Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23045 LG5 61677537 61680315 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 61677544 3_prime_UTR_variant
T/C 61677662 3_prime_UTR_variant
A/G 61677891 3_prime_UTR_variant
C/G 61677984 3_prime_UTR_variant
G/A 61677989 3_prime_UTR_variant
G/C 61677997 3_prime_UTR_variant
G/A 61678112 synonymous_variant p.Phe575Phe
A/T 61678194 missense_variant p.Val548Asp
G/A 61678269 missense_variant p.Ala523Val
T/C 61678319 synonymous_variant p.Ser506Ser
G/A 61678481 synonymous_variant p.Asn452Asn
T/C 61678490 synonymous_variant p.Glu449Glu
T/G 61678537 synonymous_variant p.Arg434Arg
T/C 61678543 missense_variant p.Asn432Asp
G/A 61678702 stop_gained p.Gln379*
G/C 61678832 synonymous_variant p.Val335Val
A/T 61678845 missense_variant p.Val331Glu
C/T 61678849 missense_variant p.Ala330Thr
G/T 61678884 missense_variant p.Pro318Gln
T/A 61678890 missense_variant p.Asn316Ile
A/T 61679217 missense_variant p.Met207Lys
T/A 61679532 missense_variant p.Glu102Val
A/G 61679630 synonymous_variant p.Ser69Ser
A/C 61679907 5_prime_UTR_variant
T/A 61679940 5_prime_UTR_variant
A/T 61680193 5_prime_UTR_variant
C/T 61680199 5_prime_UTR_variant
G/T 61680256 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23045.1
MKVDAGSGRVAWNEEEKAVVGAVLGGRALEFLTTNSVSNESVLMAVGSDEGLQNKLSDLVERPNDSNFSWNYAIFWQLSQSKSGDWVLGWGDGCCREPNEEEEGAVRGKLRLLRVDEEMEQRMRKGVLQKLHTTFGGSDEDNYAFGLDHVTDTEMFFLASMYFSFPRGHGGPGKCFVSGKHLWLKSVPDYCVRSSLVKSAGIQTIVMIPTDLGVVELGSVRVLAESFELVQAVKSVFSTQCSPYPGVNVSASGNAVYTGLAIGDGSKVDGGVPIPKVFANATGNRTHFREKLAVRKMEDNRPWAGHALPNGNNLNNNPNAMNGLHVPGWAVNSGVRQAGPVEIFASRGASTSSVVAELPNGARQDFRLGNGYQPQRQVQMQIDFTGATSRPSHVRPVVGDSELSDVEASCKEEQASVLDERKPRKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQRFYALRSVVPNISKMDKASLLGDAIAYINELQAKVKIMEAERERFGSTSKDGSVLEANSRSENKNQEKEAPDVDIQAAQDEVTVKVSCPFDTHPVSKVIQTLREAQISVVESKLAAANDTVFHTFVIKSQGSEQLTKDKLIAVFSPPESNPLQPLSSVE*


CDS Sequence:
>Vu_23045.1
