Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23126 LG5 62467909 62469653 PREDICTED: transcription factor MYB108-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 62468074 missense_variant p.Val280Gly
A/T 62468078 missense_variant p.Ser279Thr
T/G 62468117 missense_variant p.Thr266Pro
G/A 62468831 missense_variant p.His88Tyr
T/G 62469003 intron_variant
A/C 62469136 intron_variant
T/G 62469414 intron_variant
C/G 62469636 missense_variant p.Arg6Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23126.1
MEVKGRVSNSPSTIVQSDDEMDLRRGPWTVDEDLALINYIANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEEQLLILELHGRWGNRWSKIAQYLPGRTDNEIKNYWRTRVQKHAKQLKCDVNSKQFKDAMRYLWMPRLVERIQAAAAATTAAAAVRSPTASASATTTITTNNNITYNYGSNNNLNNSFEVHSGDMMLSPAIMNNNFGGSQSYTPENSSTGASSDSFGTQVSPVSELAQDYYNNVTVSNSNSHNNPNPDYYQQAQDQLSFLDCITSPSGLFSQQLDFHSMEPNTPWIQSNGDTSNGFWNVENMLLFQQLTDNI*


CDS Sequence:
>Vu_23126.1
ATGGAAGTGAAAGGAAGGGTAAGCAACTCCCCAAGCACCATAGTCCAAAGTGACGATGAGATGGACCTTCGAAGAGGTCCTTGGACCGTCGATGAAGACCTTGCTCTCATCAATTACATTGCCAATCACGGAGAAGGTCGATGGAATTCCCTTGCACGTTCTGCCGGACTCAAACGAACTGGCAAGAGTTGCAGATTGAGATGGTTGAATTATCTCCGCCCTGATGTTCGTCGTGGCAACATCACTCTTGAAGAACAGCTTCTCATTCTCGAGCTCCATGGCCGCTGGGGAAACCGATGGTCTAAAATTGCCCAATACTTGCCTGGAAGAACTGATAACGAGATCAAGAATTACTGGAGAACTCGTGTTCAAAAGCACGCCAAACAGCTCAAATGTGACGTGAATAGCAAGCAATTCAAGGATGCCATGCGCTACCTTTGGATGCCGAGGCTGGTGGAACGCATTCAAGCCGCCGCCGCCGCCACCACCGCTGCGGCCGCCGTCCGTTCTCCCACGGCTTCTGCCAGTGCTACTACAACCATCACCACCAACAACAATATAACATACAACTACGGCAGCAACAACAACCTTAACAACAGTTTTGAGGTGCACAGTGGGGACATGATGTTGAGTCCAGCAATTATGAACAACAACTTCGGTGGTTCACAAAGTTACACTCCGGAGAATAGTAGCACGGGTGCATCATCTGACTCGTTTGGGACTCAGGTTTCACCTGTCTCGGAGTTGGCTCAGGATTACTACAATAATGTCACAGTTAGTAACAGTAACAGTCACAATAACCCTAATCCTGATTACTACCAACAAGCACAAGATCAACTCAGTTTTTTGGATTGCATCACAAGCCCATCGGGGTTGTTCTCTCAGCAGCTGGATTTCCATTCCATGGAACCAAACACCCCATGGATTCAGAGTAATGGGGACACATCCAACGGTTTCTGGAACGTTGAAAACATGTTGCTGTTCCAACAACTCACTGACAACATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_23126::LG5:62469653-62471653(-)
AATGTTTTACATCAACAGCAAATTTCGTATAAATTGTATGTAGCTTACACTAAATAAAACTTGATAGTTTTCTGTTAAACAAAAAATTCACAATTATATGTAAAAGACAGAATACAGTTTTATGCGCATAATTTAAATTATATTTTTCAATTGATAAACAACATTTTATTAACATTTCTATTATAGTAATAATTTAAGTAATCGATTGATGTAATTGTTAGATTTCTTATATGTTATAGGGATTATGTAAGGAGGAGTTTATAGTCGCATTTTTTTTTCAATAAAATTCTATATCTCAGTTATTTTAAATCCATCTTCTTCCAATAAAAAAATAATTATAATTTTCTCATATTAAGATGCTCTTGTAATTTCTATGATATTGACTAATTTTAAACAACTTAAGTCGTTCTCGTCTTTTTTTTTTCACGGACCATTTTTTCACGGAAGGGAATAGGATCATTATTGCAATAAATTTAAATTATTGGTCCCACTAATAAATTATATTTGGCCCCACTATTAAATTATAATAAATTTTTAAAATTAAAGCATCATTTAATTACGATATTGAACTTTTTCAGGTTAATTAATTGTGATAAAGGAGAGGAATAAGCATTTAGAATCCTAGGGGGTGTAAAGTCATTGGGGAATATCTGGAAACATATTTAAGAAGAAAAACAGATATAGAGGATCTCTCAACAACCCCAGTATTCACTTGAACTTCAATTATAAAAATGAAAATCCTCTTTTAAAAGTACTTAGTATACAGATATATAATTTAATATTATCTTACACAAATTCTGAAGTTTTTTTTTAAGTATTTCAAAAAACTTATTCCTTTTATTGATTTTCTATTATTTCTTCTTGTTTCTTTCACTTCATCACTATTTATTAATTTATTCATATTTTCGAGCATATTTTATTTCTGATAGCAAATCATCTGTTAAATTGTTAAAATCTCTGTCAATTTTAAAGTAGGATTTTCTTAAAATATAATTTGTTGACGCTTAAACGATTTTATGTTAAAGTTACACTTAGTAAAGTTTACATAAAACACAAAGTTTCAGTCACATTAATTGACAAATAATAAATTTCTACAAAACTACTTAAATAAATCGATAACAAACCAAAGTACTACTAAGAAAATATTATTCAGAAAATTGAAAGCAAAGTTTCACCGAAAATAATAAGAGAAATTTTGACGACGGAGAAAATTAAGACACTTCAGACAAATAAAATATGAAAAAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATCCAATCCTTAGATCAGAATATTATTTAATTCCTACACTCAATACTAATAATAGAGAAGCCAATTATACTATTCATCACTTTAATGACAGTAATTTAATAAATTATATATATTTTTTATTAGAAAAGTTAAATATGCATTTTTTTTATTTTCATTTGTAACTAGGTTAACCATTGTGTACAAAAGGGGCTGCAAAATATTATTATGAGCACGTAACAACTGATAGAGTTACAGAGCGCACGCGCGCACACAACGAAGCCGGAAAAGTCAAACTATAGCGTCAAACTTCGTAGCCTTTTCTTACTTACAAGCCATAATAATAATTATTTTCCTCCTAATACTCGTTTAAGTTTTCGTTAATTAAATCATTATCTTTTTACTACTTAACCTTACTTTCTTCTTTCTCTCTCTCTCATCATCTCTTCCAACTCTATCGTTTTCTCCTTTCTTTCTTTTATTTATTTATTTTTTAATTTTCTCGCAAATTTTCAAAGCTTCATGCTTGAGTATCTATATAAAGGCTCCACCCTTCTTTATCCTCTTCGTAATAAGCCAAAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTGTTTCTCTCTCTTGATTTCTTTACCTCTTCAACCCAAACACACTAGTTAGATCAAAAGCTATCTTTGTAGTTGTTTTGGGTTCGAATCAATCAATCAATCAAAATTATTTGAAAGTGGGTGAGTCATC


Gene Sequence:
>Vu_23126(-)
ATGGAAGTGAAAGGAAGGGTAAGCAACTCCCCAAGCACCATAGTCCAAAGTGACGATGAGATGGACCTTCGAAGAGGTCCTTGGACCGTCGATGAAGACCTTGCTCTCATCAATTACATTGCCAATCACGGAGAAGGTCGATGGAATTCCCTTGCACGTTCTGCCGGTAACATAACATAACATAATAACTTTCTTTTTCTTTCTTAGATTTTTCATCCCAATATAATAAGAACTACTATACTAGTAGTGATGCACATATTTGATGATTGCAATTGTTGACGGTAATTAGTTCCACTATTTTCTTCAAGCACTGGCTCTCTCTATCTTCCACACCTATATGATTGTGAAAAGCTCTTAACCTCTCATCCCGTTTCGTCACCAATCAATTTGTTGGGTGGAAAAGCCAAAGTTTGCGGTTTTCTAATATATAAGTAGAAGGGCATGATGATATGGTAGTGGATTATTTTGGGTACGACTTTATAATGGCATATACTTGTTCGTGGTGGGGGCATAAAAATGAAATATGTAATTATAGGTTGTCGATACTTGCTTGGCCGCATCCCCATTTGCCAAAATTCAAAAAAGATGTGTGAATTGATACCACAACTAAAAAATCGCACACTCAAAATATAAAGTACCGTAAAGAAAAAACAAAATGCTCTTTCTTTATTTCCTTCGTTACTTCCTCAAGACTTTACCAATTCAAGCAATTTCTTGTATTGCAGGACTCAAACGAACTGGCAAGAGTTGCAGATTGAGATGGTTGAATTATCTCCGCCCTGATGTTCGTCGTGGCAACATCACTCTTGAAGAACAGCTTCTCATTCTCGAGCTCCATGGCCGCTGGGGAAACCGGTACGAAAACAAATCAAATATCTATAATTAACATAAATATCTTCTGCCTTTTCTCTATCTTTGCATTTACCATTTTTCGAAAGTCTGTACTCATGCAACCAAACGTTTGGCCACTTTTTAAGTTAAATTATATTTTCAGATTTTGATGATCATTTGCTTTTTTATATTCATTCATCAGATGGTCTAAAATTGCCCAATACTTGCCTGGAAGAACTGATAACGAGATCAAGAATTACTGGAGAACTCGTGTTCAAAAGCACGCCAAACAGCTCAAATGTGACGTGAATAGCAAGCAATTCAAGGATGCCATGCGCTACCTTTGGATGCCGAGGCTGGTGGAACGCATTCAAGCCGCCGCCGCCGCCACCACCGCTGCGGCCGCCGTCCGTTCTCCCACGGCTTCTGCCAGTGCTACTACAACCATCACCACCAACAACAATATAACATACAACTACGGCAGCAACAACAACCTTAACAACAGTTTTGAGGTGCACAGTGGGGACATGATGTTGAGTCCAGCAATTATGAACAACAACTTCGGTGGTTCACAAAGTTACACTCCGGAGAATAGTAGCACGGGTGCATCATCTGACTCGTTTGGGACTCAGGTTTCACCTGTCTCGGAGTTGGCTCAGGATTACTACAATAATGTCACAGTTAGTAACAGTAACAGTCACAATAACCCTAATCCTGATTACTACCAACAAGCACAAGATCAACTCAGTTTTTTGGATTGCATCACAAGCCCATCGGGGTTGTTCTCTCAGCAGCTGGATTTCCATTCCATGGAACCAAACACCCCATGGATTCAGAGTAATGGGGACACATCCAACGGTTTCTGGAACGTTGAAAACATGTTGCTGTTCCAACAACTCACTGACAACATATGA