Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23108 LG5 62308165 62310012 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 62308401 synonymous_variant p.Pro79Pro
C/G 62308527 synonymous_variant p.Thr121Thr
G/A 62308537 missense_variant p.Ala125Thr
A/T 62308719 intron_variant
G/A 62308932 intron_variant
G/T 62309273 missense_variant p.Ala184Ser
C/T 62309341 synonymous_variant p.Ala206Ala
G/A 62309958 missense_variant p.Gly289Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23108.1
MAEEKREEEAHPNNEPSTTMAFSDEIPNNFTFPSQPLTIFDAMPPPPFSSSCDHKASPFGFLDLLGVHDYHAPLFDWPPSAAPSRASSNVPDSSEVLNTPASPNLSSISSSSNEATATATTASRAEQSGKGGFEHEEAEAEEEEEGGNGGREDQDQDKTKKQLKPKKKNQKKQREPRFAFMTKSEVDHLDDGYKWRKYGQKAVKNSPYPSFGFVNEPGGLGHSGSSHFVLPHQHQHQHQHQASPLIYNSNPPFVNSASNFMNTTSFGGFGQDHANRQGFGHEALLRDNGLLQDIIVPSQVRKEEKD*


CDS Sequence:
>Vu_23108.1
ATGGCGGAGGAGAAAAGAGAGGAAGAAGCGCACCCCAACAACGAACCATCCACCACCATGGCATTCTCCGACGAGATTCCCAACAACTTCACTTTCCCTTCCCAACCACTCACCATCTTCGACGCCATGCCGCCGCCGCCCTTCTCTTCTTCCTGCGACCACAAGGCCTCGCCCTTCGGCTTCCTCGACCTGCTCGGCGTGCACGACTACCACGCTCCGCTATTCGATTGGCCCCCCTCCGCTGCGCCGTCGCGGGCGAGCTCCAACGTGCCGGACTCCTCCGAGGTGCTGAACACTCCCGCGTCGCCCAACCTGTCGTCGATTTCGTCGTCTTCGAATGAGGCCACCGCCACCGCCACGACCGCCAGCAGGGCGGAGCAGAGTGGTAAAGGTGGGTTTGAACACGAGGAAGCCGAAGCAGAGGAGGAAGAAGAAGGTGGTAATGGAGGCAGAGAGGACCAGGATCAAGACAAGACTAAGAAACAGTTGAAACCGAAGAAGAAGAACCAAAAGAAGCAAAGAGAACCGAGATTTGCGTTCATGACAAAGAGCGAGGTTGATCACCTAGACGATGGTTATAAGTGGCGCAAGTACGGCCAAAAAGCTGTGAAAAACAGCCCTTATCCCAGCTTCGGGTTCGTGAACGAGCCTGGTGGGTTGGGACATTCCGGCTCCTCACACTTCGTCCTGCCACATCAACACCAACACCAACACCAACACCAAGCTTCGCCTTTGATATATAACTCCAACCCTCCTTTTGTAAACTCCGCCAGTAACTTCATGAACACGACGTCGTTTGGTGGGTTTGGTCAGGACCACGCGAACCGTCAAGGATTCGGGCATGAGGCTTTGTTGAGGGACAATGGGTTGCTTCAGGACATTATTGTGCCATCGCAGGTGAGGAAGGAGGAGAAGGATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_23108::LG5:62306165-62308165(+)
