Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22678 LG5 57911882 57914728 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 57911957 stop_lost p.Ter358Lysext*?
G/A 57912184 missense_variant p.Pro282Leu
A/G 57912248 stop_lost&splice_region_variant p.Ter261Glnext*?
A/G 57912258 splice_region_variant&intron_variant
A/T 57912438 intron_variant
T/A 57912453 intron_variant
A/T 57912529 intron_variant
A/T 57912532 intron_variant
T/C 57912540 intron_variant
T/C 57912676 intron_variant
T/G 57912813 intron_variant
G/T 57912922 intron_variant
G/A 57913058 synonymous_variant p.Arg204Arg
T/G 57913285 intron_variant
A/C 57913539 intron_variant
A/T 57913583 intron_variant
G/A 57913585 intron_variant
G/C 57913849 intron_variant
A/G 57913897 intron_variant
T/A 57914009 intron_variant
T/A 57914012 intron_variant
C/T 57914113 intron_variant
T/A 57914167 stop_gained&splice_region_variant p.Arg188*
G/A 57914181 missense_variant p.Pro183Leu
C/T 57914264 synonymous_variant p.Ser155Ser
T/A 57914478 missense_variant p.Glu84Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22678.1
MATQTQDSPSNPNPNPNATSPTPSSSLFFRGAGASAAPFAGSGESHSHHRRALSEVSYRLPDDMMDLSPSDPFNGGSSTASLEEIGSEDDLFSTYIDVEKLGSGANGAGRGGNGSDQSGYGNGAGTSEHNDGEKSPRAAEARPRHRHSSSVDGSSSTNMFGEIMEAKKAMPPDKLAELWNIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIQELERKVQTLQTEATTLSAQLTLYQRDTTGLSSENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNDALMKEVERLKIATGEVLNNHSESFNMGMHQMPFAGSNFFSIPPHSGPPSHQNMQLPPYGLSQSSMPAHQLQQTNSHQISDILQNDQLGRLQGLDISSKGSPFVKSEGPSISANDSSTTF*


CDS Sequence:
>Vu_22678.1
ATGGCCACACAGACGCAAGATTCACCTTCAAACCCTAACCCTAATCCCAATGCCACGTCACCGACGCCGTCTTCTTCGTTGTTCTTTCGCGGCGCCGGTGCTTCCGCAGCTCCCTTCGCCGGCTCCGGCGAGTCCCACTCGCACCACCGGAGAGCACTCTCGGAGGTCAGTTACCGGCTTCCGGACGACATGATGGACCTCTCGCCGTCGGATCCGTTCAACGGCGGATCCTCGACGGCGAGCCTAGAGGAGATCGGATCCGAGGACGACCTCTTCTCCACCTACATTGACGTTGAAAAGCTCGGCAGTGGCGCTAACGGCGCCGGCCGCGGTGGAAATGGATCGGATCAGAGCGGTTACGGAAACGGCGCCGGTACTAGCGAACACAACGACGGCGAGAAGAGTCCGAGAGCTGCAGAGGCGCGGCCGAGACACCGGCACAGTAGCTCCGTCGACGGTTCCTCGTCGACAAACATGTTCGGAGAGATCATGGAAGCGAAGAAAGCAATGCCTCCTGATAAGCTAGCGGAACTTTGGAACATTGATCCAAAGCGTGCCAAGAGAATACTAGCTAATCGGCAATCTGCTGCGCGTTCAAAAGAAAGAAAGGCGCGCTATATACAAGAACTAGAGCGCAAAGTTCAGACCCTCCAAACCGAGGCAACAACACTTTCTGCCCAACTCACATTGTACCAGAGGGATACAACTGGTCTGAGTAGTGAAAATACCGAGCTTAAGCTCCGTCTCCAAGCCATGGAGCAACAGGCACAACTTCGTGATGCTCTTAATGATGCATTGATGAAGGAAGTTGAGAGGCTTAAGATTGCTACTGGCGAGGTATTGAACAACCACTCTGAGTCTTTCAATATGGGAATGCACCAGATGCCATTTGCAGGGTCAAATTTCTTTTCAATCCCACCACATTCAGGTCCTCCTAGTCACCAGAATATGCAGTTGCCTCCATATGGTCTCTCCCAATCTAGCATGCCAGCTCATCAGCTGCAACAAACAAATTCTCACCAAATCTCAGATATATTGCAAAACGACCAGCTTGGTCGTTTGCAGGGACTTGACATTAGTAGCAAAGGATCACCATTTGTGAAATCTGAAGGCCCTTCAATATCCGCAAATGATAGTAGTACTACGTTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_22678::LG5:57914728-57916728(-)
