Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22869 LG5 59889467 59892646 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   nucleus, plasma membrane, cytoplasm, nucleus
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, GTPase binding, protein serine/threonine kinase activity, GTPase binding, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 59889474 missense_variant p.Pro3Gln
A/G 59889475 synonymous_variant p.Pro3Pro
A/G 59889476 missense_variant p.Ile4Val
T/G 59889481 synonymous_variant p.Gly5Gly
C/T 59889489 missense_variant p.Ser8Phe
A/G 59889567 missense_variant p.Tyr34Cys
C/A 59889596 missense_variant p.Leu44Ile
C/T 59889692 synonymous_variant p.Leu76Leu
G/T 59889706 missense_variant p.Leu80Phe
C/T 59889781 synonymous_variant p.Thr105Thr
A/G 59889826 synonymous_variant p.Ser120Ser
C/T 59890109 intron_variant
T/A 59890188 intron_variant
G/T 59890402 intron_variant
G/T 59890403 intron_variant
T/C 59890408 intron_variant
C/T 59890409 intron_variant
T/A 59890439 intron_variant
C/T 59890463 intron_variant
T/C 59890502 intron_variant
T/G 59890578 intron_variant
T/A 59890596 intron_variant
A/G 59890600 intron_variant
G/A 59890884 synonymous_variant p.Ser246Ser
T/C 59890912 missense_variant p.Ser256Pro
T/A 59890932 intron_variant
A/C 59891068 intron_variant
G/A 59891089 intron_variant
T/A 59891126 intron_variant
C/A 59891463 intron_variant
C/T 59891506 intron_variant
G/A 59891532 intron_variant
A/G 59891587 intron_variant
C/G 59891588 intron_variant
A/T 59891835 intron_variant
G/A 59891965 intron_variant
T/A 59892068 stop_gained p.Leu349*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22869.1
MVPIGHASDDKQKKRGIVFSNPASAQCFVILIYYVSFSHCLVSLPPTFPCDENVDFYFSLADSGEIVLEEKSVVTLRELLEECISDTEKSHQPPELAGGNPSSTTEFHRRKLLRPCRMRSIERLPSFPPSCLSKLTKPKSKGIGKNTIRCNPHSSRTLVNFSLSDLRNATNNFSNENIIGRGGYAYVYKGSLQDGQLIAVKQLSRGTPEDRISVLLSELGILSHVEHPNTAMLIGFGVEGGMYLVFRLSPMGNLGSLLHGPNKNTLDWSKRYKIILGIADGLLYLHEICQRRIIHRDLKSDNILLTENFEPQICDFGLSKWLPEPCSHHIVPKFEGTVGYFAPEYVMHGIVNEKTDIYSFGVLLLEIITGRRALDHLKESIMLWAKPLLEANNIKDLVDPSLGDDYDWEQMERVVLTASLCVEQFPILRPRMSQIAILLRGDDYVMEHTERSNKMYKNTTQGAI*


CDS Sequence:
>Vu_22869.1
