Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22312 LG5 52861153 52864550 PREDICTED: disease resistance protein RPM1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 52861158 3_prime_UTR_variant
C/A 52861210 3_prime_UTR_variant
C/G 52861713 intron_variant
C/A 52861811 missense_variant p.Arg908Leu
G/T 52862046 missense_variant p.Gln830Lys
A/G 52862072 missense_variant p.Leu821Pro
A/G 52862074 synonymous_variant p.Val820Val
G/A 52862110 synonymous_variant p.Pro808Pro
A/C 52862235 missense_variant p.Ser767Ala
G/T 52862243 missense_variant p.Thr764Asn
C/T 52862307 missense_variant p.Glu743Lys
T/C 52862310 missense_variant p.Asn742Asp
G/C 52862325 missense_variant p.Leu737Val
A/T 52862353 synonymous_variant p.Leu727Leu
T/G 52862428 missense_variant p.Gln702His
G/A 52862486 missense_variant p.Ser683Phe
A/G 52862489 missense_variant p.Val682Ala
C/A 52862513 missense_variant p.Arg674Leu
T/G 52862531 missense_variant p.Lys668Thr
A/G 52862599 synonymous_variant p.Gly645Gly
A/T 52862602 synonymous_variant p.Ile644Ile
G/T 52862895 missense_variant p.His547Asn
T/C 52863151 synonymous_variant p.Pro461Pro
T/A 52863540 missense_variant p.Arg332Trp
C/G 52864118 missense_variant p.Cys139Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22312.1
MHSPFPRSKTQMENYTKVAETSMPFARRYLPPKPFEALKMMRDFSKEVADITDEHGSLLDFIDDANKVADAEEDVKRRDRMKERLMRLREAAFRMEDVIDEYCIRVKEKQPQHGPPWAASLSKTVHSIKTFILRLQIACKIQDEKSVVRDEKVGFESQYFLDKKLNSSRENKNVTFNQLRMDPLFMKEEEVVGLAEPTERLTDWLTMGREERTVISVVGIAGVGKTTLAKHVFDRVHQYFECHALITVSQSYTVEELLRDLVRKLCKERKEDPPCKISTMDRGSLIEEVRDRLHNKRYVVLFDDVWNEKFWDDIQSALIDDKNNSRIIITTRNEKVAVFCKKSSFVEVHKLEEPLKDESFRLFCRKAFKYGSAGGCPEELKDISLEIVRKCKGLPLAIVAIGGVLSQKDDSEKEWRLFSQNLSSELKRNPDLNIITKIIGLSYDNLPSHLRLCLLYFGMYPKDYEIESERLVRQWVAEGFVTHEEGKTLEEVAHEYLLGLVRRSLVQVSSFSMKGKVKKCRVHDLIHDMIRTKVKDTCFGEYIGGGHDQSESSESVRRLTIQANNDLNRRIKRSHIRSIIVIPGKKELLSVHLVKKIPKDYILLKVLDFEDCGLLCVPKKLGNLIYLRYLSFRGTQIKVLPKSIGKLVNLETLDIRQTQVCKVPKEIKKLRKLRHLLTPDSVSSSIEWKDIGGMTRLQKIPQVRMEGDGVAIREVGKLKQLRVLRVLCFGGEHITLLFSSINEMEHLQALRIEKSDDRNVVDLTTTSTISELRKLFLDLKLEKLPNWIPQLLHLERLTLRHSDLNNDPLESLKDMPSLLVLSLSHAYEGQTLHFQPGGFKKLRKLNLEHLWNLNSILMDETALQSLEHLNLKGLDELRTVPDGIQHLKKLKFVLVLSMPTLFVKEIDRIGKDQHWSINYGCM*