AGAAAGCTGACAAAATGAAGGAATTCTGATCTTTAGAAAACCCCTTCCTAAGGTCATGGGTCCTTAGCTTATGGGCTGACTGCCTCAACATAAGACCCAATAACCTTATTATTTTCAGGCTCTTACATGACACATTTTTATATTTAATTAATATATAGTATAAGAATAAAATTGTCCACAATTTTTTTTATTTTTCTAAAAATAAAAAAATAAAAAAGTTAATATCAAATAAATATAAAAAAATTATATTATATATATATATATATATATATATATTAAAATATATATTTTTAATCAAAACTGACTTATAACATCGATGAGGATTATATAAATATAGGATCAATTTTCTAAAAAGACCTAAGTTTAAAAAGCATATTCTAATTAGACCTGAATTAAACCAAAGTGGGATCTAAATTAATACGTACTATATTTGAACAATCTTTTGACGCTAAATAAAATTATAGTTTGACCCTTCGATCATGATCTTTCACGCATTCATATATATATATATATATATTCAGGAAACCAAAGTTTCAATTTAACCTAATTAACTTTATAGTACTCTTCGTATCATTTAAATTCAATCTTTCACATCATCTACACTACCATAAATTTTTTAAACATTTCTAAAGTCAAAAGGCCAACTGTACAAATAAAATATTTATTGCACGTTACACTACGAAACACATGTTAAGTAACCAAGTGAATGTATTTGCAAAATAAAGTAAAATAGGTTTTAATTAAATAGACTATTTGAATATGAAATTATTGCGTGCAAATATGAGCCACTCCACTAATAATTATTCGTTCTACAGTAACATATCAATTCTTTATACATTATTTTGCATGTGAAGCTACATGCTTTTTGAAAATGGTGTTCACGATTGTAACTTTTATTATCAATTAAGTGAATTAACTAATATTTGCATGTACAATAGAATAAAGTGAAAAATAAAAGTTTAAAAAATTAAAAATATGTTTAATTCTTAGTTTTTTTTTTTCATTTTCCATAAATTATACTGAGACGTCAATATTTTTAATTTTTAGCTAATTATTGTGAGGAAGTTTAAAATTTGCATAATAAAGATGAGAAAGTTATGCTTTTTCTTTTTTAATTAAAAGGTTTTAAAATTTATAGTAAAAAAGTATTTTATTTTCTCCTATTAGAAACTTATGTTTTTATATTAAATCTTGAAAATATTGAAATATTTTTTAGGATATATATTATATTAGCACTCTAAGTTCACATTTTTTGGGATAAAGAAAATTATTGCATTTTATTCTTTTAGTGAAAATATGATGTCATTGTGTAAAAATATTTCATTTTAAAAATTTAAATTATTTGTTCTTTTTTAAAATTTCTTTTAAGTTAATATTTTCCTTTCCTATCTGATCAAATTTCGTTAATTTTTCTTAAAAATTAATTAATTTATTATGTCTAATTATTCAATTTTCATGTTACTTTAAACATTTTTACATTAAAATAATAATAATTCAATTAAAATGTAGTGGAAATGTGAATACATCTAATACTATTATCTAACTATTACATATATGGTACATAATAAATATGTTGATTTTATAATAATCACTGAAAAATCATATACAATATTTTTATTGGTTGAACATTGGCAATGTAAGTAAACTAAATAATCATTAATTATTTAAAAAGGAATCCTAAATATTTGTTAGATTCTTCACATCTTAAACATTTCATTTCAAAATTTACAATCTTACATATTTTTTTGTGTAGCAATGCCATAAGAACTTTTTGTCAGAAGACTTGGGAAAAATAATAAATCCGCAAAATATAAATTATGCTAAACAGGAATTTTTGTTGTTATTTTATAAACAAATATTAAATAATATATTTTTGTTTTCCTTTTAAGAATTCTTAATATTTTATGTGTTGGCAACGTGGGGAGGAAGAAAGACGAGAGATTGCGCGTTATTGTGTTAGAAACAGAGCATCGATCGGAAAAAACAGAACTCAGAAGGGA


Gene Sequence:
>Vu_22678(-)
