Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22591 LG5 56946410 56951588 PREDICTED: LRR repeats and ubiquitin-like domain-containing protein At2g30105
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 56946491 5_prime_UTR_variant
A/G 56946563 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 56946669 missense_variant p.Val31Ile
G/A 56946775 intron_variant
A/G 56946791 intron_variant
C/T 56946957 intron_variant
G/C 56946960 intron_variant
A/T 56947403 intron_variant
G/C 56947726 missense_variant p.Lys113Asn
G/C 56947795 missense_variant p.Lys136Asn
C/A 56947836 downstream_gene_variant
G/T 56947845 downstream_gene_variant
G/C 56948248 downstream_gene_variant
A/C 56948432 downstream_gene_variant
C/T 56948483 downstream_gene_variant
C/G 56948510 downstream_gene_variant
A/G 56948589 downstream_gene_variant
A/T 56948609 downstream_gene_variant
T/G 56948649 downstream_gene_variant
T/A 56948805 downstream_gene_variant
T/G 56948806 downstream_gene_variant
G/C 56949504 downstream_gene_variant
A/G 56949554 downstream_gene_variant
T/A 56949651 downstream_gene_variant
T/A 56949655 downstream_gene_variant
A/C 56949808 downstream_gene_variant
A/G 56949880 splice_region_variant&intron_variant
A/G 56950036 downstream_gene_variant
G/C 56950285 splice_acceptor_variant&intron_variant
T/C 56950292 synonymous_variant p.Ser257Ser
A/C 56950296 missense_variant p.Ile259Leu
G/A 56950471 downstream_gene_variant
T/C 56951151 downstream_gene_variant
A/G 56951406 3_prime_UTR_variant
T/G 56951528 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22591.1
MEPDSIATTITVNVKFNGVNIPVSISPNSTVKDLKSLLLPSTNVLPRGQKLIFKGKVLEDPVTLTASNLTNGSKLMLVASQGLYQGDGPILKKAHVVPKSRKDSRSGSSNDVKKIPIKNRMERWKATGVVALSESKLEAIPEEVWVCGSSARVLDCKTNSIKSVPVEIARLTSLEKLFMDSNEIEDESIKWEGLTTLKHITVLTLNYNNLTTLPSALGSLTSLKELHVSNNKLGGFPDEIEHLTKLEVLQANNNRISIISDTIGNCHSLVEVDFSSNFLSELPETFSSLNNLKALYLSNNAMKSLPSKLFKTCFQLSTLDLHNTEITIDLLRQFEGWDNFDERRRSKHQKQIDFRVGVSRDFDEGADKN*


CDS Sequence:
>Vu_22591.1