ATGGTCCCAATTGGTCATGCTTCCGATGACAAGCAGAAAAAACGAGGCATAGTGTTTTCTAACCCTGCTTCTGCCCAATGCTTTGTGATTTTAATATACTATGTTTCCTTTTCACATTGTTTAGTTTCTCTTCCACCAACTTTTCCCTGTGATGAAAATGTTGATTTTTATTTTTCTCTTGCAGACTCAGGAGAAATCGTTTTGGAGGAGAAAAGTGTGGTAACTCTAAGAGAACTCTTGGAAGAATGCATTAGTGACACTGAGAAATCTCATCAACCACCTGAATTAGCTGGTGGTAATCCAAGCTCAACGACCGAGTTTCACCGGAGGAAGTTACTCAGACCATGCAGAATGAGATCAATTGAGCGCCTACCATCTTTTCCTCCAAGTTGTTTGTCAAAACTAACAAAGCCTAAAAGCAAAGGCATTGGGAAAAACACTATTCGATGTAATCCACACAGTTCCAGAACTTTGGTGAATTTCAGTCTTTCTGACCTGAGAAATGCAACCAACAATTTTAGCAATGAGAATATAATTGGAAGAGGTGGTTATGCTTATGTTTACAAGGGCAGCCTGCAAGATGGGCAACTAATAGCAGTTAAGCAACTGAGTAGAGGGACTCCAGAAGACAGGATATCAGTTCTTCTATCTGAGCTAGGAATTCTTTCTCATGTTGAACACCCCAATACTGCCATGCTTATTGGGTTTGGAGTTGAAGGGGGAATGTACCTTGTTTTTCGATTATCTCCTATGGGAAATTTAGGATCTCTTCTTCATGGTCCTAATAAAAATACCTTGGATTGGAGCAAAAGGTATAAAATTATTTTGGGGATAGCAGATGGCCTCCTCTATCTTCATGAGATTTGTCAAAGGCGAATCATTCATAGAGATCTTAAATCAGATAACATTCTGCTCACTGAGAATTTTGAGCCGCAGATTTGTGATTTTGGGCTCTCAAAATGGCTACCAGAACCCTGCAGTCATCATATTGTACCAAAATTTGAAGGCACAGTTGGGTATTTTGCTCCTGAGTATGTGATGCATGGCATTGTAAACGAAAAAACTGATATTTATTCCTTTGGGGTCTTACTTTTGGAGATTATAACTGGGCGTCGTGCTTTGGATCATCTGAAAGAAAGTATTATGCTATGGGCAAAGCCTTTATTGGAAGCTAATAATATTAAGGACCTTGTTGATCCTTCTCTGGGTGATGATTATGACTGGGAACAAATGGAACGTGTAGTTTTGACTGCATCACTGTGTGTTGAGCAGTTTCCTATCTTACGCCCCAGAATGAGTCAGATTGCAATACTGCTAAGAGGTGATGACTATGTCATGGAACATACTGAGAGGAGTAACAAGATGTACAAGAATACAACTCAAGGAGCTATTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_22869::LG5:59887467-59889467(+)
AAAATTTCAAGAGCTAAATTGTCATCTTTTGAAAATGTCTATAAGTTTCTCGGATAATACGGTGAATATTTACATTTAAATAACTACACGACAATATTTTAAAATATATAGGTCATTTTCTGAAAAGTTCTTCCAGGTTTTTCGGATAACAAAGTGAATATTCACATTTAAATAACTACACGACAAAGTTTTAAAATATATAAGTTACCTTTCAAAAAGTTTCTCTGAATTTTTCTAATAACTAAATGAATATTCACGTATAAATGACTACGCGACAAAATTTTAAAATATATAAATCAATTTTTGAAAAGTTTCTTCAAATTTTTTTATAATAAAGTTTTTTTTATAATAAAGTGAATATTCACATTTAAATAACTACACGACAACATTTTAAAATATATAGATTTTGTATTAATAGATACTGAGTTAAGTATTATAATTGACCAAATGTGATATGTTATATTTACGATTGAATTTTAAATTTTTTTTTTGTTTGTGAGTTTTCAAAATAATATTGATTTTAATATTTTAAAATATAATAAAAAAAATTGAGGTGTGATAATATTAATATACTTTGAAGATAAAAGAAAAGCATAAAAAATTTAACAGAAAAAAATCCAATTTTTTTCTTTGACCTAAGATTAAAGATATTTAATAAAAAATAATCATTATCTTATATCAATATCAAAAGTGTTTGGATTCATTTATCCGGTGGGAATGACTTCATATATTCCTTAATAGACCAAATAAACAAATATCTGGGACCGGATAGTTACGATAAAAATCTCCCAAAAGCGATAATTGAGATCATAGGTTAATGGATTGAGACAAAATTTTGAAAGATTTAGGTGTTACAACTTTGCACAAGTTTGCACCAAAAAAATAAAAATAATAAAGTAAGTTAAAAGGAGAAACTACTTTTACAGTGCTAAAATTATTATTACAGATCTACTCAAAGAACAGGACAAAATACCATTAATTAATTCGTAAATATATTTGTTTGACAGCAACCCCACAGTTTCTGAGAATCTTTTGAAGAAACGTTTTCATCAGAGTGGGGTTAAGCCTCCCAGCATAACTAGTAGCAGAGGCTTCACCGCATTGACACTGTTGTTGCATGAGAGAAACAAAAACATGCGAACTATGTAATGAACCACACTTGTTTCTCGATTTGTTTCTGGTTTCTATGTCACTTAAAATTTGTAATTGCACAACATTCTGTGGCTGATTATAGAGTAAAAGGATTTCTATAAAGACGGACTTTCTCTGGGCATCAACTACCATGTTCTCTGCTTCTGCCACCTTTAATCGCCAATGCCGGTGACCAGAGATACTGTTGTTTAACTTATGCCTGCGTTTTATCTTCTGGGTATGTCGTTTTTTCTTCTGCTCACGTGATTATTCTTTCTACTTTCCCAAATGAAGATATGTGAGTGTGGACAAGCCCACATCGGTCGATGAAATTTTCAGAATCCTGTAAATAACAAAGGATAATTCTTATTGGAATTGTGTTAGATTTCTTCCAAATTCTGAGAAGGTGACAGATCGTATATGATAATGGTCATTTTGTTTAAAATTCTAATGTGTGTAATTTTGGGACCTAGTTCATGTTCTTGGATAGTTCATCTTCCAAGGCTTTGTTTTTATTATTTTTGCTATTATTTATTAATTATTAAAGCCAGTGTCTGATGTTTTAATGGTTCCTTGTCAAATAATTAACAATGACTGAATTTCTGTTGCTACATGTTCAGGTTGGAATTCAGTCAAAACACAACATTTATGATTATTAATAATAGTTTTTATTATTATCACTGTTAGTATTATTATTGTATTAACTTTTGTGCTTTTTTTACCTTGTTTGTAACTGTTGTTTCTTTCATGATCTGCTTCTTTGATTCATGTCACACTAAAAGGAAAAAACTGTGAGGTTTTGCTAATGTCTGTGATTACTTATGTAGTGCAGGAATAGTAAAGAAAAAGTTCTGCAAACAGATTAAAGA


Gene Sequence:
>Vu_22869(+)
ATGGTCCCAATTGGTCATGCTTCCGATGACAAGCAGAAAAAACGAGGCATAGTGTTTTCTAACCCTGCTTCTGCCCAATGCTTTGTGATTTTAATATACTATGTTTCCTTTTCACATTGTTTAGTTTCTCTTCCACCAACTTTTCCCTGTGATGAAAATGTTGATTTTTATTTTTCTCTTGCAGACTCAGGAGAAATCGTTTTGGAGGAGAAAAGTGTGGTAACTCTAAGAGAACTCTTGGAAGAATGCATTAGTGACACTGAGAAATCTCATCAACCACCTGAATTAGCTGGTGGTAATCCAAGCTCAACGACCGAGTTTCACCGGAGGAAGTTACTCAGACCATGCAGAATGAGATCAATTGAGCGCCTACCATCTTTTCCTCCAAGTTGTTTGTCAAAACTAACAAAGCCTAAAAGCAAAGGCATTGGGAAAAACACTATTCGATGTAATCCACACAGTTCCAGAACTTTGGTGAATTTCAGTCTTTCTGACCTGAGAAATGCAACCAACAATTTTAGCAATGGTTTGTAGTTTAACCTTGTTTTCACACCAATTGTTTTTCTAGTAATAATGTAGTTACATTAGGACGAGGTAACAGGACATACCAAACCAGATAGAATTACATTTCGAAAATTACAGCTTGTGTTTGGTTTAATGTCTCATAGATCTGCAAGTAAATTCATGTCAAAATTATGACTATAATGCAGAAACAAGTGTTTTATGCTTCCAAATTGACGTGAGTCTATTATAATGTTGCTTGAATGGATACACTAGACAAGATAAGATTAGAAAATAAACAAAAAAGTTAGGATAACACCTACTGCAGAAAGATGATAGAACTCCTTTTAAGTGGTTTAGGAATGTACAAAGAAGACTTGTAGAAGCCCCCTCACACTGGGTAACCCAATTGCTGGAGGCAGAGAAAAACTAAAGGCAAATCCATTAGGAAATATTTTCAAGTAAATAAGTTGTTTACCTATACATGGTTTGTGTCAGAGGATTGTGTATATTTGGATTAAAGTTTGCTAACATTAGTCTGTATAAAAAGTATGTTGTGAACATAAGTTTGATAAAAATGAGTTTACTGTAACATAAGTTTCATAAATATTTGCTGTGTAGTTGCTATTAGGAACTATGTTATTGCTTGATGAAAACTGCATCAATTTGACCATGTAGTTTTTTTTCTTCCTTTTACTTGTAGAGAATATAATTGGAAGAGGTGGTTATGCTTATGTTTACAAGGGCAGCCTGCAAGATGGGCAACTAATAGCAGTTAAGCAACTGAGTAGAGGGACTCCAGAAGACAGGATATCAGTTCTTCTATCTGAGCTAGGAATTCTTTCTCATGTTGAACACCCCAATACTGCCATGCTTATTGGGTTTGGAGTTGAAGGGGGAATGTACCTTGTTTTTCGATTATCTCCTATGGGAAATTTAGGATCTCTTCTTCATGGTGTGTACTTGATTCTAATAATTCTACTGTTTTCCCGTGTGAAAGCTTTCTTCTTTTTTTACCATATTACAAGTGTAAAGTATTTGTCAATGAGATATATCTGTTGGAGAATATGATGAACCATCTTTAATGAAATCTCTCTATAAAAACACTTTTTTTCATTCAGGAGAGTCAAATTCAAGATCCTGCTTCAAAAAGTTTTCTGTTTGAATGTATTTACTCATTACTTTTTACTTTTCATGAAATATTCAGGTCCTAATAAAAATACCTTGGATTGGAGCAAAAGGTATAAAATTATTTTGGGGATAGCAGATGGCCTCCTCTATCTTCATGAGATTTGTCAAAGGCGAATCATTCATAGAGATCTTAAATCAGATAACATTCTGCTCACTGAGAATTTTGAGCCGCAGGTATTTATCAGTGATTATAGAGAATTAATAAAAGAAGGCATTATTAACCTTTGCTGGTGAAACTTGGCACAGTCTTCTGCATTTCTTCTCATTTTCTGATACACGTGAGTAGTTATCACTAGGATCATTCCATGCTTAAAAGTAATATATGATGATACTTCCTGTGGTTAGCTCGAAATGTGTGCAACTAATGAATGACGCATTGGATGGCAATGCTTTGGTCTGTGGACAATCCTCTCACAGAGCAACATCAAACTATCTATATTTTGTGATCCTTAGCATCTACGTCCAGTTTAGAATTTTGAAAATAAAGCATATTCTCTGAAAATCTTCAACCTTTCCAAGAGATGATTATATGAATTGAGCCATGACAGTGTGTGCCAATTGTTCTCTTTCATGCCATGCTATTACATATTCTGCTGGTGAAATAATTAGAAGCAGACACCTTTGCTTCTGGATCCCCTACCAGTACTCTACTAATGTACAAGTTCGAGGCTTATATATCATCTGATCTATCACTAACTAATTGAGAATTTCTACAGATTTGTGATTTTGGGCTCTCAAAATGGCTACCAGAACCCTGCAGTCATCATATTGTACCAAAATTTGAAGGCACAGTTGGGTAAGCAAATGCATACATACATCAAACTTCTAAAACTATATTCATGACTTAACACTTCCCCCTCATCATTCCATTGACAGGTATTTTGCTCCTGAGTATGTGATGCATGGCATTGTAAACGAAAAAACTGATATTTATTCCTTTGGGGTCTTACTTTTGGAGATTATAACTGGGCGTCGTGCTTTGGATCATCTGAAAGAAAGTATTATGCTATGGGTAAGTCATTCTCCCAAGTTTGGCTATGTCATATATTATCTAAGTTTACAAGCTCAGAGGCCTCAGCACATTGTGATTTCTTGTGTTACAGGCAAAGCCTTTATTGGAAGCTAATAATATTAAGGACCTTGTTGATCCTTCTCTGGGTGATGATTATGACTGGGAACAAATGGAACGTGTAGTTTTGACTGCATCACTGTGTGTTGAGCAGTTTCCTATCTTACGCCCCAGAATGAGTCAGGTAAGTATGCAACATAGAAAGTTGCAGTATTGTAATATTAGTGATAATAAACTAAGATATTGTTGGTTACTGTAACTGTAACTATATATCAGTTAACTTTGGTTTAAGAGAAGATTGATCACGTTTTCTCTGTTTGGTGCAGATTGCAATACTGCTAAGAGGTGATGACTATGTCATGGAACATACTGAGAGGAGTAACAAGATGTACAAGAATACAACTCAAGGAGCTATTTAA