Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22323 LG5 53074559 53075871 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase WNK11
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 53074590 missense_variant p.Phe289Tyr
T/C 53074910 synonymous_variant p.Lys182Lys
A/C 53075000 intron_variant
A/C 53075045 intron_variant
G/C 53075046 intron_variant
T/C 53075047 intron_variant
G/A 53075120 intron_variant
G/A 53075680 synonymous_variant p.Asn64Asn
T/A 53075750 missense_variant p.Tyr41Phe
A/G 53075751 missense_variant p.Tyr41His
T/A 53075757 stop_gained p.Lys39*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22323.1
MPSVKPDVLERESEPFVEIDPTRRYGRYNELLGCGAVKKVYRAFDQEEGIEVAWNQVKLRNFSNDPAMVERLYSEVRLLRSLTNKNIISLYSVWRDEKHNTLNFITEVCTSGNLREYRKKHRHVSMRALKKWSKQILEGLNYLHVHDPCIIHRDLNCSNVFVNGNTGQVKIGDLGLAAIVGKSHSAHSVLGTPEFMAPELYDEDYTEMVDIYSFGMCVLEMVTLEIPYSECDNVAKIYKKVSSGVRPQALNKIQDPEVKAFIERCLAQPRARPSAAELLKDPFFDLLDFDEDVDSNTS*


CDS Sequence:
>Vu_22323.1
ATGCCAAGTGTTAAGCCTGATGTATTGGAGAGAGAGTCAGAGCCATTTGTTGAAATTGATCCAACAAGAAGATATGGCAGATACAATGAACTGCTGGGATGTGGTGCTGTGAAAAAGGTGTACAGGGCATTTGATCAGGAAGAGGGGATAGAGGTGGCATGGAACCAAGTGAAACTGAGGAACTTCAGTAACGATCCTGCAATGGTGGAAAGGCTTTACTCTGAGGTGAGATTGCTCAGAAGCTTGACCAACAAAAACATCATCTCCCTTTACAGCGTTTGGAGGGATGAGAAGCACAACACTTTGAACTTCATCACTGAGGTCTGCACCAGTGGGAATCTGAGGGAGTACAGAAAGAAACACAGGCATGTGTCCATGAGAGCCTTGAAAAAGTGGTCCAAGCAGATTTTGGAAGGGTTGAATTACTTGCATGTTCATGACCCTTGTATCATCCACAGAGACCTCAACTGCAGCAATGTCTTTGTCAATGGGAACACTGGCCAGGTTAAGATTGGTGACTTGGGTTTGGCAGCAATTGTGGGGAAAAGCCACTCTGCACATTCAGTTCTAGGGACACCAGAATTCATGGCACCTGAGTTGTATGATGAAGACTACACTGAAATGGTTGACATATACTCATTTGGAATGTGTGTGTTAGAGATGGTAACACTAGAGATTCCTTACAGTGAATGTGACAATGTTGCTAAGATATACAAGAAGGTGTCATCAGGTGTGAGACCTCAAGCCCTGAATAAGATCCAAGATCCTGAAGTGAAGGCCTTCATTGAGAGGTGTCTTGCTCAGCCAAGGGCTAGACCTTCTGCTGCAGAGTTGCTCAAGGACCCCTTCTTTGATTTGCTTGATTTTGATGAAGATGTTGACTCTAATACTTCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_22323::LG5:53075871-53077871(-)
AAATTTGATATACAATAAGTTAACAAACCTTTTATATATATATATATATATTCAATATAATTTCTTTGTTAAAAAATTAATCAAGTTTGGGGATTTTTAATTTAAATTGTAAAAAAAAATTGATGTTTGATTTTTGAGTGTTTTTTTTGTGATTAGATTGTTAGTTTATGATAATTTTAAAACTACCAAAGAATAACCATTAGTGATGATCTTAAAAATCTCAATATTCGGTTATTTCTATCTTAAATATTCAGTTATTTCTTAGAATAACAAGATCTAATATTAAATTTAACCACAAACTATCATACAATTCAAACATATTATTAGTTTAACCTAATTACAATAAATTAAGATTTGCCTACCATATTCAGTTTGTGTTTTCCTACTTATATCTACCTGATATTAAATGGTTATTTAATTGTTTGTGTAATGAATTAATTCTCATTATATCGATATTCTTAATCTATAAAAACTTAAAAGAACTAATTTACAAATAAGATTAAAAAATAGTAGGAATTGCCTAATATTCTTAGATTCATGTTAACTATATCCATCTCTGAATAAATATGATTCCTGCACCTTTTTCTTTCCCTTTACAACAGATATTTTGGAAAAAGGTTAACACTATCTCCCCTGTTAGCTAGGGTTACCATGAAAGTGTGAGGGCAAAATGAAGTTAGAAACTTAAAATAAAAAATAACCAAAATTACATTTAAATAAATAAATAAATACTTTTTTTCAATAATAGCGTCCAATTACAAAATGCACATGATAAATTTTCTGACTTTCTAATGGTGTAGTACCTATTTTAAAAACTATATAAAATATAATCGTAGCTTAATCTTTTTATCATACACTATTTTTAAACATATAATTTATGTGTTAAGTTTATGATAAATTATTTATCCTGTTGTATCAGTTACTTGTAGTTATTGATATATTTTAAATATTAAAATTAATTTGAAAACAAGGATAAAAAGTTGAAAGATATAAAAGATTAAAACGGTATATCTGAAAACATTTTTAATCTTTTTAAATTCAAGATAGTAAACAGAATAGATTTTGTTTACAACTGCTTAAAATTTTTTTATTCAAGATAAAGTAGTTTTAATTTTTACTGAAAATTATATGTTTTTACATATTTCGCAAAGTGAATTTATTTTACTTTTCACAAAATTATTTCTTAAACAGTGCGGGTAAATGCTAGTTTGAAACAAATTCTTTTAAAAGATCTGAACAAGAAGTAATTAAATTAATTTAATTTGAGTTGACCAGTAACTTCAGTAGATTATATTTGTAAGGGATAATGAAAATTTTATTTTATATTTCTTTTCGTAATCATCGTTAATCAGAAAAAAATAACGAAAAATGGTTTCTGATATCTAATAAGTAATATCTATAATATCTATAATATCTATAATATCTAATATCTAATATCTAATACCTAATCCTAATGAAATTACCCTTTTAACTAACGTACCCTCCTTGATTTTGTGTATATATAGTTTCCTCCAATACCTCATCCTTTCTTGTTTTTGTGTCTCATTCTGCTTCTTCTCTCATACTTGTTTCTTCAGCTCCTCTTTCTTCTTCAAATAGCATTACTTTTTTCTTCATGGTAATCATCTTTACTTTCTCTTTCTCTATTCTGCATTATCTTCTGCTATCAATTTCTCATGTAATTTTCTGCTAGTCTGCTCAATCATCTCCATAACCATAATGAATTGATTTCTATTTCCTTAGTTTCCTCTTAGATTAATTTTGATCTTAGTTTCATGCATACCAACTTGCCAGTTTTTTTCTTTGATGTGGAAAGTAAGAAACTTTATATGAATTTTGATGATGGGTTGGTTTCTTTCTTCCTTTTTTCTCTCTAACAAACTAGAGTAACAGATGATTCTGTTCTCTGAAAATGAGACCTAAGAAAGAATTTTGTGTGCAATTATTTAACTTTTTGGCATTTTATTTTGACGGTGCTGTGATTAATGTTTTGGTGGCAG


Gene Sequence:
>Vu_22323(-)
ATGCCAAGTGTTAAGCCTGATGTATTGGAGAGAGAGTCAGAGCCATTTGTTGAAATTGATCCAACAAGAAGATATGGCAGATACAATGAACTGCTGGGATGTGGTGCTGTGAAAAAGGTGTACAGGGCATTTGATCAGGAAGAGGGGATAGAGGTGGCATGGAACCAAGTGAAACTGAGGAACTTCAGTAACGATCCTGCAATGGTGGAAAGGCTTTACTCTGAGGTGAGATTGCTCAGAAGCTTGACCAACAAAAACATCATCTCCCTTTACAGCGTTTGGAGGGATGAGAAGCACAACACTTTGAACTTCATCACTGAGGTCTGCACCAGTGGGAATCTGAGGGAGTACAGAAAGAAACACAGGCATGTGTCCATGAGAGCCTTGAAAAAGTGGTCCAAGCAGATTTTGGAAGGGTTGAATTACTTGCATGTTCATGACCCTTGTATCATCCACAGAGACCTCAACTGCAGCAATGTCTTTGTCAATGGGAACACTGGCCAGGTAACATTCTTTTTCTTCAATCTCATGTTTTTTCTTCAATCAACCAAAGGAGAGAAAGCAGTAAAAATTACGAAGGTTCCACAAAAACTATCTGCACCTGTCATTTTGGTCGCAATGTCAAGGTTTTTGAAGTGTTTGTGACAATCATTGTGATTTTCACCGACCACATTTATCCATGATTTTTCATAATATCAAGAATTGCAACACAACCAATAACAGACATATAAAACCTTGGAAATTAGATTACCAATGCTTATGATTTTATGAAATTTGCTTTCATTTCTCAAACAAATCTCAATATGGACATCCTAACTTTAGCTACTCATGGTTAAACCAGTATAATTATAATTTTTGTTGTTACTGTTTATTGCAAGATGTCATAACTGATTTTTGTTTTGTTTGATTTACATTCTTAGGTTAAGATTGGTGACTTGGGTTTGGCAGCAATTGTGGGGAAAAGCCACTCTGCACATTCAGTTCTAGGGACACCAGAATTCATGGCACCTGAGTTGTATGATGAAGACTACACTGAAATGGTTGACATATACTCATTTGGAATGTGTGTGTTAGAGATGGTAACACTAGAGATTCCTTACAGTGAATGTGACAATGTTGCTAAGATATACAAGAAGGTGTCATCAGGTGTGAGACCTCAAGCCCTGAATAAGATCCAAGATCCTGAAGTGAAGGCCTTCATTGAGAGGTGTCTTGCTCAGCCAAGGGCTAGACCTTCTGCTGCAGAGTTGCTCAAGGACCCCTTCTTTGATTTGCTTGATTTTGATGAAGATGTTGACTCTAATACTTCATGA