Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22786 LG5 58986405 58988441 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 58986779 downstream_gene_variant
A/G 58987075 downstream_gene_variant
A/T 58987079 downstream_gene_variant
T/A 58987192 missense_variant p.Glu417Val
C/T 58987314 synonymous_variant p.Ala376Ala
C/T 58987334 missense_variant p.Glu370Lys
C/T 58987345 missense_variant p.Gly366Asp
T/G 58987415 missense_variant p.Lys343Gln
G/T 58987418 missense_variant p.Leu342Met
C/T 58987429 missense_variant p.Ser338Asn
G/T 58987442 missense_variant p.Pro334Thr
G/T 58987504 missense_variant p.Ser313Tyr
C/T 58987538 missense_variant p.Ala302Thr
C/T 58987588 missense_variant p.Gly285Asp
T/A 58987595 missense_variant p.Arg283Trp
T/A 58988048 missense_variant p.Thr132Ser
C/T 58988054 missense_variant p.Ala130Thr
G/A 58988274 synonymous_variant p.Pro56Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22786.1
MPPPQTPFFIVFLCFLNACSSVFATQFDFGTLTMSTLKLLGDAHLNNNTVSLTGDPAVPNSAAGRALYSDPIRFRQQGSPSLASFSTFFSFSVTNLNPSSVGGGLAFVVSPDSTAVGDSGGFLGLQNPAAATGGGGGFVAVEFDTLMDVEFSDINGNHVGLDLNSVVSAQVSDLGSVGVDLKSGDSVNAWIEYDGSSKGLRVWVSYSTVRPKDPILKVDLDVGMYVNDFMYVGFSGSTQGSTEVHNVEWWSFNSSFDSAAAPATMSAPSATSAPEQKESKSSRNGTVGAVAGVVTAGAFVLALFAGAFIWVHSKKVKRMKKFDQSIESEIIRMPKEFSYKELKFATKGFSANRVIGHGAFGTVYKGVLPESGDTVAVKRCNHSGQGKSEFLSELSIIGSLRHRNLVHLQGWCHEKGEILLVYDLMPNGSLDKALYEARMPLSWPHRLKILLVQMLLGEAEVPIVPRAKPSTSYSTSHLLLSLQDSESDCNNAMITISTSSSENTLSDRHIL*


CDS Sequence:
>Vu_22786.1
ATGCCGCCACCTCAAACGCCCTTCTTCATCGTCTTTCTGTGTTTTCTCAATGCCTGTTCTTCTGTCTTCGCCACCCAGTTTGACTTTGGAACCTTAACCATGAGTACACTGAAACTTCTCGGCGATGCCCATTTGAACAACAACACCGTCAGCCTCACCGGTGACCCCGCCGTCCCAAACTCCGCTGCTGGCAGAGCGCTTTACTCTGACCCCATCAGATTCCGGCAACAAGGGTCCCCTTCTCTGGCGAGCTTCTCCACTTTCTTCTCCTTTTCTGTCACCAACCTCAATCCATCCTCCGTCGGCGGCGGCCTCGCCTTCGTCGTCTCGCCGGACTCCACCGCTGTCGGCGATTCCGGCGGCTTCCTCGGTCTGCAAAACCCCGCCGCCGCCACAGGCGGTGGCGGCGGGTTCGTCGCTGTTGAATTCGACACCCTGATGGACGTGGAATTCAGCGACATTAATGGAAACCATGTGGGGTTGGACTTAAACAGCGTTGTTTCGGCTCAAGTTAGCGACTTGGGAAGCGTCGGAGTGGATCTTAAAAGCGGTGACTCGGTGAACGCGTGGATCGAGTACGATGGAAGCAGCAAAGGGTTGCGCGTGTGGGTCTCGTACTCGACTGTGAGGCCGAAAGATCCGATTTTGAAGGTGGATCTCGATGTCGGTATGTATGTTAATGATTTCATGTATGTGGGGTTTTCTGGGTCTACCCAAGGTAGCACGGAGGTGCACAATGTTGAGTGGTGGAGTTTCAATTCCTCTTTCGATTCCGCGGCGGCTCCTGCCACCATGTCAGCACCCTCCGCCACTTCAGCACCTGAGCAGAAGGAAAGTAAGTCTTCTAGGAACGGTACTGTGGGGGCTGTTGCTGGGGTTGTGACTGCTGGTGCTTTTGTTCTTGCGCTCTTTGCTGGTGCATTCATTTGGGTGCATTCTAAGAAGGTGAAGCGAATGAAGAAATTTGATCAATCTATTGAGTCGGAGATTATTAGAATGCCAAAGGAGTTTAGCTACAAGGAGCTGAAATTTGCCACTAAGGGGTTCAGTGCTAATAGGGTCATTGGTCATGGTGCTTTTGGGACCGTGTACAAGGGTGTGCTGCCTGAGAGTGGTGACACTGTTGCGGTGAAGAGGTGTAATCATAGTGGTCAAGGTAAGAGTGAGTTTTTGTCCGAGTTGTCTATAATTGGGAGTCTCAGGCATCGTAATCTGGTTCACCTTCAAGGTTGGTGCCATGAGAAAGGTGAGATTTTGTTGGTGTATGACTTGATGCCCAATGGGAGTTTAGATAAGGCTTTGTATGAGGCTAGGATGCCTTTGTCATGGCCTCACAGGCTCAAAATTTTGTTAGTTCAGATGCTTCTTGGAGAGGCTGAAGTGCCTATTGTCCCTAGAGCCAAACCGTCTACTAGTTACAGCACTTCTCACCTCTTATTGAGCCTGCAAGATAGTGAATCTGACTGTAATAATGCTATGATCACCATCTCTACCTCCTCTTCAGAGAACACCCTCAGTGACAGACATATACTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_22786::LG5:58988441-58990441(-)
GAATATGGATCAATGAGTATGCTTTAAATTGTTATTTTATATGAACCTATGAATGATTTCATGAATTAATTGTGCTAGGAGATAACATGTTTTTATATCTAGCTCACCCTTGCATTGTTTGTGTTGTGTGCCAATTTGGATATGTTATTTGGCGATGATCATCCACTTGGATGGGAGCAGATGGCGGGGAGGATACCTTGGGAGCAGCTCTTGATGGAGACGGCAATGCTGCAACCTAGCTTCACTAATTCTTATTTCGTGAACTCGTTTAATTACATTTGTGTGTATTTTAAGTTTTAAATTTTCCGTGTTTTTCACGGGAGATTCCAATAATCGTATTGTCAATTTCCGCACTATTCTGAGGATGACTGTAATCCTTAAATACTCTTGACTGCTTTCCTATATTATGCATGATGACGTCTTTATTATATATGCATGATGTATATATTTGGGACGTTACATGATGTGCCTCACGTTAATGTTGACTCTTGATGACAAAAAAGAATTATGCTTACAGAGACTTAATTGAACTAAACCTCTTATTTTGATAAGAATGAATAATATTTAATTTTTAAATTGACTAAAACAATGAGAACAATTTGTGATATTTATTCCATCTCCTTTTCAAATTACCAAATTCAAACATGAAATCTTAGTTACCCTTTAATTTTTTTTCTTTGACTGTTGAGTTCTAAATGACAAACACATTATTTATATTTTTTCTATTTAATTTTTAAATATTCTTATTCGATGTATAAACTATATCACATACTTTAATAAAAAAATATCAGTTTCTAATTTTTAAATTAAAATTGTTTTTTATAAATTATTTAATTTGACTTAGGTCTATTTAAACCATTAATCTGACTCATAAGTTATTAATTTTTTAATCTAATTTAACTTGTTTTCTGCACTATTCGAACAGAAGATTTTTCATTAAAATTAGAAAGAACATAAGTACGATAGTAGCGAATCACGCTCATGTCATTGTCTTTTTTCATGGGCGATGACTGTGTCAATTTTTTATCCGAAGCCGTTATCTTTGTCCAATCGCTTAATTATTTAATGCCAGTTACTAATACGATTCTTACTCAAATTTTGTAGTAACTAGGATCATACTGCACTTATCTTAATAGTTCATTATTACAATAAACATGTAAAAATTTAAGTTAAAAAAAAATAGACCTCTTTATAAAAAAATATAAGATGTTGGAAGCGAAAAAAAGAAATAGCAAAACAGTATTCTCGATCTATTTTACTGGGAAAAGAAGAGCGGGACAGTGTTGTTGGTCAACTTTACTAAAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATGTATATAAGCATGTATATGTATACATGTATGGTATATACGTGTGTTGTTTCTAAGTAGGAATGTCAGAAAGTTTTACATTACCTATCACCAAAGAAGACTGATTCAGAATCTAACAACCACCTAATCGAGTAGAGGCATCACTATTTCCTGAGTCATGATGATATATTTACGCCAAAACTCAAACTACATTATGATATCACTCACCTAACTATGAAACTCTTTTACAACAACACGTAAACTATGCATTTGTCCCTGTTTTTCAACTGTTAGAGAAAAATAGAAAGCACTGTTGTACACATTTTTTAATTGTTATTGTGAGGGTGAAACACATAACCGTTATGAGTGCGAGAAAGTGCAGACCCACCTCTCACACACTGTCTGCTCCACACTCTCCTTTGAATTTTCTGCCATTATTATTCCTTTGTTTCCTTCTTCCGTTCAACACTTTCCCCCATACTTCTTTTCTGCATTTGGAACTCAATCAATTATACACAACGTAACAAAAACACACTCAGCACCATTACTCCCACCCCTTCAAGGTAATTAAACTCGTCAAGAACAAAGACAACATCCTTAATCATTCTAACAACATTACTTTCACTGTTTCCTCGGCATCACCGAATCAGACCACCCATCTTCGTTCCCCA


