Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23179 LG5 63032589 63037173 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HDG11-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 63032595 synonymous_variant p.Glu698Glu
T/C 63032831 missense_variant p.Ile620Val
G/A 63032974 missense_variant&splice_region_variant p.Pro572Leu
G/A 63033134 splice_region_variant&intron_variant
A/T 63033263 intron_variant
T/G 63033314 stop_lost&splice_region_variant p.Ter541Serext*?
T/A 63033318 missense_variant p.Ser540Cys
G/A 63033368 missense_variant p.Thr523Ile
C/T 63033372 missense_variant p.Ala522Thr
C/G 63033418 missense_variant p.Lys506Asn
A/C 63033441 missense_variant p.Cys499Gly
C/T 63033458 missense_variant p.Cys493Tyr
G/A 63033536 missense_variant p.Ser467Leu
A/G 63033570 missense_variant p.Trp456Arg
T/C 63033604 intron_variant
A/G 63033606 intron_variant
C/A 63033781 missense_variant p.Asp413Tyr
A/T 63033866 intron_variant
T/C 63034020 synonymous_variant p.Leu390Leu
C/T 63034063 missense_variant p.Arg376Lys
A/G 63034236 intron_variant
G/C 63034264 intron_variant
C/A 63034685 stop_gained p.Glu234*
A/T 63034686 missense_variant p.Asn233Lys
C/G 63034796 missense_variant p.Glu197Gln
C/T 63034819 missense_variant p.Arg189Lys
T/C 63035001 intron_variant
T/G 63035094 missense_variant p.Lys128Thr
C/G 63035121 missense_variant p.Cys119Ser
G/T 63035176 missense_variant p.Arg101Ser
T/C 63035323 missense_variant p.Lys81Arg
C/G,* 63035553 intron_variant
A/G 63035608 intron_variant
T/A 63035657 intron_variant
C/T 63035762 intron_variant
A/G 63035832 intron_variant
A/G 63035846 intron_variant
A/C 63035854 intron_variant
C/T 63035943 intron_variant
A/G 63036059 intron_variant
T/C 63036067 intron_variant
T/G 63036143 intron_variant
G/T 63036144 intron_variant
T/G 63036145 intron_variant
G/T 63036269 intron_variant
C/A 63036295 intron_variant
A/T 63036338 intron_variant
T/A 63036417 intron_variant
T/G 63036427 intron_variant
A/T 63036568 intron_variant
G/A 63036600 intron_variant
