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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22653 LG5 57653315 57656094 PREDICTED: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 10
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 57653405 intron_variant
A/G 57653415 intron_variant
A/C 57653624 intron_variant
G/A 57653643 intron_variant
T/C 57653694 intron_variant
T/G 57653752 intron_variant
G/A 57654329 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 57654349 5_prime_UTR_variant
G/C 57654821 missense_variant p.Cys125Ser
A/T 57654842 missense_variant p.His132Leu
T/A 57655055 missense_variant p.Phe203Tyr
G/A 57655248 synonymous_variant p.Lys267Lys
G/A 57655315 missense_variant p.Val290Ile
T/C 57655690 synonymous_variant p.Leu415Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22653.1
MESKPNILMQRYELGRLLGQGTFGKVYYGRSAITNQSVAIKMIDKDKIMRTGQVEQIRREISVMRLTRHPNIIQLFEVMANKSKIYFVMEYAKGGELFNKVAKGKLKEDVAHKYFKQLINAVDYCHSRGVFHRDIKPENILLDENGNLKVSDFGLSALVESKRQDGLLHTPCGTPAYVAPEVIKRKGYDGTKADIWSCGIVLFVLLAGYLPFHDPNLIEMYRKISKAELKCPNWFPPDVCKLLGMMLDPNPDARIPISIIREHCWFKKEPNVKNKRPVVENNTVSSSGTVLPDQTDCCDGLAAEANGESVAPLSINAFDIISRSPGFDLSRFFDDSFRIKEARFSSRLPANVIISKLEDIAKQLRMKIKKKAAGLLKLEGLEEGRKGVLTIDAEIFEVTPCFHLVEVKKSNGDTLEYQKILKEDIRPALQDIVWVWQSDQQLQSQPSEQELQQTDDQQQQQSQS*


CDS Sequence:
>Vu_22653.1
ATGGAGAGTAAACCAAATATCTTAATGCAAAGATATGAGTTAGGAAGATTACTCGGTCAGGGAACCTTTGGAAAAGTTTACTATGGTAGAAGTGCAATAACTAACCAGAGTGTGGCTATTAAAATGATTGACAAAGATAAGATTATGAGAACGGGGCAAGTTGAACAAATCAGGCGTGAAATATCTGTTATGAGATTGACTAGACACCCCAATATTATTCAGCTGTTTGAGGTTATGGCTAACAAGAGTAAGATTTATTTTGTTATGGAGTATGCCAAAGGTGGTGAGCTCTTCAACAAGGTGGCCAAAGGAAAACTGAAGGAAGATGTGGCACACAAGTATTTTAAGCAGCTAATTAATGCTGTGGATTATTGTCACAGTAGAGGTGTGTTCCACAGAGACATAAAGCCTGAGAACATTCTATTGGATGAAAATGGAAATCTAAAGGTCTCTGATTTCGGATTAAGTGCTCTTGTTGAATCCAAGAGGCAAGATGGTTTACTACATACCCCTTGTGGCACACCTGCTTATGTTGCTCCTGAAGTCATTAAAAGGAAGGGATATGATGGCACAAAAGCTGATATATGGTCTTGTGGAATAGTTCTGTTTGTCTTGTTAGCAGGTTATCTCCCTTTTCATGACCCAAATTTGATAGAGATGTATAGGAAGATAAGCAAAGCAGAATTAAAATGCCCTAATTGGTTCCCACCTGATGTATGCAAGCTATTGGGCATGATGTTGGATCCAAATCCTGACGCTAGGATTCCCATATCTATCATTAGGGAACATTGTTGGTTTAAGAAAGAACCTAACGTTAAAAACAAAAGACCTGTAGTGGAAAACAATACTGTCTCTTCTTCAGGTACTGTTCTTCCTGATCAAACTGATTGCTGTGATGGTTTAGCAGCAGAAGCAAACGGAGAGTCAGTTGCTCCCTTAAGTATAAATGCCTTTGATATTATCTCCCGTTCTCCGGGTTTTGATCTTTCTAGATTCTTTGATGACAGTTTCCGGATAAAGGAAGCAAGATTTAGTTCAAGGTTACCTGCAAATGTCATCATCTCCAAGCTGGAAGACATTGCTAAGCAACTGAGGATGAAAATAAAGAAAAAGGCTGCGGGTTTGTTGAAATTAGAGGGCTTGGAGGAAGGTAGGAAGGGGGTTTTAACCATTGATGCAGAGATCTTTGAAGTTACACCTTGTTTCCATTTGGTGGAGGTAAAAAAATCAAATGGAGACACATTGGAGTATCAGAAAATATTGAAAGAGGATATCAGGCCTGCTCTTCAGGACATTGTTTGGGTCTGGCAAAGTGACCAACAACTGCAATCACAACCGTCAGAGCAAGAACTGCAACAGACAGATGATCAGCAGCAACAACAATCACAGTCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_22653::LG5:57651315-57653315(+)
