Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_22180	LG5	49868060	49869547	PREDICTED: tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
C/A	49869081	missense_variant	p.Gly156Val
G/A	49869088	missense_variant	p.Pro154Ser
A/T	49869219	missense_variant	p.Leu110His

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22180.1

MPSPSSSSSAYSLYNSYMVSNFMVSIIVPLFLFSLFVVHVSSCSQIDKLSLLAFSGNISTSPPFPYLNWSDSLDCCAWEGITCDGDLRVTHLLLPSRGLTGFISPSLTNLSCLSHLNLSHKRLSGGLQHQFFSLLSHLVVLDLSYNHLSGELPPFGIDNSGKNSSGAAIQELDLSSNFFNGTLPNSLLENLAAAAVGGSLVSLNVSNNSFIGHIPTSLFCINDRNSSSLRFLDYSSNDFDGAIQPGLGACSKLERFRAGFNFLSWPIPSDLFDAVSLTEISLPLNRLTGTIEDGIVGLTNLTVLELYSNHFTGFIPREIGKLSKLERLLLHVNNLTGTMPPSLMNCVNLVVLNLRVNLLEGNIPAFNFSGFLSLTTLDLGNNYFIGGLPPTLYACKSLSAVRFASNQLEGEISPSILELESLSFLSISTNKLRNVTGPLTILRGLKNLSTLMLSKNFFNEMIPQDVNIIEPGGFQKLQVLGFGGCNFTGCININK*

CDS Sequence:
>Vu_22180.1

ATGCCATCACCATCTTCATCTTCCTCTGCATATTCCCTTTACAATTCTTACATGGTTTCCAACTTCATGGTCTCTATCATAGTCCCCTTATTCCTCTTCTCCTTGTTTGTTGTTCATGTTTCCTCTTGTAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCCACCTCTCCACCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTGTCTCTCTCACCTTAATCTCTCCCATAAGAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGTTTTTTTCATTGCTCAGTCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAGTGGTGCTGCTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCGAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGTTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTCTCACAGAAATCTCATTGCCCCTCAATAGACTCACTGGAACAATTGAAGATGGTATAGTTGGCCTTACCAACCTCACAGTTTTGGAGCTCTACTCCAATCATTTCACAGGTTTCATCCCCCGTGAAATTGGTAAACTCTCCAAGTTGGAACGGCTACTCCTTCATGTCAACAATTTGACAGGTACTATGCCCCCGTCTCTGATGAACTGTGTTAATCTTGTGGTGTTGAATTTAAGGGTCAATCTCTTGGAGGGAAATATCCCTGCATTCAATTTCTCAGGATTCCTCAGCCTTACTACACTTGATCTTGGCAACAATTATTTTATCGGTGGTTTACCACCAACCCTTTATGCATGCAAATCACTTTCAGCTGTGAGGTTTGCATCTAATCAGCTTGAGGGAGAGATTTCTCCCAGTATCCTTGAACTAGAGTCTTTGTCTTTCCTATCAATTTCTACTAACAAGTTAAGGAATGTTACTGGGCCTCTGACAATACTCAGGGGGCTCAAAAACCTCAGTACCCTTATGCTCTCCAAGAATTTTTTCAACGAAATGATACCTCAAGATGTGAACATAATAGAGCCAGGTGGATTTCAAAAACTGCAGGTTTTAGGATTTGGTGGTTGTAATTTCACTGGTTGTATAAATATAAATAAATAA

Promoter Sequence:
>Vu_22180::LG5:49869547-49871547(-)

