Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22964 LG5 60851183 60852965 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 60851187 missense_variant p.Asp2Val
C/T 60851229 missense_variant p.Ala16Val
T/C 60851277 upstream_gene_variant
T/A 60851278 upstream_gene_variant
G/A 60851344 missense_variant p.Arg20His
T/A 60851484 upstream_gene_variant
T/A 60851567 upstream_gene_variant
A/C 60851637 upstream_gene_variant
A/G 60851656 upstream_gene_variant
G/A 60851657 upstream_gene_variant
G/A 60851685 upstream_gene_variant
A/G 60851786 upstream_gene_variant
C/A 60851790 upstream_gene_variant
A/G 60851894 upstream_gene_variant
T/C 60851919 upstream_gene_variant
A/G 60852090 missense_variant p.Tyr92Cys
G/A 60852093 missense_variant p.Gly93Asp
A/G 60852131 splice_region_variant&intron_variant
G/T 60852305 stop_gained p.Gly132*
G/T 60852357 splice_region_variant&intron_variant
T/C 60852803 missense_variant p.Leu230Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22964.1
MDSKPVIFFLIINGSAQNTNVFVVIRDWENRKLGKKKSIRLKIVTSTSRGQWKEAAETQAVTMKTPCCERMGMKKGPWTAEEDHILVSHIQRYGHGNWRALPKQAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDIKRGKFSKEEEDTILKLHEILGNRWSAIATSLPGRTDNEIKNFWHTHLKKRIQKSGVHINGNASSHILQEAQANSSSSSGAVSSAYGNVMLDNYGLPSRKNPINPPTVGTGFYGAVSSDTFGETEDNHDSCQLSEEMEFWYNIFIKSGQTSRDNENLGHY*


CDS Sequence:
>Vu_22964.1
ATGGATTCAAAGCCCGTAATCTTCTTCTTGATCATCAATGGTAGTGCGCAGAACACTAACGTGTTTGTTGTTATACGTGACTGGGAAAATCGAAAATTGGGGAAAAAGAAAAGCATTAGATTGAAGATAGTAACTAGCACTTCACGGGGACAATGGAAAGAGGCGGCAGAAACACAAGCGGTGACTATGAAGACTCCTTGCTGTGAGAGAATGGGAATGAAGAAGGGACCTTGGACTGCAGAGGAAGATCATATATTGGTTTCTCATATTCAACGATATGGCCATGGTAACTGGCGTGCCCTTCCTAAACAAGCTGGATTGTTAAGGTGTGGCAAGAGTTGCAGGCTTCGTTGGATTAATTACCTAAGGCCAGATATTAAACGAGGGAAATTCAGCAAGGAAGAAGAAGATACCATCCTAAAGCTGCATGAAATTCTTGGAAATAGGTGGTCTGCTATAGCGACAAGCTTACCCGGAAGAACAGACAACGAAATAAAGAATTTTTGGCATACCCATTTGAAGAAGAGGATCCAAAAAAGTGGAGTGCATATAAATGGCAATGCTTCATCGCATATCTTGCAAGAGGCACAAGCAAATAGTTCATCAAGTTCAGGTGCAGTTTCTAGTGCCTATGGAAATGTAATGCTTGACAATTACGGTTTACCCTCAAGGAAGAATCCAATCAATCCACCTACTGTAGGTACTGGATTTTATGGTGCAGTCTCCTCAGATACTTTTGGAGAAACTGAGGACAATCATGATTCTTGTCAGCTAAGTGAAGAAATGGAGTTTTGGTACAATATATTCATCAAATCAGGGCAAACATCACGAGACAATGAAAATCTAGGACATTATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_22964::LG5:60849183-60851183(+)
