Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22585 LG5 56874118 56875233 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108341493
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 56874157 missense_variant p.Gln187Glu
G/T 56874294 downstream_gene_variant
T/C 56874373 synonymous_variant p.Lys160Lys
T/C 56874383 missense_variant p.Tyr157Cys
A/G 56874399 missense_variant p.Trp152Arg
T/C 56874456 missense_variant p.Arg133Gly
T/A 56874694 missense_variant p.Glu93Asp
A/C 56874770 downstream_gene_variant
G/A 56874827 downstream_gene_variant
T/A 56875123 synonymous_variant p.Pro37Pro
T/C 56875144 synonymous_variant p.Val30Val
T/C 56875192 synonymous_variant p.Gln14Gln
T/C 56875204 synonymous_variant p.Gly10Gly
C/T 56875206 missense_variant p.Gly10Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22585.1
MEQSEGRGKGKKVQDSSSNAEQSQAEMGSVGQNIMDPQLRRLFSNRISAQRSRQKKVKLVEELENRAKMLQDQVAQLQSIQARQQSRMHSLMVEEQTLFHEMEYLEKKAMLRDGKVVSSLESEDEKNRKKKSRLEKLRDIKQQQLLNLHDPFAGLSIDTSSNQGDGARSSSRQELDIAAAVDEIMDQTNLSMATARNPNP*


CDS Sequence:
>Vu_22585.1
ATGGAGCAAAGTGAAGGGAGAGGAAAGGGAAAGAAGGTTCAAGATTCTTCTTCAAATGCTGAACAATCCCAGGCTGAAATGGGTTCTGTAGGACAAAACATCATGGATCCACAACTAAGGAGATTATTCTCAAACAGAATTTCTGCCCAAAGATCAAGACAGAAGAAGGTGAAGTTAGTTGAGGAGTTGGAAAACCGTGCCAAAATGTTGCAGGATCAAGTAGCCCAACTTCAATCAATACAGGCTCGCCAACAAAGCCGAATGCACAGTTTAATGGTAGAAGAGCAGACATTGTTCCATGAAATGGAATATCTTGAGAAAAAGGCAATGCTCAGAGATGGTAAAGTTGTTTCATCTTTGGAATCTGAAGATGAGAAGAACAGGAAAAAAAAGAGTAGGCTAGAGAAACTTCGAGATATTAAGCAACAGCAATTGCTTAATCTGCATGATCCTTTTGCTGGATTGTCCATTGATACATCCTCAAATCAAGGAGATGGAGCACGGTCTTCATCAAGGCAAGAGCTGGACATAGCTGCTGCGGTGGATGAAATTATGGATCAGACCAATCTTTCAATGGCAACTGCTCGCAATCCCAATCCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_22585::LG5:56875233-56877233(-)
AAGTTGAAAATTCATTCACTTTATCTTAGCGCGAGACTCTCTTCTCTACTCAAACTTTTCTCAAACGAAGCTTGGCGATCAACACATGCAATTTTTCTTTCATTTGATACAAATGCATGTTGCTTAACTACTTTAGGTATGATTTTTGTTTGTTTTGACCGATTGTTTCCAATTTCCATGTTCTTGTCTTTCATAGACACTTTCTGCTTTCTCTCGCTGATGACAACACTTTATTCCGACGAACTCACTTTTTTGAAGGTTAGTTTTTGTTTTCAATAACTTGTTGTTGTTGTTGTTTGTGTTTGTTGTTTATAGTGAACTACACGTTATACATCTAAACTTTATGGTATAAATGAGAGTATATTGAAAACAACTCCAAGTGACCTGGAAATTTGTGCAAAAAAAATATCATGTGAAGCCCCACAAAAAATTTTAGATCAAAATTCAAAGTCTAACTATTTTAAATATTTTTGCAAAGTTTGAAAAAAAACAAAATAAATTTCCAAAAAAATAGAAAACAACGTTTTTTGGAGAATCTAGAAGGATTAGCTGGCTATGCCAGCTATCACGTTATCAGAAAGTTTTTTCTACCCCAAATCCATATATAATAATAGCAAATCGGACAACCGGAGCAAATGTTATGGTCGTTTAAAGGTCTAGCCATGTTCACCTTCCAAATAATTGTTATACTTCACACAAACCTAAAGTAAGAGCTCTCGGTGTTTTTTCCTGAACTAGGGATTCTAAAGGAGTGGTAAAAAAAGATTCAACCAAAATCAATAACCATAATTATCAAAACAAAAAATAACAAGTTAATACTACTATTATTATTGTCACTTTTTGTTTTTGTTTATAGTTCATATGTCGTATAAAATATCAAAAACTGGATTACATATGTTGTTTTTCTATTTTTTAATCTCGCAGAGTTGTAAAAAATCATAAAAAATCACAATTAATTGAAAAAAGAAAAAAGTTTATTAATGTCGGACAATAGAAAAATTCAACATTAATTGACGTCGGACATAAAGAGATATCCGACGTCAATTTGTTCTATTGGGGATTGGATTGTTCTATGTCCAACGTCAATGGACGTCGATCTCGAATTCGACGTAAAATGTCGAAAACATCGACGTTATATGGTGTTTTTGTACTAGTGATTTTGTTATAAAATTGTTATATGGTGTTTTTTTACTAGTGATTTTGTTATAAAATTATTAGAAAAATAATGTAATAAACAATGAAAACGTTAAAATATATATAATATTAAATTTAGTAGAAAATATTTGAAATCCAAAGATGAAAAAGAGAAAGATATACAACAAGCAATAAAGATAAACAAAAGGTTAATATTTAATATCTTATGCGTTTTCTAAAATCATTTTCTTATATAATCTATGTCCAATAGAGGTTTTTTCCTCTTCTAAACAAAAGTGTTGCATGTCAAGAGAATGAAAGCCATAACATCAATATGGTAGTTTTAAAAAAGGAAAATGGTTAATGAACATAAAAAAGGTGCATCAACACTTAATATACACTTAGAGAAGAGAGTAAAAACAAATAATAAGTTTGTAGGTATATGATGTGATAAGGAAAAAAAATGCATGATAGATGTAGATTAAATGAAAGTAAATGTATATCTTTGCTCTAATAAAAAAATGGTGTATATGTGCTGGCATGTGATTTGAAAGCTTTGGTATCATAATTTGGCCACAACATACTAATGATGAAGGCTTAATGCCAAGGAGCAGTTTCCATACGAGGGAAGTTCTTCTCCTGTGCATGCTTGAGGAGACAGCTACACTAATTTGACCAGCGCAGACTAATTTGTTGTCTTGTTGAAAACAGTACCTTAATTTCTGTCTCACATGAGTACCAAGCCAACTTCGCATAAACATCATCAATATATATATTAAGGATGCTACAGAAATTTTATTCCACCTGATTACCTCCTTCTACCTTTAACCAAAGCCATTTTGCATTAGCAATCTATCATTTTCTGG


Gene Sequence:
>Vu_22585(-)
ATGGAGCAAAGTGAAGGGAGAGGAAAGGGAAAGAAGGTTCAAGATTCTTCTTCAAATGCTGAACAATCCCAGGCTGAAATGGGTTCTGTAGGACAAAACATCATGGATCCACAACTAAGGAGGTAAGCTATTTTATCTGAACTTTTAGTGATAGTACAATGGAATTTTTGTTAACATACCTGTCTTTAAGTAATTTCCTTGCAGATTATTCTCAAACAGAATTTCTGCCCAAAGATCAAGACAGAAGAAGGTGAAGTTAGTTGAGGAGTTGGAAAACCGTGCCAAAATGTTGCAGGTGAATATTCTTGTTAATTTTTTTAAAAATGAATGTAATGGAAAATGTTCGTATATGTTTTTTAGAGTTAACTATGTTCATATCTATGTTTACTTCTGAGTTAACTATGTTCAAACATGGCTGACCAGTTTCAAACATTTCTGTGCGATTATCACATTATACGGATTCTTATGCAGGATCAAGTAGCCCAACTTCAATCAATACAGGCTCGCCAACAAAGCCGAATGCACAGTTTAATGGTAGAAGAGCAGACATTGTTCCATGAAATGGAATATCTTGAGAAAAAGGCAATGCTCAGAGATGGTAAAGTTGTTTCATCTTTGGAATGTGCTTATGTTTGCGTGTTTCTGCATATATACCGAAAAAATAAAGCTGTTTTATTACGCCAATTGGCAAAACATTAGTGGAGATAGTGTCACTAATTTTTGAGGCATTGTCCTTTTAGCTGAAGATGAGAAGAACAGGAAAAAAAAGAGTAGGCTAGAGAAACTTCGAGATATTAAGCAACAGCAATTGCTTAATCTGCATGATCCTTTTGCTGGATTGTCCATTGATACATCCTCAAATCAAGGTAGCAAAACATAAAACCTTGTGTACTAATTATCACTTCATTTTAACTGCGTGAAAAACTACTGTTAATGACACATTTGCTGAAAATATATAAACTGATGTAAAAACTTAAAATCACAGTTTTAATAATTTTTGTAGGAGATGGAGCACGGTCTTCATCAAGGCAAGAGCTGGACATAGCTGCTGCGGTGGATGAAATTATGGATCAGACCAATCTTTCAATGGCAACTGCTCGCAATCCCAATCCTTAA