Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22376 LG5 53958499 53959949 PREDICTED: nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 53958637 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 53958801 5_prime_UTR_variant
G/A 53959021 5_prime_UTR_variant
T/G 53959147 5_prime_UTR_variant
G/A 53959428 missense_variant p.Ala91Thr
T/G 53959466 synonymous_variant p.Pro103Pro
T/C 53959468 missense_variant p.Leu104Pro
G/T 53959469 synonymous_variant p.Leu104Leu
C/A 53959475 synonymous_variant p.Val106Val
T/G 53959476 missense_variant p.Tyr107Asp
C/A 53959485 missense_variant p.Arg110Ser
C/A 53959608 missense_variant p.His151Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22376.1
MADSDNDSGGTHNAGKGSEMSPREQDRFLPIANVSRIMKKALPANAKISKDAKETVQECVSEFISFITGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAMTTLGFEDYVEPLKVYLQRFREMEGEKTVAARDKDAPPASNATNSAYESGSYGAGGIMMHQGHVYGSGGFHQVGGSVIKGGPAYPGPGSNASRPR*


CDS Sequence:
>Vu_22376.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22376::LG5:53956499-53958499(+)
AAAAATATCAATTTTTTTATATAAATTAGAATAAGATCTTATTAATATTATATTTTTTATAATTATCTTTAAAAGACACTTTATAACTAGTGTCTACCTATTATCCGATGCGCAACAAAAAAATTACTTATTATCTCGTCTCTTGCCCACACATCTCATCCGTTACCCACACAAATAACTTTTTAAAAAATACTTACATTATTTTAAAATCCCTTAGTATCCATACTTGCAAAAATTAAAAAAAAATATTTTTTATTAAAATTTAAAATAAAACTAAAAATATATATAAAATTTAATTAATTTTAACTTTAATTAAATTTAACTTAATAAATATAAATTAATTTTTTATTTATTTTTTGCAAGTAACATATTTTCACCTGTGTAATTAATATAATACGTGTACCTAACCTATTTATAAAAAAATATTAAAATATTCGTTATCTCTTATTTGTTAATAAATATTTATGAATAAGCGATATATTATATTTATCATCTGTATTTATAGCTCACATAACTTTATATTTGTCTTTAAAATAAACATAACTAATTTTTTATAAAAGGATACTTTTTTACATTGTCTCGAAAAACCACAACCACTAACTTCAAATAAATATCATAAAAATGATAAAATATTTGCTCATCAAAGACAAAAACTTTATAAATAAAATTAATATATATTTCTATTATATTAAAAAGAATTCATGCAAGTGGGGTTGATATGTCACATGTCAGTAGCTTTTTCCTCTTAACATTTACTCTCACTTAATAAATAGATGCATATATATATTTTTATAAATTTAGTTTAATTTAAACGTTTCAAGTAGAACTTTCATATTGTTTTATAATTAACCAAAAAATATTTTAAAAGGTGTTTTTCAACAATTTTTATTGTTTAGTATATTCCATTAAAATTTTGCTGACAATTTCATTTCATTTTGTTTTAAGTGACAAAGCATTTTCTTATAACTTTTTAACGACAAAATATTAAATATTTATTTTTAAATAACATAATTCAAATTTTGATTATACATTTTAATTTTACAATTTTTAATTATTCAATATCTTAAACACACACATAAAAGATCATCATTAGGAAGTTACTTTTCAAAAAATATATTTTACGAACCTTTTTACCTTCAAAAAAAATTATTTCTAAATGTTTTTCTTAAGTTATTATTTTTTTCCAATTTATTATTTCCATTTCTTTTTCTAAATTAAATTTAATATTTTAAAATAAACTATTAATATTGAAAATTTTATTTCAACTAACTATAATCATGATATATTTATATATCCGTTTTTTAATTATTATAAATAAACATTTTTGTATAATAAAAAGATTACAATATTCTTTTTTATTTAAGAATAATAAAATTTGTATGTATTTATTATAATTTGTATATATTTAGAAACATTTATTAACTATTATTTAAAAAAAATTATATATGTAGACAGAAAGATTGATTCTCTAGAATCATATTCAATAAATATAAAACGCTTCCAAAATTTAAACAAAAAGTCAAAGAAAAAATGCTTTTATAACATAAATAGTAAAAATATTTCTTTGAATTATTTTCTTAAAAGTATGACGTAAATTTAAATTAATTTAATATTTAATGTGTGTACATTAACTTAATTAAATTTTTAAACATTTTTCTTAAAATCAGACTATAATAATAAAATTATGTATAATTTTTAATATATTTTAAATAAAACTTAATTTATATAAAAAAATATTTAAATCTTATAATATTAAATCGCATATATATCTATATGTATAAAATGATTTTGAAATTTGAATGCAATGAGGTAGTCCAACTCAGAACGGAGCACGTGCCCGATACCGAAACAACGGTCCAGATCATGGAGCAATCATCAAATCCAAGGGCCTGAATTCATCCATGTGAACTCACACTTATCGACTAACAACGGTCCATAATGTGCCACATGGTCTCAAGATAGAGCGTTATTAACCCTTCTGATCCAACGGACCCTGCTCA


Gene Sequence:
>Vu_22376(+)
ATTACCTCTCAAACAAACACCTCCGTTCCGTTTTACTTTTCCCCAACCACCCGTCACCGCCGGCCACCATATCCAGCTCTTCCAATACACCCACTTCGACTTTCAAACAAAATTATACGATTCAGTGATTTCATTCCTAGAAAACTTCGTTTCAACAGTGCTTCAAATTGACGCATCGTGTCTCGGATTTGTAACTTCTCAATCATTCCGAATCGAATTTGAAATTTCGAAGGAAAATTCACTAAATCTCAGTTCCATAGTAGCTTCTACTACGAACAGTGCTTCATTTCCACGCAGAACAACCAACTCAAATCGATTCGTGACTCGGATTTTCAACTCCTAGTTCATTCCGGGAACGAATTTGAAAGTCCGGGCACCAAGTACTGAATTTCACGTGTAACATAGTTAAACCATTTGTGGTTCGGAGTTTCAGTTCAAATCCGTTCCCAGTCGTCCTTCCAATTTCGAAGAAAACCGCGCTGACTACTTAATTTCATACACTGAACAGCGAACAGTACTTTAGTTTCACGTGGAGCGAGTCAAAGAGATTCAAATTGAGACCAAGAACTCGTCCACGGTGAACTCCGATATTTTTCCTCTACTGATTTCGTTATTCGTTTCATCTTTCTCAGCGATTCTTCGAACCTCTCTGTTCATCGATGGCGGACTCCGACAACGACTCCGGCGGCACGCACAACGCCGGCAAGGGCAGCGAGATGTCGCCGCGGGAGCAGGACCGGTTTCTGCCGATCGCAAACGTGAGTCGCATCATGAAGAAGGCGCTTCCGGCGAACGCAAAGATCTCGAAGGACGCGAAGGAGACGGTTCAGGAGTGTGTGTCGGAATTCATCAGCTTCATCACCGGCGAGGCCTCCGACAAGTGCCAGCGCGAAAAGCGAAAGACGATCAACGGCGACGATCTTCTTTGGGCGATGACGACTCTGGGCTTCGAGGACTACGTGGAGCCTCTGAAGGTCTACCTTCAGCGCTTTAGAGAAATGGAAGGAGAGAAGACCGTGGCGGCGCGTGACAAAGACGCGCCTCCTGCTTCCAATGCTACCAACAGTGCCTACGAGAGTGGTAGTTATGGTGCTGGTGGGATCATGATGCATCAGGGACACGTGTACGGTTCTGGTGGGTTCCATCAAGTGGGTGGCAGTGTTATTAAGGGTGGGCCTGCGTATCCTGGGCCTGGTTCCAATGCGAGTCGGCCTAGATAGATTACATGAGTGCCATGTGGTCTGTTCTATTTTACTGTTGTTATTATTTTTATAATTTAAAAAAAAATAGCAAGATTCGTAGTGGTTTTTAGTGAAATTAATAATAATAATAATAATAATTACTATTATTATTATAATAATGCTGGATGAGTTGGTTTGTATTGTGAGTATATAATAGATGATTGTATGGCCATTATGTATAGTATATGACACTCTTCTATGTTCTAATGC