Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23054 LG5 61837997 61839958 PREDICTED: dof zinc finger protein DOF2.5-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 61838144 intron_variant
C/T 61838215 intron_variant
A/T 61838217 intron_variant
A/C 61838325 intron_variant
T/C 61838341 intron_variant
C/T 61838411 intron_variant
A/T 61838468 intron_variant
G/A 61838473 intron_variant
G/A 61838641 intron_variant
G/A 61838686 splice_region_variant
G/A 61838879 stop_gained p.Trp58*
A/G 61838975 synonymous_variant p.Pro90Pro
G/A 61839008 missense_variant p.Met101Ile
C/T 61839179 synonymous_variant p.Pro158Pro
C/T 61839311 synonymous_variant p.His202His
A/G 61839338 synonymous_variant p.Gly211Gly
C/T 61839652 3_prime_UTR_variant
T/G,* 61839683 3_prime_UTR_variant
A/G 61839887 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23054.1
MEEIGPNSCARPSSEKKAKPQEQLNCPRCSSTNTKFCYYNNYSLTQPRYFCKTCRRYWTEGGSLRNVPVGGGSRKNKKATLSKVPDLNPPVSAISSQNPKMQGVHDLNLAFPAAIDKYHGMSPYAEMPKLEIGGDNTSHHHSPSSAPTSLSPTYGMLPRGLNPYAPNSFMPNSDSLYTPIYPMQEIKPNLSFSVDGFGNRAHGVQENGGGGRLLFPFGDIKHLSAGVEVEHNKEQGNNPTGYWTGIIGDGSSW*


CDS Sequence:
>Vu_23054.1
ATGGAAGAAATAGGTCCCAATTCATGCGCAAGGCCATCGTCAGAGAAGAAAGCAAAACCACAAGAGCAATTGAATTGTCCAAGGTGCAGTTCAACGAACACAAAGTTCTGCTATTACAACAATTACAGCCTCACACAGCCAAGATATTTCTGCAAGACTTGTAGAAGGTATTGGACAGAAGGTGGTTCTCTCAGAAACGTCCCCGTTGGAGGTGGCTCCAGGAAGAACAAGAAGGCCACCTTATCAAAGGTTCCTGACTTGAATCCACCAGTCTCGGCTATTTCTTCCCAAAACCCTAAAATGCAAGGAGTCCATGATCTTAATTTGGCTTTTCCTGCAGCTATTGACAAGTATCATGGCATGTCCCCATATGCTGAGATGCCGAAACTTGAAATCGGTGGTGACAATACCAGTCACCACCATAGCCCTTCTTCTGCTCCAACTTCTCTTTCACCGACATATGGCATGTTGCCCAGGGGTTTGAATCCTTATGCTCCTAATTCCTTCATGCCAAACTCAGATTCACTTTACACACCGATCTATCCCATGCAAGAAATTAAACCAAACCTTAGCTTTTCAGTTGATGGGTTTGGAAATAGAGCACACGGGGTTCAAGAGAACGGTGGCGGCGGAAGGCTTTTGTTCCCTTTCGGAGACATCAAGCACCTTTCTGCAGGTGTTGAAGTTGAACACAATAAAGAACAAGGAAATAATCCAACTGGATACTGGACCGGAATCATCGGTGATGGGTCATCATGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23054::LG5:61835997-61837997(+)