AAGGCACATTGTTTATCCAATTTGCACACCTTGAAGAGTCTAAGCACTTATTTGGTGAAATAATAGTAATTTTATCGTATTATATGTAGTTATATGCTAATAGGATGTAATTAATTAATGTAATCTCTTATTTTATCCTATTAATAACAATGATTTCTTATTCTAATATGGGTGTTGAGTTAACAAAACATTTCATAGCATCTATATTGTTCAAGAGATTATTTTTATCCAATTCTAGAGTCTCTTGAAATCTCTCATTCATCGCTTTTATTGATAGATTAATTATACATTGGACAAGAAGAAAAAAGTATCTTTAATGATACACTTTTTTTACTAAGCTGAAGAAGATAAAGTAAAAAAGGAGAAATGTTGCATGCTTTTGAAAAAAACTGAGAAAATAATATTTTTCTCAAGTATATTTTTTTTTCATTTTTTAAATGATTTCTTTCAATCTTTACTAGTGTATAATAAAAAATAATTCCTCAATATAAAAAAGAAAACCACTTTAAGGCTTTGTTTACTTGAATAAATTTGGAGAGAGTGATCGAATGAATTTGAGATGATTTGAAGGTAAATTTGTTGTTGTTTATTTGAGTGGATTTTAAAAGTAAGTGAGAGTGGATTTAGAAAAAAAAGTTTGTGAGAATTAGTATAGGATTTGATTGATGTGACAGATTAAAAAAATTTATTTCGAAATTATTTACTTCAAAAATCCACTCAAATAAACAAAAAAAATTATCTTTAAATTCTCTCAAATCTATTTAATTACTCTTCTCCAAATTAATTCAAGTGAACAAAATGTAAAAGATAAAAAAAAAAAGTCACGTAGAAACATTATATGTATGGAGAAAAGGAACATTGACTAATTTTCAATTTTTGAAAATGATGAACATAATAATAGCCCAATTTTGCCCTTCTATGTTAAAAGTAATTGAAGTTAAAACTATTTGAATTTATCGAGTGTTAGTAACTTTCTTATATATACTTGATTTATAAATTAAATAAACATGTTTTAACTTTATATTTTAACCAATATTTAATAAAATGCAGCGAGAAAAAGCTAAGCACATTCTTTAAATATCCGTTAAGAATAGAAATAGAAAAATTACATAAATCATTTACACATTTCATGTAATTTTTAATATATATATATTTTTTCTAATAGCCAACAAGTTATTATACCAAATACTTGTAACTAGTATTAATGGATTGCATTAAGCGAAAATAAATAATTAACTAATTTCTTACATTACGAGGAATCAAGTAATACTTATATTTAACTGAGATGCAAACTCTTTCTTTGAGTTTGTTGGCTTTATTTTTAAATTATTTTTCTCGATTACATATTTAAATGTAAAATATTTTGTCAAACATTATCAATAAATCAAATTTCACTGTATTAAAAATATTTCAAATTAAATGTAAAACAAAGAGACAACATGTGATGTGATTGTTTGAGTTTTGCGATAATGGCCCAAGTTCAATGTTTTGGAAATTGAGATATGCATAAATGTTTTAGTACATTAATTAATAATATAAGAAAAGAAGAGCTTCTTTTTCCTAACACAAAGTCAACCTTTATCATCATGATTTGACCTACGCTAAAGCTAATTAGCCCAAAGAGATACGGAGATAGATTATTTTGGCAAATCTTGCATTACTAATATTATTATATATCTTATGACAATAATAATGATAATTATTATTAATATAATTTTTTTTTTCACTTTCATTTAATTACTTTGAGATGGCATGCCGACACACACTTCTTAAAGGTGACCGAAACATTTTCGTTTATGGATATTTTTTTTAATTTAATTAATCTAAAGATATCATCACAAAGACAATTTTATTATTGAAATATTAAAAATAAGTAGTATATATAGATATATTTTTTTATTGAGAAATAAGAACGATATTTAAAATATTATAATTTTTAATAATTTTCAAGAAATCGTTATTTTTTTTGCTCGCGAAGAAGAGGGGAAAGAGCATTTGCA