CDS Sequence:
>Vu_22312.1
ATGCACTCACCATTTCCACGTAGCAAAACACAGATGGAGAACTACACAAAAGTGGCAGAAACTTCAATGCCCTTTGCTCGTCGGTATTTGCCACCAAAACCTTTTGAAGCTCTGAAAATGATGAGAGATTTCTCAAAAGAAGTTGCAGATATTACAGATGAACATGGAAGCTTGCTAGATTTCATCGATGATGCAAATAAAGTGGCTGATGCTGAAGAAGATGTCAAAAGGCGTGATAGAATGAAGGAAAGGTTGATGAGGCTGAGAGAAGCAGCTTTTCGCATGGAAGACGTGATTGATGAATATTGCATCCGTGTTAAAGAGAAACAACCTCAACATGGTCCTCCATGGGCAGCTTCACTCTCTAAGACTGTCCACAGCATCAAAACCTTCATCCTTCGACTTCAAATAGCATGTAAGATTCAGGATGAAAAATCAGTTGTTCGTGATGAAAAAGTTGGTTTTGAAAGCCAATATTTTTTAGATAAAAAACTAAACAGTTCTAGAGAAAACAAAAATGTCACGTTTAATCAACTTCGAATGGATCCTCTCTTTATGAAGGAAGAGGAGGTTGTTGGACTTGCTGAACCTACAGAGAGATTGACAGATTGGTTAACAATGGGACGAGAAGAACGCACTGTGATTTCTGTTGTAGGTATTGCAGGAGTTGGAAAAACCACTCTTGCCAAGCATGTTTTTGACAGGGTCCATCAATACTTTGAGTGCCATGCATTGATCACAGTCTCTCAATCCTACACTGTAGAAGAATTGTTGAGGGATTTGGTACGCAAACTTTGCAAAGAGAGAAAGGAAGATCCACCTTGTAAAATTTCTACGATGGATAGAGGCTCCTTGATTGAAGAAGTCAGAGATCGCCTGCACAATAAGAGGTATGTTGTCTTATTTGATGACGTATGGAATGAAAAGTTTTGGGATGACATTCAATCTGCTTTGATCGATGATAAAAACAACAGTAGGATAATAATCACTACAAGGAACGAGAAGGTTGCGGTCTTCTGTAAGAAATCTTCTTTTGTTGAAGTGCATAAGCTAGAAGAGCCATTAAAAGATGAATCTTTCAGATTGTTCTGTAGAAAGGCATTTAAGTATGGTTCTGCCGGAGGCTGCCCAGAAGAACTCAAAGACATATCTCTTGAAATTGTTAGGAAGTGTAAAGGTTTACCTCTGGCAATTGTGGCCATTGGTGGTGTCTTGTCCCAAAAAGATGACAGTGAAAAAGAATGGAGACTGTTTAGTCAAAATCTAAGTTCAGAGTTGAAGAGGAATCCTGATTTAAATATTATAACAAAAATTATAGGTTTAAGTTATGATAATTTGCCGAGCCATCTCAGATTATGTTTACTGTATTTCGGAATGTATCCAAAAGATTATGAAATTGAATCTGAGAGATTGGTTAGGCAATGGGTGGCTGAAGGATTTGTTACCCACGAAGAGGGAAAAACTTTAGAAGAAGTTGCACATGAATATTTACTAGGGTTGGTTCGTAGAAGTTTGGTGCAAGTGTCATCATTTTCCATGAAAGGAAAAGTGAAAAAATGTCGTGTTCATGACTTAATACACGATATGATCCGTACAAAAGTGAAGGATACATGTTTTGGAGAGTATATTGGCGGAGGGCATGATCAATCTGAGTCAAGTGAGTCGGTTCGACGTCTGACAATTCAAGCAAACAATGATTTAAATAGACGTATTAAAAGATCACACATTCGGTCAATTATAGTCATTCCAGGAAAAAAAGAACTATTGTCTGTCCACTTGGTAAAGAAAATCCCTAAAGATTATATTCTATTGAAGGTACTTGATTTTGAAGATTGTGGATTACTTTGTGTTCCTAAAAAGTTGGGGAATTTAATCTACCTGAGGTATTTAAGCTTTAGGGGGACGCAGATAAAAGTTCTTCCAAAATCCATTGGTAAGCTCGTGAACTTGGAGACCTTGGATATACGACAAACGCAAGTGTGTAAGGTGCCGAAGGAGATCAAAAAGCTTAGAAAGTTACGGCATCTTCTGACACCTGACTCTGTATCTTCTTCAATTGAATGGAAGGATATTGGAGGCATGACAAGGCTGCAAAAGATACCACAAGTGCGTATGGAGGGTGATGGAGTGGCCATTAGAGAGGTAGGGAAGTTAAAGCAGTTAAGGGTTCTGAGGGTGCTTTGTTTCGGCGGAGAGCACATTACTTTACTTTTCTCCTCAATCAATGAGATGGAACACTTGCAAGCACTACGCATTGAAAAATCTGATGATCGCAACGTAGTTGACTTGACCACTACGTCAACCATATCTGAACTTAGGAAGCTTTTCCTTGATTTGAAGTTAGAAAAGTTGCCAAATTGGATTCCCCAACTCCTTCATCTTGAGAGATTGACCTTGCGCCACTCTGACTTAAACAATGATCCCTTGGAATCACTAAAAGATATGCCTAGTTTGTTGGTTCTCTCTTTATCCCACGCTTATGAAGGTCAAACTTTGCATTTTCAGCCTGGAGGGTTCAAGAAACTAAGAAAGCTAAATCTCGAACATCTTTGGAACTTGAATTCGATCCTTATGGATGAGACAGCTCTGCAGTCTTTGGAACATCTTAATTTGAAAGGCCTCGATGAACTCAGAACTGTCCCCGATGGCATTCAACATCTGAAGAAACTTAAATTTGTTCTTGTCCTTTCTATGCCAACTCTATTTGTTAAGGAAATTGATCGCATTGGTAAAGACCAGCACTGGAGCATCAATTATGGCTGTATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_22312::LG5:52864550-52866550(-)
TTAAAGAAAAGCAATTTCTTTCCAAAATTTTGATAGTAAAGAAAGTGTTAAATGTAAAACTACCACCAGTCAAACAAAGTTAATGGAAACAACAACCTATCTGAGAATTCAATAAATACAATTTAGTGGTTGTAGAAGTACCACAAAATAAATGGGAAAAAGCAAACCACAACTTGGCACAAAACATTTAATATATACGCTGAAAGGTCGAAGTCACCTAAATGAACAAAAAATGCTAGAACATTATATTTAATTATTTATTTATTCAACTTTCACCCTCTCAATAAAATGTTTAATCAAATACCTTAATTTCAAAAAGTACAACAATATAATTTTTATCTATTAAAATTGATATATAGCTTGCTTTATAAACATTCACTAATCACTACTGGATTCTTATAAACTATATTATAATATAATTAGAACAGTAGTCGAAAACAGGGAGACATAATTACCCACAATATGATGACAATTTTTGCTTTAATTCAGTTATTAAAAGTTATAAAATGAAACTTGCGATGTGAGAGAAGAGAACAAGACTAATAAAGAATAGCAATACAAGAAAAAGATTCTTTTGTGGGTAATTCTAACAATTAAGTTAATTTAAAGTATCAAATATGTAAGATAACATGTGAGATCAAACTAATATTTTTAAATAGTTCATAACCACGAGTTAAAATTAAATATGTCTTGATATTTATCTCACAATATAAATTATCTAAGAACTTGTAAAAGACAAATAAAATAAACATTTGTTTGAAAACTTAGAAATGCAATTAAGTGTGCACAACTAACTATGGCAAGAGCAATCAATTGTAACCTAACCCTCTTGGTGTGGTACGGCAAAATAAATGGGAAAGAGCAAAACACGAAACATTTAATGTTGAAAGCTCAAAGTCTTTGGTTTGCCTGTATGAAGTACACAATCATTACATTCAAATAGACTTAGTTTCTAATTTATTTATTTATTTATTGTATTCAATTACAAATTCTATTAAAAAATTAATTAATCATTTTTAATTTTAAAATATAACTATGTAGTGGTGTTAAGGTTCAGTTAAACATTGAAGACAACTTCACGCAAGTTATCTTGATTATTGTACTTGTATTATATTTTTGAAGGAAGAACTGTGTTATGTTGTACAACGTTAACATAAAGTGGTGAATGACTTTTGTTCTTTGTGAGAAAAATAGGGTGAAAATGATTCAACCAATATGTATATAATTATTTACTAGTGTTAATCTAACTATATTAATTTAAAAAACTCCTTTAAAAATGTAAAAAATAACTGAAATCATATAGGTTAAGTTTCTTATGAGCAAATAAAGAATTTATCAGTGCGTGAATTCCATTAGTCTTGCGCCATCAAATATTTAAAAATCTATAATGAACTCGGCTAAGGCAAGTCACAAACTATTTACGTCTCATCTTTTCAAATCATGAACTTCATGTAACTTGCAACCAAAAAAATTATGAACTCTAAATCACAAAAATTCCTAATCCCAAATTGTAAAAAACTAATACACAGATCGTTTCATGGCCACCACCATTGCAACAAGTCCCAAGCCACCAAAATGTAAAATCCTAATTTTTGCCAAAGAAGCTCCTTGGTCATAACGACCATCGCAATTTCCAATTTCAATTTTTATCAGAAACCCAAACAATAATATGAAGACCTTAATTTTGTGATTTCCATTTACAATTTATAAGAAATCTATTTTTTTAATTGTTTAATATATCATATTCCACGTATGTCATCCATCTTTCACACAATTTAATGAAACCAGGTCACAACGATAATTCAACTAAATTTTGACCTCGTTAATCTAATTTAACCGCATGGATTCAACTGTATTTATTTTTCACGTTTAGAAACCTAATTGAAACAGAAAAAGAAAGGAACCTTGAGAAAATTAACTTAAACCGAGACTATGATAATGATTAAACCTATATTATATTTTTGAAGGCTTTAAAGGAAAAGAACTGTGGTATGTTGTAG


Gene Sequence:
>Vu_22312(-)
AACGTTAGCACAAAGTAATGCACTCACCATTTCCACGTAGCAAAACACAGATGGAGAACTACACAAAAGTGGCAGAAACTTCAATGCCCTTTGCTCGTCGGTATTTGCCACCAAAACCTTTTGAAGCTCTGAAAATGATGAGAGATTTCTCAAAAGAAGTTGCAGATATTACAGATGAACATGGAAGCTTGCTAGATTTCATCGATGATGCAAATAAAGTGGCTGATGCTGAAGAAGATGTCAAAAGGCGTGATAGAATGAAGGAAAGGTTGATGAGGCTGAGAGAAGCAGCTTTTCGCATGGAAGACGTGATTGATGAATATTGCATCCGTGTTAAAGAGAAACAACCTCAACATGGTCCTCCATGGGCAGCTTCACTCTCTAAGACTGTCCACAGCATCAAAACCTTCATCCTTCGACTTCAAATAGCATGTAAGATTCAGGATGAAAAATCAGTTGTTCGTGATGAAAAAGTTGGTTTTGAAAGCCAATATTTTTTAGATAAAAAACTAAACAGTTCTAGAGAAAACAAAAATGTCACGTTTAATCAACTTCGAATGGATCCTCTCTTTATGAAGGAAGAGGAGGTTGTTGGACTTGCTGAACCTACAGAGAGATTGACAGATTGGTTAACAATGGGACGAGAAGAACGCACTGTGATTTCTGTTGTAGGTATTGCAGGAGTTGGAAAAACCACTCTTGCCAAGCATGTTTTTGACAGGGTCCATCAATACTTTGAGTGCCATGCATTGATCACAGTCTCTCAATCCTACACTGTAGAAGAATTGTTGAGGGATTTGGTACGCAAACTTTGCAAAGAGAGAAAGGAAGATCCACCTTGTAAAATTTCTACGATGGATAGAGGCTCCTTGATTGAAGAAGTCAGAGATCGCCTGCACAATAAGAGGTATGTTGTCTTATTTGATGACGTATGGAATGAAAAGTTTTGGGATGACATTCAATCTGCTTTGATCGATGATAAAAACAACAGTAGGATAATAATCACTACAAGGAACGAGAAGGTTGCGGTCTTCTGTAAGAAATCTTCTTTTGTTGAAGTGCATAAGCTAGAAGAGCCATTAAAAGATGAATCTTTCAGATTGTTCTGTAGAAAGGCATTTAAGTATGGTTCTGCCGGAGGCTGCCCAGAAGAACTCAAAGACATATCTCTTGAAATTGTTAGGAAGTGTAAAGGTTTACCTCTGGCAATTGTGGCCATTGGTGGTGTCTTGTCCCAAAAAGATGACAGTGAAAAAGAATGGAGACTGTTTAGTCAAAATCTAAGTTCAGAGTTGAAGAGGAATCCTGATTTAAATATTATAACAAAAATTATAGGTTTAAGTTATGATAATTTGCCGAGCCATCTCAGATTATGTTTACTGTATTTCGGAATGTATCCAAAAGATTATGAAATTGAATCTGAGAGATTGGTTAGGCAATGGGTGGCTGAAGGATTTGTTACCCACGAAGAGGGAAAAACTTTAGAAGAAGTTGCACATGAATATTTACTAGGGTTGGTTCGTAGAAGTTTGGTGCAAGTGTCATCATTTTCCATGAAAGGAAAAGTGAAAAAATGTCGTGTTCATGACTTAATACACGATATGATCCGTACAAAAGTGAAGGATACATGTTTTGGAGAGTATATTGGCGGAGGGCATGATCAATCTGAGTCAAGTGAGTCGGTTCGACGTCTGACAATTCAAGCAAACAATGATTTAAATAGACGTATTAAAAGATCACACATTCGGTCAATTATAGTCATTCCAGGAAAAAAAGAACTATTGTCTGTCCACTTGGTAAAGAAAATCCCTAAAGATTATATTCTATTGAAGGTACTTGATTTTGAAGATTGTGGATTACTTTGTGTTCCTAAAAAGTTGGGGAATTTAATCTACCTGAGGTATTTAAGCTTTAGGGGGACGCAGATAAAAGTTCTTCCAAAATCCATTGGTAAGCTCGTGAACTTGGAGACCTTGGATATACGACAAACGCAAGTGTGTAAGGTGCCGAAGGAGATCAAAAAGCTTAGAAAGTTACGGCATCTTCTGACACCTGACTCTGTATCTTCTTCAATTGAATGGAAGGATATTGGAGGCATGACAAGGCTGCAAAAGATACCACAAGTGCGTATGGAGGGTGATGGAGTGGCCATTAGAGAGGTAGGGAAGTTAAAGCAGTTAAGGGTTCTGAGGGTGCTTTGTTTCGGCGGAGAGCACATTACTTTACTTTTCTCCTCAATCAATGAGATGGAACACTTGCAAGCACTACGCATTGAAAAATCTGATGATCGCAACGTAGTTGACTTGACCACTACGTCAACCATATCTGAACTTAGGAAGCTTTTCCTTGATTTGAAGTTAGAAAAGTTGCCAAATTGGATTCCCCAACTCCTTCATCTTGAGAGATTGACCTTGCGCCACTCTGACTTAAACAATGATCCCTTGGAATCACTAAAAGATATGCCTAGTTTGTTGGTTCTCTCTTTATCCCACGCTTATGAAGGTCAAACTTTGCATTTTCAGCCTGGAGGGTTCAAGAAACTAAGAAAGCTAAATCTCGAACATCTTTGGAACTTGAATTCGATCCTTATGGATGAGACAGCTCTGCAGTCTTTGGAACATCTTAATTTGAAAGGCCTCGATGAACTCAGAACTGTCCCCGATGGCATTCAACATCTGAAGAAACTTAAATTTGTTCTTGTCCTTTCTATGCCAACTCTATTTGTTAAGGAAATTGATCGCATTGGTAAAGACCAGCACTGGAGCATCAATTATGGCTGTATGTGATTCGCGGTACGTATTTACCATTATAAGATTTTCACTACTATAATCTTTTATGTTAGTATTTTATGCTCTGAATTGGTAGGTGTTGACCTCGACTCAAGAATTACGTTGTTTTTACTTTAGATGTTTATAAGTGTCATCAAGATGAACACTTTAAAACGTGAGATTTAGGAAGAAGTTTAGGCCTTCTGTTTGTAAATGTATACTGGTGTAAATTTAGTGAGTATTATTTCATTACGACTTGAAGCACATTATAAATTTATCTACATTTGATTGTGTTAACTTTAATGTTCTTAATTCTAGATCTTCTACTCACTATTGTACAATCGTGAATTTTAGGAAAGCTGTAAGTGAATATCCCCTCAAGTTCTCTCTCGTGCGATCCTTGAAGCGGTGGATCTCGATTTGATGCCTCAAACTGCAAAGCCCATCTATTTGTCATGATGTTTTCTAAGCTTCCTTCAATTTTTCCCTCTTTTCTTTTCCAAAATGTGTATTTAACTTTTAGTTTGCGGGTGAAGAATCCTAACTGCAACTTGATGTTAGATTTAATTGAAGCTCATTTCAGTGATCGCTTTTCCGTTTCTAATGCCTTTATAAATCGATCACTTCACT