GGTTTTTGGGTTGAGTGAGGTGTGAACATTGAAGGGAATGAGAGTCGATTGGTAGAATAATTATGGAGAAAGGAGGTGGTGGGTGTAGGTGTTGTGGAAAAGGAGTATGAGTGGAAGAGAGGGAGAGGTTGGTAGGTTGCAGGTGAAGGACTTAATAGTGAGAGTGCCTCGGGTTGGGTAGCATGAATGAAATAATGTGTGAAGGGCTTAGTTTCTCATCGTGGTTATGTTGGGAAAGAAAGATAATAAGAAAGGGTTTGGCATGTGCAGGGAACATGCAAGGAATATTGTAACTAGGAAATATAGTTGGTTTTAGGGTGGAGATGATTCCAGGGGTCATAGTGAGTTTAAGGGTAAATTATTTGGGAAGAATAATGGTGGTATAGGGGTATAAGGGATTATAGAAGGGTTGAGCAGGGAATGGGTATACACATTCATTAGATTGTACTAACTAACCCTAAACATATATATAACTAAGCGTAATTAGGTGTATAACCAGCCATAACAAACCTCTCAAACGCCATTGTGAAGGGTTTCAACTCTTGAAACGATGCATGTATTGTTCATGTGTTTTTTCAAATCATAATTGTAAACAAAAGCATTACAATTACTAGAACTTGCCACTGTTTTCAATGGCAGCAGCTGGAAGAGATAGTCTTAGCTCCAAATCTGGTTCTGTGGTGTTGAAGGATGTTCCACCAAGGTCTACCACTGTTAAATGTTTAGAAGTAATTTAGAAGTGCCACTCTATTTTAGATAAAATTTAGAAAAACTTGGCATCACCACAACTTTGTGACGTTAGTCTTGATGATATTGATGATCAACACTTCCTGTGCTAATTAGTTGTTTTTAGACCATTATTAGTGTAGTGTCTTAAATTGATAGATTTCACTCACTTAGTTTAGTAGTAGTTTAAATTGTTTGGCTTTTCATTCTAAAATTGATTTGAATTTCACCAAAAGAAGTACTTCTTAGTTGTGTTAGATGAACATTAAAAATTGTTTTAGACAACTTAGTGGATTTTTAGATTACCCTTAGATAGATTTTGTTGTAGTTAGTGTGCATGTTAGTTGAACTGACTTTGTAGATGCCCACACTGGCCACCTGTTAGCAGGGTTTAGCTCTGCAACTCCTTTCTCTGCCTCATCAAAAAACATCCTTGTCCTCTTTATCTGTCCCTTCATGAATTTACTAGGTTTATCTATAACTTTACCCAGGAAAATGTCATCATCTAAAAGCCTAGCTTTTGCCAATTCATCTTGTCCCTCCTCCTAGTTTACTTCCCCTTTGTTGAGAATGGCATAGTACCTTATCTGCTACTCTTCTTTCTCTTAATTACGAATAATCTTCTGCAGATCAAGCTTTGTTTGTCAAATCTGCTTCTACTTCTTTTACTGCATTATTTGTTTAGGTGGATGATATTGTTTTAATTAGCAATGATATGGCAGAAATTAATCATCTTAAGCACATCTTAGATACCAAATTTAAAATCAAAGACCTAGGATCTTTAAGATACTTTCTCGGTCTTGGAATTACAAGGTCCAAATCTGGAATTCACATGAATAAGAGAAAATATATTCTTGAACTTCTCGATGACAGTGGTTTGATTGGTTCTAAACCTACTAACACTCCTTCTGATCCTTCTATTAAACTTATGGCAAATCATGGACAACTTTTATGTAATGCTGCTGGTTACTGTCAGTTAGTTGGCAAACTTTTGCACCTCACCATCATCAAGCAAGATATTGATTATGTGTACAACAACTCAGCCAATTTCTATGCAAACCTCTTGATACTTATTACAATGCTGCTCAAAGAATCTTTCATTACCTCAATGGATCCCCTGCTCATGGCTTGTTCTTCTTTGCTTCATCAGACCTTAGAATCTCGGCCTTTGCCAATTGAGATGAGCTTGCTGTTTGGATACCAGAAGGTCTATCATGGATCCCCTGCTCATGACCAACCATCACTTCAAACACTCCATTCTCTCAGTTTTTCTC

Gene Sequence:

>Vu_22180(-)