Gene Sequence:
>Vu_22786(-)
ATGCCGCCACCTCAAACGCCCTTCTTCATCGTCTTTCTGTGTTTTCTCAATGCCTGTTCTTCTGTCTTCGCCACCCAGTTTGACTTTGGAACCTTAACCATGAGTACACTGAAACTTCTCGGCGATGCCCATTTGAACAACAACACCGTCAGCCTCACCGGTGACCCCGCCGTCCCAAACTCCGCTGCTGGCAGAGCGCTTTACTCTGACCCCATCAGATTCCGGCAACAAGGGTCCCCTTCTCTGGCGAGCTTCTCCACTTTCTTCTCCTTTTCTGTCACCAACCTCAATCCATCCTCCGTCGGCGGCGGCCTCGCCTTCGTCGTCTCGCCGGACTCCACCGCTGTCGGCGATTCCGGCGGCTTCCTCGGTCTGCAAAACCCCGCCGCCGCCACAGGCGGTGGCGGCGGGTTCGTCGCTGTTGAATTCGACACCCTGATGGACGTGGAATTCAGCGACATTAATGGAAACCATGTGGGGTTGGACTTAAACAGCGTTGTTTCGGCTCAAGTTAGCGACTTGGGAAGCGTCGGAGTGGATCTTAAAAGCGGTGACTCGGTGAACGCGTGGATCGAGTACGATGGAAGCAGCAAAGGGTTGCGCGTGTGGGTCTCGTACTCGACTGTGAGGCCGAAAGATCCGATTTTGAAGGTGGATCTCGATGTCGGTATGTATGTTAATGATTTCATGTATGTGGGGTTTTCTGGGTCTACCCAAGGTAGCACGGAGGTGCACAATGTTGAGTGGTGGAGTTTCAATTCCTCTTTCGATTCCGCGGCGGCTCCTGCCACCATGTCAGCACCCTCCGCCACTTCAGCACCTGAGCAGAAGGAAAGTAAGTCTTCTAGGAACGGTACTGTGGGGGCTGTTGCTGGGGTTGTGACTGCTGGTGCTTTTGTTCTTGCGCTCTTTGCTGGTGCATTCATTTGGGTGCATTCTAAGAAGGTGAAGCGAATGAAGAAATTTGATCAATCTATTGAGTCGGAGATTATTAGAATGCCAAAGGAGTTTAGCTACAAGGAGCTGAAATTTGCCACTAAGGGGTTCAGTGCTAATAGGGTCATTGGTCATGGTGCTTTTGGGACCGTGTACAAGGGTGTGCTGCCTGAGAGTGGTGACACTGTTGCGGTGAAGAGGTGTAATCATAGTGGTCAAGGTAAGAGTGAGTTTTTGTCCGAGTTGTCTATAATTGGGAGTCTCAGGCATCGTAATCTGGTTCACCTTCAAGGTTGGTGCCATGAGAAAGGTGAGATTTTGTTGGTGTATGACTTGATGCCCAATGGGAGTTTAGATAAGGCTTTGTATGAGGCTAGGATGCCTTTGTCATGGCCTCACAGGCTCAAAATTTTGTTAGGTGTGTCATCTGTGTTGGCCTACTTGCATCACGAATGTGAAAACCAGGTAATTCATAGGGACATTAAGACTAGTAACATTATGTTAGATGAAGGGTTCAATGCTCGGTTAGGCGATTTTGGTTTAGCAAGACAAACACAACATGATAAGTCTCCTGATGCCACTGTGGCTGCCGGAACAATGGGGTATCTTGCCCCAGAGTATGTTCTTACTGGAAGAGCAACTGAGAAAACTGATGTGTTTAGCTATGGTGCGGTGGTTCTTGAGGTGGCCTGTGGGAGGAGGCCTATTGAGAAAGATGCCGCTGCAAATGGTAAAGTTGGGGTTAGCAGCAATTTGGTGGAACGGGTTTGGAGTTTGCATCAAGAAGGTAAGTTGCTAACGGCAGCTGATCCAAGACTTGAAGGTGAGTTTGAAGAAGGGGAAATGAGGAGGGTACTCTTAGTTGGGTTAGCTTGTTCACACCCAGATTCAATGGCAAGACCAACTATGAGGGGTGCAGTTCAGATGCTTCTTGGAGAGGCTGAAGTGCCTATTGTCCCTAGAGCCAAACCGTCTACTAGTTACAGCACTTCTCACCTCTTATTGAGCCTGCAAGATAGTGAATCTGACTGTAATAATGCTATGATCACCATCTCTACCTCCTCTTCAGAGAACACCCTCAGTGACAGACATATACTCTGA