Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22710 LG5 58191638 58196209 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 58191815 3_prime_UTR_variant
A/T 58192075 synonymous_variant p.Thr585Thr
G/T 58192116 missense_variant p.Leu572Ile
G/T 58192179 missense_variant p.Leu551Ile
G/C 58192509 upstream_gene_variant
C/A 58192888 missense_variant p.Gly375Cys
C/T 58192909 missense_variant p.Val368Ile
C/T 58192972 missense_variant p.Val347Ile
C/A 58193096 missense_variant p.Trp305Cys
T/A 58194397 upstream_gene_variant
T/A 58194401 upstream_gene_variant
G/T 58194799 upstream_gene_variant
G/A 58195050 upstream_gene_variant
C/T 58195076 upstream_gene_variant
C/T 58195121 upstream_gene_variant
T/C 58195333 upstream_gene_variant
C/A 58195340 upstream_gene_variant
G/T 58195351 upstream_gene_variant
G/T 58195356 upstream_gene_variant
A/T 58195450 upstream_gene_variant
T/C 58195523 upstream_gene_variant
T/C 58195563 upstream_gene_variant
T/C 58195579 upstream_gene_variant
A/T 58195686 5_prime_UTR_variant
G/A 58195833 5_prime_UTR_variant
G/T 58195836 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/A 58195837 5_prime_UTR_variant
G/C 58195847 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 58195954 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22710.1
MMTGKVYSIFNCQYIFPSRKQLAMKFPSTSGTSFLFVIVILFPLVIADLSSDKQALLDLVNAVPHRRNLSWNPTASVCESWVGITCNEDRTRVVKVRLPGVGLVGTIPSNTLGKLDAVKIISLRSNLLSGNLPADIASLPSLQYLYLQHNNLSGDIPASLSPQLVVLDLSYNSFTGGIPKTFQNFSELTSLNLQNNSLSGVIPNLNVTQLRLLNLSYNHLNGSIPKALQSFPNSSFEGNSLLCGPPLKPCSGVPPRPSPALSPPPSSTPGRQNSKYKLSKIAIIAIGVGGAVVLFFIVLVIVICWVKKEGGRGSNVIKGKGSGGGRGEKPKEEFGSGVQEPEKNKLVFFEGSSYNFDLEDLLRASAEVLGKGSYGTAYKAILEESMTVVVKRLKEVVVGKKDFEQQMEIMGRVGQHTNVVPLRAYYYSKDEKLLVYDYILGGNLHTLLHGGRTGGRTPLDWESRIRISLGSAKGLAHIHSVGGPKFSHGNIKSSNVLLNQDNDGCISDFGLAPLMNIPATPSRAAGYRAPEVIETRKHSHKSDVYSFGVLLLEMLTGKAPLQSPGRDDMVDLPRWVQSVVREEWTAEVFDVELMRYQNIEEEMVQMLQIAMACVAKVPDMRPTMDEVVRMIEEIRQSDSENRPSSEENKSKDSNVQTP*


CDS Sequence:
>Vu_22710.1
