Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23013 LG5 61357962 61358960 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor CRF2-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 61358201 synonymous_variant p.Gly80Gly
A/T 61358204 missense_variant p.Arg81Ser
A/T 61358539 missense_variant p.His193Leu
C/T 61358540 synonymous_variant p.His193His
A/C 61358749 missense_variant p.Gln263Pro
G/A 61358955 missense_variant p.Gly332Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23013.1
MEEVSFSEEKFVTYKHVDHGILNQTAKVVRISMMDADVTDDEDEGLVKLHKTKKIVNEIRIVKKKPSTSVSVKQHIKEPGRRKFRGVRQRPWGRWAAEIRDPFKQTRIWLGTYNTAEEAAMVYDKAAISFRGCHALTNFIKPPTMEDIHKSSTQEDMPMEDMHKSYTKEDMLTMEDMHKSSTKEDMPTMEDMHMDAVSFEYGCYDESQGSWSGLVENVSGGAGSSRESHLSSPTSVLGLQHEKHEKLVPEEVFETEGLFIEDQSFEDTFSFVDLYLPSIDFNSGIDFMVDTNVKPSDDDRCDISPLDNENFQSFNWDIDSYFNDLSSPKTSG*


CDS Sequence:
>Vu_23013.1
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Promoter Sequence:
>Vu_23013::LG5:61355962-61357962(+)
TTAATTAATTAATTTTATATTATTTAACGAACATTTAAAAATTAGTTACTACAAAAGTTAATAAAATTTATTCATTAATTTATAACTAAATGGTGAATTTTTTTATTAAATATTAAATTTTAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGAGATTTGCTAATTTACAAATGTTTTTTTAGTTGGTATATTTTAACAAAGTGTATCAAGTTTTAGGTTACAAAAATATAATCATTCAAATAAAAATATATTTTTAAGAGTATTTTAATAATTTTAAAATTTAATTTAAAAAAAATTAAAAGGTAGTTATTTATCATCATGACTTTATAGTTATTTTTAAAATAAAAAAAATGTAGTTATTTATCATTAACTTTATAGTTGTTGCCACATGTATTAGTTGTTTTTTTTTAAATAAAAATAAAAGGAAATTATCTATCATTCCTGACTTCAATGTCTTAAAAAAATATGAGTGGATCATTAATGTCATTTTGGTAACAGATTTCTTTTGCAACTTTTACTTATATTTTTAATAACATATTTTCATTCTTTTTAAAAGTAATGGTTATTATTTCATGGATCTCCTCCAAACAGTTAATTATTAATCTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTTTAAACATACTTTTGTCGTAATTGAACTGAATAATTATGCATAAATCAGTTGACATATTTGTGATTATTTCAACTAATTTTTAAACTCTTATGGATAATAATCGATTAAAAAATATATAAATTTCAACTTTATTTGGAGTTAAGATATTAAAAGGCACTTCTATAACAATATCTATTGATCACTTCTAAAATTCCACATTTTAACAAAGTTTTACATTAAATCACCAACTACAAAAATGCTATATGTGAAAAGTTATAATAAAAAATCTTATTTATTTTATGCAATCACATTCATTTATAAAAATTATATATTCCTAAAATTTATATATTTTTAAAAATATTATAACTAAAAGTATTCCTAAAATCATGGATAATAGATAACTACCTTTTTATTTTATTTTTTCTTTTAAAAAACAACTAATACACAGTAACTATAAAGTCAATAACTACTTTTTATTTATTTTTTATTTTAAAAAACAACTAATACACAACAACTATGAAGGATAAATAACTATCTTTTTTTAATTAAATTTTAAAATTATTAAAATACCCTTATATTTAAAGTGGGTTTTTATTTGAATGAGAAGATTTAAAAAAAACCTTCCATAAATTAACAAACCATATATATATATATATATATATATATTTGTGATAAAAAAAATAACGAAATTTATTAGTACTATAATTAAAAAAGGGAATGCAAATAAATTTAATATTCTTTTAAAGGGTTAAATTAAAAGAATAATTAAATAAAGAATATTAAATTTAAAGAATGTTAATAGAAAAAGGAAAAAATGGTAAATTAATTATTTTAATTTAAAAGAATAGATATTTAAAGGATAAAAGAGGAAAAAAATTGTGTACACCAAAAAAAAGTCCTCTTATAAATAGTATAGTATATAATAGTATATAATAGTATATAGATATCATAGAAGTATATATAATATAATATATAATATCTATGAAAATATAGATATTATAGAAGTATATATAATATAATATATAGTATAGATACTTTCCTATTACATTAAATAATATTTTTAATTACGTTTTAAAAGGTAATATTTTGTAAATTTTAAAATAAAATTGACTTAATTATTTAAAAAGATAAAAGAAACCAACTGAGAAAACATGTTAAAGGATAAAACTATCATAATCTACAACAAATTATATAAAATCCAGGGCAGGAGAGTGTGTGTAACCAAGTACCAGAAAGGAATACCATTCTCTCTCTCTTTAAAATTCTCTGCCTTATATTCACTCCA


Gene Sequence:
>Vu_23013(+)
ATGGAAGAAGTCAGTTTCAGTGAGGAGAAATTTGTCACTTACAAGCACGTCGACCATGGTATTTTGAATCAAACAGCAAAGGTAGTTCGGATCTCGATGATGGATGCAGATGTCACAGATGATGAAGACGAAGGATTAGTTAAACTTCATAAGACAAAGAAGATTGTGAATGAGATCAGAATAGTGAAGAAGAAACCTTCAACCAGTGTGTCAGTGAAACAACACATTAAAGAGCCTGGTAGAAGAAAGTTTAGAGGAGTTCGTCAAAGACCATGGGGAAGATGGGCAGCAGAAATCAGAGATCCTTTCAAGCAAACAAGAATCTGGTTAGGGACTTATAACACTGCTGAAGAAGCTGCCATGGTTTATGACAAAGCAGCTATTAGTTTCAGAGGTTGTCATGCTCTCACTAATTTTATCAAACCTCCTACAATGGAAGACATACACAAGTCTTCTACCCAGGAAGACATGCCTATGGAAGACATGCACAAGTCTTACACCAAGGAAGACATGCTTACAATGGAAGACATGCACAAGTCTTCTACCAAGGAAGACATGCCTACAATGGAAGACATGCACATGGATGCTGTTTCTTTTGAGTATGGTTGTTATGATGAATCTCAAGGTAGTTGGAGTGGTTTGGTTGAGAATGTGAGTGGTGGGGCTGGTTCAAGTAGAGAGTCTCATCTGTCTTCACCCACTTCTGTGCTGGGACTTCAACATGAGAAACATGAGAAACTTGTGCCGGAAGAAGTTTTTGAAACAGAGGGTTTGTTTATAGAAGATCAAAGTTTCGAAGATACTTTCTCTTTTGTAGATTTATATTTACCCTCCATTGATTTCAATTCTGGAATAGATTTCATGGTTGACACTAATGTAAAACCGTCTGATGACGATCGGTGTGATATTTCCCCTCTTGACAATGAGAATTTTCAATCATTCAACTGGGATATAGATAGTTACTTCAATGATCTTTCTTCTCCTAAGACATCTGGATGA