1
MALTLHKDSANNQMDSSKYVRYTPEQVEALERVYAECPKPSSLRRQQLIRECPILSNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKEASRLQTVNRKLTAMNKLLMEENDRLQKQVSHLVYENGYMKQQIQTASAGTTTDNSCESVVMSGQNQQQNPTPQHPNRDANNPAGLLAIAEETLAEFLSKATGTAVDWVQMIGMKPGPDSIGIVAVSRNCSGVAARACGLVSLEPTKVAEILKDRQSWYRDCRCVEVLSIVPTGNGGTIELMYMQTYAPTTLAAARDFWTLRYTTSLEDGSLVICERSLTSSTGGPTGPPATTFIRAEMLPSGYLIRPCEGGGSIIHIVDHIDLDVWSVPEVLRPLYESSKILAQKLTIAALQHIRQIAQESSGEIQYGGGRQPAVLRTFSQRLCRGFNDAVNGFVDDGWSLMGTDGVEDVTIAINSSPNKFLGSNYNASMFPAFGGGVLCAKASMLLQNVPPALLVRFLREHRSEWADYGVDAYSAACLKASPYAVPCARPGGFPSSQVILPLAHTIEHEEFLEVVRIEGHAFSPEDVTLARDMYLLQLCSGVDENAIGACAQLVFAPIDESFADDALLLPSGFRVIPLDPKSDGPAATRTLDLASTMEVGSANARPSGEADLSGYNLRSVLTIAFQFTFENHTRDNVAAMARQYVRSVVGSVQRVAMAIAPSRLSTQLGPKSLPGSPEALTLARWISRSYRIHTGTELFRAESTTGDAILKQLWHHSDAIMCCSVKTNASPVFTFANQAGLDMLETTLVALQDIMLDKVLDESGRKILCSEFSKIMQQGFAYLPAGICVSSMNRPVSYEQAIAWKVLNDDDSNHCLAFMFMSWSFV*


CDS Sequence:
>Vu_23200.1
ATGGCACTTACTTTGCACAAGGACTCGGCCAACAACCAGATGGATTCAAGCAAGTATGTTAGGTACACACCTGAGCAGGTTGAGGCTTTGGAGAGGGTCTATGCTGAATGTCCCAAACCAAGTTCTTTGCGGAGGCAGCAACTCATCAGAGAGTGCCCCATCCTTTCCAATATCGAACCCAAACAAATCAAAGTTTGGTTTCAGAATAGAAGGTGTCGTGAGAAGCAGAGGAAGGAGGCTTCTCGGCTGCAGACAGTGAACAGAAAGCTGACTGCGATGAATAAACTGTTAATGGAAGAGAATGACCGTTTGCAGAAGCAGGTTTCTCATCTGGTTTACGAGAATGGATATATGAAGCAACAGATACAGACTGCCTCTGCGGGCACCACCACAGACAATAGCTGTGAGTCTGTGGTAATGAGTGGTCAGAATCAACAGCAAAACCCAACACCTCAGCATCCCAATAGGGATGCCAACAACCCAGCTGGTCTTCTCGCCATAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTCCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCGATTGGAATCGTTGCTGTTTCCCGCAACTGTAGTGGTGTGGCAGCACGAGCCTGCGGCCTTGTGAGTCTAGAACCCACTAAGGTTGCTGAGATTCTGAAAGATCGACAGTCGTGGTATCGTGACTGCCGATGCGTGGAAGTATTGAGTATAGTTCCCACAGGGAATGGGGGCACCATAGAGCTCATGTACATGCAGACATACGCGCCCACAACATTGGCAGCGGCGCGGGACTTTTGGACACTGAGATACACGACAAGTTTGGAAGATGGAAGCCTTGTGATATGTGAGAGATCATTGACATCCTCAACTGGTGGTCCCACAGGGCCTCCTGCAACAACCTTTATTAGAGCTGAAATGCTTCCCAGTGGTTATCTGATTAGACCGTGTGAGGGTGGTGGATCCATTATTCACATAGTTGATCATATTGATTTAGATGTATGGAGTGTTCCTGAAGTACTGAGGCCCCTATATGAGTCATCAAAAATCTTAGCTCAGAAATTGACCATTGCTGCCTTGCAACATATACGACAGATAGCACAAGAATCGAGTGGCGAAATTCAATATGGTGGGGGTCGCCAGCCTGCTGTATTGAGAACATTTAGTCAGAGACTTTGCAGGGGATTTAATGATGCGGTGAATGGGTTTGTTGATGACGGTTGGTCGCTGATGGGTACTGATGGGGTGGAAGATGTGACCATAGCTATAAACTCTTCTCCAAACAAATTTTTGGGGTCCAATTATAATGCTTCCATGTTCCCAGCCTTTGGAGGTGGGGTCTTGTGTGCCAAGGCATCGATGCTCCTGCAGAATGTTCCACCTGCTTTGCTTGTTCGTTTTTTGAGAGAGCATCGTTCAGAATGGGCTGATTACGGGGTTGATGCATACTCTGCTGCATGCCTTAAAGCTAGTCCCTATGCAGTTCCCTGTGCAAGACCTGGTGGCTTCCCGAGCAGCCAGGTCATTTTACCTCTTGCTCATACTATTGAACATGAAGAGTTCCTGGAGGTGGTTCGCATAGAGGGTCATGCATTTTCTCCTGAGGATGTCACGTTGGCTCGTGATATGTATCTATTGCAGCTATGCAGTGGAGTTGATGAAAATGCAATTGGGGCATGTGCTCAACTTGTGTTTGCACCTATTGACGAGTCTTTTGCAGATGATGCTCTGTTGCTGCCATCTGGATTTCGTGTCATTCCATTAGATCCTAAATCAGATGGTCCAGCTGCAACTCGAACATTGGATTTGGCATCAACAATGGAAGTAGGATCTGCTAATGCTCGGCCCTCTGGTGAAGCTGATTTGAGTGGGTACAACCTTCGGTCGGTCCTTACTATTGCTTTCCAATTTACCTTCGAAAATCATACGCGGGACAATGTTGCTGCAATGGCTCGGCAGTATGTGCGTAGTGTTGTTGGATCTGTTCAGAGAGTTGCCATGGCAATTGCTCCTTCCAGGCTTAGTACTCAACTTGGGCCAAAGTCACTCCCTGGTTCCCCTGAGGCCCTTACCTTAGCACGATGGATCAGTAGAAGCTACAGGATCCACACTGGCACAGAGCTTTTTAGAGCTGAGTCCACTACAGGTGATGCAATCTTGAAGCAACTTTGGCACCATTCCGATGCAATCATGTGCTGTTCTGTGAAAACAAATGCATCTCCAGTGTTCACCTTTGCTAATCAAGCTGGGTTAGACATGCTTGAAACTACTCTAGTCGCACTTCAAGACATAATGCTTGATAAAGTGCTAGATGAATCTGGCAGGAAGATTCTTTGCTCTGAGTTCTCCAAGATAATGCAACAGGGATTTGCTTATCTACCCGCTGGGATATGTGTATCGAGTATGAATCGGCCAGTGTCTTATGAGCAGGCCATTGCATGGAAAGTCCTGAATGATGATGATTCTAATCACTGCCTAGCCTTCATGTTTATGAGTTGGTCTTTTGTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_23200::LG5:63234108-63236108(+)
GGGCAATTAATGGGTGCATGCATGCAATTGATGAGCCATCACATAGTCATAAATCATGTGATTAACATTTCTTAGTGCTCTTCGCTGACTCTTCTCATACAATTTTTTTCAACACGGTTCAATTAATGCTTCTGCTTAAGTAAATTCATAGAACTAATACGCAAAAATATTAAAATTAAAACAGGGAAAAGGTAAACACATCCTCGGATTTTCTCTGGATCCAATCATGTTAATTACTCTTCACACGATATATAACATCTGTGGACCAAACTATGTGAATTTCGTTTACATAAAAAGACGTATAACGAACATGTTTTCGACGTATTTTATTATTGAATAGAATATAGTAGAAATTAAATTACAAGTTTCAACTTATAATAAATCACGTCTTGAGAATAACGTGTTTTTTACTAATTTTTTTTTCATAACAATATTTTCTTCATGAATTGGCATTTATCAAACATCTCTCAAGTGTTTTACTCTTATCGTTATTGTTAGAGTGGCCAGTGGATGTCTATTCAAATTGATCTTGATTATTATGTTATGGCCCCAAAATTTAAGATAAGGTATCATGTTTAAGAAGAAAAAAAACAAAAACAATAACCCTTTAAGTTAAAAATTCGCTTTTACTCCTAATCATACTTGGTTGTCAATTTTTCCTCAACTTCAACTTTCATTCATCATTCTTGGTTCGTGAATAGGCTAATTATTAAGTAAAATTATTATTTAATTTTGCCACTTTTTAAGAGAATGTTTCCGTAGTCTACAACAACTTATACAACGAGTTTAAATTTTTCTCATAGATTTCATCAAAAGGCAAGACAAATACACCATAGTAATCAGTCACACATATATAAGTCTAGGCTTATGTTCTTTATACAAAATTTATAAAGTCACATAACATTGCATAAACTATCTGTATTTAGTAATCTGGTAGACCATGTTCATAAAAGACATAATAAACGATAAAATAAAAGGAGTTTTGTGTTTTTATATAATTAAAATTAATAAAACAACATCACAAATTAAAGTAATATTAAATTAGTTTAGCAAAGCTAACAAATTTAAAGAATTTTTAAATGAGATACACGAGGTGTGCTGTTCAAAGTACGGAAAAAAATTTATTGAAAATTAAAATTTGCATTATTGTTAAGTTTATTGATAAAAGTTCTGTATTTGACATGGTCTAAGTAAAAAAAGAAAGAAAAAAAGGAGACTTTGTGCGACAATATGTGGAATTTTTGAAGTACAAATAATAGAGAAAAGAAGTAAAAGGAAAATCAAAGTGAAGCCAATTTTATGGGATCCTGCTAACATTTTCACCCTGCAACCAAATGTGATGCCAAATATTTGTCCGTCTTTTTTGTCTACTCTCTCCACCTTTCTTCACCCTCTTTACGTACGTACACTGTACTGGTACTATCCCTCTCTCTCTCTATATCTCTCTCTATATCTCTCTTCCTCATCCATATCATTTGCATCATTACTACATGTACATCCAGTCATGCATGCATACCATACCACATCATCATCACCCTTCGTTTTGAAACATGCCTTCATGAAGAGAGAGAAGCTTGGCTATTGGTGTGCCTGCGTGCCTGCAATATAGTATCTTTTTTCTGCACAAGGAGGAGAGAGAAAGACAAAGGGTTTGCAAATCACAGGGAAACTGAGTCGTCAAAAAATCGTATCTGTTATGCGCTTGTGCTGTCCTCTCATTTATATCGCTCTTTTTTTTTTTCATTTATTTGCTTTTCGTTTTAGCATCACAGTGACCAGGAGTAAAGAGCAAACCAGTTTGGTACTGCAGGAGCAACCAAAAAAGGAAAACAAATAAAAAATATGGCTCAGTAACAAATTAAAGTCCCTTTAATTGCCCATTGGTTGTTTGCTTCCTTCTCTTTGCTTTTTTCAGCCATATTGCACTACGTATTACCTTTATTTTATTATTTTATGCTATACATACAATATAATAATACAGCACAATAATATTACTATTA


Gene Sequence:
>Vu_23200(+)
ATATTATCACAGAGACAACACATAAAAACACACAACACATTCTTTCTTCCTCAGTTCTTGTTCCATCTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCGTATTCTCGAGATTCGGGTGTGTGTGGGATAGAGACTACTGTAGCGCCCCTTGAGGTTCTATCCAGAGTTGGAATTTGAGGAACTGAGCAGCATCTAATGAAGGAGAGTGGAGGCTCTCTTGGAGAAGAGAGCCTGCCCGAGACTACCACCAACAAGAGCAGTGAAGAAGAAGAGCCAAACTAGTTTCTTTCTTTCTCGCTCACTCCATTCCCATTCGTGTTTTTTTTTTTCAGTCTCAAAGACTACTTTAGTGTCAGTGTGTGTATATCAGAGAAAGCAGTGTGTTTTGGGGTGTGATAGTGTGAGATGGCACTTACTTTGCACAAGGACTCGGCCAACAACCAGATGGATTCAAGCAAGTATGTTAGGTACACACCTGAGCAGGTTGAGGCTTTGGAGAGGGTCTATGCTGAATGTCCCAAACCAAGTTCTTTGCGGAGGCAGCAACTCATCAGAGAGTGCCCCATCCTTTCCAATATCGAACCCAAACAAATCAAAGTTTGGTTTCAGAATAGAAGGTGACCCTTTTCAAATAACCCAAATGTCAAAGTCTTCTGTTTCTTATCATTTCTTACAGAAAGCCATCACCTTCACTACTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTTACCTCAGTAAAGAAAAGTAACTTGTGCTTGCGTTGGTTCTAATAGTACCTTTTAGTTTCTTTGTTTTTTGTTCTTACAAGACATTGGTGAATTTGGTGTGTAGGTGTCGTGAGAAGCAGAGGAAGGAGGCTTCTCGGCTGCAGACAGTGAACAGAAAGCTGACTGCGATGAATAAACTGTTAATGGAAGAGAATGACCGTTTGCAGAAGCAGGTTTCTCATCTGGTTTACGAGAATGGATATATGAAGCAACAGATACAGACTGTGAGGACCCATCCCTCTCGCCTTCATTTTCTGCATGTTTTTCTTATTTCTAAATGTTAATGGTTGAACCATGCTTTGGTTTGAACAGGCCTCTGCGGGCACCACCACAGACAATAGCTGTGAGTCTGTGGTAATGAGTGGTCAGAATCAACAGCAAAACCCAACACCTCAGCATCCCAATAGGGATGCCAACAACCCAGCTGGGTATGTAACAAACTATGAACTACTTCTTAGTATTTGGGTACTTGTTCGTTTAAATGTTTTCGTGGTAGTAACATGGTTACTCTTTATTGTTTCAGTCTTCTCGCCATAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTCCAGATGATTGGGATGAAGGTATATTCATTTTAATGAACATTAGTACTTGTTTCCTAATGTCTTCATCTAAGCAGTAATTATTACTATGGAGTTGAAAAACATGTACAATTTGCTCATTTATGTTAATGTTTTTTGTGTGTAATTATTCGTTGGTGATTTGTGTTGTGTAGCCTGGTCCGGATTCGATTGGAATCGTTGCTGTTTCCCGCAACTGTAGTGGTGTGGCAGCACGAGCCTGCGGCCTTGTGAGTCTAGAACCCACTAAGGTGTGTTGTTGTATCCCTCATGTTCCTTTGGTTCCTCATTGTCGAACAATTGGACTGTATTTTTCTGAAAAGTTGTGACTGTTGTTTGTCAGGTTGCTGAGATTCTGAAAGATCGACAGTCGTGGTATCGTGACTGCCGATGCGTGGAAGTATTGAGTATAGTTCCCACAGGGAATGGGGGCACCATAGAGCTCATGTACATGCAGGTCTGGTGGACGCTTTCTGCACTTGGAATGATTTAATGATTAATTTCTTGATTTTTTTTGGTTGAAATTTGATTTCTTTTTTGCCAGACATACGCGCCCACAACATTGGCAGCGGCGCGGGACTTTTGGACACTGAGATACACGACAAGTTTGGAAGATGGAAGCCTTGTGGTATGGCAAAGGATATGGTGTGCTGTGTTTTTTTTTAACAAACATTTGTCCCTGCCAAAATGGTTGTTTATTGTTCTTGTGCTGAAAATAGTCATTTCTGGAGCTGGTACCTGTACCCTCTCTCTTGAAGAGAAGGGTAGACAACATATTTGCACTAAGTCTACTAAATACTAAACACAATTTCCATTGGACACGACTTCTTATCTTTTCTTTTGAAGTTTCAACTTTTTGTTAGTTCTGTTCTGCAACATTTGAAGGTGTTGTTGCACAATTTAAAATGATTGTTTCTTCTTCCTCATGGGATTTTAGAACAAATTTGGCTTATTGAAATTATAATGCTGGATGGCAGATATGTGAGAGATCATTGACATCCTCAACTGGTGGTCCCACAGGGCCTCCTGCAACAACCTTTATTAGAGCTGAAATGCTTCCCAGTGGTTATCTGATTAGACCGTGTGAGGGTGGTGGATCCATTATTCACATAGTTGATCATATTGATTTAGATGTAAGTAAAGCATCTACAAGTTAAATCACTTTATAATCTCTGATCCTTTACGCAGTATTTTACCGTTATTGTTTGTTACAGGTATGGAGTGTTCCTGAAGTACTGAGGCCCCTATATGAGTCATCAAAAATCTTAGCTCAGAAATTGACCATTGCTGTAAGATTAATATCTTGTTCGATGAATTCGACTTTATAACTTACTCAAAATCACCATTAGACTTAAAAAAAAAGCTATACTCTTTCAGGCCTTGCAACATATACGACAGATAGCACAAGAATCGAGTGGCGAAATTCAATATGGTGGGGGTCGCCAGCCTGCTGTATTGAGAACATTTAGTCAGAGACTTTGCAGGTAAGGCTTGAATCTCCTTGTTATGTAGAACTAGTGCATAATTTTTGAATAATTTGCTGGGCACTTTTTACACTTTATGTGGGGTTGCAGCTTTTATGGATTAGTATTTTTCATATTCTCGCTAAAATTCAACTACTCAATAAGATTTTATTTAACATAATTCTTTAGGGGATTTAATGATGCGGTGAATGGGTTTGTTGATGACGGTTGGTCGCTGATGGGTACTGATGGGGTGGAAGATGTGACCATAGCTATAAACTCTTCTCCAAACAAATTTTTGGGGTCCAATTATAATGCTTCCATGTTCCCAGCCTTTGGAGGTGGGGTCTTGTGTGCCAAGGCATCGATGCTCCTGCAGGTACTTTAGAAGCAAATAGTTATATGCACAATTCCTCTTTTTCCTAATTTTCCAAGCATTTTGTATGTGTTTATTATAATCTCCTGAACAACGGTTCCTACAGAATGTTCCACCTGCTTTGCTTGTTCGTTTTTTGAGAGAGCATCGTTCAGAATGGGCTGATTACGGGGTTGATGCATACTCTGCTGCATGCCTTAAAGCTAGTCCCTATGCAGTTCCCTGTGCAAGACCTGGTGGCTTCCCGAGCAGCCAGGTCATTTTACCTCTTGCTCATACTATTGAACATGAAGAGGTATTTATCTTTTGAACTAAGAGATAACTCATTCTCTAGTTTGACAATTCATTTTATGTTCCATGCTAAATTGTGGCATGCCGTAATGTTGCAGTTCCTGGAGGTGGTTCGCATAGAGGGTCATGCATTTTCTCCTGAGGATGTCACGTTGGCTCGTGATATGTATCTATTGCAGGTAATGTGTCCGAATTTTTTATTTGCATATTTTGTTTAACTAACTTTAAGTATTTATGTTCGACACTTAATGACCCTTTTTATTTGCAACTTCTGGATGTTGCAGCTATGCAGTGGAGTTGATGAAAATGCAATTGGGGCATGTGCTCAACTTGTGTTTGCACCTATTGACGAGTCTTTTGCAGATGATGCTCTGTTGCTGCCATCTGGATTTCGTGTCATTCCATTAGATCCTAAATCAGTTGAGTGACATTTCTTTGCTATTTATATGGTTTCATTACTAGTTCTTGGCTTTTTTTTATAAGCACTAGCTCTTGGTTATAAAACTACTCCCAGTTTATTTACATCTAATCACGGTAGCATAATCGCATTAGCAGATATCAACCTGTTATGGTGTATCTTAGTTCTTTTTTAATGTGCTCCAAGTTACTAATTTTTTTGCATCTGAATGCATCCAGGATGGTCCAGCTGCAACTCGAACATTGGATTTGGCATCAACAATGGAAGTAGGATCTGCTAATGCTCGGCCCTCTGGTGAAGCTGATTTGAGTGGGTACAACCTTCGGTCGGTCCTTACTATTGCTTTCCAATTTACCTTCGAAAATCATACGCGGGACAATGTTGCTGCAATGGCTCGGCAGTATGTGCGTAGTGTTGTTGGATCTGTTCAGAGAGTTGCCATGGCAATTGCTCCTTCCAGGCTTAGTACTCAACTTGGGCCAAAGTCACTCCCTGGTTCCCCTGAGGCCCTTACCTTAGCACGATGGATCAGTAGAAGCTACAGGTTTGTCTTCTATAAATTTGGATCGCAAATCTATTATTTCAGCGTGCGGAACTTAGCATATTATATGTTTGATTTTGTTGTATTAGAGTGGTTTAGGAGCTGTTAAAGTGCCCTTAGAAACTGTGTTATCTATATCTATAGATATTCATTACTAGTATAATCTATATAGTTTATTGGTTATTTGAAAGTTGAATTCTGTTTGAACGTGAGGGGTGTTTTTTAATGTGGTGCACGACTTACTCGACAGATCTTATTCTGTTTAGTCTGACACTATATTGTGTTTCCTTTAAGGATCCACACTGGCACAGAGCTTTTTAGAGCTGAGTCCACTACAGGTGATGCAATCTTGAAGCAACTTTGGCACCATTCCGATGCAATCATGTGCTGTTCTGTGAAAACAAATGTAATCCCTTTCATAACATCTTTAATTTCTTTTCGTTGGAATTTGAAAAATCGAATAGTTGTCAGAGGACTTTGTTATTAATAATATATAATATGCAATATGTTTTGGAAGAATGTGCTATTCTTTTCTCCAATAATATTTCCATTGA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