ATGATGACTGGCAAAGTTTACTCCATATTCAATTGCCAATATATTTTTCCTTCCAGAAAACAACTCGCCATGAAGTTTCCTTCAACTTCAGGCACTTCTTTTCTTTTTGTCATAGTGATTCTTTTCCCTTTAGTTATTGCTGATCTAAGTTCAGATAAGCAAGCCCTTCTTGATTTGGTCAATGCTGTCCCCCACCGGCGAAACCTTTCATGGAATCCAACCGCCTCAGTCTGTGAATCATGGGTAGGCATTACTTGCAATGAAGATAGAACTCGTGTTGTTAAGGTTCGGCTTCCCGGCGTTGGACTAGTTGGCACCATCCCATCAAATACACTTGGCAAGCTTGATGCTGTGAAAATTATTAGCCTTCGGTCCAACCTACTCAGTGGAAATCTCCCTGCTGACATTGCTTCTCTTCCTTCTCTTCAGTATCTCTATCTCCAGCATAACAACCTTTCTGGTGATATACCTGCATCATTGTCTCCCCAACTTGTTGTGCTTGATTTGTCATATAATTCCTTCACCGGTGGCATTCCAAAGACATTTCAAAATTTTTCAGAACTAACTAGTTTGAATCTCCAAAACAACTCCCTATCTGGAGTGATACCCAATCTCAATGTCACTCAGCTTAGGCTTTTGAATTTAAGCTACAACCATTTGAATGGCTCTATTCCTAAAGCTCTTCAGAGTTTTCCAAATTCTTCCTTTGAAGGAAACTCACTTTTATGCGGACCTCCCCTAAAGCCGTGCTCGGGGGTTCCTCCTAGACCTTCTCCTGCCTTGTCTCCACCTCCATCATCAACTCCAGGGAGACAAAACTCAAAATACAAATTGAGTAAAATAGCTATCATTGCAATTGGTGTTGGAGGAGCTGTGGTGTTATTCTTTATTGTTCTTGTCATTGTTATTTGTTGGGTGAAGAAAGAAGGCGGCAGAGGCTCCAATGTGATCAAAGGAAAGGGCTCTGGTGGTGGCAGGGGTGAGAAGCCAAAAGAAGAGTTTGGGAGTGGGGTTCAAGAACCTGAGAAGAACAAGTTGGTTTTCTTTGAGGGCAGTTCTTATAATTTTGATCTTGAGGATTTGCTGAGAGCTTCAGCTGAAGTCCTGGGAAAGGGTAGTTATGGCACTGCCTATAAGGCCATACTGGAGGAGTCAATGACTGTTGTGGTGAAAAGATTGAAAGAAGTTGTGGTAGGGAAGAAGGACTTTGAACAGCAGATGGAAATTATGGGAAGAGTTGGACAACACACAAATGTTGTCCCCCTTCGCGCTTATTACTATTCAAAAGATGAAAAGCTTCTGGTTTATGACTATATCCTAGGTGGTAACCTACACACACTCTTGCATGGTGGAAGAACGGGTGGAAGAACTCCCTTAGACTGGGAGTCCCGGATAAGAATATCCCTTGGAAGTGCCAAAGGACTGGCTCACATTCATTCTGTTGGTGGTCCCAAATTCTCACATGGAAACATCAAGTCCTCAAATGTTCTTCTCAACCAAGATAATGATGGCTGCATTTCTGATTTTGGTCTTGCCCCTCTTATGAACATTCCTGCTACTCCTTCTAGAGCTGCTGGTTATCGTGCTCCAGAGGTGATTGAAACCCGAAAACACTCTCATAAATCAGATGTGTACAGCTTCGGTGTCCTCCTTCTTGAGATGCTTACTGGGAAGGCTCCTCTGCAATCTCCTGGACGTGATGACATGGTTGATCTCCCTAGGTGGGTTCAGTCTGTTGTTAGGGAAGAATGGACTGCAGAAGTTTTTGATGTTGAGCTTATGAGGTACCAAAACATTGAAGAAGAAATGGTGCAGATGTTGCAAATAGCCATGGCCTGTGTGGCCAAGGTGCCAGATATGAGGCCTACCATGGATGAAGTAGTAAGAATGATCGAAGAGATTCGGCAATCTGACTCAGAGAACCGACCATCTTCTGAAGAAAATAAATCTAAGGACTCAAATGTTCAGACTCCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_22710::LG5:58196209-58198209(-)
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Gene Sequence:
>Vu_22710(-)
GAACAAAGTCTCAAACTTTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTGGGGTCTGGGTTAGGTCAAGAAAGAGAAGGATAGCGTCCATTCTGCATTGCCTTGCTGTGCTGTCAATTTTATTCTTTAATCTTTATTTTGTTTCTTCTTTCTTTATTTTATCAGCAAAAACAAAAAATTGAGTCACTTTCTCCAACCCTTTTTATGAAGCTTCTGCATTCTGTACCTTGCTGTTCTTTCTGCTGCTACCATGAGCTTTTAGCAAAAGATGCTCCTCAATTTCATCCAAATTCCCTGCCTTTATGGCCTCTCGGTGTGCTACATGCTCCTCACAATCAAACCCACCAACAGATTTTGATATAAATGCTCCTATTCTAACAAGTTGCTGCCAACAACCACTTCATTACCCAAGCTCAAGCACCCCCACCAACTCCAATTTCTGCCTCAGCCACTGCCACTTCATTTGCTGTTTCATTTCTCTCAATTGCTGAATTCTGAGACTTGCACATGCTTCTGAACTCTCCCATGCCTCCTTTCAGGTGATTGTTCACTTAAAAGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATGTATATATAGATATCCAGTGGTACAATGAACCTCCTAATTTAACATGTAAATCTGGGCTCTTTTTGTTGTTTTTTTTTTCTCAACATTGAGAGTGGAATGTGCTACCAAGCAGGTTTTGATTTCTTCTTGATGATAGTTTTAGTGTTTTGAAAACCTGGTTTTTGGAATTTTAGGATCTGATGGTAGTTGAGGATTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTCACATTATTGTGAATTTTATGGTTGAACCACTTTGACAGTTTCTGATCTTGTGATTTCTGTCAAAATCCATCAAAAGGGTGTGCTTTTGAACAAAAAAATCAGTTCTCTGAGCACTCATTTGTTTCAAAATTCAAGTCATTCATCTTACTGTCTGGGAAGCAAAAAAAATGGGGAAAACTGGAGGGAATTGCGTTGGCTGTGGTTGGCTAGAAAATTATGTGTTTCAGAGGATAAAGAGCACAAATGTTTGTTGTGGTTATCAAATAATTCGTATGGTTACCACAGAGCTAAACAAGCCTACTCCTAACTTCTTACAGCCCAAGTTAATTTTACAATAAATGTTGTCCTTTCTTTCACTTCTCCCTCATTTTTCTTTTTCTGCCAAAATCTTGAGAGTTTCTGTTTTGCTTTTCATGAATCGTATTCCTCCTTTAGCAACAAACATGTTTCGCTCTCTTTATAATTTGATCTTTCTCTGTGTTGTCGAGTACAATCTTATGCGTGTAAAATTAGGAGGGATTGGTTAGTTTGATAAACCTAACTGTTCACTTCATCTCTTTCCAAAATTTCCTGGACATATTGTATTCAATCCTGTTTATTCTTTGTAATTGCTAAAAAATTTGGGATGAACATGCTTAAAGCGACTATTTTGACCGTCTTGATTACTTTTTTTGGTATAGTTGTAATGTGATATGTTTTGAACTCATGATTGATGCAAGTGATTTTGTTCAATGTCACAGTTCCCCCCTATTTTCTTTCCGTTGCTATTCTCCTTGCATATTGTAAACAGGGGTTGTGACTATTGTAAAAGATAAGCTCCAGGTTATCAAGATTAAGTTACTCTTGTTCTTCTACTATAACTTTCTACAAATGAAGCTAAAGTGAACTCTGCTTAAGCCTTTTCAGTATGCTTATGAAATTTTAGGGGATTTAGTTGTCTAGAGAAGACACTTAAAGGTTCAATGTGAAAATCTCTATGAAATAAAATTTCTTTTGATTTGTATCTAATGATCTGCTGGTGTAGTATATCTCTTGATGATATATAAGTGTCATTTTAATGTTCTTTTATTCATGGAAAATGCATTCCCCTGTGTCTCTCTCTTGATGGTGAAGATCTTACAAGTAGGCAAAATTTACCCTTGGCTTGAAATTTTTTTTATCTGTTTGGTGATCTTAAATCAATATGCTTCCTTTCTATTAATCATGAATGGTTATGTTTCGACTTTTGTTTTCTGCAATGTGGTAATTTCTAACACCTAGGTTTGTTATACATTGTTTATTTCATCATGCTACTGGATCCTAACTTCTGATTTATGGTTATGGTACCAACACAGGAACATATGATGACTGGCAAAGTTTACTCCATATTCAATTGCCAATATATTTTTCCTTCCAGAAAACAACTCGCCATGAAGTTTCCTTCAACTTCAGGCACTTCTTTTCTTTTTGTCATAGTGATTCTTTTCCCTTTAGTTATTGCTGATCTAAGTTCAGATAAGCAAGCCCTTCTTGATTTGGTCAATGCTGTCCCCCACCGGCGAAACCTTTCATGGAATCCAACCGCCTCAGTCTGTGAATCATGGGTAGGCATTACTTGCAATGAAGATAGAACTCGTGTTGTTAAGGTTCGGCTTCCCGGCGTTGGACTAGTTGGCACCATCCCATCAAATACACTTGGCAAGCTTGATGCTGTGAAAATTATTAGCCTTCGGTCCAACCTACTCAGTGGAAATCTCCCTGCTGACATTGCTTCTCTTCCTTCTCTTCAGTATCTCTATCTCCAGCATAACAACCTTTCTGGTGATATACCTGCATCATTGTCTCCCCAACTTGTTGTGCTTGATTTGTCATATAATTCCTTCACCGGTGGCATTCCAAAGACATTTCAAAATTTTTCAGAACTAACTAGTTTGAATCTCCAAAACAACTCCCTATCTGGAGTGATACCCAATCTCAATGTCACTCAGCTTAGGCTTTTGAATTTAAGCTACAACCATTTGAATGGCTCTATTCCTAAAGCTCTTCAGAGTTTTCCAAATTCTTCCTTTGAAGGAAACTCACTTTTATGCGGACCTCCCCTAAAGCCGTGCTCGGGGGTTCCTCCTAGACCTTCTCCTGCCTTGTCTCCACCTCCATCATCAACTCCAGGGAGACAAAACTCAAAATACAAATTGAGTAAAATAGCTATCATTGCAATTGGTGTTGGAGGAGCTGTGGTGTTATTCTTTATTGTTCTTGTCATTGTTATTTGTTGGGTGAAGAAAGAAGGCGGCAGAGGCTCCAATGTGATCAAAGGAAAGGGCTCTGGTGGTGGCAGGGGTGAGAAGCCAAAAGAAGAGTTTGGGAGTGGGGTTCAAGAACCTGAGAAGAACAAGTTGGTTTTCTTTGAGGGCAGTTCTTATAATTTTGATCTTGAGGATTTGCTGAGAGCTTCAGCTGAAGTCCTGGGAAAGGGTAGTTATGGCACTGCCTATAAGGCCATACTGGAGGAGTCAATGACTGTTGTGGTGAAAAGATTGAAAGAAGTTGTGGTAGGGAAGAAGGACTTTGAACAGCAGATGGAAATTATGGGAAGAGTTGGACAACACACAAATGTTGTCCCCCTTCGCGCTTATTACTATTCAAAAGATGAAAAGCTTCTGGTTTATGACTATATCCTAGGTGGTAACCTACACACACTCTTGCATGGTATGCATTTCTTTTCCTTAGTTTCTGTCAGATCTTCTAAAGTTAACTCTTTTTTCTTTCATTTTTGGTAGAAAATATGTTTTTTGCTACCCCTTTTGTAGGCTTCTTAATGTTATTGTATCTGCCAAAACTAGCTAAAATACTTTACTTCGCCTTAAATTTGATCTGAATTTCATTGCAGGTGGAAGAACGGGTGGAAGAACTCCCTTAGACTGGGAGTCCCGGATAAGAATATCCCTTGGAAGTGCCAAAGGACTGGCTCACATTCATTCTGTTGGTGGTCCCAAATTCTCACATGGAAACATCAAGTCCTCAAATGTTCTTCTCAACCAAGATAATGATGGCTGCATTTCTGATTTTGGTCTTGCCCCTCTTATGAACATTCCTGCTACTCCTTCTAGAGCTGCTGGTTATCGTGCTCCAGAGGTGATTGAAACCCGAAAACACTCTCATAAATCAGATGTGTACAGCTTCGGTGTCCTCCTTCTTGAGATGCTTACTGGGAAGGCTCCTCTGCAATCTCCTGGACGTGATGACATGGTTGATCTCCCTAGGTGGGTTCAGTCTGTTGTTAGGGAAGAATGGACTGCAGAAGTTTTTGATGTTGAGCTTATGAGGTACCAAAACATTGAAGAAGAAATGGTGCAGATGTTGCAAATAGCCATGGCCTGTGTGGCCAAGGTGCCAGATATGAGGCCTACCATGGATGAAGTAGTAAGAATGATCGAAGAGATTCGGCAATCTGACTCAGAGAACCGACCATCTTCTGAAGAAAATAAATCTAAGGACTCAAATGTTCAGACTCCATAGATTAACTTTCCTTTTGCTTTATCAGGAAATCACAGTATAAGAGTTAATGCCTGGTCAAGGTTTCTCAAACTGTGTTCAAACCTCTCTGTCCATTTCTTCAATATTTCTCACAGATGTTTTTCTCGTTCTTGAGTTATTTTCTCGTTTAGGTAGGTTGTTTTCCCTGAATTCTTATGTATTAATTAACATCATCATTCAATTAATGATCTTCATTC