Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22546 LG5 56388834 56391233 PREDICTED: putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 56388846 synonymous_variant p.Ala796Ala
T/A 56389036 missense_variant p.Asp733Val
C/A 56389038 missense_variant p.Leu732Phe
C/T 56389041 synonymous_variant p.Val731Val
A/G 56389044 synonymous_variant p.Ser730Ser
A/T 56389421 missense_variant p.Leu605Met
A/G 56390046 synonymous_variant p.Gly396Gly
T/C 56390340 synonymous_variant p.Val298Val
A/G 56390363 synonymous_variant p.Leu291Leu
T/C 56390624 missense_variant p.Ile204Val
A/G 56390688 synonymous_variant p.Asp182Asp
C/T,* 56390704 missense_variant p.Gly177Asp
C/T 56390772 synonymous_variant p.Arg154Arg
A/C 56390790 synonymous_variant p.Ser148Ser
C/T 56390894 missense_variant p.Ala114Thr
G/T 56391021 synonymous_variant p.Ile71Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22546.1
MTPPFTLSLSLFAVFSITAVHGLGSAATVAVTYGTATVCGIVAGELHHRIQCSRDGRRVPLTLPNSSFDAISGGRSFFCGLRSGGRSLHCWDTAAADGSLCPKRVFHSDVVQLADVAVGDSQVCAREVQSGVVRCWRGNKRVEFSSPSESLRFRSVTCGRGFSCGILRESGRVVCWGGGGGDEGAYISGEIQRKFENFSMSSLIAGVSHACGLTLHGALVCGGNNRSGQLGNSAFLSSLDFSALALGEGFTCGIRRRNGIVVCWGGGFDSDVVKGVSFESLVAGLDYVCGLMTGNLSVVCWGGKGGFDVANEIPLGEILPAPCVEGGCGSSCSTYPDSDALCHGSGSICYDCQTEVPLAVPLFPPPSSQVPSSHEGRNLKEFLVFLVVGSVGAFAGLCTIVYFLWFSAKRVLVRREVSNSSVKPTSSESDAYVDIIPMPNVGSNGTTFRTFSSKSHGSRRLRRHRSGSSSKHVDRTESFSLRELATATDNFSLYNKIGAGSFGSVYKGILGDGREVAIKRGDTSTVKKKFQEKEIAFDSELAMLSRLHHKHLVRLIGFCEENDERLLVYEYMSNGSLYDHLHDKNNTEKSSSILNSWKMRIKVALGAARGIEYIHNYAVPPIIHRDIKSSNILLDSNWNARVSDFGLSLIWLESEQELMSTKAVGTVGYIDPEYYVLNVLTTKSDVYGLGVVMLELLTGKRAVFKTEDGSSPIGVVEHTGPKIASGELWSVLDYRVGQPEVNEVESLEIMAYTAMHCVNMEGKERPEMTDIVANLERALAFIEGSPTSISLASFSAPLE*


CDS Sequence:
>Vu_22546.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22546::LG5:56391233-56393233(-)
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Gene Sequence:
>Vu_22546(-)