TGTAAGGTCGTTCGGCCATGAACGTACCCCTTTGGTTTCAGAACTGAACTGTAATATTGTTAATATGTGAATATTCTATGGTATGGTTTATACTGTATTTTTGGGATGTTACAAGATTTCATTTCAAAGGTTTAAATTTCATATTTATAATTAAAAAGAATCATACTTTTAATATTTTAAATTTTGTTTTATATTCTTTGAATTAACATTTTATTATTTTCATCTTGAAATTGTAGACAGTAAGACTTTAGTAAGACTAAAACAAAAAGTAAAAACTATCAAAGTAATTGTTTTAAAATATGCTACTAATATTTATATTGTCATTACTAGAGTCTACAGATATATATCTGGCATGCATTGATTAAACAAATTTACTAACACACTAGACAAATATAACAAAAAACATTAGATGAGTCCAACAATATATGCATTATATGAGTTTATACATACATTAATTAAACAAGTATAACAACAAATCAATAGACGAGTTTAGCAATACACACTATAAAGTATATCCATCATTAATTATATGAGTATAAAAAAATACATTAGATGAGTCATTCCATACATTAGTTAGGCAAGTATAAAAATACATTGATTTCACACATTGATTAGATGAGTATAACGAAAAACATTAAACAAGTCCAACAATACACATTGGACGAGTTTGTCCGCTTGCTAATTAGATCAATATAGCAAAAAAACATTAAATGAGTCATTTCATAAATTGGATAGATGACTTTAAGAATACATGTTCGACAAGTATGTTCATAACTGATGAAACAAGTCTTACAACATATATTAGATAAGGTTGTTCCTATAGTAATTATAGGAGTTTAGCAATATATGTTAAGAGAATATGTTCACACACATGTTAGACGAATCTATTATATATACACATTAGCCAACTTTATCCATTCTTTAATTATACGATTTTTGCAATATATACTAGACAAATTTGTTCATATATTGATTAAACAAGTTTAACAAAACACATTAGATGAATGTGTCCATATAATGATTATACGAGTATAATAACACATATTACACAAATTTGGTAATGCATTAATTAGATAAGTCTACAATAGACATTAGACAAATATGTTTATGCATTAATTTGTATTTTTAACGAGTTTACTCTACATAATTTTATTTATCTTTTATATGTTTAAAAAGTCTATTTTATTTTTGCACATTTTTTATCCTTTTTATTTTTACATACTCTATTGTTTATATTGTTATAGGTATATATCAACCTTTTAAACCTATAAATCATTTTTCAAGTTGATTCTATTTAAAACTTAAATATAAACTAAAATATTTATTATTACTTTCATAAATCTTTAAATATCTTTTAATAAACATACAAACAAACATCTAGGCATGAGTTTAAAATTAATTTTAATAAAAACTAATTAACGGATTCTAGTTAATTTTGTTTGATAATAATGATTCTTCTTAAATTCATGTCTTTTAAACTTATTTTCTAACATTAAAGAAATGTATCTTTTTTTTATAATTCGTTTATTCTCTTCATTGTTATGATAATATATATATATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATTGGAGAAAATAATTTTACTTATAATTTTTAATTTTAATATGTATTTTTTATAGAAGACAAAATTAGATTCTTAAAGAGATTAAATATAAGACATTAAATGTTTTATCCATTATTAATCGAGTTCATAAAAATAACTCACAATTAAAGATTTTTTAAAGTGTGAAACTTCTTCCTAAATTTGGAACTTATTAGATAAACAATTAAAGTGAAAAATGTTTTAGATTTGTTTTAACTGAGTCAAACTTTTACTATAATAATTAATCAAATAATTCATTTATCAATCAATTCACTTTGATTTCCTTCGTGGAAATCTTCACATATATACATACATATACATATATATTATAAACATAAACCTACAAACAGAGACATCTGTTCCTCGTTTTGTGTTG


Gene Sequence:
>Vu_22653(+)