Gene Sequence:
>Vu_22964(+)
ATGGATTCAAAGCCCGTAATCTTCTTCTTGATCATCAATGGTAGTGCGCAGAACAGTGAGTTCAACGTTTTATGTGTGTAATAATTAAGAATATTTGGAAGATTTGAATAATTTGATAAATTTTGAGCACTGTTTTTTCATGTATATATTCTGTAGCTAACGTGTTTGTTGTTATACGTGACTGGGAAAATCGAAAATTGGGGAAAAAGAAAAGCATTAGATTGAAGATAGTAACTAGCACTTCACGGGGACAATGGAAAGAGGCGGCAGAAACAGTAAGAAAACATGATCAAGAAGTGCATGATGTTCCTGCCGCGCGCATACTACTTTTGACCTATCTGCCCAAAACAATCATTACTTTTAGCCTTTACCAGATGCCCTAAGTTTACAAGAGAAGCAACCTGGAAACTCCTTTGGAGTTGGATTCTACAAACCAATGCTACTTTCTCACACAATGCATATAAAATTATGGGAGCAGTTTCTCTAGTGCTACATCTCTCTAGACATCATTACAAATCTGATTATGTGTATTTTTTTAATTTCATTTCAACAGTTTCTGTGTGCGTGCGTGCTTTAGTTTGGAATTTTATCACACAAAAGGGGATGTCATCGATCATGTGATCACTATCATGCACTTTTGTTTTGAAAGCCATGCTGTTTATTTGGACCACATGTTCATTTTCTCTGGTATAGTAATCATAAAGGAACCGAAGCTACCTTGAAAGAGCTTAAGCGGTCACCAAAGTTATTACTACTCCATAGTACAGAGGAAAAGGACACACATTATTGTGTTGTGCTGTGAAGCAAGCGGTGACTATGAAGACTCCTTGCTGTGAGAGAATGGGAATGAAGAAGGGACCTTGGACTGCAGAGGAAGATCATATATTGGTTTCTCATATTCAACGATATGGCCATGGTAACTGGCGTGCCCTTCCTAAACAAGCTGGTAAGTTCTTCTTCTAGTTAGCAACATTTTCTCTGTAAACCGGTAAAGGTTAAACAAACATATGTATGATTATATGATATGGTTGTTTAATCAGGATTGTTAAGGTGTGGCAAGAGTTGCAGGCTTCGTTGGATTAATTACCTAAGGCCAGATATTAAACGAGGGAAATTCAGCAAGGAAGAAGAAGATACCATCCTAAAGCTGCATGAAATTCTTGGAAATAGGTGGGCATCTAATAACATGTATTCATTCTAATGTCTTCTGCTGGTTCTTTCTATTGTCTTCCCTACGTGCATGAAACACCATGAATATGATTTCCTAGTATTATTATGATTTAATGTAAGAGATGTAATTAACACGTATAGGCTGAATTTGGTTAAGTAAGAAAATGTGAAAATTTGATGGTGATCACCCTTGATGCTTAGGTGGTCTGCTATAGCGACAAGCTTACCCGGAAGAACAGACAACGAAATAAAGAATTTTTGGCATACCCATTTGAAGAAGAGGATCCAAAAAAGTGGAGTGCATATAAATGGCAATGCTTCATCGCATATCTTGCAAGAGGCACAAGCAAATAGTTCATCAAGTTCAGGTGCAGTTTCTAGTGCCTATGGAAATGTAATGCTTGACAATTACGGTTTACCCTCAAGGAAGAATCCAATCAATCCACCTACTGTAGGTACTGGATTTTATGGTGCAGTCTCCTCAGATACTTTTGGAGAAACTGAGGACAATCATGATTCTTGTCAGCTAAGTGAAGAAATGGAGTTTTGGTACAATATATTCATCAAATCAGGGCAAACATCACGAGACAATGAAAATCTAGGACATTATTAG