Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23143 LG5 62693476 62696269 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 35
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 62693553 stop_gained p.Cys471*
T/A 62693585 stop_gained p.Lys461*
T/A 62693764 stop_lost p.Ter401Leuext*?
T/G 62693887 missense_variant p.Gln360Pro
G/A 62693907 synonymous_variant p.Thr353Thr
G/C 62693915 missense_variant p.Arg351Gly
T/A 62694054 synonymous_variant p.Ala304Ala
A/T 62694112 missense_variant p.Val285Asp
T/G 62694150 intron_variant
C/T 62694222 intron_variant
A/G 62694235 intron_variant
A/T 62694241 intron_variant
T/C 62694455 intron_variant
A/T 62694667 intron_variant
A/T 62694687 intron_variant
A/T 62694725 intron_variant
A/T 62694728 intron_variant
G/C 62694757 intron_variant
T/C 62694862 missense_variant p.Gln253Arg
A/T 62695426 intron_variant
A/C 62695521 intron_variant
C/A 62695540 intron_variant
A/G 62695605 missense_variant p.Ile222Thr
T/C 62695708 missense_variant p.Thr188Ala
G/A 62695856 synonymous_variant p.Thr138Thr
T/C 62696092 missense_variant p.Thr60Ala
C/T 62696182 missense_variant p.Gly30Ser
G/A 62696248 missense_variant p.Pro8Ser
A/G 62696254 missense_variant p.Phe6Leu
G/A 62696258 synonymous_variant p.Cys4Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23143.1
MCSCIFGPIIMDNYQGDLTDIVRASGGAYGGGGGGSSSCSTGTSSVELPTTSHHHTITHTLSRNDHWHQHFSSSSSSSDPITFSSVLQDPRGLTNFGDPFSTMRDPFLQELDMPSASSYFTGGLEEAAASFGASAVSTSTNTNTSTTVFAAHKILEEHDMRRPCKNIFSNMIQISPNAKLPVSPYDSTTAVAPSPRAIKPPAVVSPNMVTANSSKDCLVDTIGVQISSPRNPGLKRRKNQAKKVVCIPAPAAANSRQTGEVVPSDLWAWRKYGQKPIKGSPYPRGYYRCSSSKGCSARKQVERSRTDPNMLVITYTSEHNHPWPTQRNALAGSTRSQPSKNNAGNSKSSEASNPQKSTISKAKDEQQQQESNNSEGNMSPVVAGNSSANSASVKEENMEDIEKQFEMDEGEFSDGLPYKPCLMDQSNNQSEDFFAELGEIEADPLDILFTQGFGAADDQREESKALDPFHLFDWSGDNNTSTNTGSFEEPNAKRRL*


CDS Sequence:
>Vu_23143.1
