Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22886 LG5 60091628 60095965 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 60091666 3_prime_UTR_variant
C/A 60091749 3_prime_UTR_variant
T/A 60091949 3_prime_UTR_variant
T/A 60092266 stop_gained p.Lys484*
T/A 60092297 missense_variant p.Arg473Ser
C/A 60092298 missense_variant p.Arg473Ile
G/T 60092403 upstream_gene_variant
G/A 60092418 upstream_gene_variant
G/T 60092446 upstream_gene_variant
C/T 60092700 synonymous_variant p.Lys446Lys
A/C 60092828 3_prime_UTR_variant
C/T 60092831 3_prime_UTR_variant
T/C 60093137 missense_variant p.Asp427Gly
A/T 60093349 upstream_gene_variant
C/T 60093543 synonymous_variant p.Ala382Ala
G/T 60093571 missense_variant p.Ala373Asp
A/T 60093575 missense_variant p.Ser372Thr
A/G 60093578 missense_variant p.Ser371Pro
A/C 60093790 upstream_gene_variant
G/A 60093793 upstream_gene_variant
G/T 60093824 upstream_gene_variant
T/C 60093971 intron_variant
T/C 60094006 intron_variant
C/G 60094036 intron_variant
G/A 60094451 intron_variant
C/T 60095104 intron_variant
C/G 60095640 intron_variant
T/A 60095832 5_prime_UTR_variant
A/G 60095833 5_prime_UTR_variant
A/T 60095854 5_prime_UTR_variant
T/A 60095861 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22886.1
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>Vu_22886.2
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CDS Sequence:
>Vu_22886.1
ATGGGGTGTGTGATTAGCAGGGAGGTGTCGAAGGGGATAATCTCTGAGGTGAAGGAGGAGAAGGGTTTGAGTGGTCAGAGTAAGAGGAAGGTTGATGGAGTGTCGGGGAGCAAGAGTGAGGTTGTGGTAGAGGTTCAGAATGGCGAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGTGGTGGTGAAGGGGTGCAACGGCCTCGAGGCGAAAGGAGGAGATCGAAGGCGAATCCGAGGCTGAGCAATCTGCCCAAACATTTGCGGGGGGAGCAGGTTGCTGCTGGATGGCCGCCGTGGCTCACTGCAGTGTGTGGGGAAGCACTCAGTGGCTGGATTCCGCGAAAGGCAGACACCTTTGAGAAAATTGATAAGATTGGACAAGGAACTTATAGTAATGTGTACAAAGCTAAAGACACAATGACTGGTAAAATTGTTGCCCTAAAGAAGGTTCGTTTTGACAATTTAGAACCTGAGAGTGTAAAATTCATGGCGAGAGAGATTCTTATTTTGCGAAGGTTGGACCATCCCAATGTTGTAAAGTTGCAAGGTTTAGTTACGTCAAGGATGTCCTGTAGTTTGTATTTGGTGTTCGATTACATGGATCATGATTTGGCTGGACTTGCTGCAAGCCCAGGAATCAGATTCACAGAGCCTCAGGTAAAATGTTACATGCATCAGCTGCTATCAGGACTTGAGCACTGTCATAGCCGTCATGTACTTCACCGTGATATTAAAGGGTCAAATCTTCTTATTGACAATGAAGGAACACTTAAGATTGCCGACTTTGGATTGGCTTCTATTTTTGATCCAAACCATAAGCATCCAATGACTAGTCGTGTAGTAACCCTTTGGTATCGACCTCCTGAGCTGCTCCTTGGTGCCACAGATTATAGTGTGGGTGTAGACCTCTGGAGTGCTGGATGTATTTTAGGAGAATTATTGGCTGGGAAACCAATCATGCCTGGTCGTACAGAGGTGGAACAACTGCACAAGATATACAAACTATGTGGTTCACCTTCAGATGAGTTTTGGAAGAAGTCAAAGTTGCCTAATGCTACCTTGTTTAAACCGCGAGAGCCATACAAGAGGCGCATAAGAGAGATTTTTAAAGATTTTCCATCTTCTGCTCTACCCCTCATTGATACACTTCTCGCGATTGATCCTGTAGAACGGGAAACTGCCTCAGATGCTTTGAGAAGTGAGTTCTTTACCACAGAACCTTATGCTTGTGATCCTTCTAGTCTTCCAAAATATCCCCCAAGCAAGGAAATGGATGCTAAACGAAGGGATGATGAAATGAGGAGACTAAGAGCTGCTGGCAAAGCTCAGGCTGATGGCCCCAAGAAGCATCGTACTCGTGATCGTGGAACAAAAGCTTTTCCTGCTCCTGAAGCCAATGCTGAGCTTCAATCGAATATTGATAGAAGAAGGCTAATCACTCATGCAAATGCCAAGAGCAAGAGTGAAAAGTTCCCTCCACCACATCAAGATGGACAACTTGGTTTTCCTTTGGGTTCTTCCCATCATATTGATCCGGATACTGTTCCAACTGATGTCTCTTTCACATCAACCTCTTATACCTATTCAAAGGAACCATTCCAAGCTTGGTCTGGTCCCATTGGCAATGCTGCTGACATTGGAGTACCAAAGCGGAAGAAACACACTGCAGGTGATGCATTGGATTTATCAAAACCACAGAAAGATTCTCTCAAGGACAAGATTAAAGGAAAGAAAATCATAGCTTAG

>Vu_22886.2
ATGGGGTGTGTGATTAGCAGGGAGGTGTCGAAGGGGATAATCTCTGAGGTGAAGGAGGAGAAGGGTTTGAGTGGTCAGAGTAAGAGGAAGGTTGATGGAGTGTCGGGGAGCAAGAGTGAGGTTGTGGTAGAGGTTCAGAATGGCGAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGTGGTGGTGAAGGGGTGCAACGGCCTCGAGGCGAAAGGAGGAGATCGAAGGCGAATCCGAGGCTGAGCAATCTGCCCAAACATTTGCGGGGGGAGCAGGTTGCTGCTGGATGGCCGCCGTGGCTCACTGCAGTGTGTGGGGAAGCACTCAGTGGCTGGATTCCGCGAAAGGCAGACACCTTTGAGAAAATTGATAAGATTGGACAAGGAACTTATAGTAATGTGTACAAAGCTAAAGACACAATGACTGGTAAAATTGTTGCCCTAAAGAAGGTTCGTTTTGACAATTTAGAACCTGAGAGTGTAAAATTCATGGCGAGAGAGATTCTTATTTTGCGAAGGTTGGACCATCCCAATGTTGTAAAGTTGCAAGGTTTAGTTACGTCAAGGATGTCCTGTAGTTTGTATTTGGTGTTCGATTACATGGATCATGATTTGGCTGGACTTGCTGCAAGCCCAGGAATCAGATTCACAGAGCCTCAGGTAAAATGTTACATGCATCAGCTGCTATCAGGACTTGAGCACTGTCATAGCCGTCATGTACTTCACCGTGATATTAAAGGGTCAAATCTTCTTATTGACAATGAAGGAACACTTAAGATTGCCGACTTTGGATTGGCTTCTATTTTTGATCCAAACCATAAGCATCCAATGACTAGTCGTGTAGTAACCCTTTGGTATCGACCTCCTGAGCTGCTCCTTGGTGCCACAGATTATAGTGTGGGTGTAGACCTCTGGAGTGCTGGATGTATTTTAGGAGAATTATTGGCTGGGAAACCAATCATGCCTGGTCGTACAGAGGTGGAACAACTGCACAAGATATACAAACTATGTGGTTCACCTTCAGATGAGTTTTGGAAGAAGTCAAAGTTGCCTAATGCTACCTTGTTTAAACCGCGAGAGCCATACAAGAGGCGCATAAGAGAGATTTTTAAAGATTTTCCATCTTCTGCTCTACCCCTCATTGATACACTTCTCGCGATTGATCCTGTAGAACGGGAAACTGCCTCAGATGCTTTGAGAAGTGAGTTCTTTACCACAGAACCTTATGCTTGTGATCCTTCTAGTCTTCCAAAATATCCCCCAAGCAAGGAAATGGATGCTAAACGAAGGGATGATGAAATGAGGAGGTATCTCTGCTATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_22886::LG5:60095965-60097965(-)
