Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22595 LG5 56979079 56982656 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108342209
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 56979274 synonymous_variant p.Ala510Ala
G/A 56979437 intron_variant
A/G 56979650 intron_variant
G/A 56979805 intron_variant
T/G 56979811 intron_variant
T/C 56979957 intron_variant
A/G 56980210 intron_variant
A/T 56980291 intron_variant
A/T 56980328 intron_variant
A/T 56980339 intron_variant
A/C 56980353 intron_variant
T/C 56980368 intron_variant
G/T 56980713 missense_variant p.Thr380Lys
T/C 56980845 missense_variant p.Lys336Arg
T/A 56980933 missense_variant p.Met307Leu
T/C 56981098 missense_variant p.Lys252Glu
G/A 56981100 missense_variant p.Pro251Leu
T/A 56981705 intron_variant
T/C 56981870 intron_variant
A/G 56981955 intron_variant
G/T 56981967 intron_variant
A/G 56981992 intron_variant
C/A 56982054 intron_variant
G/A 56982075 intron_variant
A/G 56982111 intron_variant
A/G 56982112 intron_variant
A/T 56982172 intron_variant
C/A 56982181 intron_variant
C/T 56982183 intron_variant
T/A 56982254 intron_variant
C/A 56982256 intron_variant
G/T 56982378 synonymous_variant p.Pro93Pro
C/G 56982411 synonymous_variant p.Thr82Thr
G/A 56982412 missense_variant p.Thr82Met
G/T 56982477 synonymous_variant p.Leu60Leu
A/T 56982485 missense_variant p.Ser58Thr
A/G,C 56982486 synonymous_variant p.Leu57Leu
G/T 56982544 missense_variant p.Ser38Tyr
G/A 56982546 synonymous_variant p.Pro37Pro
G/T 56982582 synonymous_variant p.Ser25Ser
T/C 56982588 synonymous_variant p.Ala23Ala
G/A 56982626 missense_variant p.Arg11Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22595.1
MAAAMECWSRRTTSDEDDAFLTAHSSQPRDSSSSSSPSSSLVHKKLLKLTRNVSEALSSLRNSLTTMNDSSKPDAPRNLVWTAVVRNLSHIYPGTHLPEKLVCNIRKHYDSLPLSYSQAGFDVKDVFLHMKLMEQALEDEQAAILIQEEGDGEIQLQGSLFKLTFACNSPISWPAMSRALDGYSICCKKIQIFEKKGFTLGIVLLLVLSSGQHDKLVRTQVENALKISMKRPKASGVKLPFGLCGCQEENTKGRGHGEIEEDGGDACCGNGFDNLSQKFQLQVPLPSSSFLVVVDEWQTIQSGGNDNEKWLLNSDRLEFAEQIGPNSYKGMYMGRKVGIEKLRGCDKGNSYEFELRKDLLALMTCGHRNIMQFFGVCVDDNYGLCVLTKLVEGGSVHDLMLKNKKLSSKDVVRIAVDVAEGMKFMNDHGVAYRDLNTQKIVLDKHGNAFLGDMGIVTACESVGEAMEYETDGYRWLAPEIIASDPESVTETWMSNAYSFGMIIWEMVTGEAAYSAYSPVQAAVGIAACGLRPEIPKDCPQTLKSLMIKCWNNTPSKRPNFSEILAILLRQNNYNR*