ATGGAACCTGATTCGATTGCCACCACCATAACCGTAAACGTCAAGTTCAATGGCGTCAACATACCGGTCTCAATTTCACCCAACTCTACCGTCAAAGACCTCAAGTCCCTTCTTCTACCTTCTACCAATGTCCTCCCTCGGGGCCAGAAACTCATCTTCAAAGGTAAGGTTTTGGAAGACCCCGTGACTTTGACTGCATCCAACTTGACTAATGGATCCAAACTCATGCTTGTGGCTTCTCAAGGTTTATATCAAGGGGATGGACCCATCTTGAAGAAAGCTCATGTTGTTCCCAAATCGAGGAAAGATAGTCGCTCAGGCTCTAGCAATGACGTGAAGAAAATTCCTATTAAGAACAGGATGGAACGGTGGAAAGCAACCGGAGTTGTAGCATTATCTGAAAGCAAGTTAGAGGCCATACCTGAAGAAGTGTGGGTTTGTGGATCTTCTGCAAGAGTTCTAGATTGCAAAACCAATTCAATCAAAAGTGTCCCTGTCGAAATTGCACGTCTTACAAGTCTAGAGAAACTATTCATGGATTCAAATGAGATAGAGGATGAATCAATTAAGTGGGAAGGACTAACAACTCTGAAGCACATAACTGTATTAACATTGAACTATAACAATTTAACTACTTTGCCGTCTGCACTTGGGTCACTTACCTCTTTGAAGGAGCTGCATGTTTCCAATAATAAATTGGGTGGCTTTCCTGATGAAATAGAGCATCTGACTAAATTAGAAGTCTTGCAAGCCAACAACAATAGGATAAGTATCATCAGTGACACTATTGGGAACTGCCATTCTCTTGTTGAGGTTGATTTCTCATCAAATTTTCTGTCAGAATTGCCAGAGACATTTAGTAGTTTGAACAATTTGAAGGCACTGTACCTCAGTAACAATGCCATGAAATCTCTTCCATCAAAACTATTCAAGACCTGTTTTCAACTCTCCACATTGGATCTCCACAACACAGAAATAACAATTGATCTCCTTCGCCAGTTTGAAGGGTGGGACAATTTTGACGAGCGCCGGCGTTCAAAGCATCAAAAACAAATTGATTTCAGAGTTGGAGTCTCCAGAGATTTTGATGAAGGTGCTGATAAGAACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_22591::LG5:56944410-56946410(+)
ATGATCCAATTATATTTGATAGACCAAAATTACCTAATTATATTTTTTATTATATAAAATAAATATTTATTTTTCATACTTAAAATTCTATAAATAATCTTGTTTGAATATATAAAGTATATATTGAATTTAAATTATGATATAATATTTCATTTTTTTAGAAGTTCTAATCTTCGACAACAATTCCATTTTTCCACATACACTGTTTCACACCTATAATAATCCAGATTTCTTCTGCCAAAAATTAAACAAATAATTAATTTGGCCCAAAATATAAACAATAAAAAGATAATGTAAAAAATAGAAATTCAAAGAAAACTCATGTTGAAAGACAAAGGAATAGAAAACTCCAATAATTTAAGTGACTACTAATTAAATTCTTTCAATTTACTTTATACTTTGCAAAAAAAATTGTCATGAGAATTATTTTATATCATTAGCAAAGCAAATAGAAAAATGCATTTGTACAAGCCAAATTAAGACTAGAAATCATCTAATATATATTAGAGATCTTTATTTGAATTATAACTTATCATTTACTATAAAAAAATGTATTTATAGAAAATAATTATATCTATCATCCATGAAACTCATATTGTAATGAATATAAATAATTTTTATTAATTTTATAAATAATTGTTTGTTATAAATAATTAAATAAATAATAACATTTAATTTACAAAATATTACCAATAGAATAAAATTAATAAGATAATTATTTTAATTAAAATAAATATTTAATAAGATAATCACTTTTAAGCTAATTTAATTTATGAAAAATAATTATTTTTACTTCTCTATTTTATAGGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGTATTTACATTAGTCAAATAACATACCACCAATAGAACATGTTGTATGAGTAGTTTAGAAATAAGGAAAAATGTAAGAATAAACTGTTGAAAATTATTAATAAAAGTTGTTAGATATTAAATGAATTGTTTATAATTAATTAACATATTTATTGACTGACTGTTTATAAGATTAAAATGTAAATTTCTAATATTAATTTTTTATTTCAGCAAGTTTAATTTACATAAAACCTCATATTTTATCTTTCTAATGCGGTTATTTGATCAATTTGATTCATAAATATTTAATATATAATATATATAATATAATATATATGGGAGAGAGCAAAATTATAATAATATATATATATATATATATATATTATATTGTTTCTAGAATTTAATTAAAGTTTTGCGGTGAGACTAAACCCACTTTAACCCTGACCTTAACCCATTTGAGAAGGAGTTTTGGGAGTTGAGATTTTTTTTTGACCCCTATTTCAAAGACTTCTTAAAATATGACTTTTTCGGTTGGGGCTAAACAAGTCATGAATTAAATTGACACCTCTAAATAAAATTATACTTATTTCAACTAAATCTCCTAGAAGTTTTGTTTAGCACATAAATCTCCAACATGCTCATGAAAAATACTGATTAATGAAAATAAAAGTACCACTACAATTTTTTACTAGCAGACATTCACATCTGTCCACCAACTTAGTTTATTTATTTATTTTTAAAAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAACTATTGGCCGTTTCTGGTTTTCGTCCCTCTTTTAAAGTAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTATCGAAAAATTCGTTTTAGTCCTCGGAATTTTGGTTTTAGTCCTCATTTGTTGCTAAATGAGGACCTACCTTACTTTGAAACAGGGACGAAAACCAGAAACTGCCAACAGTTTAGGGACTAAAAACATATTTAACCCTTTTTAAAAATATTAAAAGCATCATTTCAACTTGTTTTTGTGAAATTGAAACAGTATATTAAATTAGTATTTATTTCTTTTAAAAGTCATATTTTAAAGAAAAAATTATACTATTTTCTAAAAAAGTAAGACTTACGACCAATATAAAATCCTAACATTTCTTCAATCATTTTTA


Gene Sequence:
>Vu_22591(+)
ACCTGTGAAACGCTTGAAAAACAGTTACTCACTGCAGAATCTATCGTCATTTGAATCACTCCTTCAAAATCCAACAAAATCGTATAATTTGTGAAACTATGATGCTCTTTAACTTCCTTCGTAGTACACGCTCTTCGTCTTGAAAACACTCATAGCAGGAATCGGTGAAATGGAACCTGATTCGATTGCCACCACCATAACCGTAAACGTCAAGTTCAATGGCGTCAACATACCGGTCTCAATTTCACCCAACTCTACCGTCAAAGACCTCAAGTCCCTTCTTCTACCTTCTACCAATGTCCTCCCTCGGGGCCAGAAACTCATCTTCAAAGGTTTCAGCTTTTGCCCCTTTCTCTTTTTCATTCGACACCCTTATGAAAGAACCCCCACCCCTTTTGAATTCGTGTGTGAATCAAATTAAAGAATGATCTTACAGGTAAGGTTTTGGAAGACCCCGTGACTTTGACTGCATCCAACTTGACTAATGGATCCAAACTCATGCTTGTGGCTTCTCAAGGTTTATATCAAGGGGTATTGTATATTGCTTCATGAATCTCTTTCTCTGTTCTGGGTTTTGTCAGCTACGGAGATAGTGTTCAATAAAATTAGTTTTTATTTTCTATCAGTGAATTTAAAATGCATACATTTTACATGAGAAATGCTAGCAACATAGTCCCTAAAAAACACTTTTGGAGAGACTCTTAGGAAATTTATTGCAATTAATGAACCCCACTTATATTCTTTTAGTTTTCAATAAATTTTAACCAACAGTGAAGAATTTGTTAGAGAATGTATCATGGTGTATGGTAAGATTGTTGGCTTTTTAAATTGGCAAACTGTGTAAAAATCTTAACATGGTGCATGAAAATTAAAATCAAAATCTTAAGTAAAAAAATCTACTTTATTGAAGCATGACGGGTCGTTAACTCTGCTGTATGATACTATGATTTCATCATTAAGTTAAATTGTGGTTTTATGGTTATTGGGTAACCCAAAGGAAAATGTTTTATACGAATGCCTTGCCAAAATTGGTATAGACAAACTAGATGGATCCTTTCGAATAGGAGATGAATGGAGCTACTTAGAATGGATATTATACAATCAGACAAGTTTGATGAGGTTTATCATGCTTCTCATTGAAAATAAAAATTATGTTTAAAGATGTGCTTGTGTAGAGTTTGCTTGTTTCTATGGCAAACAGAAAAATGTAGCTTGAAGATTTTGATTCTTTTACAGGATGGACCCATCTTGAAGAAAGCTCATGTTGTTCCCAAATCGAGGAAAGATAGTCGCTCAGGCTCTAGCAATGACGTGAAGAAAATTCCTATTAAGAACAGGATGGAACGGTGGAAAGCAACCGGAGTTGTAGCATTATCTGAAAGCAAGTTAGAGGTAATAATATTTTTTTCTTATATTCAACTAGACGCTTGGTTTTGTGTCAAATGGAAAATTAGAGATGAGGAACGTGGTAAATTTTATTCATGGCACGATATGAAAGTATCCACTTTTGTCTTCTTTTTTTCATGCCATATGTGCATATGGAATCTATTTTGTAGTTCACATGTTAGGAATGTGTAGGTCGAGCCAGGCTATAACATCATTTACAAAACAATCCATCAAATCATTACAATTCAAAGCAGATTTCTTTTTCAAGTATAAGAAAGTTCTTGGTGGAAGGGAAGTTTTCATTCCAAGGTTAAGGCATGTCACAATACTAAGAGTTTGGAATGACGGTTATGACAAAAGAGTGAACCCAAGACCTTTGCATCAATGCTGTTTGATCCTAGCAATTTGGCCAACTGCTGTTGTCTAATTCATAATTCATGGTAGTTTCATATGATTGTGTATAAGTAGGTTTTTGGTGCGGAGCAAGATGGATCACTGATTATTATGGTTAAAATTAAAATAATTTTTTTGTTTTGTCTTTTTTGTCCATGTAATTGTTGGTTGTCCATGTCCAGACCAGAAGAACTTCATACTGTCTTGTTCATCTTTTTTGTCTCTTCTGTCCATTATTTAACCATAAAATCTTATTGAACAACCACACATGTGGTATGTGGTTATACCACAAAACAAATCATACAGGAAAAGGAGATTCCGCACATTACCTCTCTGAAGACAATATGCCAGAATAAATCACTGATTTCATGTTCATATCTGATGTGACTCTCAATTTTATATCAAATACCTGCTGAGGTCAATATTTTTTATAAGCAAATAATTGGAGTTCCAACTCTAGTTACTCATTTTGGATTAGGCATAGCGCTAGACAACATCATAGAACTTGGTTGAAGCTACATATGCAACTCTGCACATTATACTTATTAAATTGTTATTAGCTGTGTAATACACGTGTTTTAGTGGAAGGATAGGCTCCAGTATCGCTGTTCACTTCTTTCTTGTAAAACCTATCATAACCTAAGCAACTTAGTGTGCCAACAAGAACATGTCAAGTTTGGGTTACAAAATAGGGAATTCTAACAGCTCAAGTTCTAGGCTTGAAATCATTATAGAAATTATTGCTGAAAATCCAATAATAATGGTGACTGGTCCTTTATTGTTAAACGTAGCCTACATTAGTTAGTTCTGATAGCATGCTCTGTGCCTTGGTGAATCTAGAAAGGAAGTATTTAAACAGCCAATGGAAACAGAAATCAATGGAAAATAAAATAAATTTTGGTAATATGTAATTATTATCAGTTTCGGAAACACTCATTTTTTCTAGAAATTTTTATTTAAATAGGCCATACCTGAAGAAGTGTGGGTTTGTGGATCTTCTGCAAGAGTTCTAGATTGCAAAACCAATTCAATCAAAAGTGTCCCTGTCGAAATTGCACGTCTTACAAGTCTAGAGGTAAGCTGAATGTCTCTATAGGTTTAGTTTCTGCTACATCAAGTTGTTTTCATTGAGCAATAATTAACACTGCTTGCTTTTTTTAAAACACTGCAGAAACTATTCATGGATTCAAATGAGATAGAGGATGAATCAATTAAGTGGGAAGGACTAACAACTCTGAAGCACATAACTGTATTAACATTGAACTATAACAAGTGAGCAGATGTTATCATTTGTAATTTCAATGTGTGCCTGCTTGGATTTAGTTGCATAAAACAACAAATGAATTTATATAAATATTTCTTTCAATATGGATTTTTGTTAGTCCCTCTAAACCATCATAATTTCAATAGTTGGTTCCCGGCCCAAAGATAATGGGATGCAGTAATTATATTTCTTGTTTGTTTCCTAGCATATTGCTTGTTGAGTTTAATGTAAAAGGCCAAAGGTTACTTGCTTACTAACCATTATTTCAGGTTATTCTGGTTTAATGTTAAATCTATAAAACAAATTCTTTGCATATTTGAAAGAATGACTTCAAAGTTTTAACTAACCTTAGCTTATTGGTCTTTGTATTGAAAGTTGATCAAGAAGGTTGTTTCTTCACGTAATTTGGTTGTTTAACATGATTTCTATGCAGTTTAACTACTTTGCCGTCTGCACTTGGGTCACTTACCTCTTTGAAGGAGCTGCATGTTTCCAATAATAAATTGGGTGGCTTTCCTGATGAAATAGAGCATCTGACTAAATTAGAAGTCTTGCAAGCCAACAACAATAGGTATTATTTAAAATTTAGTACTTGATTAAGTATGAATATATTATTGCAACACATTGTAAGTTTGGTCAAATCACTAAAACCCTGTTTAAGGATTGTCCTGCACTTGGCTCGTTTACTACTTAGGTAGTTGAGTTTACTACTTAGCTGAACAAACCAGTTTATTCAAAATCCATCTACTTCTTGCAGTAATTACCACTAACAAATTGCTAACTGATGTTGATTAAAAAGTTGTTATTTTTATTGATGTGTATCATCTTCTCAGGATAAGTATCATCAGTGACACTATTGGGAACTGCCATTCTCTTGTTGAGGTACAATTGCTGGTCTTCTTCTATCCTTTCCTTTCTCTCATCTTTGTTTTCCTTTTTCAGATGGGACTTCCCAATTGAGACAGGATTGAAAAATTAAAACGCCACTGAAAATAATCATTTTTCTTCGATAATTTATGCTCTTAAATATATATGCAACTTTTCTTGTGACGTAGGTTGATTTCTCATCAAATTTTCTGTCAGAATTGCCAGAGACATTTAGTAGTTTGAACAATTTGAAGGTACCCTTTTCTGACCCATCTTATCTAACATGAAAAGAAAATGTAATGTGGGTTTGTTTCCCATCACAAGTTATTTATTAACTATTTGGTATGTTATCTTTAAATGGTTTTGAAGTTTAAGAACTGTAACTATATACTGTTGCAATTTCACTCCTCTACCTTAGTACTACATGAGGACTACTTCACATTGATGTATCATTTTAAACACTATCACTTTAATCCTATGTTTTTTGGATGTTGGACTAATCTGATTGTAGATTTACACATTCAAGTATTTGTTTGAACTTTTTTAAATTCAGAGACTAATGTGACAGTTTCAAATTCAGGGGCCAAAGTGAGCATTTACTCAATATATTAATCTTCCATACTTGGTCACTCATGTCTTGGTAAAAATGGATATAACTTTTCCTACTCATTACTCCATTTCTCTGTGAATTATGCAGGCACTGTACCTCAGTAACAATGCCATGAAATCTCTTCCATCAAAACTATTCAAGACCTGTTTTCAACTCTCCACATTGGATCTCCACAACACAGAAATAACAATTGATCTCCTTCGCCAGGTGTGCACATTTTTTTTTCGTCAGAAGGGTTGGTTTATCATGGTTATGTCAGTTCAACTGAACATGTAATTTCTAAGAAACAAACTGTTACATGACAGTCAAATATGCATTGATTGATTTATTGCAGTTTGAAGGGTGGGACAATTTTGACGAGCGCCGGCGTTCAAAGCATCAAAAACAAATTGATTTCAGAGTTGGAGTCTCCAGAGATTTTGATGAAGGTGCTGATAAGAACTAAAATTATTTGTTATAAATAATGCTGTTCATTCAGAT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