TATATAAGTGTAAACTCATTTTATGTCAATTAAAAAATAAGTTTTTATATGAATCCCGTAAAAGAGAATATTCTACTATTTTCTTATGTCCTCTCTCTATTATAAATACTAAAACGTGGTATTTTTCTTTTGTTTGTGTAATTGGTGTGTCTATTTGCAATGTAAATAACTTTTACTTCTCCCATCACACATTATAAATACCAAATTTATTGATTAAATAAGTTTTCAAAAGTCATGCTTTAATATTAATTGATGTATAATGTATTAAACCGAATGGTTATCATGTGATGAATTGAACAGTCAATTAACACCAAATAATAATTAACTTAGAGTAAAGTAGGATTATTAGCAATTGAGTCGTGATTAGGCCATTATTAATTTAAGATTCACTCTAGAACTATAAATCCAGGTTTAAAATAAGGAGATAAATGATTGTATTTAATTGTGCACTAATTGGTATAACAACCAAACGGACTTTGATATATAATTAGACCCAATAGAGTAAAAGATGAAAGAACACAGAGACAAGAAATTGGACACACACAACTTATAAGACTTATAACCTCAATTCCAAACAAATAATAGTGTAATTTTTATATCAGAATAACATGTAAATTAAATATATTTTTTAATCTTGTAGTAGTTATTATTCATAGTTCCAGTATTTTACTTTGAAATAAATAAAGGGGTAAGTTTCCTAAAAATACTTTTTCCCTTTTCTTCAAGGGGAGGGAGGGTTGTTACAAAGGTATCTAAGAGACTAAAGACACTTCATGTGGGGAACCTGGACTTGATAAATTACAGAATGTAGACAAAAAGAACTAGTTTCCTCCAAAAGACTTCGAACCACTTTCGGTATGTTCGGCTTTATTTATTTATGGAAATATGTGTACTTTTTTAAATGACCAAGTACCAAAATAAGATGAGTGAAATACGTATTTTGAGTCAACATTCTCAGAATTACTAAAATTGTTTTATTAATAAGACCATCATGTTATGACTTAGGACTTCACCAACGCCCCCAAATGATATATAGCTTTAATTTATGCATAGTAATATATATTACATTAAATGCTGATAATTTCTTACTTTAAAAAATGTATTCCGTTCTCAGAACAAGATATAAATTAATATTATGTAGTGAGTAGAAAAATAAAATATTTATGTATGCTTATATTAAACCGACATTATGTCAAAATAGTTCATTCATTGTTTAATTCTTTTCCTGGAAAAAGATTAAAGTAGACCTATAATTATAAACTATAAAACATATCAGTTTTCTGGTTATGTTGTTATGGACTTATGAGCATCCTATGTTGCTTAGTGGTTGATTAAGCTTGCAATTTTTGTTTCATCACATATTTTAGCTGTTAATTGGCCAGGTTTTCGAGTTAATCTGTACTAAAAATTTTGAAAGCTCTCTCTGGCACAGAAGTTCACAGTAGATGAAAGAAAAACGAAGCCGACGAATGAATACATAGGAGAATTGAATGTGTTTGATCGCATCGTAAGCAAACCCTAGTGTGTACTGCTGAAAACATGTAGAAAGTTTATTAATTGCAGCAAAAGCATCTTTGATAATTAAAGAAAGACATGAATGAAAACATTCACATACATTATAATCTCTTTGATGAACCTAAAAATCACATCTATTCAAAGGTGGTCCTTGATTAGAGAAAAAGAAGGTTTGACAATTGAAGCATTAGTGAAGAGTCTATATCGTTAAAAAAAAGGAAAAATCCATTCATGACCACACCACATACTCATTATTCCACCACATAAAATTAATCAAAAGCAGACAAAAAGAAATCAACTTGGAATTAATAGGAAAGGAAAAGGAATTTGTAGACATTAAAAAATTAGAGGGAGTCCTAAAGGTTAAAACATCATTAAAGAAGAGAAATTGCAAGTATAGTCAAATTTGACACATTTTCTTCTAAAACTTTTTTTTTTCCTTTTTCATCGTTGATAAAGTAAGAAGCTAGCAGATAAAGCCACCC


Gene Sequence:
>Vu_23054(+)
CCACAACAGAACTAAAACATTCTTTCTTGCACTAAAGCGCAGCTGCAGACAAACAAGGTGAACTCTTTCTCTCTCTCATAATCTTCGTTGCTTTTCTTTGTCTTTTCTCTCTGAAGTATTCATGGCTACCGTTCACTCTGCAAACACGGTGGTTGGTTTTTTCTCTTGTCTTTTCCTTAATGCACGACTTTGAGCTGTTCATTTCGAGGTTTAGTTTGCTAAAAAGCTGACACGAACATGAGGTCTACTAGACCTAATATTTGTTTGAATCTTTGTTTTAAATTTGTTGCTATATCTGGGAGATGGTATTCATGACATAAGATGCAAAATCCACCGTGTACTATTGATCTCCTACGTTCTCCTTTTCTACCAAAAAAGGTTACGATCCGATCCTAAACATGAAAAGCGCTGCCACTGCTTTAACTTTTGCCCTTCTTTACCTTCTTCCTCGTGTGATAATTATTGTCAAATACATAGCAGGGCTTAAAAAGGATTACTAATTTGTTATTATTATTGATTCGTTAAGTTTACTCATTCCTCTCTTGTTTTGACTGCCTTAATAATTATCTCTCCAATATGTTTTTCTGTAATGAAATTACGATGTCGTGCTCTTGAAATTCTTTTTGTCTGTATGAATTATTGTCGGATAAGAACATGCGTACTCATAACCTCTTTTGAGTTTGTTAGGAGGTTGAGCCAGTGAGGAGACATGGAAGAAATAGGTCCCAATTCATGCGCAAGGCCATCGTCAGAGAAGAAAGCAAAACCACAAGAGCAATTGAATTGTCCAAGGTGCAGTTCAACGAACACAAAGTTCTGCTATTACAACAATTACAGCCTCACACAGCCAAGATATTTCTGCAAGACTTGTAGAAGGTATTGGACAGAAGGTGGTTCTCTCAGAAACGTCCCCGTTGGAGGTGGCTCCAGGAAGAACAAGAAGGCCACCTTATCAAAGGTTCCTGACTTGAATCCACCAGTCTCGGCTATTTCTTCCCAAAACCCTAAAATGCAAGGAGTCCATGATCTTAATTTGGCTTTTCCTGCAGCTATTGACAAGTATCATGGCATGTCCCCATATGCTGAGATGCCGAAACTTGAAATCGGTGGTGACAATACCAGTCACCACCATAGCCCTTCTTCTGCTCCAACTTCTCTTTCACCGACATATGGCATGTTGCCCAGGGGTTTGAATCCTTATGCTCCTAATTCCTTCATGCCAAACTCAGATTCACTTTACACACCGATCTATCCCATGCAAGAAATTAAACCAAACCTTAGCTTTTCAGTTGATGGGTTTGGAAATAGAGCACACGGGGTTCAAGAGAACGGTGGCGGCGGAAGGCTTTTGTTCCCTTTCGGAGACATCAAGCACCTTTCTGCAGGTGTTGAAGTTGAACACAATAAAGAACAAGGAAATAATCCAACTGGATACTGGACCGGAATCATCGGTGATGGGTCATCATGGTAATTAAGTAACGAAAGAACTATTGGGAGAACATGGATCAAACCTGCATTGTTTTCTTTATCTTCACTCTTTCCTTTTATCCTTTCTCACGTGAATCATTATGATCTATTTGTTTGAAGTTGTTCAGATCACTAACAATAGGATACATCTGGTTACTCTGTTCTGTATACATTACTACTACTACTACCACGTTTCTATGTGAGCAATGTGAGGATTTGTCTGCTCATCTTGGTTGTTTTTCCATTTAGAGAGAGGTAGATAGAAGAAGAGGTGAATATAGGGTCTAATTTTGTCCAGGTCATGCACTAGCCTGTATTCAGTATTCTTCTGTCAAGAGTAGATATATATCACCTTTATTGATGTATGCATGTTTCTTTCAAAGATTTGGTCGAAATGACTTTGGATGATTAAGGAAAGACTCAAATACTCAAGTTTGTAACCATAATTATACATGTATTTGATTGGTTGTGTTGTGATATATAGTTGTTTGTGTG