TATTGTTTCGTATGTTAAAAAATGTGAAGACTAACATTTTATATAAAATGGTATTACAATGTGAGATGATAAGTGATTTTTATTGTTTTAATTGAAAAATATTAGATAGTATAATTGTTACCATACTCTTTTAATAACTTTTATGTTTTACAATGATCAAGAGATTTTTGTTATCATTATCACTAATATAAGTAACCACGTTGATTCCTTATTGTACAACATGTTTGCAATGAAAACAATTAAAATAATTCAACAATTTATATTAATCTTATATAATTTTATATTAAATACAAAACCTCTTACTTTTTTAATGTATGAAAACAATGCTAAAAAATATGACTGTATAACAATCACATCAATAGATTAGTGAATAAATTAAACTATAAATATTCAATTAAAAATATTAAAAATTAGGATTCTTAATATATCAAATTTTTTCAGTAAAAATTCAATTAGCAATAATTATTAAATTTATAAGAGACTTAAAACTTAATTAATTCCGATTATTTAATATTTAATATTTTTATCTTCCTTTTAAATTTAAATATATTTCTAAAAAATTAGACACTATAACTGAATTTTATATTATGAACTATAAAAAGAAAGTAAATAATGAACTATATTTCTAGATTTTTTTTTTCTTAAAAAGGAAAGTAAATAATGAACTATAAAAAGATAGTAAGATAAAAATTAAAAAAAGTAGAAACTAATAAATTCAAATGCTATATAAAGCAATAAATTTCTAATATAAAAAAGAAAAACAACATTAAGATTACGCACCAAAAATAATATACTTAAATTTGATGAAAATATTAATTAATTAATTGTTAATAGTATCTTATGAAACACACCAAAAAGTAGTACCCACGTGTACAGTAGGGAGAATGCTTGGTTCACACGCTAAGCCGGTTACCAGTCAAATATCCGCGTCAAGAAGCAGTGGGGCCCTATGGCGGTCCTCTTTTGTGGTAAATGCCATCAACATCTTGCTGCCATTCTTCGTACGCTTCGTAACTGACAGGTGCCCGTCGTCTCAAGCTGCAAATTCCAAACCCTCTCACTCTCTTCATACATACATACCTGTTCTCCAAATTCCCAACCCTATCAAGCTTTCTTTTCACACAACAACGACCTAATTATATTCTACTCACTCGCTTTTTTTATTTTATTTTCTAAGCCTTCAAATAAAACCAACAAACTTTTTCTCTTCATACATATCATTTTTCTAATCAATGTTTTCTTTTTCTCTAATACTCACACAAAAATATTAATATTCTTTGCACTGACTCATGATAAAAATATTCATTAGAGCACTAACCATAAGTTAAAATATGTAATTTTTTACCGAGTATATATATCCCATGCATTAAAAAATCGGTACTATTAACACTGTATAAAACCTTTAACCTTATTTAAATACGTGTTTTATTATTTTATGTAATTTAAAAAAAAAGTAATAAAATTAACTAATTTTCCACAGATTTTTCTCATAGATTTTGACCAGTTTTAGATATTGTCATGGACTATGAAATGTTTTGATTTGTGATAGTTACTTATAGACGAATCAAATAATAAGTTAGTCCAGTTCGATTTTATAAATTATGGTGGAAACATTGAAGAATAAAATTATTTAACAATTTTTGAAATAGTACTTCTATTTAAAGAAACATAGAATGCCTCTAATTATTATTGATTATTTAAGAAAATAGTATATTTAAAAATTGAATAATAATTTAACAGTAATTATGATGACATTGGTTAAGAAATCTCAAATTTGAATCTATGGAGAGAGTACTCTCCTAATCCCCAAACTATCCCTTTCTCTCTCTTCCTTTCTGTCTCTTTTTATATCTTTTGTAATAATAACAAGTGGTAGAATTTAGAGGCACACTTCCTTTTGAGTTCGCAGCACAAAAGCAAGATCTCCAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAGGAAGAATATGTGCCACGCTGATATATAGCCGAAGCAATCCACGAAAATCAA


