Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22533 LG5 56183751 56187058 PREDICTED: calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 56183887 5_prime_UTR_variant
A/G 56183947 5_prime_UTR_variant
A/T 56184161 missense_variant p.Asp35Val
C/T 56184169 missense_variant p.His38Tyr
T/A 56185031 synonymous_variant p.Val203Val
A/G 56185090 intron_variant
A/G 56185101 intron_variant
A/C 56185674 synonymous_variant p.Arg278Arg
A/G 56185817 synonymous_variant p.Glu325Glu
G/A 56185820 missense_variant p.Met326Ile
T/C 56185956 intron_variant
T/A 56186005 intron_variant
C/G 56186028 intron_variant
G/A 56186158 intron_variant
A/G 56186159 intron_variant
G/A 56186165 intron_variant
A/T 56186449 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22533.1
MKKTPVHSLHQSNQRKRNVGVQDRGAGNGTRKRSDENHSVLTYFNSVKNFFSFFLSGKKKIPSEAPQSDDGKTTHKVGGVSSSADVSSDSSRSSSKYVFSQSSASSGTSSSQLGVGNFTFEEIYKATAKFSPDNKIGEGAFGTVYRGRLYDGSLVAVKRARKDLQNKNLAEFKNEINTLSNIEHRSLVRWRGYLEHGDEKILVVEYVSNGTLREHLDGFRGNGLEIGERLDIAIDVAHGITYLHMYTDHPIIHRDIKASNILITDKLRAKVADFGFARLGSEDPAATHISTQIKGTAGYIDPDYMRTHHLSEKSDVYSFGVLLVEMMTGRHAVEPKRPLSERVTIKWAMQLLKQGEVVIAMDPRLKRSPASNKAVQKVMKLAFQCLAPVRRSRPSMKSCAEVLWEIRKDFTDRTSSHTHNGSHHSANFPQRDGRKNRHKTYGIEDGKGYKFVSA*


CDS Sequence:
>Vu_22533.1
ATGAAGAAAACCCCAGTTCACAGTTTGCATCAATCTAATCAAAGAAAAAGGAATGTTGGTGTCCAAGATAGAGGTGCAGGGAATGGCACACGGAAGCGCAGTGATGAGAACCATTCTGTTCTGACATATTTCAATTCCGTCAAGAATTTTTTTTCATTTTTTCTATCTGGGAAAAAAAAAATTCCCTCAGAAGCCCCTCAGAGTGATGACGGAAAGACCACACACAAGGTTGGAGGGGTATCGTCTTCCGCAGATGTATCGTCTGATAGTTCTAGGAGTTCATCAAAGTATGTATTCTCTCAATCCTCTGCATCATCTGGCACTTCAAGTAGCCAGCTTGGAGTTGGGAACTTCACCTTTGAGGAAATTTACAAGGCAACAGCAAAATTCTCTCCGGACAATAAGATTGGGGAAGGTGCGTTTGGAACAGTGTATAGGGGAAGGCTTTATGATGGATCCCTCGTGGCTGTGAAGCGTGCCAGGAAGGATTTGCAGAACAAGAACTTAGCTGAGTTCAAGAATGAAATAAACACCTTATCAAATATTGAGCACAGGAGCCTTGTGAGGTGGCGTGGGTATTTGGAGCATGGAGATGAAAAGATTCTTGTTGTTGAATATGTTAGTAATGGAACTCTTCGAGAACATTTAGATGGTTTTCGGGGAAATGGACTTGAAATTGGTGAGCGTCTGGACATAGCCATTGATGTAGCTCATGGAATTACTTATCTTCACATGTACACAGATCATCCAATTATTCATAGGGACATCAAAGCATCAAATATCTTAATCACTGATAAACTAAGGGCCAAAGTAGCAGACTTTGGTTTTGCTAGGTTGGGTTCAGAAGACCCTGCTGCAACCCATATTTCAACTCAAATAAAAGGAACAGCTGGGTACATAGATCCTGATTACATGAGAACCCATCATCTATCTGAAAAGAGTGATGTCTATTCCTTTGGTGTGTTGCTTGTTGAAATGATGACAGGACGACATGCAGTTGAACCAAAGAGACCTCTTAGTGAGAGAGTTACAATTAAATGGGCAATGCAGTTGTTGAAACAAGGAGAAGTTGTGATTGCCATGGATCCAAGACTAAAGAGAAGTCCAGCATCAAACAAAGCAGTACAAAAGGTTATGAAGCTAGCTTTCCAATGCCTTGCACCGGTGAGGCGATCACGACCATCTATGAAGAGTTGTGCAGAGGTTCTGTGGGAAATCCGCAAAGATTTTACAGATAGAACATCTTCTCACACTCATAATGGTTCTCACCATTCTGCAAATTTCCCTCAAAGAGATGGGAGGAAGAATAGGCATAAGACATATGGTATTGAAGATGGTAAAGGCTATAAGTTTGTATCGGCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_22533::LG5:56181751-56183751(+)
AGTATTTTTGTTTTTTCATGATACTTATAAAACTGGTATAAAAAAGAAATGTTTAATATATTATTTGGTCCTTAGTTTGGAGCGTTGTGTTCAAAGTCGTCATATCTTTTAAATTTTTTTACTATTGTTCCATATTTCTTTAAAAACGGTTCAAGTTGGTCCTTTTGACTTACGACATTAAAAACTTAACGGTGTAATAATGTGGCAACTGTGACATGTCCAATTTTTGATTACGTGACAACTGTAACCTGTTCAATGTTTATGCGAGAGAGCCTTCATGATTCTGCACCCTGACTCGTGACAACTCATGGTGGCGCAACGCGTTTGATCAGCAATGAACAAAGAAGAAGTTCTCGTTCTTAGCTTTTGCTCTTTGCAAAGAAGACGAAGATGAAGGACGCATGAAGAGACTTCTTGCACGATGCATGAAGGCACATTGTTCTATGTTTCTGGCTTGTGCAATTTGCAGGTGGATGTCCATGGATACTGCTTGAGAACTAGGGTTTTTGGGATTTGGGTAGCTATTATGTATGTTTATGGTTTGTTGCAGGTGTGAATTTGGTTTCTAGGTGTCGCGATTGCGATTTTCTTGTTCATGTTTTTGGGTTGGAATTTTTGGTTTGCAGTTAGGGACTTCGATTCGGTTCTTTCTTAATGGTGGTGAAGCGCGACGCATGGTGGAGATTTTGCCCTGATTATTGGCCACACGGTTTAGGGTTTCATGGTGGCTAGGGTTTGGTTGGAAGTAGGCGATTTGGGTTTGATTTCTGGATTTTTTGTTGCTTTTCTCTGCTTCGAATTGTAGGTTTGTGTTGATGGTGGTGACAACGGCATGGTGGCCTGAGGGTTTGGTGGTGGCGCCTTTTGTTTTGCGACAGCGGCGGCGGCTAAGGTTTCACAATGGTGGCACAAGGTTTCTGGCCTTAGGGAAATTAGGGTTTCACGGTTCCTCCTGACCTTTTACGTTAACATTGCACATCAAATGGATCACAGTTACCGTGTCATAAAAAATTGGACAGGTCACAGTTGACACATCATCGCACCGTTATGTTTTTAACGTTGTAAGTTAAAAGAATTAACTTAACCGTTTTTAACAAAATATGAGACAATAGTGAACTTTTTTAAAGAGTAAGACGACTTTAAACATAACATCCTAAATTAGAGACCAAATAGTGTATTAAATAAAAAAGAAATATGAACAAAATCTTGTATCTCCGTTATCTTCAAATCTTCAGTCATTCTTGTAAGTAATAATGAGAATACAAGTTGTTAGTAAGTGACTTTTTCTGTTTTATAAATCACACGCACTTAGAACAATTTTGTTTGAATCAGAAGCATATTCAACACTATAATTCAAAAACAGTGATGATCTAGTTACTGTTTAGATGACCCTCTTCCGTATATTGACATTGTAAATCAATCATATGTCACTCTTATGGTCTCTGGCTCTCTTTCGTGAATATTTTTTTCCTTCTTCTTACCTAGAAATTCTTTGTCAGTTTCCAGGAATCCTCAAACAATGTCTTTTCTTCCATTACAAGAAAAAACATGTTCTTATTTTCTGACTGACAGCTACATACCAAACTCATCTTGTTCATCAATACTTTCTTGGTCGTAGTTTTTGCTGTTTTGAAAAAAAAATTCATAGTCTAGTCAACATCATTATTTTCAAATGACAAATTATCATTACCTTCTCCCACATTACATTCACAGTTTAAATTGCTTAAATTTTAACTTTTTATGACTTGAGCCATCTGTATAAACAGTGACCCATTTCAAAACATTTGCACTTTAGAAATAAACAAAGGTTGATTACTCATTTTTCAATTATTAAAATCTCATCCGAATACTTAAATAGAAACACTTTTCAGAATAAAAGAAAACAGATCCACTGTTAAACATTTTTTATATCAAAAGTTCGTTTGATCATAATCAGTAACTTGTGTCTTTCATGTTACCTCCAAAAAAACACACATTATGAGAAACAGTAGAATAGTTTA


Gene Sequence:
>Vu_22533(+)
ATAACAATTTGTGTATTAGGAAGGATCAAAGGAAAACCGCGTGCTGACTATGACTGCCACATTCCGGTCAAACTCCAGCTGGCCATGGACCTGGAATGGTTTTAATGCTTTTTTTTTTCTTGGCTGGTGATCCTTTGACCTGTGGGATGTAAAATGTAGGACTTTTAGTTATAAAATAATAACTTCAACTTGCAGGAAGCAGATTCACATTGGAAGAACAAAACGCATGAAATGGAAGCCTTTGAGATCATCTTCCTTTTGATATTTGGTTACAAGAGATGATATGGAATAGCATTAGCTTCTGCAAATGAAGAAAACCCCAGTTCACAGTTTGCATCAATCTAATCAAAGAAAAAGGAATGTTGGTGTCCAAGATAGAGGTGCAGGGAATGGCACACGGAAGCGCAGTGATGAGAACCATTCTGTTCTGACATATTTCAATTCCGTCAAGAATTTTTTTTCATTTTTTCTATCTGGGAAAAAAAAAATTCCCTCAGAAGCCCCTCAGAGTGATGACGGAAAGACCACACACAAGGTTGGAGGGGTATCGTGTAAGTTTCTTGAATAAAGATCTGTGCTTTCTTCTCTGCAATTTGGTTATGTGAGTTGATTTCGTAGTGTATCTGTTCATGGTCAAGGCAACCCTTTGTTTATGTAAAGATTGTCAATGCTTATAGGGTTTTCTATTTAGCTTAGGGCATGGTCATGTGTTTGTGAGATTGCGTTTTGATGGGTTTTCCCAAAACTAAATTTCATTGTAATTTGCAGCTTCCGCAGATGTATCGTCTGATAGTTCTAGGAGTTCATCAAAGTATGTATTCTCTCAATCCTCTGCATCATCTGGCACTTCAAGTAGCCAGCTTGGAGTTGGGAACTTCACCTTTGAGGAAATTTACAAGGCAACAGCAAAATTCTCTCCGGACAATAAGATTGGGGAAGGTGCGTTTGGAACAGTGTATAGGGGAAGGCTTTATGATGGATCCCTCGTGGCTGTGAAGCGTGCCAGGAAGGTATCACATAACATAATGATGTTCATCTTTCTGGACTCTTTTCAATTGAAGTTGAAGTTAGAGAAGCATGTTCGTAATATGTGAGACTGATCATGTTTTATCTTTAGCTTTTATCAATGAGCCTGATATAGGAAATGTTTGTTGACAGGATTTGCAGAACAAGAACTTAGCTGAGTTCAAGAATGAAATAAACACCTTATCAAATATTGAGCACAGGAGCCTTGTGAGGTGGCGTGGGTATTTGGAGCATGGAGATGAAAAGATTCTTGTTGTTGAATATGTTAGTAATGGAACTCTTCGAGAACATTTAGATGGTGAGCCCAGTTTATAAAGAAACTCTAATGATTTCAGCAATCCCTCATAGTCTATATACTGCCCTGTGGTACAGTTATCAAATAGTGGATTCTCCAAACCTGTTTGAAGAATAAACTCAGTTTTGTGACATGTTTGGTTGTCTTCAAAAGTCAATTTTTGTCTAAAAGTAGTTTTTGTATAAGCAAGATATTGGTTGTTTCTGCAAAAGTTGAACTATGTTTGCAACCTTTAATCCAAACATATGTCACTTGTTAAATGCAGGTTTTCGGGGAAATGGACTTGAAATTGGTGAGCGTCTGGACATAGCCATTGATGTAGCTCATGGAATTACTTATCTTCACATGTACACAGGTATGTGTCATTAGAATTAGATTACAAAATGATAAATGTGTTACAACAGATTTTGGATGGCTTAATTATTGCAATGTATCTACAAGTGTTCCTGATAAAGTAATAATTTATAATCTTGTTTGTGTTCTTAATGTAGAATGTATGTGTTTGATTGACAGATCATCCAATTATTCATAGGGACATCAAAGCATCAAATATCTTAATCACTGATAAACTAAGGGCCAAAGTAGCAGACTTTGGTTTTGCTAGGTTGGGTTCAGAAGACCCTGCTGCAACCCATATTTCAACTCAAATAAAAGGAACAGCTGGGTACATAGATCCTGATTACATGAGAACCCATCATCTATCTGAAAAGAGTGATGTCTATTCCTTTGGTGTGTTGCTTGTTGAAATGATGACAGGACGACATGCAGTTGAACCAAAGAGACCTCTTAGTGAGAGAGTTACAATTAAATGGGTAAGTTGGTCCAATCTATCCAATGCATACAAAAATAACTAGGTTATAAGAACATGAGTGGTTTTAGAATAATTTTTTATTGGTTAAACTATATCTCATAAATAAATAAGAGTTAAGTATGTTTTTAGTCCTTGAACTTTGATACGAAATTAAAATTTTTCTCTGATCAAAACTTTGATACATTTTGATCCAAACTTTAAAAAGAATGGATAGTTCTTTCAACCAAATTACATTAAACTTTGTTGACATGTCAAAGCGTTTCCATATTAACACCGAAGCCAGGACGTATCAAATGAGGTAAACAATGCTAGTATGAAATGTGGTTGACAAAGATTATATATATTCATTTTTAAAGTTTGAGAACTAAAATGTATCAAATTTTCATACAAGGATGAATTCCAATTTTGTGTTAAACTTCAAAGATTAAATAAACTATGTTTCTGAGAAGCTATTAGTTTGTTTAGCAAGTTAGACTTAGATTTGTGAACAACCTAAAATGCAGCATGCCACTTTTTGTGTTTTATAATGATCATTGCAATGAAATTGTGAGAACAAAGTGCACTACAATGAACTCTGAGCTGATATAGTTTGCATGCCATGCAGGCAATGCAGTTGTTGAAACAAGGAGAAGTTGTGATTGCCATGGATCCAAGACTAAAGAGAAGTCCAGCATCAAACAAAGCAGTACAAAAGGTTATGAAGCTAGCTTTCCAATGCCTTGCACCGGTGAGGCGATCACGACCATCTATGAAGAGTTGTGCAGAGGTTCTGTGGGAAATCCGCAAAGATTTTACAGATAGAACATCTTCTCACACTCATAATGGTTCTCACCATTCTGCAAATTTCCCTCAAAGAGATGGGAGGAAGAATAGGCATAAGACATATGGTATTGAAGATGGTAAAGGCTATAAGTTTGTATCGGCATAATCAATTTCACATTGGAAGTTTGTTCATTGATTGTTCAGATAGTGAAACTACAGCTCTCGTTTGTATAATGTTCCTTTTTTTTGAAGCTGTTAGTTTGAGAAGGTTTTCCCTCTTCCATTTTGAAATTCTCAAGGTTTTAGATTGTTGAGAGTGGAAGGTATGATTTGTTTGTAACCCAAATGGGTAAGATTGCCAAGTTAAGGGACACTCATCAGCTTGAATTTCAGGGTATGCAAGTTTTTGTCTTC