Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22486 LG5 55595025 55596082 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 55595033 synonymous_variant p.Glu3Glu
C/T 55595194 missense_variant p.Ser57Leu
A/G 55595272 missense_variant p.Glu83Gly
T/C 55595366 downstream_gene_variant
A/T,C 55595568 missense_variant p.Met149Leu
A/G 55595623 missense_variant p.Tyr167Cys
G/C 55595638 missense_variant p.Cys172Ser
G/A 55595644 missense_variant p.Arg174His
G/T 55595670 missense_variant p.Val183Leu
A/G 55595752 missense_variant p.Asp210Gly
C/T 55595756 synonymous_variant p.Asn211Asn
G/C 55595851 missense_variant p.Arg243Thr
G/C 55595876 missense_variant p.Leu251Phe
C/A 55595899 missense_variant p.Pro259Gln
A/G 55595934 missense_variant p.Asn271Asp
A/T 55595998 stop_lost p.Ter292Leuext*?
T/C 55596001 missense_variant p.Phe293Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22486.1
MTEQSDECQNEFRASPSKLLPIIQTQSSPSHNFNDMSETTSPLSCPVQDVVESLPMSSSSQTSQRDNMRVQSKKSKRITWTTEEHRRFLEALSKYEKGNWKQISAYIQTKNVTQVASHAQKYFIRQGRSEEQKKRKSIHDMVLDTNIDNENSSSSKTNPAISQFYEIQPLQMQPQQSIPPTQCNQRQPPQVQPLQRQPLQSVHHTQFNQRQPPQVQPLQSVHHTQFNKIRRTHSVMEANSFNKKAHHPTQFAKMQPVHPMASVNSNNIVHQPAQFNPPTTNVFLQVNPVNTIIHHPSQFNQMQPTRETVYTNVKNWSRG*


CDS Sequence:
>Vu_22486.1
ATGACGGAGCAGAGTGATGAATGCCAGAATGAATTTCGTGCTTCGCCTTCAAAACTGTTGCCTATCATTCAAACTCAGTCTTCTCCATCGCACAACTTCAATGATATGTCGGAAACAACCTCCCCCCTCAGCTGCCCTGTTCAAGATGTCGTCGAATCTCTTCCGATGTCGTCGTCGTCTCAAACATCACAACGTGACAACATGCGAGTTCAGTCCAAAAAATCGAAAAGGATAACTTGGACTACAGAAGAGCATAGACGGTTTCTAGAAGCACTCAGTAAATATGAGAAAGGAAACTGGAAACAAATTTCAGCATATATTCAAACAAAAAATGTAACTCAAGTAGCCAGTCATGCACAAAAGTATTTTATCCGTCAAGGTAGATCAGAAGAGCAAAAAAAGAGAAAAAGCATTCATGACATGGTTTTGGATACTAATATTGATAATGAGAATTCATCTTCTTCTAAAACAAATCCTGCAATTTCACAATTTTATGAGATACAACCATTGCAAATGCAACCGCAACAATCAATACCTCCTACACAGTGTAACCAGAGACAACCACCGCAGGTGCAACCACTGCAAAGACAACCACTGCAATCTGTACATCATACACAGTTTAACCAAAGACAACCACCACAGGTGCAACCACTGCAATCAGTACATCATACACAGTTTAACAAGATTCGACGAACACATAGTGTAATGGAGGCGAATTCTTTCAACAAGAAAGCTCATCATCCTACACAGTTTGCCAAGATGCAACCAGTACATCCCATGGCAAGTGTGAATTCCAACAACATAGTTCATCAACCTGCACAGTTTAATCCACCAACAACGAACGTCTTCCTGCAGGTTAATCCCGTCAACACCATAATTCATCATCCCTCACAGTTTAATCAAATGCAACCGACAAGAGAAACAGTGTATACTAATGTTAAGAATTGGTCAAGAGGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_22486::LG5:55593025-55595025(+)
TTCATAGTTCATGCATTATAAAATACCAAAAACTGAAATTTGTTGCCTTTTGCTTTTCAGGTCTCATAGAGTTGTAAAAATCGATCATAATTAATTAGAAAAACAAAAAAATTGATTAACGTTGAATATTGACAAAATTCAACGTCGAAAATTCGACGTTAACGTCAAATTTTTTAAATTCGACGTTAACATCAAATTTTTTAAATTCGACGTTAACGTCTTAAATTTGACGTTTAGAAGTTAACATCAAATTTTTTAAATTCAACGTTAAGTTAACGTCAAATTTAAATTTGACGTTAAGTTAACGTCAAATTTAAATTTGACGTTAAGTTAACGTCGAATTTTTAAAATTCGTTTAATGTCTCCTAACGTCGTTTGCGAATTTACCGTTAAAAGTCTAAAATATTTGATGTTGTATGTGATTTTTGTACCAGTGCAACTTAATGATAATTAAACACAGTCCATACAAACATTTTTAAAAGCTTTTAAAATGCCAAATTAAGATATTTAAAACTTAATATATTAAAACATAAAAACAAGAAACTAACATTTAGGGAGTGAAATATAACTTGGCTAAAATTTGTTTATATCAAATATCTATCATAAGTTTTGTTTAATATTAATTTTTTAATAATTATATTTATATTTATATTTATTGTGACATATTACAATATTAATATTTATATTTATTTTTATTATGACATATACTTAGATACTAATATAATATTATCTAACACTTATTTTGAAATACTTAAAACTTTGATACGACAGTTTAAAATATCTACTTAATATATTCTTAAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAATTATTGGCCGTTTCTGGTTTTCGTCCCTCTTTCAAAATAAGATACAATTTGGTCATCATTCTTTTCGAAACTTTAGTTTTAGTCCTCGAAACTTTAGTTTTAGTCCTCGAAACTTTGGTTTTAGTCCTCGAAAACTAAACTTGAAAACTACCAAATTTTTAACGGTGTTAGTTTTCGAGGACTAAAACCAAAGTTTCGAAAAGAATGAGGACCAAATTGTACTTTATTTTGAAAGAGGGACGAAAACCAGAAATAACCAATAGTTTAGGGACTAAAAACATATTTAACCCTATTCTTAATTAAAATATTATTCATCAAATCTTATATCTTATAAATTTTGTATATAGAATAAATATTTTCAAATTAAATAATTACTAAATCCTCTTATATATCTTTTAGAATTTCTTTTAACTAAATGATTTTATCTCTTATCATATTCTTCAAATAAAATAAATATTTTAAATTAGATATAACTAATAAACTATTCTATCTCTTTACTTAAAGTATCTATTTAACTTCATGTGTTATTAATTTTATAATTATTATAATTTTTAGAGTCACATCACACCACCATTGACATTTAAAAATCTTAATTGTAATTTAAAAATCTTTTAATTGAATAAAAATTACCTATAAAACAAAATATAAATTTTTAAATGATATCTTTGGGAATTTTCATTATCAATTTTTGAACAACTACTCATGATTTTATAATGTGAAAAATAGTATTTTAAACCTACTATCATTTACTTAATTTTTTTATCTTGTATATAGTATAAATTATATCATTTATGCTTTTTGATTATTTATATTTTCATTATATGAGTATAGTTATCTAAATGTCGATGAACACATATTATCATTATTATTATCATTTTATCCTATACTAAGTTATCATCACCTAGTTTAAACTAGATCATTAATAATCAGTTTGACATAAATAAAAGATTAATTAGTGCTTTAAACGTAACATTATTAATTAACATGATATCGTGATATGTTTTATTTTTGTTTTTAGATAAATTAATGTTTACGATTAGTTGATATGTATATATCATTTATTGTTATTTTATCAATAAATAATATATAAATTGAAAAAGAAGGAAAAAAGAGAAAGCATCAATAGAATTTCTGTAGTGAGTTGGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAGAAGA


Gene Sequence:
>Vu_22486(+)
ATGACGGAGCAGAGTGATGAATGCCAGAATGAATTTCGTGCTTCGCCTTCAAAACTGTTGCCTATCATTCAAACTCAGTCTTCTCCATCGCACAACTTCAATGATATGTCGGAAACAACCTCCCCCCTCAGCTGCCCTGTTCAAGATGTCGTCGAATCTCTTCCGATGTCGTCGTCGTCTCAAACATCACAACGTGACAACATGCGAGTTCAGTCCAAAAAATCGAAAAGGATAACTTGGACTACAGAAGAGCATAGGTTATTTTATCTGTCACCTTATTATTATTCTTTTTATTTATTGTTTATGATTCCTTCTTCACATTATACTAATTCATATGTTTGTTTATTCTCCATAGACGGTTTCTAGAAGCACTCAGTAAATATGAGAAAGGAAACTGGAAACAAATTTCAGCATATATTCAAACAAAAAATGTAACTCAAGTAGCCAGTCATGCACAAAAGTATTTTATCCGTCAAGGTAGATCAGAAGAGCAAAAAAAGAGAAAAAGCATTCATGACATGGTTTTGGATACTAATATTGATAATGAGAATTCATCTTCTTCTAAAACAAATCCTGCAATTTCACAATTTTATGAGATACAACCATTGCAAATGCAACCGCAACAATCAATACCTCCTACACAGTGTAACCAGAGACAACCACCGCAGGTGCAACCACTGCAAAGACAACCACTGCAATCTGTACATCATACACAGTTTAACCAAAGACAACCACCACAGGTGCAACCACTGCAATCAGTACATCATACACAGTTTAACAAGATTCGACGAACACATAGTGTAATGGAGGCGAATTCTTTCAACAAGAAAGCTCATCATCCTACACAGTTTGCCAAGATGCAACCAGTACATCCCATGGCAAGTGTGAATTCCAACAACATAGTTCATCAACCTGCACAGTTTAATCCACCAACAACGAACGTCTTCCTGCAGGTTAATCCCGTCAACACCATAATTCATCATCCCTCACAGTTTAATCAAATGCAACCGACAAGAGAAACAGTGTATACTAATGTTAAGAATTGGTCAAGAGGATGA