Gene Sequence:
>Vu_23108(+)
ATGGCGGAGGAGAAAAGAGAGGAAGAAGCGCACCCCAACAACGAACCATCCACCACCATGGCATTCTCCGACGAGATTCCCAACAACTTCACTTTCCCTTCCCAACCACTCACCATCTTCGACGCCATGCCGCCGCCGCCCTTCTCTTCTTCCTGCGACCACAAGGCCTCGCCCTTCGGCTTCCTCGACCTGCTCGGCGTGCACGACTACCACGCTCCGCTATTCGATTGGCCCCCCTCCGCTGCGCCGTCGCGGGCGAGCTCCAACGTGCCGGACTCCTCCGAGGTGCTGAACACTCCCGCGTCGCCCAACCTGTCGTCGATTTCGTCGTCTTCGAATGAGGCCACCGCCACCGCCACGACCGCCAGCAGGGCGGAGCAGAGTGGTAAAGGTGGGTTTGAACACGAGGAAGCCGAAGCAGAGGAGGAAGAAGAAGGTGGTAATGGAGGCAGAGAGGACCAGGATCAAGACAAGACTAAGAAACAGTAAGTATTGGGTAAGGAAAATGACAAGTGCACAGTTGAATTCTGATTTTTTAATGTTATTTCGCTGCAATGTATAAAAATTAAACTTTTATCCGAGAACAGCTCAAGAAAGTAACACTTTCTTAAGAAAGAACTGGGTTTACGTTTTGTTGAAATGTTTAGAATGAATGAACGAAAAATGAAAAAAGAAAACAGAAAGAAGAATAGTAAGAGTGAAAAATATAATGGAATATTTAATGTTAACATAAGGTGAAAAATAGATGAAAATAGCGAAAGACGCGTGGGTATACAGTGGATTATTAATTTTTATATGCTTTTCCTTTTTTGATTATTGAGAATTTACATTTATGTTTTGTTTAATGGCTTAATGGCAAAGTAAAAAGGAAAGGGGAGGTAAAGTCCGTTTGGGGAAAGTGATGAGACAGTTTGTGACGAAGGAACTTAAAATGGGTTTGTGGTTTTATCTTTGTTAGTGTCCTCTTTTGACTCTGTTTTTCATTTGATGTATATTTTTTCCGATTTGTTATCGTTGTTGACTCTGTAATGAAAATCCAACAGGTTGAAACCGAAGAAGAAGAACCAAAAGAAGCAAAGAGAACCGAGATTTGCGTTCATGACAAAGAGCGAGGTTGATCACCTAGACGATGGTTATAAGTGGCGCAAGTACGGCCAAAAAGCTGTGAAAAACAGCCCTTATCCCAGGTAGCATATTACTGTCATTTCATTTTTTTTTTCATTTTTCAATATTCACTCGTCATATTCTCTCTCTCTATCTCTATTATATATATATATTCATCCATCGCTCTCTTTCGCTTGTCCCTAGCGAACGGTCTAGTTGACAAAATAGCACTAGAGTTTCCCACTAATTTTCCTCTTTCCATCTAAATTAATTTTTTCTTGCGGAACACGCAACCGTCGTGCCACGTCACCTTTTAGGAGCTACTACCGTTGCACCACCACCGGTTGCGGCGTAAAGAAGCGAGTCGAGCGTTCCTCCGACGACCCTTCCATCGTGGTTACCACTTACGAGGGGCAGCACACGCACCCTTGCCCTGCTTCGTCTCGGGCCAGCTTCGGGTTCGTGAACGAGCCTGGTGGGTTGGGACATTCCGGCTCCTCACACTTCGTCCTGCCACATCAACACCAACACCAACACCAACACCAAGCTTCGCCTTTGATATATAACTCCAACCCTCCTTTTGTAAACTCCGCCAGTAACTTCATGAACACGACGTCGTTTGGTGGGTTTGGTCAGGACCACGCGAACCGTCAAGGATTCGGGCATGAGGCTTTGTTGAGGGACAATGGGTTGCTTCAGGACATTATTGTGCCATCGCAGGTGAGGAAGGAGGAGAAGGATTGA