Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22675 LG5 57879911 57882737 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108342963
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 57880070 missense_variant p.Gln54Lys
C/A 57880132 missense_variant p.Asp74Glu
C/A 57880168 synonymous_variant p.Ala86Ala
C/A 57880207 synonymous_variant p.Ala99Ala
T/C 57880252 synonymous_variant p.Ile114Ile
G/C 57880343 missense_variant p.Val145Leu
A/G 57880348 synonymous_variant p.Gly146Gly
A/C 57880367 synonymous_variant p.Arg153Arg
C/T 57880694 intron_variant
T/C 57880782 intron_variant
T/C 57880808 intron_variant
C/T 57880996 intron_variant
A/C 57881201 intron_variant
C/T 57881242 intron_variant
C/A 57881267 intron_variant
T/A 57881272 intron_variant
A/C 57881371 intron_variant
C/T 57881377 intron_variant
T/A 57881519 intron_variant
C/A 57881654 missense_variant p.Ser296Tyr
A/C 57881891 missense_variant p.Tyr375Ser
T/A 57882027 intron_variant
G/C 57882038 intron_variant
G/T 57882062 intron_variant
C/A 57882178 intron_variant
A/T 57882231 intron_variant
A/T 57882416 splice_region_variant&intron_variant
C/G 57882532 splice_region_variant&intron_variant
G/T 57882569 intron_variant
C/T 57882653 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22675.1
MDTDISRWVMEFLLRSSVPDSLIQKALIVLPLSGADSRLKKTLLLRTLRTLLLQASLSETALQIFEHLEELDGDSTSVALRRAYLAVAVECTVKYLAAAPDDPEGVFSGAVKRIWRGRVAALEARRSGLVSGELAQWRDDVEAAVGDSRACERLADFNSRREAMKEVRAYLKEAWESMGPSFLESVAAMSKGLTKEKEDFVISGDRCDNDQDNGNNGDHGCMEGVAMHDENQTKQQLEEKIEANQEVGGCDLPLQGDKVIQKRNLRVKHKHSALRACHRGVKINYSEEGRSKHDSVPSSEVKEVRESLKSSSYDLRALVKDPLPDALHLSEAVRSKLATSDTNIEPPIEKQSPDVDLPDPDVCQTIVLFQPNDANIGKKSSVYCSDLHQPNLMERNRSAQTSEWDDSIDNSPQARQPKRRKRRWSSLEEETLRAGVKMFGEGNWATIKSFYSNIFDNRSG


CDS Sequence:
>Vu_22675.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22675::LG5:57877911-57879911(+)
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Gene Sequence:
>Vu_22675(+)
ATGGACACGGACATTTCCCGGTGGGTGATGGAGTTCCTCCTCCGCAGTTCCGTCCCCGATTCCCTAATCCAAAAAGCCCTAATCGTCCTTCCTCTCTCCGGGGCCGACTCCCGCCTCAAGAAGACCCTTCTTCTTCGCACTCTCCGCACCCTCCTCCTCCAGGCCTCCCTCTCCGAAACTGCGCTCCAAATCTTCGAACACCTCGAAGAACTCGATGGTGACTCCACCTCCGTCGCGCTCCGCCGCGCGTACCTGGCCGTTGCCGTCGAGTGCACTGTCAAGTACCTCGCCGCCGCCCCCGATGACCCCGAGGGGGTGTTTTCTGGCGCCGTGAAGCGGATTTGGCGCGGCCGCGTGGCGGCACTGGAGGCGCGCCGGAGCGGGCTGGTGTCTGGCGAGCTGGCGCAGTGGCGGGACGACGTGGAGGCAGCGGTTGGAGATTCTAGGGCTTGCGAGAGGCTGGCGGATTTCAATAGCAGGAGGGAGGCGATGAAAGAGGTGAGGGCGTATTTGAAGGAAGCGTGGGAATCGATGGGTCCTTCGTTCTTGGAATCGGTTGCGGCGATGTCGAAGGGTTTAACCAAGGAGAAAGAGGATTTTGTTATTAGTGGTGACAGGTGTGATAATGATCAAGATAATGGAAATAACGGTGATCATGGCTGCATGGAGGGTGTGGCAATGCATGATGAGAATCAGACCAAACAACAATTGGAAGAGAAAATTGAGGCGAATCAGGAAGTGGGTGGATGTGACTTGCCACTTCAGGGAGATAAAGGTACCTTTCTTAACGACTGTGAGATTTGATTCTTGAATTTCAAATTTTTTCTTTTAGTGTGAACTTTTTGTTACTTGCAACGCAAATTATCTTTGTTTTTGGGTGTTACACTCAGTAGTGCTTGTTTAAGTTGTGGTAGTTAATGGAAGTGGTGGAAGCTTAATTTGTTCACAACTTAGTTGTCGGGTTTTGTGAGGCATGTTTTGAGTTTGCACTACGTGTTTTGTCCAGGTTTCTATGTTTTCGCTTGCAACGTTTTTTAAATATATGTTTTTTTTAATTACTGAGTTTATGTATATGAATATTTTATCTAGTACCTTAGAATTTTTAATCAAGGTGTGCGTGCCTCTGCATGCAACAGTGTTTGTCTGTGGAAAGAAGTGTGAGTTTGGATACTAAATGATTCCCTGCATCATGGATGCGATTTAGAAATGGGACGTGGATGTGATTTTTCACTATTAGTTCTAGCTTTTGTGTTTTTCACAACTTGAATGTGAATTTTTTGGATGTGGAACATTTTCCTAAACATGTTATTAGTTGCTTCGTGTATACAACACGAAAGCAAAGATGTGGGTGCAAAACGTTTTATAATAATGCTGTGTATTTGCTGTTGCCTTTACTAGTGTTGTTATCGTCAAGTGGAACCAGTTAGTATTTTTTTTCCTCACTTTGGACCCACTCAATAAAAAATCCTGTCAAATTAAAATTGGCTTCAACTTTGGAAAGATATATGTTAAAATTGGTCATTCATTATTTGGAATTAACTCCAACAATGAAGTCACAACACTGTTCGATAAATGCTATTCTTTCTACTGTTTCACTGTTATTTACACTTTACATTTGTTTTCCCAATAGTAATTCAAAAGCGGAATCTTCGGGTTAAACACAAACACTCTGCACTTCGTGCATGTCATAGGGGAGTTAAAATAAATTATTCAGAGGAAGGACGGAGCAAACATGATTCTGTTCCTAGTTCTGAAGTAAAAGAAGTTAGAGAATCCCTTAAATCAAGTTCTTACGATTTAAGAGCATTGGTCAAGGATCCTCTTCCTGATGCATTGCATTTATCTGAAGCTGTAAGATCGAAATTGGCTACAAGTGATACAAATATTGAGCCACCTATTGAAAAGCAGAGTCCAGATGTAGATTTACCAGATCCAGATGTTTGCCAGACTATTGTACTTTTTCAGCCTAATGATGCCAATATTGGGAAGAAGTCTTCTGTTTATTGTAGTGATTTACATCAGCCCAACTTAATGGAACGAAACAGAAGTGCCCAGACATCTGAGGTAATCATGTTTGTTATTGTCTGTTTTAATCTAGGGGCAGATTCCTTTAATGTTGTATTGTTAGCCAGTGTCTATTTTTGATGTAAAGAATGCGTCGAGGTAACTTCTTTCATGGATTAATGCTTGCTATCTCTTGGAGTAAGCTTTCCTGCAAGGATTACCATCTCCCCGTGCTTTTTTCTTGTGGTTTGACAAGTTCTAAACAATTGCAATACAATGAAACTGGTGTAACAGCAACTGTGATCATGATGTATAAACCACACTTAAAACCTTGCTACCACTTGATCCAGTGGCCTGTGGATCCCCAAAGATGATGTTGATCATTAAGATGGTTTATAGTCCTTTTTTGATGGATTCTTTTTCTTGCTGTTGATACTTTGTATTTGGTTGCCATTTTGTTTTTGATTTTTGCATTGGCATATAACTTAGGTCCTTTTATTTACCAGTGGGATGATTCAATAGACAACTCGCCACAAGCAAGACAGCCTAAGAGGAGGAAAAGGAGATGGAGTTCTTTGGAAGAGGAGACACTAAGGGCCGGTGTAAAAATGTATGCACTTGTTCTAAACTAGTCAAACCATAAATTTTCCTGGTGAACTGTGATATATTAGTTATAAGTACAATGGAAAGCTAATAAATTTGTAATAGTTTTGTGCCTTGAGATTTCATGTTCTCATTCACCATTTTTTTATACAGGTTTGGAGAAGGAAACTGGGCAACAATAAAAAGTTTTTACAGTAACATATTTGACAACAGAAGTGGA