ATGGCCACACAGACGCAAGATTCACCTTCAAACCCTAACCCTAATCCCAATGCCACGTCACCGACGCCGTCTTCTTCGTTGTTCTTTCGCGGCGCCGGTGCTTCCGCAGCTCCCTTCGCCGGCTCCGGCGAGTCCCACTCGCACCACCGGAGAGCACTCTCGGAGGTCAGTTACCGGCTTCCGGACGACATGATGGACCTCTCGCCGTCGGATCCGTTCAACGGCGGATCCTCGACGGCGAGCCTAGAGGAGATCGGATCCGAGGACGACCTCTTCTCCACCTACATTGACGTTGAAAAGCTCGGCAGTGGCGCTAACGGCGCCGGCCGCGGTGGAAATGGATCGGATCAGAGCGGTTACGGAAACGGCGCCGGTACTAGCGAACACAACGACGGCGAGAAGAGTCCGAGAGCTGCAGAGGCGCGGCCGAGACACCGGCACAGTAGCTCCGTCGACGGTTCCTCGTCGACAAACATGTTCGGAGAGATCATGGAAGCGAAGAAAGCAATGCCTCCTGATAAGCTAGCGGAACTTTGGAACATTGATCCAAAGCGTGCCAAGAGGTCTCTTCTATCATCCTTCACTTTAAATTTTTCCGAATTTATTTTCGTGAAAGATGCTTATAGTTTTCGCCTTTAGATTTCGGTTTCAGAATCCTAATGCAGGATATTAACGTTGATATCACGTAAATAACTCAACGTTTGTTTCATAATTAAATAATTAATTAATTGTTCTGTCCGAGATTTTAGAATTTCGCGTTGCTCCAGGGAGTTTCCATATTAGTTACTTTTTACTCACATATGCCTATTCTTTGATTATGTAATTTCCTTTTAATATTGAAAATTAGAGTTGGCTTGTAAATGTATTTAGATGATGCGCCACTGTTTCGGGCTCAATTGTCATTGATAGGAGAATCTTGTATGTTTGACATGACAATGATTTGGATAGTTGCTTGTTTTCGTACTGTTCTTTGGTCAACAGTTTGTTTCATAACTCCAGTGCGTGTATAGATTTTACGTTACGTGATCATTCAATGGATAGTGGCATTTATACACAGTCACACTACTGAATCATTAAATTGTATACTTACTGAGACGTGATTGATTTATGAATAGATAGGGAGAATATTTCACCCTGCCGTTGCTTTTTTAACTTCAAAACTGGGGACAATCGTTAGAAAGTATGAATGTTGTGGTGCATTTCCGTTGCATGATCAGTCTGGAGGATTCGAAGCCCGCAATATAATTGTAATTGCTGATTGCTACTTAAACGATCTGTCATTATACTATTCTCTTTTTCTGTCGGAAAATTATGTTAAATCTAATTATAATGGTTTTTATAAAGTGATACGTTAAAAGTTCTGAATATGCAGAGAGACAATTATGAATCTTCTTCCTTTATAGTCTAAATTATTTTGATATAATAAATATATAACGGCCGTGTAATTATGATTTCTAACAGTTGAACGTTTAAAATAGGGATGGGAGTTCTGCGAATGCGAGTGAGTGAGGGTTATGCCAGAGATACTGCTTTCTAGTTTCATTTATCTTCCGTACCTGCATTTTGGTAGCTGCCATGCATTTGTTTTGTTATTCTCAACAAGTATTGTTGTTTTGTATAGAATACTAGCTAATCGGCAATCTGCTGCGCGTTCAAAAGAAAGAAAGGCGCGCTATATACAAGAACTAGAGCGCAAAGTTCAGACCCTCCAAACCGAGGCAACAACACTTTCTGCCCAACTCACATTGTACCAGGTTTGTTGTTGATTTTCATCTATATGTACTACTTAAGTATTTGTCATCCCCCCTTCAAAGAAACAGAGGCGATAATGTTTATTGGCTCTGCATTTTATTGGCTTCATGTTTTTTTCCAGAAATCTTTTAGAAGTTGGCTGGCCTACATTAAAGCCTGCTACATTTTTTCTCTTGTTTTGATTCTTATTATATTACATTATTAGCTGCAAAAATTGATTCGACCTTATGTGAGCAATGCGCATATCTGTTCCCTTTGTCTCAAATAATGCACTAAAAATATAACAGGATAAATATCTTTATTGGTATTATTTTAATGACTAGAATTTGACATAGGTGATTAGATGCAGTCTTGTCTTTCTTTTCACAAATTCCTCTATTTTTTTAATTCATAGTTTAGGGATTTAATTTTACAAATTACCTTGGTAATTCCTGGTACACTTACTGATTTTTTTTTCTTAAACTTCATATCTAGTTGACTTGCTTTTTCATGTATAAACTTGTGGCTGAATAAGAGTACAACTAATACCGTTTCTTGGTTACTTATAGAGGGATACAACTGGTCTGAGTAGTGAAAATACCGAGCTTAAGCTCCGTCTCCAAGCCATGGAGCAACAGGCACAACTTCGTGATGGTAACTGTTTTAGCCAATCACTTCCTTTAGATACAACGTCATACATATATTTTACATAATTATATGCTAATTTACCTCTGTTTTGTTGTAGCTCTTAATGATGCATTGATGAAGGAAGTTGAGAGGCTTAAGATTGCTACTGGCGAGGTATTGAACAACCACTCTGAGTCTTTCAATATGGGAATGCACCAGATGCCATTTGCAGGGTCAAATTTCTTTTCAATCCCACCACATTCAGGTCCTCCTAGTCACCAGAATATGCAGTTGCCTCCATATGGTCTCTCCCAATCTAGCATGCCAGCTCATCAGCTGCAACAAACAAATTCTCACCAAATCTCAGATATATTGCAAAACGACCAGCTTGGTCGTTTGCAGGGACTTGACATTAGTAGCAAAGGATCACCATTTGTGAAATCTGAAGGCCCTTCAATATCCGCAAATGATAGTAGTACTACGTTTTGA