TATCTACATAAATTTAAAACAAAAATTGAGATAATTGTAATATTATTTTATTTGTAAATATTATTGTAGGTTAAGGATATATTAAGACTTGTTTTGTCCTTCATGTCACATTTGGTATTTTAACATTTTTTTTTTCAATATTAAATATACTTCAATATTTCGATATACAAGTCAATATTTAGTTAAAATAAAGTTTAATAAATATAATAAATTTAAAAGTATTGAATATTTTATCTGTATATTATATGTATATTATATTTATAGATATTTTAATGATTTTTTTGATCTTAATGATAATATAATAATAATTTGATTACTTTTTAATCTTGTTTAACATAATTTTATATTTAATTGCAAATTTATCTTTATTTGCAATCTCGACCAGAAAACTTGGAGCCGATTTAAATGAAGTTTAAACACCGATCGATTTAATTATAGTTTCCTATATATATCATATGTAAAGGAAAAAAAACTATTAACTTTTATTCTTTTTTTCATAAGCAACCATACTTACAGAGAGAAATAATACATCTTAACATTCAATTTATACTTAATTAGGAATTGCTTATTTAACACAATACTAAATAATCCTCCGTTGCTATAAGACGAGGAAATTTAAAAGGTATAAATACAAAAACATAATAATACAAAATACACTTAAAATAGTTCATTTTAAAAAGTTACATTTTATTTTATTTTTAAATTAGAATTTATATTTATTTATTTTTATAGTTTATAAATGTCATCAACAATATTTTCTCCATAGGTTATATTATAATAATTTAAAATACGCGTTTTGTCATATAAAAGACTCATTACTTCACGTGTTATATATTGAGAAAAGTGTATTACATTACTTATATAAAATACAACAACGTATATTAATTTAAAGACAAAAACAGTATTTTACAAAATAACTAGAGAAACAAACGTATTAGAGATCATATAAATCGAATTTATAATATATAAATAAATAAAAACTTTATTTTATTAAAGTTTTATGTTAGTTAAAAATTAAACAATTTTATAAGCGATTTTTGTATAAAGTTAAGTTAGATATAGAATCGTAGAAAATATTTATTTGTATTTTATGTCATACAGGTAAAAGAAAAGTCAGAGGAATATATAATCTCTAACTATAACTATTTTTAACGATAACTTCTAATAAAGTTTATTAGTAAACCTTATTTGTTAAGTATATTAAACTTTGATTATGGTTTTGTCGATTATAAAATTTATTTCGAGATAAGACAAAGAAAGTAGGTAATTTTTTTATTACCAATTTAAGATTTTATTTTACATCCAATCGATTAGATTAGTAACTTTAGCGTCAAAATATTTTAACAGATATAAAACTATTTAACCTTAAAAAATAGTATAATTTTGTTTATTTTGAAAAAGAAGAAAAATGTTAAAACAAGATTTAAAACAAGAAATGAATTATTTCTTAAAACAATAAGATAATGATATTTTAGTAAAATTATTTTGATAATATTTTAACATCATTTACATTATATTCTATGATTGGTCCATGTTAGTGTTTATGATTATTATTATTGATTATGGAGTAATTTTGGACCAATAACAGAATGACACGATGTTAAAATATTGTCAAAAAAATGTTATGAAAGTATCATTATTCAAACAATAATGATCACATGGATTAGATGCAGCAACATATGGCAGACATGCACTCATTGGGATGTGTTAGCACTCCCATTCATTCATTAAACTCTGCAACCCAAGTTTTATTTTTCTTAAACAAGACACCAAATTCCTTCTCCTAACGCAATAAATAAAGTTACTAAATGTTTATTAATAAAGATTATCAATTACGGATTAATGGCCGTGCCTTAGGAGTTACGAAACATCCCACTAAATACCCGTTAATTTAGGACACACACATCACTTACGTACAATAATACGGTCTATGTATGTATGTTGTATGTATCTATACAAACATCTACGACTACAAAAACGGCTTCGTTTCTGTTCTGTTT