GCATCTTCAATGTGTACCAACATGTGCTAGTCCTGATCCTCAAGGTAGTCCATTATTTTTCTGTTTTAATTTTTTAAATCTGGAAAAATTCTCTGTTTCAATTTATGTGTACAAGTTGAACATGTTCCTGAATCATCGAGATGATACCATCGCCAATCGCTGTATGTATGAATTTGGGTCGGTTCTTCCCACTTCCAGACTAATCATAAAAGCTTTGTCTTACTGCAAAGAAAAATTTAGTCATGGTATTTCCTGCAAACAATCATCATACACTGACACTGTAACTAAGATTCTCAGGTTCTTATTTGTATGCCACACTTTCATCTCTGCCCTCTGCACCCTTTTGGATTCTTGTTGAAAGAAAGAGTGATAAAGTTTCTAAATTTATTCGGTAGTACAGATTGTTTCTTTGATTCAATTTCCATTTATGCAATCATTTAAAGATCATATCTGTAAAAATTCAGTGGGTTTACTTTCTGTTCCTTTCCATTTATTTTCAAATTTAACTTCAAAACAGGTATCTTCTTTATTATTTATATTTACCTGGAAACTGATTAATAAGCATGTGGTGACCATTTTTACCAATTCATCTTCTGTGTTTCAAGATCAGCATTTGATCTGTGTTCATCATCTTAATATATGTTTCCCCTTTTGTTTCTATGTAGATCTTGACAGTTATTTAACTGAGATTTGTTCCTGTTTTGTTTCTCAGGTTCCTCTTATAAATGCTCATCTGCCGAAAATTCAAGTTTGATGCTGAAGTTCATCGATTCACGGTTTCCGGCACATATTGTCTGTTGTGGTTGACAGAGACACTGGGCATGCCAAAAAGATGTGTCTTGTTGATTGCAGATATGTGGCTGAGATTCATAAGGTGATGCCCTTGCTCTTAATGCCCCACTTCATGCTTGCTAAGAGTGGACCACAAGTTTGTAGCTCATTCATTAGCTATTCCTTGAAGGACAATAGGCACACAAGTTTTTTTTCAGTGCCTGTTCTGCTGATACTTGATCCGTGTGAAGACGGTTGAGACAACTTTCTGCCATGTGTATATAGTTTTAGTTAAACATACACTTCATAATAGCAAATGATATAGAGTTTAAGTGGGCTGGGGAAGTTGTGTAAAAGTTCGTATGGAGAGTAAACCAAATATCTTAATGCAAAGATATGAGTTAGGAAGATTACTCGGTCAGGGAACCTTTGGAAAAGTTTACTATGGTAGAAGTGCAATAACTAACCAGAGTGTGGCTATTAAAATGATTGACAAAGATAAGATTATGAGAACGGGGCAAGTTGAACAAATCAGGCGTGAAATATCTGTTATGAGATTGACTAGACACCCCAATATTATTCAGCTGTTTGAGGTTATGGCTAACAAGAGTAAGATTTATTTTGTTATGGAGTATGCCAAAGGTGGTGAGCTCTTCAACAAGGTGGCCAAAGGAAAACTGAAGGAAGATGTGGCACACAAGTATTTTAAGCAGCTAATTAATGCTGTGGATTATTGTCACAGTAGAGGTGTGTTCCACAGAGACATAAAGCCTGAGAACATTCTATTGGATGAAAATGGAAATCTAAAGGTCTCTGATTTCGGATTAAGTGCTCTTGTTGAATCCAAGAGGCAAGATGGTTTACTACATACCCCTTGTGGCACACCTGCTTATGTTGCTCCTGAAGTCATTAAAAGGAAGGGATATGATGGCACAAAAGCTGATATATGGTCTTGTGGAATAGTTCTGTTTGTCTTGTTAGCAGGTTATCTCCCTTTTCATGACCCAAATTTGATAGAGATGTATAGGAAGATAAGCAAAGCAGAATTAAAATGCCCTAATTGGTTCCCACCTGATGTATGCAAGCTATTGGGCATGATGTTGGATCCAAATCCTGACGCTAGGATTCCCATATCTATCATTAGGGAACATTGTTGGTTTAAGAAAGAACCTAACGTTAAAAACAAAAGACCTGTAGTGGAAAACAATACTGTCTCTTCTTCAGGTACTGTTCTTCCTGATCAAACTGATTGCTGTGATGGTTTAGCAGCAGAAGCAAACGGAGAGTCAGTTGCTCCCTTAAGTATAAATGCCTTTGATATTATCTCCCGTTCTCCGGGTTTTGATCTTTCTAGATTCTTTGATGACAGTTTCCGGATAAAGGAAGCAAGATTTAGTTCAAGGTTACCTGCAAATGTCATCATCTCCAAGCTGGAAGACATTGCTAAGCAACTGAGGATGAAAATAAAGAAAAAGGCTGCGGGTTTGTTGAAATTAGAGGGCTTGGAGGAAGGTAGGAAGGGGGTTTTAACCATTGATGCAGAGATCTTTGAAGTTACACCTTGTTTCCATTTGGTGGAGGTAAAAAAATCAAATGGAGACACATTGGAGTATCAGAAAATATTGAAAGAGGATATCAGGCCTGCTCTTCAGGACATTGTTTGGGTCTGGCAAAGTGACCAACAACTGCAATCACAACCGTCAGAGCAAGAACTGCAACAGACAGATGATCAGCAGCAACAACAATCACAGTCATAGCCTGTTTTGAGATTTCATGCTTACTGCATTTCATGGCAATCCCAGTTCTTTCTTTTTTATTTTTTCCAAATTTTGCTTTTGCATATCTTGCATTTCACGATGCTTTGACCTCTCTGTAACACTTATTCCTCATTTTTAGTTGTTTCATCTTGTTGTAGCATATCTCGTCTCAAATTTTTTGCAAAGTTGTACACCGTTTCTCAAATTTTCTGTACAATATGAACCTTAGAAACTTTTTTCCAGTGTTAGTTC

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