Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22407 LG5 54302814 54306366 PREDICTED: ABC transporter G family member 26-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 54302881 missense_variant p.Ile23Thr
A/C 54302886 missense_variant p.Asn25His
C/T 54302978 synonymous_variant p.Phe55Phe
T/C 54303150 upstream_gene_variant
C/T 54303160 upstream_gene_variant
G/A 54303209 upstream_gene_variant
G/A 54303404 upstream_gene_variant
A/T 54303484 missense_variant p.Ser77Cys
C/T,* 54303540 synonymous_variant p.His95His
G/T 54303641 missense_variant p.Gly129Val
G/A 54303715 missense_variant p.Val154Ile
A/T 54304080 missense_variant p.Lys181Ile
T/A 54304225 upstream_gene_variant
A/C 54304259 upstream_gene_variant
G/T 54304714 missense_variant p.Leu322Phe
T/C 54304719 missense_variant p.Phe324Ser
C/A 54304727 missense_variant p.Gln327Lys
G/A 54304830 missense_variant p.Gly361Asp
T/C 54305361 synonymous_variant p.Phe488Phe
T/A 54305469 synonymous_variant p.Thr524Thr
A/G 54305482 missense_variant p.Ile529Val
T/G 54305531 missense_variant p.Leu545Trp
A/G 54305545 missense_variant p.Ile550Val
G/T 54305609 upstream_gene_variant
T/A 54305790 upstream_gene_variant
G/C 54305859 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22407.1
METGREDEIVDMPMSPPVVGSNINNDFCHHKEFMSQTYMQNKYSEIDIDTEDSNFDQNRPLPIFLKFEDVEYKVRNSQAGSGNVVKSMMSKVTTHLTVEEDRYKRILKGITGSIGPGEILALMGPSGSGKTTLLRVIGGRLVDNVKGKVTYNDVRFNPALKRRIGFVTQEDVLFPQLTVEETLVFSALLRLPGSMSKQQKYAKVDTTIKELGLERCRHTKIAGGYLKGISGGERKRTCIGSEILVDPSLLLLDEPTSGLDSSSANKLLLTLQGLAKAGRTIITTIHQPSSRIFHMFDKLLLISEGYPVYYGKAKETIEYFSFLRFTPQIPMNPAEFLLDLATGQVNDISVPPDIFQDQESSGPSKVVIEYLQLKYKSLLEPKEKEQNHRVASTPEHLQLAIQVKMEWTSSWLDQFMILSRRTYKARRKEYFDKLRLFQALGIALVLGLLWWKSSINTEAGLRDQVGLAFYICIFWTSSCIFAAVYVFPFEEYYLVKENKADMYRLSVYYACSTLCDMVATVFYPTFFMLILYFMAGFNRAVASFFLTLLTILLIAITSQGAGEMFGAAIMSVKRAGTAATLLLMLFLLTGGYYVQHIPKFMRWLKYLSFMYYGFRLLLKVQYSGDQLYDCGSMGGCRTLQSSPTFDSVNLKGGLKEVWILLAMALIFRLLAYLCLRVRIVGRKN*


CDS Sequence:
>Vu_22407.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22407::LG5:54300814-54302814(+)
TTTAACATTTTCACTTGAATGGATTTGGGGGAGAGTGATTCAGGAGATTTGAGAGGATTTGAAAGTAAATTTTTTTGTTGTTTATTTGAGTGAATTTTGAAGTAAATGAGAGTGGATTTGGAAGTAAATTTTTTTAATCTGTCACGTCAATCAAATTCTACACTAATTCTCACAAACTTTACTTCCAAATTCACTCCTACTTACCTCAAAATCCACTCAAATAAACAACAACAAAATTTACTTTCAAATCCTCTCAAATCCCATCAATCACTCTTTGCCAAATCCATTCAAGTTAACAAGTGAGTCAAATGAATTGAATTTACTTACTTTTTGATCCAGACATAAGTCCCAGAAGATATGACAATACATACATAATCCTTAAGAGCACCGTTGGAAGGTTGTGAAACGAGTTATGAGATGCTTAAGTAACATTGTCACTGATGCCTTATTCATTATTCCTTTAACTACTTTCCTCCTAAATTGTTTTCAATGATGACTGGGGATCTGATTTGGATGATAGAAAATCTATAAGAGGGATTTGTATCTATCTTGGTAATAAGATAATTTCTTAGCACTTTCACAAACAAAAAGTAGTTTCTCGGCACAACACTAAAGTTGAATACGCGAGCATCATTGTACTATTCTCATAAGTTATATATATTTATTATTATTCTAGGATAGCTTAATCTTCATTCTACCACTCCAACTATTTATCCAAACAATTTAGGAGTTGTCTTGCTCTCTACCAATCTCATTCAACACTCTCTTACCTAAAAGCCATAAGCCAAGCAACTAAGAATTAAGCTTGATACTTATGATTGGTGAATTATGTATTAAGGAAGAGATAGGAGTAGATGAGGTATCAAAACTCATGATGAAAAAAAGAGTTTTAAATACCATGTAAGATAATTTTTTTTAAGAAGAATAATGATTTTGTATATTATTGATTAATGAAAAAAGATACAAAATATGTAAAAAAAAAATGAGATGCTCACCTTTAATATTGAATTCTTAATTAATTTTTGTATTAACTCCATACATTTATATACTAACACCCATGGTATAATGATGTATTTAGTAGAAATTTTATGACACCAGTAGACATTAAACCGTATTTAGTGAATTTGTTTTTGAAATTTAAACATTTTTACATAATTTTACCTATAAAAGAAATGTTCTTTTAATATAATAATAGATATATAAATTCAAAAAGTTCATAACCCACTAGCTTATATTTCTTAAATGTTAATATTCTTTCTTAAATAAATTGAATCTATGTAATTCAAATAGTAAATAAATTATTATTAAAATTCATAATATATAAATCATTCATAAATTATAATTTATGGTAAAGTATGAACAGATATTTTTGTCAACTATTCAAGAGGTTACATAAACCATATATATATATAATAATAAAACATTTTCTGTTTTTTATTTTTTAAATTTTAACTATGAAAAAATATTATTATTTTTAACGTTGAAAATTACAAATTCGATAAAAATAAAGAAAATATTTCTATGATTAGATACAAATTACACGTTGTTTTTTTTAACGTAAAATTCACTTTATTTAACGTTGTCTAAGAGAAAGATTCTTGAAGATAAAATTTCCGTCAAAGGCTCAACGATTGCATTCACATTCTTTTCTCCTCAGTTCTTTGTGAAACAATGGTTTTATGAAAAGCAAAGCTACGAGTGCACCTAAACAACGGAATGCTGCAATATTGAAGGAAATGGGTATTTTAAATGTTCAGAATCTCCTCAAACCAAACATTCTTCATTTTCTTAGTAAGCATATCATAATGGTTGAAAACACACCGAAAACTTTTGATATTGGTTAAAGGGCATGTATACTAGGACTAGATAGAACACACCAACAACTTGTCATGAAAAGTTTGTGTCACACGAACCAAAATTTTCCCTTTATATATAGCCATGATTTTTGGTTCGATGCAGTTGACTCAACACATCAAAACTCTCATTGATTTCATTGATCA


Gene Sequence:
>Vu_22407(+)
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