G/T 63036634 intron_variant
C/T 63036661 intron_variant
G/A 63036662 intron_variant
G/T 63036663 intron_variant
G/T 63036688 intron_variant
G/A 63036694 intron_variant
G/T 63036703 intron_variant
T/C 63036727 intron_variant
A/C 63036799 intron_variant
G/A 63036876 intron_variant
G/T 63036930 intron_variant
T/C,* 63036962 intron_variant
G/A 63037022 intron_variant
A/G 63037023 intron_variant
C/T 63037146 missense_variant p.Gly10Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23179.1
MDFAMGAAGGSGDDKHNHNHNKSSNKGKKAYHGHNSDRTSKLEEMFRKCPHPTKSTRSQIAEELGLEPKQVKFWFQNKRTQIKTQTERTNNSLFRIENERIRKDNLLLREAFKNIICPSCGGPSEVDEKRTHSLEQLRIENARLREEHERVSSALAKYMDKPVLDLNMGYSLMRGSSSSCVPLTPGSYLRLIGSFQREDTMFNLGNRITQMEKTMMSQIAVAAKEELIKLLCTNEPIWVKSSNHQRFVLHQESYQTFFPRINHFKNSQARVESSKDSRVVRVKAMELVNMFLNSEYWADLFSTIVTKARLIKVLENGSNRSGVLLLMSEELHVLSPLVPSREMFFLRYCEQIEAHSWVIVDVSVDCTNGNNNPKYWRFPSGCIIHQISNELCWISWVEHVEVDERIETHQLYKDVVNNSIAYGAERWLLELQRMCARFTSIGDEIPDYDINGVIPVIGGRKNMMKFSHQMVKNFYGILNISSKTEYIQHLAEENANIMILARKYTNSSQSNAMIIFIATTSFRLPLPSEYVFDFFRNPTKRAKWDVMCYESPVHEVARVSVGTNPSNCISIIQPLHRTANNMAIIQESFIDALGSYVVYSPVNISDIKMAVNGKDSARIMSIFPSGIVISKDVQTITHASAWSSGSDDTRRHGTLLTVTFQILMNGPTTMVAESKTVVNSLMTSTIQKINHALVNGSNLEF*


CDS Sequence:
>Vu_23179.1
ATGGATTTTGCCATGGGAGCTGCAGGTGGATCTGGAGATGATAAACACAATCACAATCACAATAAGAGCTCAAACAAAGGGAAAAAGGCCTACCATGGTCACAACTCTGATAGAACTTCTAAGCTTGAAGAAATGTTCCGGAAGTGTCCACATCCAACAAAAAGCACAAGATCTCAAATAGCAGAAGAACTGGGACTTGAGCCAAAACAAGTAAAATTTTGGTTTCAGAATAAGAGAACTCAAATAAAGACTCAAACTGAGCGAACAAATAACAGTCTCTTCCGTATTGAGAATGAAAGGATACGTAAAGATAACCTTTTGTTAAGAGAGGCATTCAAAAATATAATTTGTCCATCTTGTGGAGGTCCATCAGAGGTTGATGAAAAACGTACACACTCTCTAGAACAACTTCGTATTGAAAATGCTCGTCTTAGAGAAGAGCATGAGAGAGTGTCTAGTGCTCTTGCAAAGTACATGGATAAACCAGTGTTAGACCTAAACATGGGCTATAGTCTTATGAGGGGATCTTCATCATCGTGTGTTCCATTAACACCAGGAAGTTATCTGAGACTAATTGGTTCATTTCAACGTGAAGATACCATGTTCAACCTTGGGAACAGAATTACACAAATGGAGAAAACAATGATGTCACAAATTGCAGTGGCTGCTAAGGAAGAATTAATTAAGCTTCTGTGTACCAATGAACCCATATGGGTCAAATCTTCAAATCATCAAAGATTTGTTCTTCATCAAGAAAGCTACCAAACATTCTTTCCAAGGATTAATCACTTCAAGAATTCTCAAGCTCGTGTAGAATCATCAAAAGATTCAAGGGTTGTGAGAGTTAAGGCAATGGAATTAGTTAACATGTTTCTGAATTCGGAATACTGGGCAGATCTTTTCTCAACAATTGTTACAAAAGCACGCTTAATCAAAGTACTTGAAAATGGTTCAAACCGAAGCGGAGTTTTGTTGTTGATGAGTGAAGAGCTGCATGTTCTTTCACCTTTAGTTCCATCTCGGGAAATGTTCTTCCTTCGTTATTGTGAACAGATTGAAGCACATTCATGGGTGATAGTAGATGTTTCTGTTGACTGCACCAATGGGAACAACAATCCTAAGTATTGGAGGTTTCCCTCTGGATGCATAATTCATCAAATTTCAAATGAGTTATGCTGGATTTCTTGGGTTGAACATGTGGAAGTGGATGAGAGGATTGAAACGCATCAACTATACAAAGATGTAGTTAATAACAGCATTGCGTATGGAGCAGAACGATGGCTGTTGGAACTTCAAAGAATGTGTGCAAGATTTACAAGTATTGGAGATGAAATACCTGATTATGACATCAATGGAGTGATACCTGTTATTGGAGGAAGAAAAAATATGATGAAGTTTTCTCATCAAATGGTGAAAAACTTCTATGGAATTTTAAACATTTCAAGTAAGACAGAGTACATTCAACATTTAGCTGAGGAGAATGCTAATATTATGATTCTTGCTCGGAAATACACAAACTCAAGTCAATCAAATGCCATGATTATATTCATTGCTACTACTTCTTTTCGGCTACCACTCCCCTCGGAATATGTTTTTGACTTCTTTAGAAATCCAACAAAACGAGCTAAGTGGGATGTTATGTGTTATGAGAGTCCAGTGCACGAAGTTGCACGTGTCTCGGTTGGAACTAACCCTAGCAATTGCATATCGATTATACAGCCTCTTCACCGAACGGCTAATAACATGGCCATTATTCAGGAAAGTTTTATTGATGCTTTGGGATCATACGTTGTGTATTCCCCTGTGAATATATCTGACATAAAGATGGCTGTAAATGGTAAAGATTCAGCAAGAATAATGTCAATCTTTCCATCAGGCATTGTTATATCAAAAGATGTTCAAACTATCACACATGCTTCTGCATGGAGTAGTGGAAGTGATGACACGAGAAGGCACGGTACTCTACTGACTGTGACTTTTCAAATACTGATGAATGGTCCAACAACTATGGTAGCAGAATCCAAGACTGTTGTTAACTCTCTCATGACCTCAACAATACAAAAAATAAACCATGCTTTGGTAAATGGTTCTAATTTAGAGTTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_23179::LG5:63037173-63039173(-)
TTAATTGGTTTAAAGATGAATTTAACCAAAACATTGCATTAACCAAAGTGTTGTGATTATGAAAAAAAGAAAAAAAACTTTTAAGATGCCATGTGTCTCCATCATGTCCATCCACTCTTTTTGAGTTGCATCAGAACCGATTATTCTCACTTAGGCCTTGTTCACTTGAATGGATTTGGGGGAGAGTAATTAAGGGAATTGAGAGGATTTGAAGATAAATTTTTTTGTTGTTTATTTGAGTGAATTTGGAGGTAAGTGAGAATGAATTTGAAAGTAAAGTTTGTGAGAATTAGTGTAAGATTTGATTGATGTGACAGATTAAAAAAATTTACTTCCAAATCCACTTTCATTTACCTTTAAATTCACTCAAATAAATAACAAAAAAATGTATCTTCAAATCCTCTCAAATCTCCAATTACTCTCCTCCAAATCCATTCAAATGAACAAGCCTTAAAAAAATTGAATTATTTAAATAATTATATCAACTTGTTTAACCAATCAGATTTAGTCCACGTATGCAAATATGTTAATAATTAATTATTTATGTTCTTAAAAGGTCGGTGGAAATTTCGTGGAAATTTCACAAAACCTTTTAATTACTATTTAGTGTTCGGAAATGTTATAACAATTGATATTTTAATTCATACATAAATTTAATTATCAGTTATACATATTTAACTAAAACGTTACACAAGTTTAAAATAAGTACTGTTCAACAAATAAATAAATAACAGGTGGAAGTGTAAAATGAGTGTGCATTACAAGGAGGTGTACGTTTATCATTTTTCTTTCTATAATAGATTATTGTAGGCTTAAAATTGTTGTTATTTTACAAACCTTATTTTTTTTATATTAAATATAAATAAAAATAACAGAATAACATTGATTTTAAATGGAATAATCTTAAAACTTTAATTTTTTGTACTTTCTTTCTTCTTTTAATTATTTTTTTGTTTTATTTACTCTCTCAATATTTATTTTTCTACAACAAACACAATCCTCAAAAACATTAATTAGCATTTAACTTGTAATAAATATATTAAAAGTCATACACAACCAATCATTAAATAAATGTGTAAACTGTTTTACACTCTTAACCTTTAATATATGCATAACTGTCGGTAGTTGATTAATTGATTTTATCATCCACATTTATTACTTTATTTTCGGTTTAACTTTTTTAATATTATAATAAAAAGAACATAAATTTAATTCAATTAATGTCTGTGAAGACAATTACTGGGAGCATATAAATATGATATAATAAAGCAATATAAATAAAGGGTTCATTTAATGAGTTTTTGTAATAGATGAAGAAAACAAATTCTGAAAAGCATTACAAATTGATTGCTTACAACATCTTGAATTTGACTGGCTCTCACCAATGACTTCCTTCAACCCAATAACATTAAATTGAAAGATTCCTCTTCATTACAAATGCAAGCAGAAACTCAACCCCACCACTTTCATATTTCACAAAACCACAAAACCAAAACCAAACCAAACCCGCGTTTCAATCCACCAAATCCAAAATTCGGTTTCAGTGACTTTGTTTTTTAGTTTCACATTTTCCCAGTTCTCTCCCCTTTTGCATGCAGATGAGTTGTCATGTGCTTGGCAAAAAGGCAAGGCTAGCAAAACCATCGGTTACATATTCTGAGTTTTTCATTCAATAACATTACATTTTCTTTTCCTAATTTCTGTAATTTTTGTTTTTTTCTACAGCTATAGCTGTTACTAGGTTGGAGTGATGATATCTTAGTATGTGGGGTTATACAAGTTGAGACCTTTCATTTCCGTTCACCATTAATCTAAGGAAAAAGGTGGTGAAAATCTCATCAGTATTTTCTTTATCAGCTTTTATTGCCTTTGTCATACTGAAATGCAAAGGGTTGGCATCTATAAAGTCCCTTCTTCAGAATTCACATAACTCACCCCAGAAAAAGTTCAAAAACCAAACTCAGAAGTTTAGTCTCTTTTGCAGGTGAATTGAAAAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_23179(-)
ATGGATTTTGCCATGGGAGCTGCAGGTGGATCTGGAGATGATAAACACAATCACAATCACAATAAGAGCTCAAACAAAGGGAAAAAGGCCTACCATGGTCACAACTCTGATAGAACTTCTAAGCTTGAAGAGTAAGATCACTTTTTTACTTCCTCAACAACTTCTTTCTTTTATTTATTTCAAGTTTTCAATTATGAACGATGTGTAAAAAAGGGCTAATTTCTAGATCTACCATCCATATATCTCTTCCTGTATCATAAAATTTGTGCAGTTTTTATCTTGTTCAATTATTTATGACGAAAATCACCATTTTCCGTGGTTTGGTCCTGCTTTTGCCTTTGCTTTGTTTAATAGTTTTAATGGATGAAATTCACTACTTTTTTTTGTAATTTATATTTTTATTAATTTTAATTTGTGACCAATCTTATGTCTCTTCATTTAATGAGAAGAAGTTGATTTCGTTTTGACTTCCTTTTGATCTTGATCTCGTGAAAGATGAGAGTGGGCATGCCGTGAGTTTAGAAATTTGAAATATAATTCATTTCCTTTATATTTAGTAAGGTTTAAAAGAAACAGGAGTGATAAAATAGTTGAATGCAATGTATTAAGCGAATATCATTGAGAAAGATTGGTTCATTGACCCATATTTAAAAAAAAAATGAGATTAATTTTAATGTTATTAATGTTGTTGGGGAAAATCTTAATGATTATGAGTGTTTGGTCATGAGTTTTCTTAATTTTAATTAAATTACCATAATAACAACTTTAAATTTAATTACCAGTTAAACAGTTTATCTTTTCCATCTATATCTGAATTAGACATTTTTTTTGAACATGCTATGGCCTCAACATTTACAATGTTCCTATCCTTTGAATATGTTTAATCTTTTTTCTTTCTTGAATACGCTATGTTGTAAAAGCCTTTCAAAATTGAAAGGTACCCACTTAAATACTTTTCATTTTTTGAATATGCAATGGTGTTCCAACCCAGAATGTTTATATACAAAAAAAAAAAGCAAATATTCATAACAACAAAATATGAGTACTCTCCTTCGAACAAGACTTTTCCATACACAATCAAATTTATTATAAATCAAAATGACCTTACATTTTATGTTTCTGTTGGCATTCATCTATAGAGTCAAATTATATTTCCCCTTATAGATTATCTCTCACATGTTAGTAAGAAATAACATATATTTTTCTCATAAGTCTCTGATTTAGTAAAAAGTAAAAAAATTAAATAACATATAAAAAATTATCATTTCAAAATTTTAGATTAAAATGATATTAACTCATTATTTATATTTTATTGGTATTTATGTTTTATTGGTGTTTCCCTGATCATGAGTCATCTATCACAATACCCATGAGTAGTTTCAAGCCCATTGTTTTAAATCTTTCCAATCCAGTATTATATATTAATTTTATGCATAAAGGTTATGTTTCAATAACTTTAACTTCCAAATATGTTGAATTTAAATTATATTTTAATCTCCCCCAATAAAACTAATATAGAAGAAAAACTTTCAAAAAAGGATAATTTTTTCCATTAAGTTGATTATTAGTGTTAAATTAGAAAGAATATATTTTTGATATTGCTGATGTCTTTTTCCCTTTGTTTTACATAACATATTCACATTCTCTCTCTCTCTATTCCTTGTTACCTGTGTCACTTTTGTACGGGTATTTGTCGTTTATATAACTGTATTAACGGTGATATTTATTATGGGTTAAAGAATGTTCCGGAAGTGTCCACATCCAACAAAAAGCACAAGATCTCAAATAGCAGAAGAACTGGGACTTGAGCCAAAACAAGTAAAATTTTGGTTTCAGAATAAGAGAACTCAAATAAAGGTAATCTATATTTATTTTCTTTTCATATTTATTAAAAAATTGTTTTAGTGATAATAACCATTTTACATGTGTTTGTTTGATTGAAGACTCAAACTGAGCGAACAAATAACAGTCTCTTCCGTATTGAGAATGAAAGGATACGTAAAGATAACCTTTTGTTAAGAGAGGCATTCAAAAATATAATTTGTCCATCTTGTGGAGGTCCATCAGAGGTTGATGAAAAACGTACACACTCTCTAGAACAACTTCGTATTGAAAATGCTCGTCTTAGAGAAGAGGTTTCTTCACTGATTTCATCATTTTTTACATTTCAATAACTTTTTACCATGGCAATATATGATTCATGTTTATTTATGCTTTTTTTTTTCAGCATGAGAGAGTGTCTAGTGCTCTTGCAAAGTACATGGATAAACCAGTGTTAGACCTAAACATGGGCTATAGTCTTATGAGGGGATCTTCATCATCGTGTGTTCCATTAACACCAGGAAGTTATCTGAGACTAATTGGTTCATTTCAACGTGAAGATACCATGTTCAACCTTGGGAACAGAATTACACAAATGGAGAAAACAATGATGTCACAAATTGCAGTGGCTGCTAAGGAAGAATTAATTAAGCTTCTGTGTACCAATGAACCCATATGGGTCAAATCTTCAAATCATCAAAGATTTGTTCTTCATCAAGAAAGCTACCAAACATTCTTTCCAAGGATTAATCACTTCAAGAATTCTCAAGCTCGTGTAGAATCATCAAAAGATTCAAGGGTTGTGAGAGTTAAGGCAATGGAATTAGTTAACATGTTTCTGAATTCGGTCAGTACTCTCAAAAGATCCACTTTAATATTTTACCAAATAGTTTATTCAAATCTCTCTGTCTCTCTTCCTTTATATAATCATATCCATTTTTATCAGGAATACTGGGCAGATCTTTTCTCAACAATTGTTACAAAAGCACGCTTAATCAAAGTACTTGAAAATGGTTCAAACCGAAGCGGAGTTTTGTTGTTGGTATACCTCGTGCAAACCTCGCTCGCTCTGTGTAATCAGTTTCTTTCTTACATTTATATAACAACTTAATACCTTTTTTTTGTTTTGCTTATGTAGATGAGTGAAGAGCTGCATGTTCTTTCACCTTTAGTTCCATCTCGGGAAATGTTCTTCCTTCGTTATTGTGAACAGATTGAAGCACATTCATGGGTGATAGTAGATGTTTCTGTTGACTGCACCAATGGGAACAACAATCCTAAGTATTGGAGGTTTCCCTCTGGATGCATAATTCATCAAATTTCAAATGAGTTATGCTGGGTGAGTATTATATATAGATAAAATGCATTGGTGAACTAAGTTACCACTACTATATGTATTGCTATTATAATTAGGTCATTATTTTCATCATGGGTGTATATGTATGTACGTGGACGAAATGTGAATGATGATTTAAACAAATTTGTGTTATAAAATCTTATATTCCTTCTAGATTTCTTGGGTTGAACATGTGGAAGTGGATGAGAGGATTGAAACGCATCAACTATACAAAGATGTAGTTAATAACAGCATTGCGTATGGAGCAGAACGATGGCTGTTGGAACTTCAAAGAATGTGTGCAAGATTTACAAGTATTGGAGATGAAATACCTGATTATGACATCAATGGAGGTTCTTATTTCTAGCTTTATTCCAAACCTGTTAATATTTGTGCATACCTAATTAAGATTATATCTGACATGAATTTTCAGTGATACCTGTTATTGGAGGAAGAAAAAATATGATGAAGTTTTCTCATCAAATGGTGAAAAACTTCTATGGAATTTTAAACATTTCAAGTAAGACAGAGTACATTCAACATTTAGCTGAGGAGAATGCTAATATTATGATTCTTGCTCGGAAATACACAAACTCAAGTCAATCAAATGCCATGATTATATTCATTGCTACTACTTCTTTTCGGCTACCACTCCCCTCGGAATATGTTTTTGACTTCTTTAGAAATCCAACAAAACGAGCTAAGGTTCAGAAATTTAACCCATTTTTTTTATCAATGTATAAATTTTTTTAGTAGTCCATTTATTTGTTATTTTTTTTTATTTGACAGTGGGATGTTATGTGTTATGAGAGTCCAGTGCACGAAGTTGCACGTGTCTCGGTTGGAACTAACCCTAGCAATTGCATATCGATTATACAGGTACCCAATTACCATATTATAAGGGAATGTTTGATCATTATCTATTGAGATAATTAGAATAATAGCTTTAGCTGAGCTTTTAATCAAATTTTTAAATTTGGTGTTGTTACTTTTTTTTGTATGAACATGATTAAACTAATTTTAATTATTCATGTGGAACAGCCTCTTCACCGAACGGCTAATAACATGGCCATTATTCAGGAAAGTTTTATTGATGCTTTGGGATCATACGTTGTGTATTCCCCTGTGAATATATCTGACATAAAGATGGCTGTAAATGGTAAAGATTCAGCAAGAATAATGTCAATCTTTCCATCAGGCATTGTTATATCAAAAGATGTTCAAACTATCACACATGCTTCTGCATGGAGTAGTGGAAGTGATGACACGAGAAGGCACGGTACTCTACTGACTGTGACTTTTCAAATACTGATGAATGGTCCAACAACTATGGTAGCAGAATCCAAGACTGTTGTTAACTCTCTCATGACCTCAACAATACAAAAAATAAACCATGCTTTGGTAAATGGTTCTAATTTAGAGTTTTAG