Gene Sequence:
>Vu_22886(-)
GGGATTTGACTTGTGAGAATCAGAATGAGAAGAAGATCTCACTCTTTTCTTCTTGTCCCAGACCAAAAGTCCAAACACTGCGCTACACTTCCGAACAACACTCAATTTCACTTCTCTTTTTATTTATTACCCTAACTCAGAGGCCATTCATAGATTTTCATTTCGCTGTCCTTTTTCGCCCAGATCACTGAATCTTGCTGGAACTACTGACGTTTCTGGTTTCTCTATGTGCTCCAAGATTGTCGAAATCAGGTTTGATTTTGGTTTCGATTTTAATTGCTGATTAAAATCGTGTTCTCTCGTGCAGTGAAGCTTAGGTGCATTTGTCTTTTTTTTTTTTTAGATTGGATTAATTGGCGTGTTGATGATTGATTGTTTAGGTAATTGGGAATGCCGATGGATGGAGCTTAGATTTGAGGAATGGGGTGTGTGATTAGCAGGGAGGTGTCGAAGGGGATAATCTCTGAGGTGAAGGAGGAGAAGGGTTTGAGTGGTCAGAGTAAGAGGAAGGTTGATGGAGTGTCGGGGAGCAAGAGTGAGGTTGTGGTAGAGGTTCAGAATGGCGAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGTGGTGGTGAAGGGGTGCAACGGCCTCGAGGCGAAAGGAGGAGATCGAAGGCGAATCCGAGGCTGAGCAATCTGCCCAAACATTTGCGGGGGGAGCAGGTTGCTGCTGGATGGCCGCCGTGGCTCACTGCAGTGTGTGGGGAAGCACTCAGTGGCTGGATTCCGCGAAAGGCAGACACCTTTGAGAAAATTGATAAGGTGTGTCTCAGGGTGTGTTTGTGTATAATTTGTGTGTACATATGCATTGCATTGTGATTAAGAAACGGAAAAGCATTTGTAATCATCAGTCATGCCTAATCTGGATGTGCTAATGTGGTTTGTTTGAAACTCATTGCTACAGATTATCCCATGTCCCCGGTGTTGTCAAAAGTGAAACTTATGGTTGACTGTTAATCTGTTTGTAATTTGCTGGTGGTAGAATTAACTGGAATTGAATTTGTGCATTGTTTGAGTGGATGGGATAAACTTGTGTAGTTTGGGTTCTTATATTTTCTTCTGACTATGATTATTTCTTCTCTTTGTTTCCTCTTTTTTCTTTCGTTTTAGATTGGACAAGGAACTTATAGTAATGTGTACAAAGCTAAAGACACAATGACTGGTAAAATTGTTGCCCTAAAGAAGGTTCGTTTTGACAATTTAGAACCTGAGAGTGTAAAATTCATGGCGAGAGAGATTCTTATTTTGCGAAGGTTGGACCATCCCAATGTTGTAAAGTTGCAAGGTTTAGTTACGTCAAGGATGTCCTGTAGTTTGTATTTGGTGTTCGATTACATGGATCATGATTTGGCTGGACTTGCTGCAAGCCCAGGAATCAGATTCACAGAGCCTCAGGTTAGACCAGGTTTGCCTTAAAAATTTAAGAATTACTTATCTCATTTCGTAATTGGTACATTTTCTTTTCAAAGGCTAGGATCTGATGTCCCCAAATACGGTACCCTCCTTGCAGGTAAAATGTTACATGCATCAGCTGCTATCAGGACTTGAGCACTGTCATAGCCGTCATGTACTTCACCGTGATATTAAAGGGTCAAATCTTCTTATTGACAATGAAGGAACACTTAAGATTGCCGACTTTGGATTGGCTTCTATTTTTGATCCAAACCATAAGCATCCAATGACTAGTCGTGTAGTAACCCTTTGGTATCGACCTCCTGAGCTGCTCCTTGGTGCCACAGATTATAGTGTGGGTGTAGACCTCTGGAGTGCTGGATGTATTTTAGGAGAATTATTGGCTGGGAAACCAATCATGCCTGGTCGTACAGAGGTAACAACTCACCTACAGGCTATATCATCTTGTTGGCTTTTCATCATTTCCCTCTTATTAGGTAATTCTATGAATGTGTCGTATAATATGTATACATTTGTGAGGACAGAAACTAGAGAGGTGCTGGGAAGATTATAAGGATATTAACAGTAATTTAGCTTCAGTCATGCAACATAGATCACTACCTACCAAATTGCGTTGTGTACAATATGTAAATAATTTTCATATCCTGTTTATAGAAAGATGCTTTCTTTTAATTGGCATACTATTAGTAGATCTTATGTTTTGATTTCTCTTGCATATTTTGTCAAGAAGATATATAGCCATTGTTGCATTTAATTTCATGGTTATAAAAAATCGCAATTGGATTTTTTCTAACACTTTTCTTGTACAGGTGGAACAACTGCACAAGATATACAAACTATGTGGTTCACCTTCAGATGAGTTTTGGAAGAAGTCAAAGTTGCCTAATGCTACCTTGTTTAAACCGCGAGAGCCATACAAGAGGCGCATAAGAGAGATTTTTAAAGATTTTCCATCTTCTGCTCTACCCCTCATTGATACACTTCTCGCGATTGATCCTGTAGAACGGGAAACTGCCTCAGATGCTTTGAGAAGTGAGGTGAGGTTTCTCAAAATTCCAGATCTTCTTGTTAAAATGCTGGTTTGTTTCTTTCAAATTTTGCACTGCCGTGTTTTTTATTTATAATTTTTTAAATTTTCACAATAAAGTGGGCCGTTGATCTTAAATTAATGTAATATACTTATATCTGTGTAAAAGTTGATAGAATGACCTTCATTCTAATTTATGTGTTTTTCCTGCTGTGTTTTTATTATCTTTTTAAATCAAACCCATGTACATTTACCTTGCCTGTCTGCTCCTGCATTTTGCAGTTCTTTACCACAGAACCTTATGCTTGTGATCCTTCTAGTCTTCCAAAATATCCCCCAAGCAAGGAAATGGATGCTAAACGAAGGGATGATGAAATGAGGAGGTATCTCTGCTATTAAGTTTCTTTTCTGCAAAACCAAAGTATATGTACACACACAAATATATGGTGAGAGAAATTGGAAGGAAAATAAGGCATGTGATGAGTAAATGCAATGTGTTGTTGGCCCTGATGCTGCTTAACAATTAGATTTTGTATTCTTTAGATTATTCATTGGCATTTGTAACCTTATACCATCTAACAAACACACCCTTTCAACAAGCACATACACAAAATATAAACCCCAGACTACGCTTACTGATATTTATAGTGGTTATCAGAGCGAAAATTTTCTTGTCTTTGTAGTTAATCTTTGCTAGTTATAATATAGCCATCCTACTGTGTTTAGTTATCTCTAAGATACTTCATCTATATGAATGTACAGACTAAGAGCTGCTGGCAAAGCTCAGGCTGATGGCCCCAAGAAGCATCGTACTCGTGATCGTGGAACAAAAGCTTTTCCTGCTCCTGAAGCCAATGCTGAGCTTCAATCGAATATTGATGTAAGTTTAATAATCACTAGTATACTAGAGATGCTTTGGTTCAGTTTATAAAACCACTGAATATTATATGCTTTGAGATTATTATCTTTTGCAAGAATGCTTAGCACAATGAAATGATTGAGAGTAAGTACTAAGGACAATTAGGATTTGGCAACAGAACTTTTTTGTCTCAGACTGGCTCAAATATCTGCCGAGTGCCAACAGTACCATTTTCAACTTTCCTTCTAATATCTGTCCTACTTTACAATAGAAAAAAATATATATATGAATGATTATGCATCCTGAGTTAAAAATATAGTTGATTAAACTTGTTGTGTAACAGAGAAGAAGGCTAATCACTCATGCAAATGCCAAGAGCAAGAGTGAAAAGTTCCCTCCACCACATCAAGATGGACAACTTGGTTTTCCTTTGGGTTCTTCCCATCATATTGATCCGGATACTGTTCCAACTGATGTCTCTTTCACATCAACCTCTTATACCTATTCAAAGGAACCATTCCAAGCTTGGTCTGGTCCCATTGGCAATGCTGCTGACATTGGAGTACCAAAGCGGAAGAAACACACTGCAGGTGATGCATTGGATTTATCAAAACCACAGAAAGATTCTCTCAAGGACAAGATTAAAGGAAAGAAAATCATAGCTTAGATATTAATACATTCTTATAGAGTCAATTAAGAATCTCCCTCTGCTACCTCATTTTTGGATGCATACAACTGCTGCGCAATGCGTTTTTTAAAAATGTCGTGCTGCTTCCTCATTCCTCGGTAAAAGTATAATAGCTCTCAGTTCTCAGCAAGGGTACAAATTACTTACACCCATCTTTACACCTTCATTTTCCCCATTTTTTATTTCTTGGTTTTTATTTCAATGAAATGAAAATTTTCTTTTCTGTTCAATCTGTTAGTATGATGAGAGAATTACTACTTTGTACATCGTGATTTATTTTTTAAAAGGAGTACCGTGTTAATATCTGAAATGTGTTTGTTTTAGAATTAC