ATGTGCAGCTGCATCTTTGGGCCAATAATCATGGACAATTACCAAGGTGATTTAACTGACATAGTCCGAGCCAGTGGTGGAGCATATGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGCAGCAGCTGCAGCACAGGCACTTCATCTGTTGAATTACCTACCACATCTCATCACCATACTATTACTCACACCCTCTCTCGTAATGATCACTGGCACCAACACTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGATCCCATCACCTTCTCTTCTGTGCTTCAAGACCCCAGAGGACTCACCAACTTTGGTGATCCCTTCTCCACCATGAGAGATCCCTTCCTTCAGGAGCTTGACATGCCTTCCGCTTCTTCCTACTTCACTGGGGGCTTGGAAGAAGCAGCTGCGAGTTTTGGTGCTTCTGCTGTTAGTACCAGTACTAATACTAATACTAGCACCACTGTTTTTGCTGCACACAAGATTCTCGAGGAGCATGACATGAGAAGACCTTGTAAAAACATATTCTCCAACATGATTCAGATCTCTCCCAATGCAAAGTTACCGGTCTCACCCTATGATTCCACCACAGCGGTGGCACCTTCTCCAAGGGCAATTAAACCTCCTGCTGTTGTTTCACCCAACATGGTTACTGCGAACTCCTCCAAGGATTGCCTTGTGGACACCATAGGAGTGCAGATCTCGTCTCCACGGAATCCGGGTCTTAAACGAAGGAAGAACCAGGCCAAAAAGGTTGTTTGTATTCCTGCACCAGCAGCTGCAAACAGCAGACAAACTGGAGAGGTTGTTCCGTCAGATTTGTGGGCTTGGAGAAAATATGGTCAGAAACCCATTAAAGGTTCACCTTATCCCAGGGGTTACTACAGATGCAGCAGCTCAAAGGGTTGCTCTGCGAGGAAGCAAGTTGAGCGGAGCAGAACAGACCCAAACATGTTGGTTATTACATACACATCAGAGCACAACCATCCATGGCCAACTCAAAGAAATGCTCTGGCTGGTTCGACCAGGTCACAGCCATCCAAGAACAATGCTGGAAATTCAAAGAGCTCAGAAGCGTCAAACCCCCAAAAGAGCACAATATCAAAAGCAAAGGATGAGCAGCAGCAGCAGGAGAGCAACAACAGTGAGGGCAATATGTCTCCAGTTGTTGCTGGGAACTCATCAGCGAACAGTGCATCTGTGAAGGAAGAGAATATGGAGGACATAGAGAAGCAGTTTGAGATGGATGAGGGAGAGTTCAGTGATGGACTCCCTTACAAGCCTTGTTTGATGGATCAGAGTAATAATCAATCTGAGGACTTCTTTGCTGAGTTGGGAGAAATAGAAGCTGACCCGCTGGATATTCTGTTTACCCAAGGTTTTGGTGCGGCTGATGATCAAAGGGAAGAATCCAAAGCCTTGGATCCATTCCATCTGTTTGACTGGTCAGGAGACAACAATACCAGCACAAACACCGGTTCATTTGAAGAGCCTAATGCAAAGAGAAGGTTATAA


Promoter Sequence:
>Vu_23143::LG5:62696269-62698269(-)
TGTTTCATTCAACAAAACAAAAAAAAGGGTTAAGTTTTTCATATTTTATTGTATTTGTTTCGTTTATTCATAGAACAAAGTTAATAATCTAGCATATACACAATAATGTATAATAATTAATTAGATAATAACTTGGTAAAAATACTGTATTTATTGATATAATATAATCATGTTCAATTATCAATACAAATGAATACGCATTTACCATGCTAAAGAAAACGAAAGTAAGAGATAAAAGTGATTAAGAATGGCACTAAAGCTTTAATTTAAATAATTATTAATGGAATCTGATTGGACGACTAAGTAGATTTTTTGTGCTATAATTGCGAAGCATAATAATGAATGTACAATGCAATTAATATGATAATAAATTTTACATGAAAAAAATGACACTTTTCATACGTCCTTTCAGAGTTCATAGACTTTATACCTAACGTAAGACACGTATCATCAAACATCTAATCTATTCTGATATAGGGCCACAAATTTTCATATTTTTCGTAAAAAAAAAAATATATATCTTATAGTTTAATATCTTTATTACTTTTACATGTAGCACATGCACAATTTTAATTAATGTAGTCCAATTCCAAGGACACAAAATTAATTTTCTTATTCCCGTCGAACGGTACGTGATAGGACCTTATGCGATCACATGTTTAACTAAATATGGTAATACCAAATTAAACACGATCGTAAAACCTTCTAATAAAGCACTTCTTCACTCTTGAGTTGCTTCACTCAAACATTGATGATTGTGTTTTGGAGATTTAAAGTTGCAAAATTCCAAGGCGCGTGAACATTCCCATTAATAGTTGCAAAATTTAAAGAATATATTTATTAAAAAGAAAAGGGTATTTCCTAAAATGGATAGAGTGAAAAAGAAAATGTTGTTTTGAAGAGAAAAAAGAAAAAAAAAATGGAATGATTTTAAGAAGAGGGTAATGGTGTGTGAGAAAGGAAGAAGAGACACATAGATTGGTGCCACGCTAAAACATTCTTTCCTTACGGAAAGAAACGGGAGACTCAGATTATTGAATGCCTCGAAACGTTTCTCCGCGAAATGCGGCTACTTGCCGCATCTTTTGTTTCTTCTCCATTGTTTTATTTTCCTTAGAACACCATTCTTTTTTTTTTATTCATTATTGATTTCGCCCTAATTCTATCATAATTGTAATATCTAACAAGTTTTCACACTTGTATTATTACAATTACAATTATTTTATATATTTGTGAGATTTAAAATTTAATAACTTCTTATATATTGACTACTTGTTGATGATTTATATATACTAAAAAAATACAAGTATCTAAAACATGTGATATTTTTATATATGTTGAAGTGGGATTTGAATCTAAGTATTAAATAAAAAGATGTTGTGTTGATTAATAGGCGTATTTGATGGTATTGAAATGAGAGGGGTTTTGTTATTAATATTTTGGAGAAGGACAGAAGGGAGAATATATTTATAAGTTATAAAGAAAAGAGTGGGAAAAAATAGAGCCTTAGATGGTGTTTGATAAATGTCCCAGCTCAAGAGTTGTGGTATTTTATTAGTCGAAGCAGTTTTTGTGATTTAAAATTCCTTCTCTCTCCTGATGTTGCGTATGGAATGGAGCTGTTTTGTGTGAAAAGTCAGCGTCTCTGTCTCTCTCTCTCTATAAACCCATTCTCTTTTGTTTGTTATTGAGAGGAACAATCAGTTTCAACCTCCAAAAACCTGTTCCTTAATTTGCTTTTTCTTGCTTCTTAACAGCCAAAATCCCATCTTCCCAGGAGAAAGCCTTTCTTCTCACAACCCCTTCTTAATCCTCCCAACCTACCTCCTCACACACCCAACAAAATTCCTACAATTTCATCTCTTTTTCTCTCTCTCTTATTCTCTCAGGCACCAACATATCTCCATCATTTATGCTCCCAAACATGTCACAGACACAACCTTCTCCCTCCTTATACTTGAACAACAATCTCTTGTTCCACTAATAGGAAGAGAAAAAGC


Gene Sequence:
>Vu_23143(-)
ATGTGCAGCTGCATCTTTGGGCCAATAATCATGGACAATTACCAAGGTGATTTAACTGACATAGTCCGAGCCAGTGGTGGAGCATATGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGCAGCAGCTGCAGCACAGGCACTTCATCTGTTGAATTACCTACCACATCTCATCACCATACTATTACTCACACCCTCTCTCGTAATGATCACTGGCACCAACACTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGATCCCATCACCTTCTCTTCTGTGCTTCAAGACCCCAGAGGACTCACCAACTTTGGTGATCCCTTCTCCACCATGAGAGATCCCTTCCTTCAGGAGCTTGACATGCCTTCCGCTTCTTCCTACTTCACTGGGGGCTTGGAAGAAGCAGCTGCGAGTTTTGGTGCTTCTGCTGTTAGTACCAGTACTAATACTAATACTAGCACCACTGTTTTTGCTGCACACAAGATTCTCGAGGAGCATGACATGAGAAGACCTTGTAAAAACATATTCTCCAACATGATTCAGATCTCTCCCAATGCAAAGTTACCGGTCTCACCCTATGATTCCACCACAGCGGTGGCACCTTCTCCAAGGGCAATTAAACCTCCTGCTGTTGTTTCACCCAACATGGTTACTGCGAACTCCTCCAAGGATTGCCTTGTGGACACCATAGGAGTGCAGATCTCGTCTCCACGGAATCCGGGTCTTAAACGAAGGTCAGAATAATAAGATATTGCTTGGCTAATTAATATCTTCACAGAACTAAACTTAGTTTATGCTCGTGTGTATTAATTTCATGGGGTCGTCATAAATTATGAATCACATACTTTTGATTTTTTTAAGGTGCGGTGGGGTGAAATTTTATGAAAGTGGCTACGGTGAAGTTTGTACTGTAGAGAGAAAGTAGGGTTTGGCATGAGTTAGGTACTCGTGTTCCTTTTCTTGCGCTTTCCAAATCGGTTCCGTTGACTGGCCCAGTTAAGCTAGGTAGCTGCTCAGAATGAGAAACAGTAGTTTCATTGTCATGAGACTAACTAAACATGGTTTATTCATTGAGGCTTTTCGTAGGCTTTAATCCACCTGAAAAGTAGAGTTAGCTCGGCGTGTCACGCACACAATAACAGTCACACACTTAGCTTTCACCCAACTTATCTTAAACCACCTGAAAATTCCTATTCCTTTTATCCTCATTTTCATCACACAGAACCGTATTCCTTCGTTCGAAGCCAAATTAAAACGGCCTGATCTCATGCTTATTCTCGAATATTCTATTTCTCTTTGTAATATTCTTATTTCTTGCTCATATCATGCTTGTTTGGTCAGAGTTAAAGTTAATTTGATGTGTTATTGTTGTAATTGCTGCAGGAAGAACCAGGCCAAAAAGGTTGTTTGTATTCCTGCACCAGCAGCTGCAAACAGCAGACAAACTGGAGAGGTTGTTCCGTCAGATTTGTGGGCTTGGAGAAAATATGGTCAGAAACCCATTAAAGGTTCACCTTATCCCAGGTTAGCCTCATACTTTAGCCTTAGGTATACGATTGATATATTATTCTCTGTAAGATTGGATATTTTAGGAATAATATCACTGTGGGTATATATTGGCCACACTGCACAAAATATAGATCACAACTTCTCTCCCCCCCATATACTCAATTTTTTGTAGCTTACTATACATGTATCGTGTTAATTTCTTCGATGTTTATTTATATTTTTAATCTTGACCATTAAATATGGACCGGTCACACTTCGAGGTTTAAAAAACAACTAGGCTAAAGGCTTTCCCATTCAGAAGGCTTTCTTTACCCAATTTTTTATTAGAGAAAAATCACTACGAGCACACGTCTGGTTAAAGATTCGTCGTTTTCTTTAAGTTCTTTTAAAAAACTGCCAACAAAAGCAAATGGTTCATTTAAATAATTAAGTTGAACCGAATTCATTGGAGAGCAGTGACGGTACCCTTTGAAATCTAATGAGGATTTTCATACAACCGCCTTTTAGGTCAATTGAATGAGTTTGCACAAACGAACAAGAGATTGTTAATGAAGGGGTTTTTGCATCATCGTGATGTTATTATAGGTCTTGGTTTTCTCTCATTTTCATCTGGGGTGTTGTTATGGTTTTTCTTATTATACATCGTTCTCTTGTGGTTATATCTATCAGGGGTTACTACAGATGCAGCAGCTCAAAGGGTTGCTCTGCGAGGAAGCAAGTTGAGCGGAGCAGAACAGACCCAAACATGTTGGTTATTACATACACATCAGAGCACAACCATCCATGGCCAACTCAAAGAAATGCTCTGGCTGGTTCGACCAGGTCACAGCCATCCAAGAACAATGCTGGAAATTCAAAGAGCTCAGAAGCGTCAAACCCCCAAAAGAGCACAATATCAAAAGCAAAGGATGAGCAGCAGCAGCAGGAGAGCAACAACAGTGAGGGCAATATGTCTCCAGTTGTTGCTGGGAACTCATCAGCGAACAGTGCATCTGTGAAGGAAGAGAATATGGAGGACATAGAGAAGCAGTTTGAGATGGATGAGGGAGAGTTCAGTGATGGACTCCCTTACAAGCCTTGTTTGATGGATCAGAGTAATAATCAATCTGAGGACTTCTTTGCTGAGTTGGGAGAAATAGAAGCTGACCCGCTGGATATTCTGTTTACCCAAGGTTTTGGTGCGGCTGATGATCAAAGGGAAGAATCCAAAGCCTTGGATCCATTCCATCTGTTTGACTGGTCAGGAGACAACAATACCAGCACAAACACCGGTTCATTTGAAGAGCCTAATGCAAAGAGAAGGTTATAA