ATGAAGGTTGACGCGGGGTCAGGGCGCGTGGCGTGGAACGAGGAGGAGAAGGCCGTTGTTGGGGCTGTTCTGGGTGGTCGAGCTCTGGAGTTCTTAACGACAAACTCGGTGTCGAATGAGAGTGTTTTAATGGCGGTTGGGAGCGACGAAGGACTTCAGAACAAGCTCTCGGATCTGGTGGAGCGTCCCAACGACTCAAATTTCAGTTGGAACTACGCGATTTTCTGGCAGCTCTCGCAGTCGAAATCCGGTGACTGGGTTCTGGGTTGGGGAGACGGGTGCTGCAGGGAGCCCAACGAGGAAGAGGAGGGTGCGGTGAGAGGAAAGCTGAGGCTTCTTCGCGTGGACGAGGAGATGGAGCAGAGGATGAGGAAGGGGGTGCTGCAGAAGCTGCACACTACTTTTGGAGGATCGGATGAGGACAATTACGCCTTTGGCCTCGACCACGTGACCGACACGGAGATGTTCTTCCTTGCTTCCATGTACTTCTCTTTCCCTCGCGGGCATGGTGGCCCAGGTAAGTGCTTCGTTTCCGGGAAGCATTTGTGGCTGAAATCTGTGCCCGATTATTGCGTGCGGTCTTCCTTGGTTAAATCTGCCGGAATTCAGACCATCGTTATGATCCCTACTGATTTGGGAGTGGTGGAGCTGGGTTCCGTGAGAGTGTTAGCGGAGAGTTTTGAACTCGTGCAGGCCGTTAAATCTGTGTTCTCCACGCAGTGTTCGCCGTACCCTGGGGTGAACGTGAGCGCCAGTGGGAATGCGGTTTATACAGGTTTGGCCATTGGGGATGGTAGTAAGGTAGATGGCGGAGTTCCAATTCCTAAGGTTTTTGCAAACGCAACTGGCAATCGGACCCATTTCAGAGAGAAACTTGCTGTTAGAAAAATGGAGGATAACAGGCCTTGGGCAGGCCATGCCCTCCCCAATGGGAATAACCTTAACAACAATCCGAATGCAATGAATGGTCTTCATGTTCCGGGTTGGGCAGTGAATTCAGGTGTCAGACAGGCTGGTCCTGTTGAGATTTTTGCTTCTAGGGGGGCATCCACGAGCAGTGTTGTAGCGGAGTTACCTAACGGTGCTAGACAGGATTTTAGGCTTGGCAACGGCTATCAACCTCAAAGGCAGGTGCAAATGCAAATTGACTTTACCGGAGCCACTTCTAGGCCCTCACATGTGAGACCTGTTGTTGGTGATTCAGAGCTTTCTGATGTTGAGGCCTCTTGCAAGGAGGAGCAAGCCAGTGTTTTGGATGAAAGGAAGCCCAGGAAGCGGGGTAGGAAGCCTGCTAATGGAAGGGAAGAACCCCTGAATCATGTGGAAGCCGAGAGACAGAGACGTGAAAAGCTCAACCAACGGTTCTATGCATTGAGATCTGTAGTCCCTAATATCTCCAAGATGGACAAAGCTTCGTTGTTGGGCGATGCCATTGCCTACATCAACGAGCTTCAGGCGAAGGTCAAAATCATGGAGGCTGAAAGAGAGAGATTTGGAAGCACCTCGAAAGATGGATCAGTTTTGGAAGCTAACTCAAGATCTGAAAATAAAAATCAAGAGAAAGAAGCTCCTGATGTGGATATTCAAGCAGCTCAAGATGAGGTAACTGTAAAGGTGAGTTGCCCTTTTGATACTCACCCTGTTTCCAAAGTAATTCAAACACTCAGAGAGGCACAAATCAGTGTTGTAGAATCAAAACTTGCTGCTGCAAATGATACTGTTTTCCACACATTTGTAATTAAGTCCCAAGGATCCGAACAACTTACAAAGGACAAGTTGATTGCTGTTTTTTCCCCACCAGAATCCAACCCATTGCAGCCATTGTCATCAGTTGAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_23045::LG5:61680315-61682315(-)
AACTGAGCTTGAATTAGTCGATCCTTACCAAAAATTGATCGAATTCGGCTGGAACAATCACAATTGAAAATCGGTCGAGATCGCAACGGTTGAAACTCAATCAAGTCAATTCCAACTGAAATTCTGTTGAGTCAACTTCGACTGAAAATCTAGCAAATTTGTTTGGGACGACCACAACTAAAACTCAGTAAAGTCGAATCTCGACCGAAATTTGGCCAAATTCAGTAGAGTCAGTCCCTGTGGAAAATTGATCGGGACTACCATGGTTGAAACTCGGTCAAGCCAATCTTGACCGAAAGTCGATCAAATTCAATCGAGTCGGTATCAAATTTTGCAAAGTCGATCACGACCAGAACTCAATTGTGTTTGTCCCTACAAAATCCGACCAAGTCAGTTTCAGCCAAAAATTAGCTGAGTCGACTCTAACTGAAAATCGACTGAATTCGATAGAATTGGCTCTAGGCAGAAATATCGACCGAATTAGGTTAATTCGGCTCCAATCGAAAATTGGTTTAATTTGCCCGAGTCAACTACCGCTAAAGTTTGGTTGAGTCGGTAACAACTAAAGTAAAGTGCAACTTTAGAGACTTTCAAACAAGTAAAGGGTATAAATGATATAGTTTTAAGTTAATGAAAGTATACTACAACTTTAGATGTTCAGTTGTTTAAAACTAAACTATTGAATGATGATGTTCTGTTTTTAGTCTAAACAATTCAGTATTTTTGGTATAATATAATATAGTTAATTGATAATTTAGTTAATTTTGTCCAATGCTATTTGTAAATAGAATAACTGAGCAATGACATGACATATAATAATGTGAAGACATTCTTATCTAGCCTTTTACATATGCTCCTTTATCCAAATATTTAGATTACACAGTGGGTTTCAAAAGTCTCAAATGAATTAGAGACAACAATAATCTAGAATATATACAAATGAATGTAAATTTCACCTTATAAGTTGATTTTATGGGATTGAATTAAACTTAAAGTTCACTTTTATTTAAAATGATATCAAAACTACGAGTTAAAGTCTTTTTTATTTTAGTAACATTTATTGTTTGTTCATAATATATAAATACATGAAAATCTCACTAAATTAATTTATAAAATTGAGTTAAACTTATAAAAAATTTTACTATTTAACATAATATCAAAATCATAAATTAGAATTCAATTTTAAAAAAACTTGTTAAGTCTATTATTTCATTTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACCTGAATTGATTATATACGTGGATATATATGATAAGTTATAATTTATTTCTTTTAAAAGCTAAATTTAATTCTTTTTCATTTATTTTAAATTTTTTACAATCAATAGACTAATGACTGGAACTAAATGTGAAAGCTTAAACGTATGTCATATATTTTCTTCAAAATTAAAAATATGTTATTAATATATTCTATTTTTATTATCAATTAAATGATTTAACCTAACTTATTTTCATCTATCATTCCAATACAGTTACTTTATTTTTAATTTTTTTAAATATCAATGGTTAATAATAATGATGATCTTAAATTTAAAAATATAATTTATATATTCAAACCATTTATTTATCGCATACTTGAAAGTATCTATTTATTGTATATCTTATTATACAATAAAATGTATACTATATCATATATATACTAAAATAATATTTGCTTAATGATTCTTCTGCCGTCAAATATAAAATACATACCCGTGTTTAAATGTTTTCTTTTCAATCAAACGTGGATAAATGAATAAAAAACGTGGATAAGAAAATTTTACAATATGTTCCAATTAATTAATAATAAGAAAAAAAAGGGGAGGAGAGGACACGAGGCATGGTATGATAATTGTTGTGTACTAACTGTGGTAAAGTGAGAAAGGTAGGTTGACCTAACCATGGTTTAGCATTTTGCAGTTAGAAGTTGTAGAGGCTATAGCAGAGTGTAACCTGC


Gene Sequence:
>Vu_23045(-)
ATCTTTCAATTCTCTCTCTTCTCGTGGGTTTCTCCTTCTCTACCCTCGTGCCTTGCTTCCTCTTCCTTCTTCCTTTCTCCAATTTTCATTTTCCGTTACGAACCAAGCAACAAAACGCTCTTTTCTTTTCATTCGGTGGCGACATCCCTCCTTGTCTCTGCTTTTGTTTCCTTCCACTCGCAGTTTTTTCCGAATGTGTGTTTCTCCCCCACAACTTTCCTTTCTCGTCCAGTTTTGTCTCCCCTTTCCCAGCTTAGCCTCATAAGTAAATCCCACTTCCTGTTTCTATCTTTGTCTCTGTTTTTATTTTAGCTTTGGTCGGCGAAGCCCAAATCTGAAAGATCTGAGAGCACCTTCATGAGATGGAAATGGACAAACAGTTGCATTTCGGTTATTAAAGGAGGTTTGTGGTGTTGGATTAAGGGGTTGAAAACTTGAGATAATTGGTTGGTGGGTGGTAGTTTTAATTTGTTCAGGAGATGAAGGTTGACGCGGGGTCAGGGCGCGTGGCGTGGAACGAGGAGGAGAAGGCCGTTGTTGGGGCTGTTCTGGGTGGTCGAGCTCTGGAGTTCTTAACGACAAACTCGGTGTCGAATGAGAGTGTTTTAATGGCGGTTGGGAGCGACGAAGGACTTCAGAACAAGCTCTCGGATCTGGTGGAGCGTCCCAACGACTCAAATTTCAGTTGGAACTACGCGATTTTCTGGCAGCTCTCGCAGTCGAAATCCGGTGACTGGGTTCTGGGTTGGGGAGACGGGTGCTGCAGGGAGCCCAACGAGGAAGAGGAGGGTGCGGTGAGAGGAAAGCTGAGGCTTCTTCGCGTGGACGAGGAGATGGAGCAGAGGATGAGGAAGGGGGTGCTGCAGAAGCTGCACACTACTTTTGGAGGATCGGATGAGGACAATTACGCCTTTGGCCTCGACCACGTGACCGACACGGAGATGTTCTTCCTTGCTTCCATGTACTTCTCTTTCCCTCGCGGGCATGGTGGCCCAGGTAAGTGCTTCGTTTCCGGGAAGCATTTGTGGCTGAAATCTGTGCCCGATTATTGCGTGCGGTCTTCCTTGGTTAAATCTGCCGGAATTCAGACCATCGTTATGATCCCTACTGATTTGGGAGTGGTGGAGCTGGGTTCCGTGAGAGTGTTAGCGGAGAGTTTTGAACTCGTGCAGGCCGTTAAATCTGTGTTCTCCACGCAGTGTTCGCCGTACCCTGGGGTGAACGTGAGCGCCAGTGGGAATGCGGTTTATACAGGTTTGGCCATTGGGGATGGTAGTAAGGTAGATGGCGGAGTTCCAATTCCTAAGGTTTTTGCAAACGCAACTGGCAATCGGACCCATTTCAGAGAGAAACTTGCTGTTAGAAAAATGGAGGATAACAGGCCTTGGGCAGGCCATGCCCTCCCCAATGGGAATAACCTTAACAACAATCCGAATGCAATGAATGGTCTTCATGTTCCGGGTTGGGCAGTGAATTCAGGTGTCAGACAGGCTGGTCCTGTTGAGATTTTTGCTTCTAGGGGGGCATCCACGAGCAGTGTTGTAGCGGAGTTACCTAACGGTGCTAGACAGGATTTTAGGCTTGGCAACGGCTATCAACCTCAAAGGCAGGTGCAAATGCAAATTGACTTTACCGGAGCCACTTCTAGGCCCTCACATGTGAGACCTGTTGTTGGTGATTCAGAGCTTTCTGATGTTGAGGCCTCTTGCAAGGAGGAGCAAGCCAGTGTTTTGGATGAAAGGAAGCCCAGGAAGCGGGGTAGGAAGCCTGCTAATGGAAGGGAAGAACCCCTGAATCATGTGGAAGCCGAGAGACAGAGACGTGAAAAGCTCAACCAACGGTTCTATGCATTGAGATCTGTAGTCCCTAATATCTCCAAGATGGACAAAGCTTCGTTGTTGGGCGATGCCATTGCCTACATCAACGAGCTTCAGGCGAAGGTCAAAATCATGGAGGCTGAAAGAGAGAGATTTGGAAGCACCTCGAAAGATGGATCAGTTTTGGAAGCTAACTCAAGATCTGAAAATAAAAATCAAGAGAAAGAAGCTCCTGATGTGGATATTCAAGCAGCTCAAGATGAGGTAACTGTAAAGGTGAGTTGCCCTTTTGATACTCACCCTGTTTCCAAAGTAATTCAAACACTCAGAGAGGCACAAATCAGTGTTGTAGAATCAAAACTTGCTGCTGCAAATGATACTGTTTTCCACACATTTGTAATTAAGTCCCAAGGATCCGAACAACTTACAAAGGACAAGTTGATTGCTGTTTTTTCCCCACCAGAATCCAACCCATTGCAGCCATTGTCATCAGTTGAATAACAAATGAACTGCAGTTTAGCATAGGCTATAGGGATTCATACATAGAGAACAACCAATTTCTAAAGCTCTCAGAAATTTTTGTTACACCCGTATCTAAAAGTAAAAGTGGTGGGAACTAGAGTAGTAGAGTAATAGCTCCCCATTAACCATGTAGGCAGCCATTTTATGTTTTGTCTATAGTGTATACACATCAGAAATATTGTTCCTGCTATGTCAATTATTTTATTTAGTTTAACCAATCTAGTTGTTATGGGTAAAGAGTTTGTTTACATGTCTGAAATCATGTTTTTAAGGTTTTCCTTTTCACTCTTGTCCCTTGCTTAAGAGGGAAGAGTATTAGTTTTTTTTTTTTATATAATTTTTATATTGTTTATGTGTTCTTTCTTATTAGAGAGACATATAATTGTAAATTTTTTTATTGTGTATGTTTTAAGTTGTTTTTGCCTTCATAAGCATTCAAG