CDS Sequence:
>Vu_22595.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22595::LG5:56982656-56984656(-)
AAATGAAGATAAAATATTGAAACTCACCATTCCAACCTTTTTTATCCGATAATAAGTAGATTATTGAATAAATCACATGAAAAAATACATTTAGTTATACTTTGTAAATTGATTATCTAAAAATAACTATTGTGTATTATTTCTATACAATAGTTACAAAATTGGTTTTTTCACCAAACTAGGCATATTTGCCTTTAATATTACCAAAATGGACAGATTCAACCGAAATTACGAAAATGGGGAAATTGTGGGGGTCCAAACGACTTCAATTGAAAAAGTCGTGTCCCCTGCACGACTTCACACTGTTCATTTGACCAGTGTTGAAGTCGTGCACTCCAAAAACGACTTCGGGGTGCTGTAATCGATTACCAAACACTGTAATCGATTACCACAACTTTTTTTCGTTAAAAATAATAAAAGTATTGAAGTTGTACCGGGGGTCACGACTTTAATATGAGAAGTCGTACACCCTCCACACACTTTTATCTTTTTTTTTAATTTTTAATTTCTTTATTAATTAAAATGATTTATAATTAATAAATAATATTTTTAAATATATTTAAAATAATATAAATTATATCTAATTAATATTTAAAAATTATATTTCATTATAATTTAATTTTATGAATTTTAATTATTATATTATACCTTTTTCTGAATTATAATTAATTAATAAATTTTTTTATTATAAACTATTTAAAATAATAAAAAATTTTAAAAGTTGAAAACGTTTGGGGGTTCACCACTTCTTTACTTAAAGTCGTGCACCCCTTCACACTTTTATTTCTTTAGTTTTTTATTATTTAAAAAGATTTATAAGTTTTATATAATATATTTAAATGTATATAAAACATTTTAAATTATACATAATCAATAATTAAATTTTTTTAATATTATTAAATAAATATATTTTATGGTTTTATTTATTTTTGTAATTAAATTAATTTTTTATAAAAGATATTTCAATTAAATAATTTCTAACCATAATTATTGTGATTACATAAATAAAAATGTATAAACTTATTATATTTCATCATAAATTATTTTTTATTATAATTAATTATAAAAATAGTTAATTAATTAAATAGTTAATATTTAGTATTTTTATTAATTAAATAGTTTATAGTGAAAAAAATTATTAATTAATTATAATTTGTTAAAAGATATTCTACAATCATAAAAATTCAAAAAAATAAATTATAATAAAATATAATTATTTTTAAATTTTAATTACATAATTAAAATAATTATAGTTATAAATTATTTAACTAAAATTATTTTATAAAAAATTTAATTTAATTACAAAAATAATTAAAATTATAAAATTCATTTATTTAATAATATTAAAAAAATATAATTATTAATTAGATATAATTTTAATTATACTAAATACATTAAAAATATTATTTACAAATTATAAATGATTTTAATTAATAAAAATATTAGAAAATATAAAAAATAAGAATGAGAGGGGGTGCACGACTTCAATAAGAGAAGTCCCTTAATTTTTTATGAAAAATGACTTTGTAATCGATTACAAGTCTCTGGTAATCGATTACCATGTTCTAAAGTCGTTTTTGGGTTGCACGACTTCAACACTGAACAAATGAACAATGTGAAATCGTGTTGGGGGCACAACTCCTTCATTTGAAGTGGTTTTGGCCCCACGACTTCACTTTAGGTCAAAATTTGTCCATTTTAGTAATATTGAAAACATATTTACCTACTGATGCAAAAACCTACAAAATTATATATTTTTTGAAATTTTATTATTTTAATATTTTTAATATCATCCTTAAAAAATTATATCATCACCTTGATAAAGTAATGGAAATTCAAATGCTCTCTCTCTCTGCGGAACAATAGAAAAACAAAAAGCACAGGTATTTTCTTCTTCCTCCCTTTCCCACTGTAAGAACAAAAACATGGTCACTCTCACAGACTCCAAAGCGTGAACCTTCTGAATCCTCTTTCTCTCATCATTTTTCCTTCGAACTTCA


Gene Sequence:
>Vu_22595(-)
ATGGCTGCAGCGATGGAGTGCTGGTCGCGCCGCACCACCAGTGACGAGGACGACGCATTCCTCACCGCACATTCCTCGCAACCCCGAGACTCTTCTTCTTCGTCTTCCCCCTCTTCCTCTCTCGTCCACAAGAAGCTCCTCAAACTCACGCGCAACGTCTCCGAGGCTCTTTCCTCCCTCAGAAACTCCCTTACCACTATGAATGATTCTTCCAAACCCGACGCACCTCGCAACCTTGTGTGGACGGCCGTCGTGCGCAATCTCAGCCACATATACCCCGGGACCCATCTCCCTGAGAAGCTTGTCTGCAACATTCGCAAGCACTATGACTCCCTGCCTCTCAGGTTCGGATCCCAACCTCAGTTTGCTCGTTTGCATCGGTTGCAACTAATGGGTTTGTGAATGAATGTCAATGTGAAGAGTGAAGATTCAGTTGCACTTTTTTGGTGTGCTTAAGGTCACCTAGTACGGTGGCGTTTTTTTTTGGGACATGCATTAAATTAATGTTTTTGGCGCTATTCTTAAATCCGAACTGGAGTTTTATTTCGTAATAAAGGTTTTCATTGCATTAAAGATCAACTCAGATTACAGGGGTGAAACTTGTATTCTGGTGGGAGTACAACATGAAATACATTTATGAAGTGTTTGTAAGTTTTGTTCTTTTTTTCTTTTGGGAATGGGATTTACTTCTTTTTTAATTTTGGAAGCTCTAAAGTTTCCAACTTAGAGGTGATCCAGTATGAATGTGCGTGTTGATGCTAATTTCCTTGTTTTTAAGGTCACCTCAGTTGGACGCTCAACGATTTTATTTTTGTGTTTTTTCCTATGGGAGATGGGTTTTGCTTCTGCTGTGTTAGAAGTTGTGTTCTAATCTGAATGTGAATGCGGAGAAATTATTGTATGGTCGATCTCTATGTCACACCCCACCGAGGTTTTCTATTGATGAAAAAAATTTAATAATACTAGTTGACCATCATTTGGAAATTGATACTGTTGGTCTCAAATCATGTAATAATTTTCATGAATGTGAATCCGAAGGTTTAGTAGCACTGTGTTTGGCAATCACTTCCTTCGGTGATGGATTTTGCTCTTTTTTTTAATTATAAAATTCTAGAGTTTGTGTTATTTATTTATTTTGTTTTTGGCAGTTATTCTCAGGCAGGGTTTGATGTGAAAGATGTGTTTCTTCACATGAAGCTGATGGAGCAAGCTTTGGAAGATGAGCAGGCTGCGATTTTGATTCAAGAGGAGGGTGATGGTGAGATTCAACTTCAGGGGTCTTTGTTCAAGTTGACATTCGCTTGCAACTCTCCTATTTCATGGCCCGCAATGTCAAGAGCGTTGGATGGTTACTCCATTTGCTGCAAGAAGATTCAGATATTTGAGAAGAAAGGATTCACCCTTGGGATTGTGCTTCTTCTTGTACTGTCAAGTGGTCAGCATGATAAGTTGGTCAGGACCCAGGTTGAAAATGCTCTCAAGATATCCATGAAGAGGCCTAAAGCCAGCGGTGTGAAGCTTCCCTTTGGTCTTTGTGGATGTCAAGAAGAGAACACCAAAGGGAGAGGACATGGAGAGATCGAGGAAGATGGTGGTGATGCATGTTGTGGAAATGGGTTTGATAATTTGAGCCAAAAGTTTCAGCTTCAGGTGCCATTACCTAGTTCATCTTTTCTTGTAGTGGTAGATGAATGGCAGACTATTCAATCAGGTGGGAATGATAATGAAAAATGGTTGTTGAACTCAGATCGTCTTGAGTTTGCAGAACAGATTGGGCCCAATTCGTATAAGGGGATGTACATGGGAAGAAAAGTTGGCATCGAGAAGCTTAGAGGGTGTGATAAAGGGAACTCTTACGAGTTTGAGCTCAGGAAAGACCTGCTGGCATTGATGACCTGTGGTCATAGAAATATTATGCAATTTTTTGGTGTTTGTGTGGATGACAACTATGGGTTATGTGTATTGACAAAACTTGTGGAAGGTGGATCTGTTCACGACTTAATGTTAAAGAATAAGAAGCTTTCGAGCAAGGATGTTGTAAGAATTGCAGTTGATGTGGCTGAGGGGATGAAGTTTATGAATGATCACGGTGTTGCATACAGAGACCTTAATACGCAGAAGATTGTTTTGGATAAGCATGGGAATGCTTTCTTGGGTGATATGGGTATTGTCACTGCTTGCGAGAGTGTTGGAGAGGCAATGGAGTATGAAACTGATGGTTATCGGTGGCTAGCACCAGAGGTTTGTCCCTATCAAACTCCTTTCAAGTTAGAAATGTAATCACTAAAATTATGAAAAATATGTCAGGTCATTAGGCTGCATAATGTTTTCGAATTCTGTATTTGCATCAAATTTAGGAAATGTGTTTTTGGCTTTTAAGTTGTTGATCCAGATCATGCTTTAACATGTCATGATTTGTTTTTAAATAACTCTCTTACTCTAGCACTGTGTATAGAAATCAGATTTAGTTGTAAGATTCAATTGTAACCAGCATTTCAAAGAAAAATAATTTTTGTGGTTGCAATGTCTGATAGCAGCTTTTCTTAATATATGTTAGTATCATCTTTTATGTGTCTGAGGTTGGATCAAGTTGTTATGTGATTTTTTTTTCTCTTTTTAACACCATAGCTGGTTGTTTTGTTTATTGTCATTTAAGCTTGTTTAAACTAAAGTTCTAATTCATGTGTTTGAGCTCATCTATAGCAGCATAAAGTAACAATCTGTTAGATTTATTGCTTGGAGGATGTTATTTAGGTCCATTGTATGTAAAATGCAATGCTGAACTAGACATCTAAAAACAAGATTTCATGTCACTTGTCTTGGCATCATTGTTTGAGCATGCTTAACATGGCTTAATAATTGTTGTGTACTTTCACTTTATATAGTGTATGCCATTGTTTAAACACCACTGTATATCATTAGACAAATCAGCATTGTGCTGTGTAATGCCAATTGTACCTTGATTGATTTCAAATGGAGCCCACACACCTTAAACCGTAAGCATGATCTGTCCCCCTATTGTACTTATTTTTATCCAATCGATAAGGCTGCTTGGAGCCTTTCAAGCCTTGTGTTCGGAAAGAAAATAATGAATGAAAACTATTGATTAAAATCGTTCTTTCAATGAGAAAATAACATTCTAAAGGTAAGGCTTCAATAAGAAATAAATAAAGTTCATGCACCTTGGCTTTGTCTGATTGTGATAGTGTATGAATTTTACTAAATTATTTTGTATAAATGAGAGATAACATATATGGATTTTTGTGCCCTCTTTTTTGTTGAAACAGATAATTGCTAGTGATCCAGAGAGTGTAACAGAGACATGGATGAGTAATGCTTATAGTTTTGGAATGATTATTTGGGAGATGGTAACTGGTGAGGCGGCATATTCTGCATATTCACCCGTGCAAGCAGCAGTTGGCATTGCTGCTTGTGGCCTAAGACCTGAAATCCCCAAGGACTGCCCTCAAACTCTAAAGTCTCTCATGATAAAGTGCTGGAACAACACCCCTTCAAAACGCCCTAACTTCTCTGAAATTTTGGCCATATTGCTACGACAAAACAACTACAATAGGTAA