ATGACACCACCCTTCACTCTCTCCCTCTCCCTCTTCGCCGTTTTCTCTATAACCGCCGTGCACGGCCTCGGCTCCGCCGCCACCGTCGCCGTCACATACGGCACCGCCACCGTCTGCGGTATCGTCGCCGGGGAGCTCCACCACCGCATTCAGTGCTCCAGGGACGGAAGGCGCGTCCCTCTCACACTCCCCAACTCCTCCTTCGATGCCATCTCTGGCGGCAGGAGCTTCTTCTGCGGCCTGCGCTCCGGCGGCCGGAGCCTCCACTGCTGGGACACTGCCGCCGCAGACGGTTCGCTCTGCCCCAAGAGGGTCTTCCACAGCGACGTGGTGCAGCTGGCCGACGTGGCAGTTGGTGATTCCCAGGTGTGCGCGAGGGAGGTGCAATCCGGTGTGGTGAGGTGCTGGAGAGGAAACAAGAGGGTCGAATTTTCTTCTCCCTCTGAGAGCTTAAGGTTTCGGAGTGTCACATGTGGTCGTGGTTTTTCATGTGGGATATTGAGAGAGAGCGGGAGGGTTGTGTGTTGGGGTGGTGGTGGTGGTGATGAGGGTGCATATATCAGTGGTGAGATTCAAAGAAAGTTTGAGAATTTTTCTATGTCGAGTTTGATTGCTGGGGTGTCTCATGCATGTGGTTTGACTCTTCACGGGGCTTTGGTTTGTGGAGGGAACAATCGTTCAGGTCAACTTGGAAACAGTGCTTTTTTAAGTTCTTTGGATTTTTCGGCTCTTGCTTTGGGAGAGGGTTTCACGTGTGGTATTAGGCGGAGGAATGGGATTGTTGTGTGTTGGGGTGGTGGTTTTGATAGTGATGTGGTGAAGGGTGTTTCTTTTGAGTCTCTTGTTGCTGGTTTGGATTATGTTTGTGGGTTGATGACTGGGAATTTGTCTGTAGTTTGTTGGGGTGGTAAGGGTGGGTTTGATGTGGCTAATGAGATTCCATTGGGAGAGATTCTCCCGGCTCCTTGTGTGGAGGGTGGATGTGGTAGCTCTTGTAGTACATATCCTGATTCTGATGCTCTTTGTCATGGGTCTGGGAGTATTTGTTATGATTGCCAAACTGAGGTTCCACTGGCTGTGCCATTGTTTCCACCACCATCATCACAAGTGCCTTCTTCACATGAAGGAAGAAACTTGAAGGAGTTTTTGGTGTTTCTGGTTGTTGGATCAGTTGGGGCTTTTGCGGGTCTATGTACTATTGTTTATTTCCTTTGGTTTAGTGCAAAGAGGGTTTTGGTGAGGAGAGAAGTAAGTAATAGTTCTGTGAAGCCTACAAGCTCGGAGAGTGATGCCTATGTGGATATAATCCCAATGCCTAATGTTGGTTCCAATGGAACAACCTTCAGAACTTTTTCTAGCAAAAGCCATGGGTCAAGAAGATTGAGGAGGCATAGGAGTGGTTCATCATCGAAGCATGTGGACAGGACCGAGAGTTTCTCATTGCGTGAACTGGCTACAGCCACTGACAATTTCTCATTGTATAATAAGATAGGTGCTGGTAGCTTCGGCAGTGTTTACAAAGGCATTCTAGGAGATGGTCGTGAAGTGGCCATTAAAAGAGGAGATACTAGTACTGTGAAGAAGAAATTTCAGGAGAAAGAAATTGCTTTTGATTCTGAATTGGCCATGCTGTCCCGGCTTCACCACAAGCATTTGGTGAGGCTAATTGGGTTCTGCGAGGAGAACGATGAGAGGCTTTTGGTCTATGAGTACATGAGCAATGGCTCACTTTATGACCATTTGCACGACAAAAACAATACAGAGAAGAGTAGCAGCATTTTAAATTCTTGGAAGATGCGGATCAAGGTTGCTTTGGGTGCTGCTAGGGGAATTGAATACATTCACAACTATGCTGTGCCACCCATTATTCACAGGGATATCAAGTCATCAAACATACTTTTGGACTCAAACTGGAATGCCAGAGTATCTGATTTTGGATTGTCACTAATTTGGCTCGAGAGTGAGCAAGAGTTGATGTCCACCAAGGCAGTTGGAACTGTTGGCTACATAGACCCTGAGTACTATGTGCTGAATGTGCTAACCACAAAGAGTGATGTGTATGGTTTAGGAGTGGTGATGCTGGAGCTTCTCACAGGAAAGAGAGCAGTGTTCAAAACTGAAGATGGGTCAAGCCCTATAGGGGTAGTGGAACACACAGGGCCAAAGATAGCATCAGGAGAGCTTTGGAGTGTGTTGGATTACAGAGTTGGACAGCCAGAAGTAAATGAGGTTGAGTCCCTTGAGATCATGGCTTACACTGCTATGCACTGTGTGAACATGGAGGGAAAAGAGAGGCCAGAAATGACTGACATAGTTGCTAACTTGGAGAGGGCATTGGCTTTCATTGAAGGCAGCCCTACCAGCATTTCCCTTGCTTCCTTCTCTGCCCCTCTTGAATGA